RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000460558.5

ECHDC1-211, Transcript of ethylmalonyl-CoA decarboxylase 1, humanhuman

TSL 5

Gene ECHDC1, Length 301 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECHDC1-211ENST00000460558 C9orf131Q5VYM1 1079 aa6□□□□□ -1.45
ECHDC1-211ENST00000460558 SLF2Q8IX21 1173 aa6□□□□□ -1.45
ECHDC1-211ENST00000460558 FLAD1Q8NFF5 587 aa6□□□□□ -1.45
ECHDC1-211ENST00000460558 HLA-CQ95604 372 aa6□□□□□ -1.45
ECHDC1-211ENST00000460558 TRIM34Q9BYJ4 488 aa6□□□□□ -1.45
ECHDC1-211ENST00000460558 PRM3Q9NNZ6 103 aa6□□□□□ -1.45
ECHDC1-211ENST00000460558 SEPT9Q9UHD8 586 aaPredicted RBP6□□□□□ -1.45
ECHDC1-211ENST00000460558 BCS1LQ9Y276 419 aa6□□□□□ -1.45
ECHDC1-211ENST00000460558 POLR3AO14802 1390 aaPredicted RBP6□□□□□ -1.45
ECHDC1-211ENST00000460558 SLIT3O75094 1523 aa5.99□□□□□ -1.45
ECHDC1-211ENST00000460558 HMGB2P26583 209 aaKnown RBP5.99□□□□□ -1.45
ECHDC1-211ENST00000460558 GUCA2AQ02747 115 aa5.99□□□□□ -1.45
ECHDC1-211ENST00000460558 MTMR2Q13614 643 aa5.99□□□□□ -1.45
ECHDC1-211ENST00000460558 RGL3Q3MIN7 710 aa5.99□□□□□ -1.45
ECHDC1-211ENST00000460558 VARS2Q5ST30 1063 aaKnown RBP5.99□□□□□ -1.45
ECHDC1-211ENST00000460558 WWC1Q8IX03 1113 aa5.99□□□□□ -1.45
ECHDC1-211ENST00000460558 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP5.99□□□□□ -1.45
ECHDC1-211ENST00000460558 HMX1Q9NP08 348 aaPredicted RBP5.99□□□□□ -1.45
ECHDC1-211ENST00000460558 PODXL2Q9NZ53 605 aa5.99□□□□□ -1.45
ECHDC1-211ENST00000460558 CCNL1Q9UK58 526 aaPredicted RBP5.99□□□□□ -1.45
ECHDC1-211ENST00000460558 NDUFB9Q9Y6M9 179 aa5.99□□□□□ -1.45
ECHDC1-211ENST00000460558 ACEP12821 1306 aa5.99□□□□□ -1.45
ECHDC1-211ENST00000460558 CNTNAP1P78357 1384 aa5.98□□□□□ -1.45
ECHDC1-211ENST00000460558 CFAP99D6REC4 459 aa5.98□□□□□ -1.45
ECHDC1-211ENST00000460558 VEGFAP15692 232 aaPredicted RBP5.98□□□□□ -1.45
ECHDC1-211ENST00000460558 CTDSPL2Q05D32 466 aa5.98□□□□□ -1.45
ECHDC1-211ENST00000460558 FUT2Q10981 343 aa5.98□□□□□ -1.45
ECHDC1-211ENST00000460558 ZNF687Q8N1G0 1237 aa5.98□□□□□ -1.45
ECHDC1-211ENST00000460558 NUDT16Q96DE0 195 aaKnown RBP5.98□□□□□ -1.45
ECHDC1-211ENST00000460558 TRAIPQ9BWF2 469 aa5.98□□□□□ -1.45
ECHDC1-211ENST00000460558 WBP1LQ9NX94 342 aa5.98□□□□□ -1.45
ECHDC1-211ENST00000460558 TIAM2Q8IVF5 1701 aa5.98□□□□□ -1.45
