RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000437755.1

TTLL4-209, Transcript of tubulin tyrosine ligase like 4, humanhuman

TSL 3

Gene TTLL4, Length 747 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTLL4-209ENST00000437755 SOGA3Q5TF21 947 aa25.5■■□□□ 1.67
TTLL4-209ENST00000437755 TNRC6CQ9HCJ0 1690 aaKnown RBP25.5■■□□□ 1.67
TTLL4-209ENST00000437755 ZNF219Q9P2Y4 722 aaPredicted RBP25.5■■□□□ 1.67
TTLL4-209ENST00000437755 FER1L6Q2WGJ9 1857 aa25.49■■□□□ 1.67
TTLL4-209ENST00000437755 FANCIQ9NVI1 1328 aa25.49■■□□□ 1.67
TTLL4-209ENST00000437755 CCER2I3L3R5 266 aa25.49■■□□□ 1.67
TTLL4-209ENST00000437755 ALDH1B1P30837 517 aa25.49■■□□□ 1.67
TTLL4-209ENST00000437755 NLRP10Q86W26 655 aa25.49■■□□□ 1.67
TTLL4-209ENST00000437755 STK31Q9BXU1 1019 aa25.49■■□□□ 1.67
TTLL4-209ENST00000437755 GPBP1L1Q9HC44 474 aaPredicted RBP25.49■■□□□ 1.67
TTLL4-209ENST00000437755 RNF181Q9P0P0 153 aa25.49■■□□□ 1.67
TTLL4-209ENST00000437755 CRY2Q49AN0 593 aa25.48■■□□□ 1.67
TTLL4-209ENST00000437755 RIC3Q7Z5B4 369 aa25.48■■□□□ 1.67
TTLL4-209ENST00000437755 RPGRQ92834 1020 aaKnown RBP25.48■■□□□ 1.67
TTLL4-209ENST00000437755 PHAXQ9H814 394 aaKnown RBP25.48■■□□□ 1.67
TTLL4-209ENST00000437755 DDX58O95786 925 aaKnown RBP25.47■■□□□ 1.67
TTLL4-209ENST00000437755 RASSF7Q02833 373 aa25.47■■□□□ 1.67
TTLL4-209ENST00000437755 ZNF526Q8TF50 670 aaPredicted RBP25.47■■□□□ 1.67
TTLL4-209ENST00000437755 TRMT112Q9UI30 125 aaKnown RBP25.47■■□□□ 1.67
TTLL4-209ENST00000437755 LMNB1P20700 586 aa25.46■■□□□ 1.67
TTLL4-209ENST00000437755 NLRP3Q96P20 1036 aa25.46■■□□□ 1.67
TTLL4-209ENST00000437755 MYH16Q9H6N6 1097 aa25.46■■□□□ 1.67
TTLL4-209ENST00000437755 SLC10A5Q5PT55 438 aa25.45■■□□□ 1.66
TTLL4-209ENST00000437755 SH3TC1Q8TE82 1336 aa25.44■■□□□ 1.66
TTLL4-209ENST00000437755 ISCA1Q9BUE6 129 aa25.44■■□□□ 1.66
TTLL4-209ENST00000437755 DICER1Q9UPY3 1922 aaKnown RBP25.43■■□□□ 1.66
TTLL4-209ENST00000437755 NFKBIEO00221 500 aa25.43■■□□□ 1.66
TTLL4-209ENST00000437755 RBM17Q96I25 401 aaKnown RBP25.43■■□□□ 1.66
TTLL4-209ENST00000437755 TAOK3Q9H2K8 898 aa25.43■■□□□ 1.66
TTLL4-209ENST00000437755 ATP5J2-PTCD1G3V325 749 aa25.42■■□□□ 1.66
TTLL4-209ENST00000437755 HOXA10P31260 410 aaPredicted RBP25.42■■□□□ 1.66
TTLL4-209ENST00000437755 CCDC93Q567U6 631 aa25.42■■□□□ 1.66
