RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000433317.1

TTC28-AS1-212, TTC28 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene TTC28-AS1, Length 3,080 nt, Biotype antisense RNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC28-AS1-212ENST00000433317 C9orf78Q9NZ63 289 aaPredicted RBP17.14■□□□□ 0.33
TTC28-AS1-212ENST00000433317 NMIQ13287 307 aaPredicted RBP17.13■□□□□ 0.33
TTC28-AS1-212ENST00000433317 GPATCH3Q96I76 525 aa17.13■□□□□ 0.33
TTC28-AS1-212ENST00000433317 TAF6LQ9Y6J9 622 aa17.13■□□□□ 0.33
TTC28-AS1-212ENST00000433317 USP42Q9H9J4 1324 aaKnown RBP17.13■□□□□ 0.33
TTC28-AS1-212ENST00000433317 TNRQ92752 1358 aa17.13■□□□□ 0.33
TTC28-AS1-212ENST00000433317 EIF4A1P60842 406 aaKnown RBP17.13■□□□□ 0.33
TTC28-AS1-212ENST00000433317 TRIM5Q9C035 493 aa17.13■□□□□ 0.33
TTC28-AS1-212ENST00000433317 SPATA32Q96LK8 384 aa17.12■□□□□ 0.33
TTC28-AS1-212ENST00000433317 N4BP2Q86UW6 1770 aaPredicted RBP17.12■□□□□ 0.33
TTC28-AS1-212ENST00000433317 LARP1Q6PKG0 1096 aaKnown RBP17.12■□□□□ 0.33
TTC28-AS1-212ENST00000433317 CCDC8Q9H0W5 538 aaPredicted RBP17.12■□□□□ 0.33
TTC28-AS1-212ENST00000433317 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa17.12■□□□□ 0.33
TTC28-AS1-212ENST00000433317 TNFRSF11AQ9Y6Q6 616 aaPredicted RBP17.12■□□□□ 0.33
TTC28-AS1-212ENST00000433317 EVI5LQ96CN4 794 aa17.12■□□□□ 0.33
TTC28-AS1-212ENST00000433317 ZFP91-CNTFA0A0A6YYC7 529 aaPredicted RBP17.11■□□□□ 0.33
TTC28-AS1-212ENST00000433317 SLC27A2O14975 620 aa17.11■□□□□ 0.33
TTC28-AS1-212ENST00000433317 BABAM1Q9NWV8 329 aa17.11■□□□□ 0.33
TTC28-AS1-212ENST00000433317 PTPRUQ92729 1446 aa17.11■□□□□ 0.33
TTC28-AS1-212ENST00000433317 CWF19L2Q2TBE0 894 aaKnown RBP17.11■□□□□ 0.33
TTC28-AS1-212ENST00000433317 ADCY9O60503 1353 aa17.11■□□□□ 0.33
TTC28-AS1-212ENST00000433317 BLOC1S2Q6QNY1 142 aa17.1■□□□□ 0.33
TTC28-AS1-212ENST00000433317 ABTB2Q8N961 1025 aa17.1■□□□□ 0.33
TTC28-AS1-212ENST00000433317 KCNB2Q92953 911 aa17.1■□□□□ 0.33
TTC28-AS1-212ENST00000433317 IGSF3O75054 1194 aa17.1■□□□□ 0.33
TTC28-AS1-212ENST00000433317 PLPPR3Q6T4P5 718 aa17.1■□□□□ 0.33
TTC28-AS1-212ENST00000433317 BOLA2Q9H3K6 86 aa17.1■□□□□ 0.33
TTC28-AS1-212ENST00000433317 MAP3K2Q9Y2U5 619 aa17.1■□□□□ 0.33
TTC28-AS1-212ENST00000433317 A0A0D9SFI3 127 aa17.1■□□□□ 0.33
