RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000468310.5

PRKCZ-208, Transcript of protein kinase C zeta, human

TSL 5

Gene PRKCZ, Length 690 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PRKCZ-208	ENST00000468310	ANKRD36C	Q5JPF3	1778 aa		28.08	■■■□□ 2.09
PRKCZ-208	ENST00000468310	DDN	O94850	711 aa	Predicted RBP	28.07	■■■□□ 2.08
PRKCZ-208	ENST00000468310	COPS6	Q7L5N1	327 aa		28.07	■■■□□ 2.08
PRKCZ-208	ENST00000468310	DNAJC5G	Q8N7S2	189 aa		28.07	■■■□□ 2.08
PRKCZ-208	ENST00000468310	XAGE3	Q8WTP9	111 aa		28.06	■■■□□ 2.08
PRKCZ-208	ENST00000468310	RBM17	Q96I25	401 aa	Known RBP	28.05	■■■□□ 2.08
PRKCZ-208	ENST00000468310	UTP14A	Q9BVJ6	771 aa	Known RBP	28.05	■■■□□ 2.08
PRKCZ-208	ENST00000468310	HOXA10	P31260	410 aa	Predicted RBP	28.04	■■■□□ 2.08
PRKCZ-208	ENST00000468310	SYNE4	Q8N205	404 aa		28.04	■■■□□ 2.08
PRKCZ-208	ENST00000468310	DDX21	Q9NR30	783 aa	Known RBP eCLIP	28.04	■■■□□ 2.08
PRKCZ-208	ENST00000468310	HSP90AB3P	Q58FF7	597 aa		28.03	■■■□□ 2.08
PRKCZ-208	ENST00000468310	IARS	P41252	1262 aa	Known RBP	28.02	■■■□□ 2.08
PRKCZ-208	ENST00000468310	HDGFL1	Q5TGJ6	251 aa		28.02	■■■□□ 2.08
PRKCZ-208	ENST00000468310	NLRP3	Q96P20	1036 aa		28.02	■■■□□ 2.08
PRKCZ-208	ENST00000468310	CHPF2	Q9P2E5	772 aa		28.02	■■■□□ 2.08
PRKCZ-208	ENST00000468310	CC2D2B	Q6DHV5	1058 aa		28.01	■■■□□ 2.07
PRKCZ-208	ENST00000468310	CFAP44	Q96MT7	982 aa		28.01	■■■□□ 2.07
PRKCZ-208	ENST00000468310	CRAMP1	Q96RY5	1269 aa		28.01	■■■□□ 2.07
PRKCZ-208	ENST00000468310	C3orf67	Q6ZVT6	689 aa		28	■■■□□ 2.07
PRKCZ-208	ENST00000468310	PSMD1	Q99460	953 aa		28	■■■□□ 2.07
PRKCZ-208	ENST00000468310	ZNF541	Q9H0D2	1346 aa		27.99	■■■□□ 2.07
PRKCZ-208	ENST00000468310	IQCA1L	A6NCM1	817 aa		27.99	■■■□□ 2.07
PRKCZ-208	ENST00000468310	TCERG1	O14776	1098 aa	Known RBP	27.99	■■■□□ 2.07
PRKCZ-208	ENST00000468310	PPEF1	O14829	653 aa	Predicted RBP	27.99	■■■□□ 2.07
PRKCZ-208	ENST00000468310	HOXB7	P09629	217 aa		27.99	■■■□□ 2.07
PRKCZ-208	ENST00000468310	SCN4A	P35499	1836 aa		27.99	■■■□□ 2.07
PRKCZ-208	ENST00000468310	RNF123	Q5XPI4	1314 aa		27.98	■■■□□ 2.07
PRKCZ-208	ENST00000468310	APAF1	O14727	1248 aa		27.98	■■■□□ 2.07
PRKCZ-208	ENST00000468310	NLRP10	Q86W26	655 aa		27.98	■■■□□ 2.07
PRKCZ-208	ENST00000468310	KLRG1	Q96E93	195 aa		27.98	■■■□□ 2.07
PRKCZ-208	ENST00000468310	SNED1	Q8TER0	1413 aa		27.98	■■■□□ 2.07
PRKCZ-208	ENST00000468310	TCIRG1	Q13488	830 aa		27.97	■■■□□ 2.07