TTLL4-209ENST00000437755 LAMB2P55268 1798 aa25.41■■□□□ 1.66
TTLL4-209ENST00000437755 LTBP3Q9NS15 1303 aa25.41■■□□□ 1.66
TTLL4-209ENST00000437755 ZC3H4Q9UPT8 1303 aaKnown RBP25.41■■□□□ 1.66
TTLL4-209ENST00000437755 EXOSC9Q06265 439 aaKnown RBP25.41■■□□□ 1.66
TTLL4-209ENST00000437755 TRIM28Q13263 835 aaKnown RBP25.41■■□□□ 1.66
TTLL4-209ENST00000437755 C7orf43Q8WVR3 580 aa25.41■■□□□ 1.66
TTLL4-209ENST00000437755 TCERG1O14776 1098 aaKnown RBP25.4■■□□□ 1.66
TTLL4-209ENST00000437755 CRAMP1Q96RY5 1269 aa25.4■■□□□ 1.66
TTLL4-209ENST00000437755 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP25.4■■□□□ 1.66
TTLL4-209ENST00000437755 VAMP4O75379 141 aa25.39■■□□□ 1.66
TTLL4-209ENST00000437755 SLC4A2P04920 1241 aa25.39■■□□□ 1.66
TTLL4-209ENST00000437755 RTKN2Q8IZC4 609 aa25.39■■□□□ 1.66
TTLL4-209ENST00000437755 ZNF521Q96K83 1311 aa25.38■■□□□ 1.65
TTLL4-209ENST00000437755 TIAM2Q8IVF5 1701 aa25.38■■□□□ 1.65
TTLL4-209ENST00000437755 HCLS1P14317 486 aaPredicted RBP25.38■■□□□ 1.65
TTLL4-209ENST00000437755 KSR2Q6VAB6 950 aa25.38■■□□□ 1.65
TTLL4-209ENST00000437755 C3orf67Q6ZVT6 689 aa25.38■■□□□ 1.65
TTLL4-209ENST00000437755 MYD88Q99836 296 aa25.38■■□□□ 1.65
TTLL4-209ENST00000437755 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP25.37■■□□□ 1.65
TTLL4-209ENST00000437755 CC2D2BQ6DHV5 1058 aa25.37■■□□□ 1.65
TTLL4-209ENST00000437755 SYNE4Q8N205 404 aa25.37■■□□□ 1.65
TTLL4-209ENST00000437755 ZNF428Q96B54 188 aa25.37■■□□□ 1.65
TTLL4-209ENST00000437755 METTL22Q9BUU2 404 aaPredicted RBP25.37■■□□□ 1.65
TTLL4-209ENST00000437755 MAP3K2Q9Y2U5 619 aa25.37■■□□□ 1.65
TTLL4-209ENST00000437755 KDM2BQ8NHM5 1336 aa25.37■■□□□ 1.65
TTLL4-209ENST00000437755 PRELPP51888 382 aa25.36■■□□□ 1.65
TTLL4-209ENST00000437755 CCDC191Q8NCU4 936 aa25.36■■□□□ 1.65
TTLL4-209ENST00000437755 FAM89AQ96GI7 184 aa25.36■■□□□ 1.65
TTLL4-209ENST00000437755 DDX60Q8IY21 1712 aaKnown RBP25.36■■□□□ 1.65
TTLL4-209ENST00000437755 PI4KAP2A4QPH2 592 aa25.35■■□□□ 1.65
TTLL4-209ENST00000437755 HSP90B1P14625 803 aaKnown RBP25.35■■□□□ 1.65
TTLL4-209ENST00000437755 GRIPAP1Q4V328 841 aa25.35■■□□□ 1.65
TTLL4-209ENST00000437755 PI4KAP1Q8N8J0 262 aa25.35■■□□□ 1.65
TTLL4-209ENST00000437755 TMX4Q9H1E5 349 aaPredicted RBP25.35■■□□□ 1.65