TTC28-AS1-212ENST00000433317 BICD2Q8TD16 824 aa17.1■□□□□ 0.33
TTC28-AS1-212ENST00000433317 MAP4K1Q92918 833 aa17.1■□□□□ 0.33
TTC28-AS1-212ENST00000433317 DNAJC25Q9H1X3 360 aa17.1■□□□□ 0.33
TTC28-AS1-212ENST00000433317 NR1I2O75469 434 aa17.09■□□□□ 0.33
TTC28-AS1-212ENST00000433317 PDCP20941 246 aa17.09■□□□□ 0.33
TTC28-AS1-212ENST00000433317 UTP14CQ5TAP6 766 aaKnown RBP17.09■□□□□ 0.33
TTC28-AS1-212ENST00000433317 ANKRD7Q92527 254 aa17.09■□□□□ 0.33
TTC28-AS1-212ENST00000433317 SIL1Q9H173 461 aa17.09■□□□□ 0.33
TTC28-AS1-212ENST00000433317 PIK3C2AO00443 1686 aa17.09■□□□□ 0.33
TTC28-AS1-212ENST00000433317 PSMA5P28066 241 aa17.09■□□□□ 0.33
TTC28-AS1-212ENST00000433317 LEO1Q8WVC0 666 aaPredicted RBP17.09■□□□□ 0.33
TTC28-AS1-212ENST00000433317 FSD1Q9BTV5 496 aa17.09■□□□□ 0.33
TTC28-AS1-212ENST00000433317 TLR7Q9NYK1 1049 aaKnown RBP17.09■□□□□ 0.33
TTC28-AS1-212ENST00000433317 RGPD8O14715 1765 aaPredicted RBP17.09■□□□□ 0.33
TTC28-AS1-212ENST00000433317 NWD1Q149M9 1564 aa17.08■□□□□ 0.33
TTC28-AS1-212ENST00000433317 ELP1O95163 1332 aa17.08■□□□□ 0.33
TTC28-AS1-212ENST00000433317 ZNF75DP51815 510 aa17.08■□□□□ 0.33
TTC28-AS1-212ENST00000433317 EAF2Q96CJ1 260 aaPredicted RBP17.08■□□□□ 0.33
TTC28-AS1-212ENST00000433317 CRYBG1Q9Y4K1 1723 aa17.08■□□□□ 0.33
TTC28-AS1-212ENST00000433317 CTIFO43310 598 aaKnown RBP17.08■□□□□ 0.32
TTC28-AS1-212ENST00000433317 TEFQ10587 303 aa17.08■□□□□ 0.32
TTC28-AS1-212ENST00000433317 NAA30Q147X3 362 aaPredicted RBP17.08■□□□□ 0.32
TTC28-AS1-212ENST00000433317 SCAND2PQ9GZW5 306 aaPredicted RBP17.08■□□□□ 0.32
TTC28-AS1-212ENST00000433317 DIP2BQ9P265 1576 aa17.07■□□□□ 0.32
TTC28-AS1-212ENST00000433317 BTBD11A6QL63 1104 aa17.07■□□□□ 0.32
TTC28-AS1-212ENST00000433317 TNNT1P13805 278 aa17.07■□□□□ 0.32
TTC28-AS1-212ENST00000433317 ZNF165P49910 485 aa17.07■□□□□ 0.32
TTC28-AS1-212ENST00000433317 PROSER3Q2NL68 480 aa17.07■□□□□ 0.32
TTC28-AS1-212ENST00000433317 ZSCAN25Q6NSZ9 544 aa17.07■□□□□ 0.32
TTC28-AS1-212ENST00000433317 DDX11Q96FC9 970 aa17.07■□□□□ 0.32
TTC28-AS1-212ENST00000433317 NCBP1Q09161 790 aaKnown RBP17.07■□□□□ 0.32
TTC28-AS1-212ENST00000433317 MPRIPQ6WCQ1 1025 aa17.07■□□□□ 0.32
TTC28-AS1-212ENST00000433317 JAK2O60674 1132 aa17.07■□□□□ 0.32
TTC28-AS1-212ENST00000433317 RPS6KB1P23443 525 aa17.07■□□□□ 0.32
