RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000480416.1

TNS1-215, Transcript of tensin 1, human

TSL 2

Gene TNS1, Length 335 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TNS1-215	ENST00000480416	BTAF1	O14981	1849 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TNS1-215	ENST00000480416	ACE	P12821	1306 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TNS1-215	ENST00000480416	CPD	O75976	1380 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TNS1-215	ENST00000480416	SPDYE5	A6NIY4	337 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TNS1-215	ENST00000480416	CCDC85C	A6NKD9	419 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TNS1-215	ENST00000480416	FDX1	P10109	184 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TNS1-215	ENST00000480416	JUND	P17535	347 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TNS1-215	ENST00000480416	SSTR3	P32745	418 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
TNS1-215	ENST00000480416	RGS19	P49795	217 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TNS1-215	ENST00000480416	WNT7B	P56706	349 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TNS1-215	ENST00000480416	C16orf71	Q8IYS4	520 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
TNS1-215	ENST00000480416	CRIPAK	Q8N1N5	446 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TNS1-215	ENST00000480416	SNIP1	Q8TAD8	396 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
TNS1-215	ENST00000480416	TOR4A	Q9NXH8	423 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TNS1-215	ENST00000480416	MKRN1	Q9UHC7	482 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
TNS1-215	ENST00000480416	QSER1	Q2KHR3	1735 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TNS1-215	ENST00000480416	KCP	Q6ZWJ8	1503 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TNS1-215	ENST00000480416	RGPD5	Q99666	1765 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TNS1-215	ENST00000480416	WNK3	Q9BYP7	1800 aa		4.9	□□□□□ -1.62
TNS1-215	ENST00000480416	KAT6B	Q8WYB5	2073 aa		4.9	□□□□□ -1.62
TNS1-215	ENST00000480416	NHS	Q6T4R5	1651 aa		4.9	□□□□□ -1.62
TNS1-215	ENST00000480416	C6orf229	H3BNL8	230 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TNS1-215	ENST00000480416	AXIN1	O15169	862 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TNS1-215	ENST00000480416	ZMYND10	O75800	440 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TNS1-215	ENST00000480416	LBX1	P52954	281 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TNS1-215	ENST00000480416	AMHR2	Q16671	573 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TNS1-215	ENST00000480416	ARHGAP27	Q6ZUM4	889 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TNS1-215	ENST00000480416	TULP4	Q9NRJ4	1543 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TNS1-215	ENST00000480416	COL18A1	P39060	1754 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TNS1-215	ENST00000480416	USP19	O94966	1318 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TNS1-215	ENST00000480416	WDR17	Q8IZU2	1322 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TNS1-215	ENST00000480416	BRD4	O60885	1362 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
TNS1-215	ENST00000480416	ROCK1	Q13464	1354 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TNS1-215	ENST00000480416	PIK3C2G	O75747	1445 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TNS1-215	ENST00000480416	KIAA1210	Q9ULL0	1709 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TNS1-215	ENST00000480416		A0A0G2JLW4	131 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TNS1-215	ENST00000480416	AVP	P01185	164 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TNS1-215	ENST00000480416	CSB-PGBD3	P0DP91	1061 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TNS1-215	ENST00000480416	SMCP	P49901	116 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
TNS1-215	ENST00000480416	SLC27A3	Q5K4L6	730 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TNS1-215	ENST00000480416	C9orf131	Q5VYM1	1079 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TNS1-215	ENST00000480416	NLRP13	Q86W25	1043 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TNS1-215	ENST00000480416	ZC3H15	Q8WU90	426 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
TNS1-215	ENST00000480416	CARD10	Q9BWT7	1032 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TNS1-215	ENST00000480416	PRDM10	Q9NQV6	1147 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TNS1-215	ENST00000480416	AAAS	Q9NRG9	546 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TNS1-215	ENST00000480416	BCS1L	Q9Y276	419 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TNS1-215	ENST00000480416	ANKRD30B	Q9BXX2	1392 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TNS1-215	ENST00000480416	MS4A1	P11836	297 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TNS1-215	ENST00000480416	GJA5	P36382	358 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TNS1-215	ENST00000480416	SMC1B	Q8NDV3	1235 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TNS1-215	ENST00000480416	SYTL4	Q96C24	671 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
