RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000439407.1

LMCD1-AS1-202, LMCD1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 4 BASIC

Gene LMCD1-AS1, Length 576 nt, Biotype antisense RNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 FAM89AQ96GI7 184 aa8.35□□□□□ -1.07
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 UTP14AQ9BVJ6 771 aaKnown RBP8.35□□□□□ -1.07
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 BICC1Q9H694 974 aaKnown RBP8.35□□□□□ -1.07
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 NARFQ9UHQ1 456 aa8.35□□□□□ -1.07
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 NIP7Q9Y221 180 aaKnown RBP eCLIP8.35□□□□□ -1.07
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 EXOC6BQ9Y2D4 811 aa8.35□□□□□ -1.07
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 COL15A1P39059 1388 aa8.35□□□□□ -1.07
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 TJP1Q07157 1748 aa8.34□□□□□ -1.07
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 SBF2Q86WG5 1849 aa8.34□□□□□ -1.07
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 HSP90B1P14625 803 aaKnown RBP8.34□□□□□ -1.07
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 POLA2Q14181 598 aa8.34□□□□□ -1.07
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 USPL1Q5W0Q7 1092 aa8.34□□□□□ -1.07
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 LMBR1LQ6UX01 489 aa8.34□□□□□ -1.07
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 CLEC4GQ6UXB4 293 aa8.34□□□□□ -1.07
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 ARHGEF1Q92888 912 aaKnown RBP8.34□□□□□ -1.07
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 LRRC4BQ9NT99 713 aa8.34□□□□□ -1.07
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 IRS4O14654 1257 aaPredicted RBP8.33□□□□□ -1.08
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 NPHP1O15259 732 aa8.33□□□□□ -1.08
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 SMARCA5O60264 1052 aaPredicted RBP8.33□□□□□ -1.08
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 MTX1Q13505 466 aa8.33□□□□□ -1.08
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 TAF7LQ5H9L4 462 aa8.33□□□□□ -1.08
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 EPHA10Q5JZY3 1008 aa8.33□□□□□ -1.08
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 SUSD4Q5VX71 490 aa8.33□□□□□ -1.08
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 KAZALD1Q96I82 304 aa8.33□□□□□ -1.08
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 SETDB2Q96T68 719 aa8.33□□□□□ -1.08
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 LRRCC1Q9C099 1032 aa8.33□□□□□ -1.08
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 TFCP2L1Q9NZI6 479 aa8.33□□□□□ -1.08
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 SRP68Q9UHB9 627 aaKnown RBP8.33□□□□□ -1.08
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 IBTKQ9P2D0 1353 aaPredicted RBP8.33□□□□□ -1.08
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 SH3TC1Q8TE82 1336 aa8.32□□□□□ -1.08
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 AFDNP55196 1824 aaKnown RBP8.32□□□□□ -1.08
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 PDE8AO60658 829 aa8.32□□□□□ -1.08
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 ADRA2BP18089 450 aa8.32□□□□□ -1.08
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 CASP7P55210 303 aa8.32□□□□□ -1.08
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 FOXO4P98177 505 aa8.32□□□□□ -1.08
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 CCDC57Q2TAC2 916 aa8.32□□□□□ -1.08
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 ERC1Q8IUD2 1116 aa8.32□□□□□ -1.08
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 PROM2Q8N271 834 aa8.32□□□□□ -1.08
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 KIF1BPQ96EK5 621 aa8.32□□□□□ -1.08
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 CCDC85AQ96PX6 553 aaPredicted RBP8.32□□□□□ -1.08
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 PA2G4Q9UQ80 394 aaKnown RBP8.32□□□□□ -1.08
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 ARFGEF2Q9Y6D5 1785 aa8.32□□□□□ -1.08
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 CDHR2Q9BYE9 1310 aa8.31□□□□□ -1.08
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 228 aaKnown RBP8.31□□□□□ -1.08
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 RGL2O15211 777 aa8.31□□□□□ -1.08
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 PDE4AP27815 886 aa8.31□□□□□ -1.08
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 BAG6P46379 1132 aa8.31□□□□□ -1.08
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 EN1Q05925 392 aaPredicted RBP8.31□□□□□ -1.08
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 IFIT5Q13325 482 aaKnown RBP8.31□□□□□ -1.08