ECHDC1-211ENST00000460558 CPSF1Q10570 1443 aaKnown RBP5.98□□□□□ -1.45
ECHDC1-211ENST00000460558 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa5.98□□□□□ -1.45
ECHDC1-211ENST00000460558 ERBB3P21860 1342 aa5.98□□□□□ -1.45
ECHDC1-211ENST00000460558 TOGARAM1Q9Y4F4 1720 aa5.97□□□□□ -1.45
ECHDC1-211ENST00000460558 POM121CA8CG34 1229 aa5.97□□□□□ -1.45
ECHDC1-211ENST00000460558 TK2O00142 265 aa5.97□□□□□ -1.45
ECHDC1-211ENST00000460558 HSPA8P11142 646 aaKnown RBP5.97□□□□□ -1.45
ECHDC1-211ENST00000460558 PDIA4P13667 645 aaKnown RBP5.97□□□□□ -1.45
ECHDC1-211ENST00000460558 ABL2P42684 1182 aa5.97□□□□□ -1.45
ECHDC1-211ENST00000460558 GRIPAP1Q4V328 841 aa5.97□□□□□ -1.45
ECHDC1-211ENST00000460558 CFAP70Q5T0N1 1121 aa5.97□□□□□ -1.45
ECHDC1-211ENST00000460558 SAMD7Q7Z3H4 446 aa5.97□□□□□ -1.45
ECHDC1-211ENST00000460558 HELBQ8NG08 1087 aaPredicted RBP5.97□□□□□ -1.45
ECHDC1-211ENST00000460558 GLMNQ92990 594 aa5.97□□□□□ -1.45
ECHDC1-211ENST00000460558 RNF181Q9P0P0 153 aa5.97□□□□□ -1.45
ECHDC1-211ENST00000460558 AXIN2Q9Y2T1 843 aa5.97□□□□□ -1.45
ECHDC1-211ENST00000460558 ZC3H4Q9UPT8 1303 aaKnown RBP5.97□□□□□ -1.45
ECHDC1-211ENST00000460558 C4BP0C0L5 1744 aa5.96□□□□□ -1.45
ECHDC1-211ENST00000460558 DICER1Q9UPY3 1922 aaKnown RBP5.96□□□□□ -1.46
ECHDC1-211ENST00000460558 ST18O60284 1047 aa5.96□□□□□ -1.46
ECHDC1-211ENST00000460558 CFHP08603 1231 aa5.96□□□□□ -1.46
ECHDC1-211ENST00000460558 IL2RBP14784 551 aa5.96□□□□□ -1.46
ECHDC1-211ENST00000460558 ATP6V1AP38606 617 aa5.96□□□□□ -1.46
ECHDC1-211ENST00000460558 SLC4A3P48751 1232 aa5.96□□□□□ -1.46
ECHDC1-211ENST00000460558 TGFB2P61812 414 aa5.96□□□□□ -1.46
ECHDC1-211ENST00000460558 WASHC4Q2M389 1173 aa5.96□□□□□ -1.46
ECHDC1-211ENST00000460558 ADAMTS19Q8TE59 1207 aa5.96□□□□□ -1.46
ECHDC1-211ENST00000460558 SYTL4Q96C24 671 aaPredicted RBP5.96□□□□□ -1.46
ECHDC1-211ENST00000460558 NBPF3Q9H094 633 aa5.96□□□□□ -1.46
ECHDC1-211ENST00000460558 NSD3Q9BZ95 1437 aa5.96□□□□□ -1.46
ECHDC1-211ENST00000460558 LTN1O94822 1766 aa5.95□□□□□ -1.46
ECHDC1-211ENST00000460558 ADGRB1O14514 1584 aa5.95□□□□□ -1.46
ECHDC1-211ENST00000460558 DESI1Q6ICB0 168 aa5.95□□□□□ -1.46
ECHDC1-211ENST00000460558 NECTIN2Q92692 538 aa5.95□□□□□ -1.46
ECHDC1-211ENST00000460558 ZFRQ96KR1 1074 aaKnown RBP5.95□□□□□ -1.46