TNS1-215	ENST00000480416	AK7	Q96M32	723 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TNS1-215	ENST00000480416	NUDT12	Q9BQG2	462 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TNS1-215	ENST00000480416	CDCA7	Q9BWT1	371 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
TNS1-215	ENST00000480416	CDK19	Q9BWU1	502 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TNS1-215	ENST00000480416	N4BP2	Q86UW6	1770 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
TNS1-215	ENST00000480416	TNRC18	O15417	2968 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
TNS1-215	ENST00000480416	CCNYL3	P0C7X3	344 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TNS1-215	ENST00000480416	GIGYF2	Q6Y7W6	1299 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
TNS1-215	ENST00000480416	DDX54	Q8TDD1	881 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
TNS1-215	ENST00000480416	SPIRE2	Q8WWL2	714 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TNS1-215	ENST00000480416	HLA-C	Q95604	372 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TNS1-215	ENST00000480416	MRGPRX2	Q96LB1	330 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TNS1-215	ENST00000480416	SENP2	Q9HC62	589 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TNS1-215	ENST00000480416	CCNL1	Q9UK58	526 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
TNS1-215	ENST00000480416	SPATA31E1	Q6ZUB1	1445 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TNS1-215	ENST00000480416	PLEKHG3	A1L390	1219 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TNS1-215	ENST00000480416	POTEC	B2RU33	542 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TNS1-215	ENST00000480416	ST8SIA5	O15466	376 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TNS1-215	ENST00000480416	KCNA3	P22001	575 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TNS1-215	ENST00000480416	CTCF	P49711	727 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
TNS1-215	ENST00000480416	GUCA2A	Q02747	115 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TNS1-215	ENST00000480416	MTMR2	Q13614	643 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TNS1-215	ENST00000480416	PTPRN	Q16849	979 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TNS1-215	ENST00000480416	RC3H1	Q5TC82	1133 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
TNS1-215	ENST00000480416	DESI1	Q6ICB0	168 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TNS1-215	ENST00000480416	ARHGEF25	Q86VW2	580 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TNS1-215	ENST00000480416	BEGAIN	Q9BUH8	593 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TNS1-215	ENST00000480416	POLR3A	O14802	1390 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
TNS1-215	ENST00000480416	PPIP5K1	Q6PFW1	1433 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TNS1-215	ENST00000480416	CIC	Q96RK0	1608 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
TNS1-215	ENST00000480416	HSPA8	P11142	646 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
TNS1-215	ENST00000480416	DPEP1	P16444	411 aa		4.85	□□□□□ -1.63
TNS1-215	ENST00000480416	VEGFB	P49765	207 aa		4.85	□□□□□ -1.63
TNS1-215	ENST00000480416	PPARGC1B	Q86YN6	1023 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
TNS1-215	ENST00000480416	EHBP1	Q8NDI1	1231 aa		4.85	□□□□□ -1.63
TNS1-215	ENST00000480416	KIFC2	Q96AC6	838 aa		4.85	□□□□□ -1.63
TNS1-215	ENST00000480416	ZNF775	Q96BV0	537 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
TNS1-215	ENST00000480416	RNF181	Q9P0P0	153 aa		4.85	□□□□□ -1.63
TNS1-215	ENST00000480416	NSD2	O96028	1365 aa		4.85	□□□□□ -1.63
TNS1-215	ENST00000480416	LY75	O60449	1722 aa		4.85	□□□□□ -1.63
TNS1-215	ENST00000480416	KIAA1551	Q9HCM1	1747 aa		4.85	□□□□□ -1.63
TNS1-215	ENST00000480416	PXDNL	A1KZ92	1463 aa		4.84	□□□□□ -1.63
TNS1-215	ENST00000480416	IL2RB	P14784	551 aa		4.84	□□□□□ -1.63
TNS1-215	ENST00000480416	SMPD1	P17405	629 aa		4.84	□□□□□ -1.63
TNS1-215	ENST00000480416	PRR7	Q8TB68	274 aa		4.84	□□□□□ -1.63
TNS1-215	ENST00000480416	SYMPK	Q92797	1274 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
TNS1-215	ENST00000480416	TBC1D2	Q9BYX2	928 aa		4.84	□□□□□ -1.63
TNS1-215	ENST00000480416	NLRP2	Q9NX02	1062 aa		4.84	□□□□□ -1.63

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