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 TBC1D9BQ66K14 1250 aa8.31□□□□□ -1.08
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 TPTE2Q6XPS3 522 aa8.31□□□□□ -1.08
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 C16orf71Q8IYS4 520 aaPredicted RBP8.31□□□□□ -1.08
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 SYNE4Q8N205 404 aa8.31□□□□□ -1.08
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 FLAD1Q8NFF5 587 aa8.31□□□□□ -1.08
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 RHPN1Q8TCX5 695 aa8.31□□□□□ -1.08
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 PLA2G12BQ9BX93 195 aa8.31□□□□□ -1.08
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 NYXQ9GZU5 481 aa8.31□□□□□ -1.08
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 SIL1Q9H173 461 aa8.31□□□□□ -1.08
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 NOP58Q9Y2X3 529 aaKnown RBP8.31□□□□□ -1.08
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 MYH14Q7Z406 1995 aaKnown RBP8.31□□□□□ -1.08
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 ZNF831Q5JPB2 1677 aa8.3□□□□□ -1.08
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 ANKRD18BA2A2Z9 1011 aa8.3□□□□□ -1.08
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 HCLS1P14317 486 aaPredicted RBP8.3□□□□□ -1.08
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 SSFA2P28290 1259 aa8.3□□□□□ -1.08
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 EZH2Q15910 746 aaKnown RBP8.3□□□□□ -1.08
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 RABL6Q3YEC7 729 aaPredicted RBP8.3□□□□□ -1.08
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 NBPF5PQ86XG9 351 aaPredicted RBP8.3□□□□□ -1.08
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 NUTM1Q86Y26 1132 aa8.3□□□□□ -1.08
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 CLASRPQ8N2M8 674 aaKnown RBP8.3□□□□□ -1.08
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 KLHDC4Q8TBB5 520 aa8.3□□□□□ -1.08
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 IL1RAPL2Q9NP60 686 aa8.3□□□□□ -1.08
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 COPRSQ9NQ92 184 aa8.3□□□□□ -1.08
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 STK32BQ9NY57 414 aa8.3□□□□□ -1.08
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 N4BP2Q86UW6 1770 aaPredicted RBP8.3□□□□□ -1.08
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 UBN2Q6ZU65 1347 aa8.29□□□□□ -1.08
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 LY75O60449 1722 aa8.29□□□□□ -1.08
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 NUP98P52948 1817 aa8.29□□□□□ -1.08
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 CSF1RP07333 972 aa8.29□□□□□ -1.08
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 IFIT2P09913 472 aaKnown RBP8.29□□□□□ -1.08
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 FAM161AQ3B820 660 aa8.29□□□□□ -1.08
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 ERFEQ4G0M1 354 aa8.29□□□□□ -1.08
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 PLEKHM2Q8IWE5 1019 aa8.29□□□□□ -1.08
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 TTLL11Q8NHH1 800 aa8.29□□□□□ -1.08
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 ZNF594Q96JF6 807 aaPredicted RBP8.29□□□□□ -1.08
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 BCL2L12Q9HB09 334 aa8.29□□□□□ -1.08
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 NUP188Q5SRE5 1749 aa8.29□□□□□ -1.08
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 USP42Q9H9J4 1324 aaKnown RBP8.29□□□□□ -1.08
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 EYA2O00167 538 aa8.28□□□□□ -1.08
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 NTSR2O95665 410 aa8.28□□□□□ -1.08
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 ITGA6P23229 1130 aa8.28□□□□□ -1.08
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 RFX5P48382 616 aaPredicted RBP8.28□□□□□ -1.08
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 CTSWP56202 376 aa8.28□□□□□ -1.08
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 PTPN12Q05209 780 aaKnown RBP8.28□□□□□ -1.08
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 CCDC152Q4G0S7 254 aa8.28□□□□□ -1.08
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 CCDC125Q86Z20 511 aa8.28□□□□□ -1.08
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 AKT1S1Q96B36 256 aa8.28□□□□□ -1.08
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 NLRP3Q96P20 1036 aa8.28□□□□□ -1.08
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 CAMKK2Q96RR4 588 aa8.28□□□□□ -1.08
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 CNNM1Q9NRU3 951 aa8.28□□□□□ -1.08
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 CEP126Q9P2H0 1117 aa8.28□□□□□ -1.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 47.2 ms