RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000441692.5

THOC2-208, Transcript of THO complex 2, human

TSL 5

Gene THOC2, Length 4,364 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
THOC2-208	ENST00000441692	IL17RE	Q8NFR9	667 aa		4.9	□□□□□ -1.62
THOC2-208	ENST00000441692	ARHGAP45	Q92619	1136 aa		4.9	□□□□□ -1.62
THOC2-208	ENST00000441692	ZNF428	Q96B54	188 aa		4.9	□□□□□ -1.62
THOC2-208	ENST00000441692	C22orf23	Q9BZE7	217 aa		4.9	□□□□□ -1.62
THOC2-208	ENST00000441692	KIF3C	O14782	793 aa		4.9	□□□□□ -1.63
THOC2-208	ENST00000441692	EIF2S2	P20042	333 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
THOC2-208	ENST00000441692	NIM1K	Q8IY84	436 aa		4.9	□□□□□ -1.63
THOC2-208	ENST00000441692	TEX13A	Q9BXU3	409 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
THOC2-208	ENST00000441692	NIP7	Q9Y221	180 aa	Known RBP eCLIP	4.9	□□□□□ -1.63
THOC2-208	ENST00000441692	ERVV-2	B6SEH9	535 aa		4.9	□□□□□ -1.63
THOC2-208	ENST00000441692	DDN	O94850	711 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
THOC2-208	ENST00000441692	MAP1S	Q66K74	1059 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
THOC2-208	ENST00000441692	HACL1	Q9UJ83	578 aa		4.9	□□□□□ -1.63
THOC2-208	ENST00000441692	LBX1	P52954	281 aa		4.89	□□□□□ -1.63
THOC2-208	ENST00000441692	MLLT1	Q03111	559 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
THOC2-208	ENST00000441692	ITPK1	Q13572	414 aa		4.89	□□□□□ -1.63
THOC2-208	ENST00000441692	CCDC93	Q567U6	631 aa		4.89	□□□□□ -1.63
THOC2-208	ENST00000441692	API5	Q9BZZ5	524 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
THOC2-208	ENST00000441692	PDCL3	Q9H2J4	239 aa		4.89	□□□□□ -1.63
THOC2-208	ENST00000441692	UPF2	Q9HAU5	1272 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
THOC2-208	ENST00000441692	GLTPD2	A6NH11	291 aa		4.89	□□□□□ -1.63
THOC2-208	ENST00000441692	KCNQ3	O43525	872 aa		4.89	□□□□□ -1.63
THOC2-208	ENST00000441692	GSPT1	P15170	499 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
THOC2-208	ENST00000441692	GPT	P24298	496 aa		4.89	□□□□□ -1.63
THOC2-208	ENST00000441692	MAP2K1	Q02750	393 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
THOC2-208	ENST00000441692	TSHZ3	Q63HK5	1081 aa		4.89	□□□□□ -1.63
THOC2-208	ENST00000441692	DZIP3	Q86Y13	1208 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
THOC2-208	ENST00000441692	LGR6	Q9HBX8	967 aa		4.89	□□□□□ -1.63
THOC2-208	ENST00000441692	ATG3	Q9NT62	314 aa		4.89	□□□□□ -1.63
THOC2-208	ENST00000441692	TSKS	Q9UJT2	592 aa		4.89	□□□□□ -1.63
THOC2-208	ENST00000441692	RGPD1	P0DJD0	1748 aa		4.89	□□□□□ -1.63
THOC2-208	ENST00000441692	PLEKHG2	Q9H7P9	1386 aa		4.89	□□□□□ -1.63
THOC2-208	ENST00000441692	C6orf229	H3BNL8	230 aa		4.89	□□□□□ -1.63
THOC2-208	ENST00000441692	ANXA1	P04083	346 aa		4.89	□□□□□ -1.63
THOC2-208	ENST00000441692	GAS2L2	Q8NHY3	880 aa		4.89	□□□□□ -1.63
THOC2-208	ENST00000441692	PPIP5K2	O43314	1243 aa		4.88	□□□□□ -1.63
THOC2-208	ENST00000441692	WDHD1	O75717	1129 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
THOC2-208	ENST00000441692	CD2BP2	O95400	341 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
THOC2-208	ENST00000441692	GYS1	P13807	737 aa		4.88	□□□□□ -1.63
THOC2-208	ENST00000441692	INTS3	Q68E01	1043 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
THOC2-208	ENST00000441692	CEP85	Q6P2H3	762 aa		4.88	□□□□□ -1.63
THOC2-208	ENST00000441692	ZNF710	Q8N1W2	664 aa		4.88	□□□□□ -1.63
THOC2-208	ENST00000441692	ZNF830	Q96NB3	372 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
THOC2-208	ENST00000441692	FMNL2	Q96PY5	1086 aa		4.88	□□□□□ -1.63
THOC2-208	ENST00000441692	FOXD4L1	Q9NU39	408 aa		4.88	□□□□□ -1.63
THOC2-208	ENST00000441692	KDR	P35968	1356 aa		4.88	□□□□□ -1.63
THOC2-208	ENST00000441692	TUBGCP6	Q96RT7	1819 aa		4.88	□□□□□ -1.63
THOC2-208	ENST00000441692	TMEM88B	A6NKF7	163 aa		4.88	□□□□□ -1.63
THOC2-208	ENST00000441692	BTBD11	A6QL63	1104 aa		4.88	□□□□□ -1.63