TTLL4-209ENST00000437755 PPEF1O14829 653 aaPredicted RBP25.34■■□□□ 1.65
TTLL4-209ENST00000437755 C1QTNF8P60827 252 aa25.34■■□□□ 1.65
TTLL4-209ENST00000437755 FKBP4Q02790 459 aaKnown RBP eCLIP25.34■■□□□ 1.65
TTLL4-209ENST00000437755 NEXNQ0ZGT2 675 aa25.34■■□□□ 1.65
TTLL4-209ENST00000437755 ZBTB38Q8NAP3 1195 aaPredicted RBP25.34■■□□□ 1.65
TTLL4-209ENST00000437755 DDX46Q7L014 1031 aaKnown RBP25.33■■□□□ 1.65
TTLL4-209ENST00000437755 CWC25Q9NXE8 425 aaPredicted RBP25.33■■□□□ 1.65
TTLL4-209ENST00000437755 IRS4O14654 1257 aaPredicted RBP25.32■■□□□ 1.64
TTLL4-209ENST00000437755 FLIIQ13045 1269 aa25.32■■□□□ 1.64
TTLL4-209ENST00000437755 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP25.32■■□□□ 1.64
TTLL4-209ENST00000437755 OLFM4Q6UX06 510 aa25.32■■□□□ 1.64
TTLL4-209ENST00000437755 G2E3Q7L622 706 aa25.32■■□□□ 1.64
TTLL4-209ENST00000437755 ABCC4O15439 1325 aa25.32■■□□□ 1.64
TTLL4-209ENST00000437755 E9PSI1 815 aa25.31■■□□□ 1.64
TTLL4-209ENST00000437755 BBOX1O75936 387 aa25.31■■□□□ 1.64
TTLL4-209ENST00000437755 FKBP5Q13451 457 aaPredicted RBP25.31■■□□□ 1.64
TTLL4-209ENST00000437755 TAF1P21675 1872 aa25.3■■□□□ 1.64
TTLL4-209ENST00000437755 PCCAP05165 728 aaPredicted RBP25.3■■□□□ 1.64
TTLL4-209ENST00000437755 DPY19L2Q6NUT2 758 aa25.3■■□□□ 1.64
TTLL4-209ENST00000437755 PSMD1Q99460 953 aa25.3■■□□□ 1.64
TTLL4-209ENST00000437755 GLTPD2A6NH11 291 aa25.29■■□□□ 1.64
TTLL4-209ENST00000437755 KIF3CO14782 793 aa25.29■■□□□ 1.64
TTLL4-209ENST00000437755 SF3B3Q15393 1217 aaKnown RBP25.29■■□□□ 1.64
TTLL4-209ENST00000437755 NMRK2Q9NPI5 230 aa25.29■■□□□ 1.64
TTLL4-209ENST00000437755 GRAPQ13588 217 aa25.28■■□□□ 1.64
TTLL4-209ENST00000437755 GRAPLQ8TC17 118 aaPredicted RBP25.28■■□□□ 1.64
TTLL4-209ENST00000437755 ZNF277Q9NRM2 450 aaPredicted RBP25.28■■□□□ 1.64
TTLL4-209ENST00000437755 ATP6V0A2Q9Y487 856 aa25.28■■□□□ 1.64
TTLL4-209ENST00000437755 IGKV5-2P06315 115 aa25.26■■□□□ 1.63
TTLL4-209ENST00000437755 IARSP41252 1262 aaKnown RBP25.26■■□□□ 1.63
TTLL4-209ENST00000437755 TMC4Q7Z404 712 aa25.26■■□□□ 1.63
TTLL4-209ENST00000437755 MIER1Q8N108 512 aa25.26■■□□□ 1.63
TTLL4-209ENST00000437755 DNAAF4Q8WXU2 420 aa25.26■■□□□ 1.63
TTLL4-209ENST00000437755 SNED1Q8TER0 1413 aa25.26■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39 ms