RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000485450.5

USP4-211, Transcript of ubiquitin specific peptidase 4, humanhuman

TSL 2

Gene USP4, Length 3,541 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP4-211ENST00000485450 TEFQ10587 303 aa9.55□□□□□ -0.88
USP4-211ENST00000485450 DCTN1Q14203 1278 aa9.55□□□□□ -0.88
USP4-211ENST00000485450 CCDC146Q8IYE0 955 aa9.55□□□□□ -0.88
USP4-211ENST00000485450 SPEF2Q9C093 1822 aa9.55□□□□□ -0.88
USP4-211ENST00000485450 ADCY9O60503 1353 aa9.55□□□□□ -0.88
USP4-211ENST00000485450 GYS1P13807 737 aa9.55□□□□□ -0.88
USP4-211ENST00000485450 KIAA1211Q6ZU35 1233 aa9.55□□□□□ -0.88
USP4-211ENST00000485450 DDX21Q9NR30 783 aaKnown RBP eCLIP9.55□□□□□ -0.88
USP4-211ENST00000485450 ATP6V1AP38606 617 aa9.54□□□□□ -0.88
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USP4-211ENST00000485450 DNAJC10Q8IXB1 793 aa9.54□□□□□ -0.88
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USP4-211ENST00000485450 CENPQQ7L2Z9 268 aaPredicted RBP9.53□□□□□ -0.88
USP4-211ENST00000485450 STARD3NLO95772 234 aa9.53□□□□□ -0.88
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USP4-211ENST00000485450 SLC39A6Q13433 755 aa9.52□□□□□ -0.88
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USP4-211ENST00000485450 ZBTB1Q9Y2K1 713 aa9.52□□□□□ -0.89
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USP4-211ENST00000485450 TAF1P21675 1872 aa9.51□□□□□ -0.89
USP4-211ENST00000485450 BECN1Q14457 450 aa9.51□□□□□ -0.89
USP4-211ENST00000485450 TTC5Q8N0Z6 440 aa9.51□□□□□ -0.89
USP4-211ENST00000485450 AK7Q96M32 723 aa9.51□□□□□ -0.89
USP4-211ENST00000485450 ECM29Q5VYK3 1845 aa9.5□□□□□ -0.89
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USP4-211ENST00000485450 HOXA10P31260 410 aaPredicted RBP9.46□□□□□ -0.9
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USP4-211ENST00000485450 CHMP4CQ96CF2 233 aa9.46□□□□□ -0.9
USP4-211ENST00000485450 A1BGP04217 495 aa9.45□□□□□ -0.9
USP4-211ENST00000485450 LTBP3Q9NS15 1303 aa9.45□□□□□ -0.9
USP4-211ENST00000485450 SLC20A2Q08357 652 aa9.45□□□□□ -0.9
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