PRKCZ-208	ENST00000468310	GRIPAP1	Q4V328	841 aa		27.97	■■■□□ 2.07
PRKCZ-208	ENST00000468310	SLC10A5	Q5PT55	438 aa		27.97	■■■□□ 2.07
PRKCZ-208	ENST00000468310	JDP2	Q8WYK2	163 aa		27.97	■■■□□ 2.07
PRKCZ-208	ENST00000468310	L3MBTL3	Q96JM7	780 aa	Predicted RBP	27.97	■■■□□ 2.07
PRKCZ-208	ENST00000468310	MBIP	Q9NS73	344 aa		27.97	■■■□□ 2.07
PRKCZ-208	ENST00000468310	DBF4	Q9UBU7	674 aa	Predicted RBP	27.97	■■■□□ 2.07
PRKCZ-208	ENST00000468310	LAMB2	P55268	1798 aa		27.96	■■■□□ 2.07
PRKCZ-208	ENST00000468310	DUSP27	Q5VZP5	1158 aa		27.96	■■■□□ 2.07
PRKCZ-208	ENST00000468310	CHADL	Q6NUI6	762 aa		27.96	■■■□□ 2.07
PRKCZ-208	ENST00000468310	TMX4	Q9H1E5	349 aa	Predicted RBP	27.96	■■■□□ 2.07
PRKCZ-208	ENST00000468310	TRMT112	Q9UI30	125 aa	Known RBP	27.96	■■■□□ 2.07
PRKCZ-208	ENST00000468310	CALD1	Q05682	793 aa	Known RBP	27.95	■■■□□ 2.06
PRKCZ-208	ENST00000468310	POTEI	P0CG38	1075 aa		27.94	■■■□□ 2.06
PRKCZ-208	ENST00000468310	POTEJ	P0CG39	1038 aa		27.94	■■■□□ 2.06
PRKCZ-208	ENST00000468310	PLBD2	Q8NHP8	589 aa		27.94	■■■□□ 2.06
PRKCZ-208	ENST00000468310	FZD9	O00144	591 aa		27.93	■■■□□ 2.06
PRKCZ-208	ENST00000468310	HCLS1	P14317	486 aa	Predicted RBP	27.93	■■■□□ 2.06
PRKCZ-208	ENST00000468310	TAF1D	Q9H5J8	278 aa	Predicted RBP	27.93	■■■□□ 2.06
PRKCZ-208	ENST00000468310	IFT57	Q9NWB7	429 aa		27.93	■■■□□ 2.06
PRKCZ-208	ENST00000468310	SH3TC1	Q8TE82	1336 aa		27.92	■■■□□ 2.06
PRKCZ-208	ENST00000468310	ANKRD13D	Q6ZTN6	518 aa		27.92	■■■□□ 2.06
PRKCZ-208	ENST00000468310	SLC51A	Q86UW1	340 aa		27.92	■■■□□ 2.06
PRKCZ-208	ENST00000468310	ZNF428	Q96B54	188 aa		27.92	■■■□□ 2.06
PRKCZ-208	ENST00000468310	HYPK	Q9NX55	129 aa		27.92	■■■□□ 2.06
PRKCZ-208	ENST00000468310	ABCC4	O15439	1325 aa		27.92	■■■□□ 2.06
PRKCZ-208	ENST00000468310	ZNF853	P0CG23	659 aa		27.91	■■■□□ 2.06
PRKCZ-208	ENST00000468310	GNAI1	P63096	354 aa		27.91	■■■□□ 2.06
PRKCZ-208	ENST00000468310	LARGE2	Q8N3Y3	721 aa		27.91	■■■□□ 2.06
PRKCZ-208	ENST00000468310	HACL1	Q9UJ83	578 aa		27.91	■■■□□ 2.06
PRKCZ-208	ENST00000468310	EIF6	P56537	245 aa	Known RBP	27.9	■■■□□ 2.06
PRKCZ-208	ENST00000468310	EAPP	Q56P03	285 aa	Predicted RBP	27.9	■■■□□ 2.06
PRKCZ-208	ENST00000468310	GPC2	Q8N158	579 aa		27.9	■■■□□ 2.06
PRKCZ-208	ENST00000468310	ATP6V0A2	Q9Y487	856 aa		27.9	■■■□□ 2.06
PRKCZ-208	ENST00000468310	COL4A5	P29400	1685 aa		27.89	■■■□□ 2.06