ECHDC1-211ENST00000460558 TRAK1Q9UPV9 953 aa5.95□□□□□ -1.46
ECHDC1-211ENST00000460558 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa5.94□□□□□ -1.46
ECHDC1-211ENST00000460558 USP47Q96K76 1375 aa5.94□□□□□ -1.46
ECHDC1-211ENST00000460558 A0A0G2JLW4 131 aa5.94□□□□□ -1.46
ECHDC1-211ENST00000460558 ACTN4O43707 911 aaKnown RBP5.94□□□□□ -1.46
ECHDC1-211ENST00000460558 ITGAEP38570 1179 aa5.94□□□□□ -1.46
ECHDC1-211ENST00000460558 VEGFBP49765 207 aa5.94□□□□□ -1.46
ECHDC1-211ENST00000460558 MAP2K1Q02750 393 aaPredicted RBP5.94□□□□□ -1.46
ECHDC1-211ENST00000460558 MORN1Q5T089 497 aa5.94□□□□□ -1.46
ECHDC1-211ENST00000460558 LRRN4Q8WUT4 740 aa5.94□□□□□ -1.46
ECHDC1-211ENST00000460558 GCC1Q96CN9 775 aa5.94□□□□□ -1.46
ECHDC1-211ENST00000460558 CALR3Q96L12 384 aaKnown RBP5.94□□□□□ -1.46
ECHDC1-211ENST00000460558 FAM208AQ9UK61 1670 aaKnown RBP5.94□□□□□ -1.46
ECHDC1-211ENST00000460558 GLTPD2A6NH11 291 aa5.93□□□□□ -1.46
ECHDC1-211ENST00000460558 HRO43593 1189 aa5.93□□□□□ -1.46
ECHDC1-211ENST00000460558 EMP3P54852 163 aa5.93□□□□□ -1.46
ECHDC1-211ENST00000460558 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP5.93□□□□□ -1.46
ECHDC1-211ENST00000460558 RETREG3Q86VR2 466 aa5.93□□□□□ -1.46
ECHDC1-211ENST00000460558 ARHGEF25Q86VW2 580 aa5.93□□□□□ -1.46
ECHDC1-211ENST00000460558 ALG2Q9H553 416 aa5.93□□□□□ -1.46
ECHDC1-211ENST00000460558 NLRP2Q9NX02 1062 aa5.93□□□□□ -1.46
ECHDC1-211ENST00000460558 NSD2O96028 1365 aa5.93□□□□□ -1.46
ECHDC1-211ENST00000460558 ITGB4P16144 1822 aa5.92□□□□□ -1.46
ECHDC1-211ENST00000460558 C4AP0C0L4 1744 aa5.92□□□□□ -1.46
ECHDC1-211ENST00000460558 C6orf229H3BNL8 230 aa5.92□□□□□ -1.46
ECHDC1-211ENST00000460558 KMT5BQ4FZB7 885 aa5.92□□□□□ -1.46
ECHDC1-211ENST00000460558 RETREG2Q8NC44 543 aa5.92□□□□□ -1.46
ECHDC1-211ENST00000460558 KCNH5Q8NCM2 988 aa5.92□□□□□ -1.46
ECHDC1-211ENST00000460558 PRR7Q8TB68 274 aa5.92□□□□□ -1.46
ECHDC1-211ENST00000460558 DDX54Q8TDD1 881 aaKnown RBP5.92□□□□□ -1.46
ECHDC1-211ENST00000460558 EPS8L1Q8TE68 723 aa5.92□□□□□ -1.46
ECHDC1-211ENST00000460558 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP5.92□□□□□ -1.46
ECHDC1-211ENST00000460558 SCN4AP35499 1836 aa5.92□□□□□ -1.46
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.2 ms