THOC2-208	ENST00000441692		H7C1D1	291 aa		4.88	□□□□□ -1.63
THOC2-208	ENST00000441692	PIP4K2A	P48426	406 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
THOC2-208	ENST00000441692	PRELP	P51888	382 aa		4.88	□□□□□ -1.63
THOC2-208	ENST00000441692	AIMP1	Q12904	312 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
THOC2-208	ENST00000441692	TBC1D9	Q6ZT07	1266 aa		4.88	□□□□□ -1.63
THOC2-208	ENST00000441692	PNMA8A	Q86V59	439 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
THOC2-208	ENST00000441692	ZBTB1	Q9Y2K1	713 aa		4.88	□□□□□ -1.63
THOC2-208	ENST00000441692	GNAT3	A8MTJ3	354 aa		4.88	□□□□□ -1.63
THOC2-208	ENST00000441692	MYL6B	P14649	208 aa		4.88	□□□□□ -1.63
THOC2-208	ENST00000441692	NFIX	Q14938	502 aa		4.88	□□□□□ -1.63
THOC2-208	ENST00000441692	PLEKHM2	Q8IWE5	1019 aa		4.88	□□□□□ -1.63
THOC2-208	ENST00000441692	SGIP1	Q9BQI5	828 aa		4.88	□□□□□ -1.63
THOC2-208	ENST00000441692	PHAX	Q9H814	394 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
THOC2-208	ENST00000441692	ZNF277	Q9NRM2	450 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
THOC2-208	ENST00000441692	ALDH1B1	P30837	517 aa		4.88	□□□□□ -1.63
THOC2-208	ENST00000441692	GCC1	Q96CN9	775 aa		4.88	□□□□□ -1.63
THOC2-208	ENST00000441692	RTL1	A6NKG5	1358 aa		4.88	□□□□□ -1.63
THOC2-208	ENST00000441692	PDE4C	Q08493	712 aa		4.87	□□□□□ -1.63
THOC2-208	ENST00000441692	GPR101	Q96P66	508 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
THOC2-208	ENST00000441692	DCTPP1	Q9H773	170 aa		4.87	□□□□□ -1.63
THOC2-208	ENST00000441692	EXOC6B	Q9Y2D4	811 aa		4.87	□□□□□ -1.63
THOC2-208	ENST00000441692	FMN2	Q9NZ56	1722 aa		4.87	□□□□□ -1.63
THOC2-208	ENST00000441692	MARF1	Q9Y4F3	1742 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
THOC2-208	ENST00000441692	NF2	P35240	595 aa		4.87	□□□□□ -1.63
THOC2-208	ENST00000441692	FKBP5	Q13451	457 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
THOC2-208	ENST00000441692	DGKZ	Q13574	1117 aa		4.87	□□□□□ -1.63
THOC2-208	ENST00000441692	BECN1	Q14457	450 aa		4.87	□□□□□ -1.63
THOC2-208	ENST00000441692	ANKRD44	Q8N8A2	993 aa		4.87	□□□□□ -1.63
THOC2-208	ENST00000441692	KIF2C	Q99661	725 aa		4.87	□□□□□ -1.63
THOC2-208	ENST00000441692	BCLAF1	Q9NYF8	920 aa	Known RBP eCLIP	4.87	□□□□□ -1.63	6e-8	■■■□□ 14.6
THOC2-208	ENST00000441692	BRWD3	Q6RI45	1802 aa		4.87	□□□□□ -1.63
THOC2-208	ENST00000441692	PRAMEF22	A3QJZ6	481 aa		4.87	□□□□□ -1.63
THOC2-208	ENST00000441692	ZBTB22	O15209	634 aa		4.87	□□□□□ -1.63
THOC2-208	ENST00000441692	EPHX2	P34913	555 aa		4.87	□□□□□ -1.63
THOC2-208	ENST00000441692	BMP2KL	Q5H9B9	411 aa		4.87	□□□□□ -1.63
THOC2-208	ENST00000441692	CNTROB	Q8N137	903 aa		4.87	□□□□□ -1.63
THOC2-208	ENST00000441692	PNMA6E	A0A0J9YXQ4	647 aa		4.86	□□□□□ -1.63
THOC2-208	ENST00000441692	ECM2	O94769	699 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
THOC2-208	ENST00000441692	FLII	Q13045	1269 aa		4.86	□□□□□ -1.63
THOC2-208	ENST00000441692	RC3H1	Q5TC82	1133 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
THOC2-208	ENST00000441692	NLRP3	Q96P20	1036 aa		4.86	□□□□□ -1.63
THOC2-208	ENST00000441692	CELF2	O95319	508 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
THOC2-208	ENST00000441692	MASTL	Q96GX5	879 aa		4.86	□□□□□ -1.63
THOC2-208	ENST00000441692	ZBTB3	Q9H5J0	574 aa		4.86	□□□□□ -1.63
THOC2-208	ENST00000441692	NARF	Q9UHQ1	456 aa		4.86	□□□□□ -1.63
THOC2-208	ENST00000441692	PLCH1	Q4KWH8	1693 aa		4.86	□□□□□ -1.63
THOC2-208	ENST00000441692	NWD2	Q9ULI1	1742 aa		4.86	□□□□□ -1.63
THOC2-208	ENST00000441692	COL22A1	Q8NFW1	1626 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
THOC2-208	ENST00000441692	MYC	P01106	439 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
THOC2-208	ENST00000441692	KCNJ4	P48050	445 aa		4.86	□□□□□ -1.63
THOC2-208	ENST00000441692	AKAP4	Q5JQC9	854 aa		4.86	□□□□□ -1.63

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