PRKCZ-208	ENST00000468310	LDHD	Q86WU2	507 aa		27.89	■■■□□ 2.06
PRKCZ-208	ENST00000468310	ELL2	O00472	640 aa	Predicted RBP	27.88	■■■□□ 2.05
PRKCZ-208	ENST00000468310	ZEB1	P37275	1124 aa	Predicted RBP	27.88	■■■□□ 2.05
PRKCZ-208	ENST00000468310	DDX46	Q7L014	1031 aa	Known RBP	27.88	■■■□□ 2.05
PRKCZ-208	ENST00000468310	JMY	Q8N9B5	988 aa		27.88	■■■□□ 2.05
PRKCZ-208	ENST00000468310	GJA3	Q9Y6H8	435 aa		27.88	■■■□□ 2.05
PRKCZ-208	ENST00000468310	ATP5J2-PTCD1	G3V325	749 aa		27.87	■■■□□ 2.05
PRKCZ-208	ENST00000468310	EPHX2	P34913	555 aa		27.87	■■■□□ 2.05
PRKCZ-208	ENST00000468310	DDX60	Q8IY21	1712 aa	Known RBP	27.87	■■■□□ 2.05
PRKCZ-208	ENST00000468310	BBOX1	O75936	387 aa		27.86	■■■□□ 2.05
PRKCZ-208	ENST00000468310	NIM1K	Q8IY84	436 aa		27.86	■■■□□ 2.05
PRKCZ-208	ENST00000468310	CLEC11A	Q9Y240	323 aa		27.86	■■■□□ 2.05
PRKCZ-208	ENST00000468310	PPIP5K2	O43314	1243 aa		27.85	■■■□□ 2.05
PRKCZ-208	ENST00000468310	ISCA1	Q9BUE6	129 aa		27.85	■■■□□ 2.05
PRKCZ-208	ENST00000468310	TAF1	P21675	1872 aa		27.85	■■■□□ 2.05
PRKCZ-208	ENST00000468310	GOLGA2	Q08379	1002 aa		27.84	■■■□□ 2.05
PRKCZ-208	ENST00000468310	CCDC184	Q52MB2	194 aa		27.84	■■■□□ 2.05
PRKCZ-208	ENST00000468310	SUPT20H	Q8NEM7	779 aa		27.84	■■■□□ 2.05
PRKCZ-208	ENST00000468310	FAM89A	Q96GI7	184 aa		27.84	■■■□□ 2.05
PRKCZ-208	ENST00000468310	GRAP	Q13588	217 aa		27.83	■■■□□ 2.05
PRKCZ-208	ENST00000468310	AOC3	Q16853	763 aa		27.83	■■■□□ 2.05
PRKCZ-208	ENST00000468310	IFFO2	Q5TF58	517 aa		27.83	■■■□□ 2.05
PRKCZ-208	ENST00000468310	DPP8	Q6V1X1	898 aa	Predicted RBP	27.83	■■■□□ 2.05
PRKCZ-208	ENST00000468310	RIC3	Q7Z5B4	369 aa		27.83	■■■□□ 2.05
PRKCZ-208	ENST00000468310	PNMA8A	Q86V59	439 aa	Predicted RBP	27.83	■■■□□ 2.05
PRKCZ-208	ENST00000468310	SP8	Q8IXZ3	490 aa		27.83	■■■□□ 2.05
PRKCZ-208	ENST00000468310	GRAPL	Q8TC17	118 aa	Predicted RBP	27.83	■■■□□ 2.05
PRKCZ-208	ENST00000468310	LMOD1	P29536	600 aa	Predicted RBP	27.82	■■■□□ 2.04
PRKCZ-208	ENST00000468310	MPND	Q8N594	471 aa		27.82	■■■□□ 2.04
PRKCZ-208	ENST00000468310	CREBZF	Q9NS37	354 aa		27.82	■■■□□ 2.04
PRKCZ-208	ENST00000468310	ADAMTSL1	Q8N6G6	1762 aa		27.81	■■■□□ 2.04
PRKCZ-208	ENST00000468310	RTL5	Q5HYW3	569 aa	Predicted RBP	27.81	■■■□□ 2.04
PRKCZ-208	ENST00000468310	C8orf58	Q8NAV2	365 aa		27.81	■■■□□ 2.04
PRKCZ-208	ENST00000468310	VPS33B	Q9H267	617 aa		27.81	■■■□□ 2.04

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 12 ms