RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000443528.5

ACTB-206, Transcript of actin beta, humanhuman

TSL 4

Gene ACTB, Length 569 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-206ENST00000443528 ZNF622Q969S3 477 aaKnown RBP eCLIP20.19■□□□□ 0.82
ACTB-206ENST00000443528 ARFGEF2Q9Y6D5 1785 aa20.18■□□□□ 0.82
ACTB-206ENST00000443528 YY1P25490 414 aa20.18■□□□□ 0.82
ACTB-206ENST00000443528 ZNF428Q96B54 188 aa20.18■□□□□ 0.82
ACTB-206ENST00000443528 RIC1Q4ADV7 1423 aa20.18■□□□□ 0.82
ACTB-206ENST00000443528 TNRC6CQ9HCJ0 1690 aaKnown RBP20.17■□□□□ 0.82
ACTB-206ENST00000443528 DDX58O95786 925 aaKnown RBP20.17■□□□□ 0.82
ACTB-206ENST00000443528 TRIM28Q13263 835 aaKnown RBP20.17■□□□□ 0.82
ACTB-206ENST00000443528 STYK1Q6J9G0 422 aa20.17■□□□□ 0.82
ACTB-206ENST00000443528 SYNE4Q8N205 404 aa20.17■□□□□ 0.82
ACTB-206ENST00000443528 MASTLQ96GX5 879 aa20.17■□□□□ 0.82
ACTB-206ENST00000443528 ADCY9O60503 1353 aa20.17■□□□□ 0.82
ACTB-206ENST00000443528 PI4KAP2A4QPH2 592 aa20.16■□□□□ 0.82
ACTB-206ENST00000443528 FLIIQ13045 1269 aa20.16■□□□□ 0.82
ACTB-206ENST00000443528 CRY2Q49AN0 593 aa20.16■□□□□ 0.82
ACTB-206ENST00000443528 SLC10A5Q5PT55 438 aa20.16■□□□□ 0.82
ACTB-206ENST00000443528 KSR2Q6VAB6 950 aa20.16■□□□□ 0.82
ACTB-206ENST00000443528 PI4KAP1Q8N8J0 262 aa20.16■□□□□ 0.82
ACTB-206ENST00000443528 MYD88Q99836 296 aa20.16■□□□□ 0.82
ACTB-206ENST00000443528 METTL22Q9BUU2 404 aaPredicted RBP20.16■□□□□ 0.82
ACTB-206ENST00000443528 TRMT112Q9UI30 125 aaKnown RBP20.16■□□□□ 0.82
ACTB-206ENST00000443528 MAP3K2Q9Y2U5 619 aa20.16■□□□□ 0.82
ACTB-206ENST00000443528 RNF123Q5XPI4 1314 aa20.16■□□□□ 0.82
ACTB-206ENST00000443528 ARFGEF1Q9Y6D6 1849 aa20.16■□□□□ 0.82
ACTB-206ENST00000443528 NPR1P16066 1061 aa20.15■□□□□ 0.82
ACTB-206ENST00000443528 ARHGAP27Q6ZUM4 889 aa20.15■□□□□ 0.82
ACTB-206ENST00000443528 C3orf67Q6ZVT6 689 aa20.15■□□□□ 0.82
ACTB-206ENST00000443528 CNKSR1Q969H4 720 aa20.14■□□□□ 0.81
ACTB-206ENST00000443528 CHD4Q14839 1912 aa20.14■□□□□ 0.81
ACTB-206ENST00000443528 SH3TC1Q8TE82 1336 aa20.13■□□□□ 0.81
ACTB-206ENST00000443528 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP20.13■□□□□ 0.81
ACTB-206ENST00000443528 HCLS1P14317 486 aaPredicted RBP20.12■□□□□ 0.81
ACTB-206ENST00000443528 PRPF40BQ6NWY9 871 aaKnown RBP20.12■□□□□ 0.81
ACTB-206ENST00000443528 FAM89AQ96GI7 184 aa20.12■□□□□ 0.81
ACTB-206ENST00000443528 IGKV5-2P06315 115 aa20.11■□□□□ 0.81
ACTB-206ENST00000443528 FKBP5Q13451 457 aaPredicted RBP20.11■□□□□ 0.81
ACTB-206ENST00000443528 CCDC191Q8NCU4 936 aa20.11■□□□□ 0.81
ACTB-206ENST00000443528 NLRP3Q96P20 1036 aa20.11■□□□□ 0.81
ACTB-206ENST00000443528 C21orf2O43822 256 aa20.1■□□□□ 0.81
ACTB-206ENST00000443528 HOXA10P31260 410 aaPredicted RBP20.1■□□□□ 0.81
ACTB-206ENST00000443528 C7orf43Q8WVR3 580 aa20.1■□□□□ 0.81
ACTB-206ENST00000443528 ZNF219Q9P2Y4 722 aaPredicted RBP20.1■□□□□ 0.81
ACTB-206ENST00000443528 SLX4Q8IY92 1834 aa20.1■□□□□ 0.81
ACTB-206ENST00000443528 ALDH1B1P30837 517 aa20.09■□□□□ 0.81
ACTB-206ENST00000443528 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP20.09■□□□□ 0.81
ACTB-206ENST00000443528 ZBTB38Q8NAP3 1195 aaPredicted RBP20.09■□□□□ 0.81
ACTB-206ENST00000443528 CWC25Q9NXE8 425 aaPredicted RBP20.09■□□□□ 0.81
ACTB-206ENST00000443528 CACNA1FO60840 1977 aa20.08■□□□□ 0.81
