RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000445427.1

PRKCQ-AS1-202, PRKCQ antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PRKCQ-AS1, Length 1,133 nt, Biotype lincRNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 MYH16Q9H6N6 1097 aa27.84■■■□□ 2.05
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PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 RIC3Q7Z5B4 369 aa27.83■■■□□ 2.05
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 SBF1O95248 1867 aa27.83■■■□□ 2.04
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 C21orf2O43822 256 aa27.82■■■□□ 2.04
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 ZNF219Q9P2Y4 722 aaPredicted RBP27.82■■■□□ 2.04
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 DDX58O95786 925 aaKnown RBP27.81■■■□□ 2.04
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 CRY2Q49AN0 593 aa27.81■■■□□ 2.04
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 SOGA3Q5TF21 947 aa27.81■■■□□ 2.04
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 C9orf131Q5VYM1 1079 aa27.81■■■□□ 2.04
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PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 TRMT112Q9UI30 125 aaKnown RBP27.8■■■□□ 2.04
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PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 ISCA1Q9BUE6 129 aa27.79■■■□□ 2.04
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP27.79■■■□□ 2.04
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 RNF181Q9P0P0 153 aa27.79■■■□□ 2.04
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 FER1L6Q2WGJ9 1857 aa27.78■■■□□ 2.04
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 SH3TC1Q8TE82 1336 aa27.78■■■□□ 2.04
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PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 SLC10A5Q5PT55 438 aa27.78■■■□□ 2.04
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 NLRP3Q96P20 1036 aa27.78■■■□□ 2.04
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 CACNA1FO60840 1977 aa27.78■■■□□ 2.04
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 ZNF521Q96K83 1311 aa27.77■■■□□ 2.04
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 ATP5J2-PTCD1G3V325 749 aa27.77■■■□□ 2.04
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 NFKBIEO00221 500 aa27.76■■■□□ 2.03
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PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 LMNB1P20700 586 aa27.76■■■□□ 2.03
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PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 CCDC88AQ3V6T2 1871 aa27.76■■■□□ 2.03
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PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 ZNF526Q8TF50 670 aaPredicted RBP27.75■■■□□ 2.03
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 RBM17Q96I25 401 aaKnown RBP27.75■■■□□ 2.03
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PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 SLC4A2P04920 1241 aa27.74■■■□□ 2.03
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 LAMB2P55268 1798 aa27.73■■■□□ 2.03
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 CCDC93Q567U6 631 aa27.73■■■□□ 2.03
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 C7orf43Q8WVR3 580 aa27.73■■■□□ 2.03
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 MYD88Q99836 296 aa27.73■■■□□ 2.03
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 LTBP3Q9NS15 1303 aa27.72■■■□□ 2.03
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PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 KSR2Q6VAB6 950 aa27.72■■■□□ 2.03
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 C3orf67Q6ZVT6 689 aa27.72■■■□□ 2.03
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 METTL22Q9BUU2 404 aaPredicted RBP27.72■■■□□ 2.03
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 TAOK3Q9H2K8 898 aa27.72■■■□□ 2.03
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 SYNE4Q8N205 404 aa27.71■■■□□ 2.03
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 ZNF428Q96B54 188 aa27.71■■■□□ 2.03
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 CRAMP1Q96RY5 1269 aa27.71■■■□□ 2.03
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 MAP3K2Q9Y2U5 619 aa27.71■■■□□ 2.03
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PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 PI4KAP1Q8N8J0 262 aa27.69■■■□□ 2.02
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PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 TIAM2Q8IVF5 1701 aa27.69■■■□□ 2.02
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 DICER1Q9UPY3 1922 aaKnown RBP27.69■■■□□ 2.02
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PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 NEXNQ0ZGT2 675 aa27.68■■■□□ 2.02
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PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 G2E3Q7L622 706 aa27.68■■■□□ 2.02
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 RTKN2Q8IZC4 609 aa27.68■■■□□ 2.02
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PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 MIER1Q8N108 512 aa27.67■■■□□ 2.02
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PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 PPEF1O14829 653 aaPredicted RBP27.66■■■□□ 2.02
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PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 DDX46Q7L014 1031 aaKnown RBP27.65■■■□□ 2.02
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 ABCC4O15439 1325 aa27.65■■■□□ 2.02
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 IRS4O14654 1257 aaPredicted RBP27.64■■■□□ 2.02
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 FKBP4Q02790 459 aaKnown RBP eCLIP27.64■■■□□ 2.02
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 TMX4Q9H1E5 349 aaPredicted RBP27.64■■■□□ 2.02
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PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 GRIPAP1Q4V328 841 aa27.63■■■□□ 2.01
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 PCCAP05165 728 aaPredicted RBP27.62■■■□□ 2.01
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 SLFN5Q08AF3 891 aa27.62■■■□□ 2.01
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 BBOX1O75936 387 aa27.6■■■□□ 2.01
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 IGKV5-2P06315 115 aa27.6■■■□□ 2.01
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 SF3B3Q15393 1217 aaKnown RBP27.6■■■□□ 2.01
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 DNAAF4Q8WXU2 420 aa27.6■■■□□ 2.01
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 GRAPQ13588 217 aa27.59■■■□□ 2.01
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 GRAPLQ8TC17 118 aaPredicted RBP27.59■■■□□ 2.01
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 PSMD1Q99460 953 aa27.59■■■□□ 2.01
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 ATP6V0A2Q9Y487 856 aa27.59■■■□□ 2.01
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 SNED1Q8TER0 1413 aa27.58■■■□□ 2.01
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 ZNF277Q9NRM2 450 aaPredicted RBP27.58■■■□□ 2.01
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 TAF1P21675 1872 aa27.57■■■□□ 2
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 NEURL1BA8MQ27 555 aa27.57■■■□□ 2
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 C1QTNF8P60827 252 aa27.57■■■□□ 2
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 CWF19L2Q2TBE0 894 aaKnown RBP27.57■■■□□ 2
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 NMRK2Q9NPI5 230 aa27.57■■■□□ 2
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 GLTPD2A6NH11 291 aa27.56■■■□□ 2
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 DPY19L2Q6NUT2 758 aa27.56■■■□□ 2
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