ACTB-206ENST00000443528 CWF19L2Q2TBE0 894 aaKnown RBP20.08■□□□□ 0.81
ACTB-206ENST00000443528 MRPL50Q8N5N7 158 aaKnown RBP20.08■□□□□ 0.81
ACTB-206ENST00000443528 DNAAF4Q8WXU2 420 aa20.08■□□□□ 0.81
ACTB-206ENST00000443528 RPGRQ92834 1020 aaKnown RBP20.08■□□□□ 0.81
ACTB-206ENST00000443528 NEURL1BA8MQ27 555 aa20.07■□□□□ 0.8
ACTB-206ENST00000443528 PCCAP05165 728 aaPredicted RBP20.07■□□□□ 0.8
ACTB-206ENST00000443528 RASSF7Q02833 373 aa20.07■□□□□ 0.8
ACTB-206ENST00000443528 NEXNQ0ZGT2 675 aa20.07■□□□□ 0.8
ACTB-206ENST00000443528 SSH1Q8WYL5 1049 aa20.07■□□□□ 0.8
ACTB-206ENST00000443528 CRAMP1Q96RY5 1269 aa20.07■□□□□ 0.8
ACTB-206ENST00000443528 F6X3S4 739 aa20.06■□□□□ 0.8
ACTB-206ENST00000443528 NFKBIEO00221 500 aa20.06■□□□□ 0.8
ACTB-206ENST00000443528 IRS4O14654 1257 aaPredicted RBP20.06■□□□□ 0.8
ACTB-206ENST00000443528 PRELPP51888 382 aa20.06■□□□□ 0.8
ACTB-206ENST00000443528 DDX60Q8IY21 1712 aaKnown RBP20.06■□□□□ 0.8
ACTB-206ENST00000443528 JARID2Q92833 1246 aaPredicted RBP20.06■□□□□ 0.8
ACTB-206ENST00000443528 RBM17Q96I25 401 aaKnown RBP20.06■□□□□ 0.8
ACTB-206ENST00000443528 CACNA1SQ13698 1873 aa20.05■□□□□ 0.8
ACTB-206ENST00000443528 CT47B1P0C2W7 299 aaPredicted RBP20.05■□□□□ 0.8
ACTB-206ENST00000443528 OLFM4Q6UX06 510 aa20.05■□□□□ 0.8
ACTB-206ENST00000443528 LAMB2P55268 1798 aa20.05■□□□□ 0.8
ACTB-206ENST00000443528 SF3B3Q15393 1217 aaKnown RBP20.04■□□□□ 0.8
ACTB-206ENST00000443528 ALDH1L2Q3SY69 923 aa20.04■□□□□ 0.8
ACTB-206ENST00000443528 C9orf131Q5VYM1 1079 aa20.04■□□□□ 0.8
ACTB-206ENST00000443528 ZNF784Q8NCA9 323 aaPredicted RBP20.04■□□□□ 0.8
ACTB-206ENST00000443528 LINS1Q8NG48 757 aa20.04■□□□□ 0.8
ACTB-206ENST00000443528 BCL2L13Q9BXK5 485 aa20.04■□□□□ 0.8
ACTB-206ENST00000443528 ABCC4O15439 1325 aa20.03■□□□□ 0.8
ACTB-206ENST00000443528 GCKRQ14397 625 aa20.03■□□□□ 0.8
ACTB-206ENST00000443528 BEND3Q5T5X7 828 aa20.03■□□□□ 0.8
ACTB-206ENST00000443528 SOGA3Q5TF21 947 aa20.03■□□□□ 0.8
ACTB-206ENST00000443528 SLC51AQ86UW1 340 aa20.03■□□□□ 0.8
ACTB-206ENST00000443528 H7C1W4 665 aa20.02■□□□□ 0.8
ACTB-206ENST00000443528 CCDC93Q567U6 631 aa20.02■□□□□ 0.8
ACTB-206ENST00000443528 ZBED9Q6R2W3 1325 aa20.02■□□□□ 0.79
ACTB-206ENST00000443528 CDHR2Q9BYE9 1310 aa20.02■□□□□ 0.79
ACTB-206ENST00000443528 RNF181Q9P0P0 153 aa20.01■□□□□ 0.79
ACTB-206ENST00000443528 SNED1Q8TER0 1413 aa20.01■□□□□ 0.79
ACTB-206ENST00000443528 FER1L6Q2WGJ9 1857 aa20.01■□□□□ 0.79
ACTB-206ENST00000443528 LTBP3Q9NS15 1303 aa20.01■□□□□ 0.79
ACTB-206ENST00000443528 PPEF1O14829 653 aaPredicted RBP20■□□□□ 0.79
ACTB-206ENST00000443528 PDE8AO60658 829 aa20■□□□□ 0.79
ACTB-206ENST00000443528 LMNB1P20700 586 aa20■□□□□ 0.79
ACTB-206ENST00000443528 DDX46Q7L014 1031 aaKnown RBP20■□□□□ 0.79
ACTB-206ENST00000443528 SMC4Q9NTJ3 1288 aa20■□□□□ 0.79
ACTB-206ENST00000443528 SBF1O95248 1867 aa19.99■□□□□ 0.79
ACTB-206ENST00000443528 HSP90B1P14625 803 aaKnown RBP19.99■□□□□ 0.79
ACTB-206ENST00000443528 RARSP54136 660 aaKnown RBP19.99■□□□□ 0.79
ACTB-206ENST00000443528 CASP7P55210 303 aa19.99■□□□□ 0.79
ACTB-206ENST00000443528 GRAPQ13588 217 aa19.99■□□□□ 0.79
ACTB-206ENST00000443528 UBE3BQ7Z3V4 1068 aa19.99■□□□□ 0.79
ACTB-206ENST00000443528 GRAPLQ8TC17 118 aaPredicted RBP19.99■□□□□ 0.79
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