TTC28-AS1-212ENST00000433317 CEBPZQ03701 1054 aaKnown RBP17.07■□□□□ 0.32
TTC28-AS1-212ENST00000433317 TOB2Q14106 344 aaPredicted RBP17.07■□□□□ 0.32
TTC28-AS1-212ENST00000433317 ERC1Q8IUD2 1116 aa17.07■□□□□ 0.32
TTC28-AS1-212ENST00000433317 CLSTN2Q9H4D0 955 aa17.07■□□□□ 0.32
TTC28-AS1-212ENST00000433317 NPHP3Q7Z494 1330 aa17.06■□□□□ 0.32
TTC28-AS1-212ENST00000433317 SASH1O94885 1247 aa17.06■□□□□ 0.32
TTC28-AS1-212ENST00000433317 MTX1Q13505 466 aa17.06■□□□□ 0.32
TTC28-AS1-212ENST00000433317 ZNF592Q92610 1267 aa17.06■□□□□ 0.32
TTC28-AS1-212ENST00000433317 PGBD1Q96JS3 809 aa17.06■□□□□ 0.32
TTC28-AS1-212ENST00000433317 DDX19AQ9NUU7 478 aaKnown RBP17.06■□□□□ 0.32
TTC28-AS1-212ENST00000433317 CLIP2Q9UDT6 1046 aa17.06■□□□□ 0.32
TTC28-AS1-212ENST00000433317 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP17.06■□□□□ 0.32
TTC28-AS1-212ENST00000433317 ZNF589Q86UQ0 364 aaPredicted RBP17.06■□□□□ 0.32
TTC28-AS1-212ENST00000433317 KLHL34Q8N239 644 aa17.06■□□□□ 0.32
TTC28-AS1-212ENST00000433317 EDC3Q96F86 508 aaKnown RBP17.06■□□□□ 0.32
TTC28-AS1-212ENST00000433317 G3BP1Q13283 466 aaKnown RBP eCLIP17.05■□□□□ 0.32
TTC28-AS1-212ENST00000433317 TPD52L1Q16890 204 aaPredicted RBP17.05■□□□□ 0.32
TTC28-AS1-212ENST00000433317 RNF20Q5VTR2 975 aa17.05■□□□□ 0.32
TTC28-AS1-212ENST00000433317 PLA2G4DQ86XP0 818 aa17.05■□□□□ 0.32
TTC28-AS1-212ENST00000433317 KLHDC4Q8TBB5 520 aa17.05■□□□□ 0.32
TTC28-AS1-212ENST00000433317 CACTINQ8WUQ7 758 aaKnown RBP17.05■□□□□ 0.32
TTC28-AS1-212ENST00000433317 PRAMEF22A3QJZ6 481 aa17.05■□□□□ 0.32
TTC28-AS1-212ENST00000433317 FOSBP53539 338 aa17.05■□□□□ 0.32
TTC28-AS1-212ENST00000433317 CCDC144BQ3MJ40 725 aa17.05■□□□□ 0.32
TTC28-AS1-212ENST00000433317 CCDC144CPQ8IYA2 1237 aa17.05■□□□□ 0.32
TTC28-AS1-212ENST00000433317 CEMIPQ8WUJ3 1361 aa17.05■□□□□ 0.32
TTC28-AS1-212ENST00000433317 UBR1Q8IWV7 1749 aa17.05■□□□□ 0.32
TTC28-AS1-212ENST00000433317 ANKRD1Q15327 319 aa17.05■□□□□ 0.32
TTC28-AS1-212ENST00000433317 NBPF6Q5VWK0 638 aa17.05■□□□□ 0.32
TTC28-AS1-212ENST00000433317 NBPF4Q96M43 638 aa17.05■□□□□ 0.32
TTC28-AS1-212ENST00000433317 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa17.04■□□□□ 0.32
TTC28-AS1-212ENST00000433317 AIMP1Q12904 312 aaKnown RBP17.04■□□□□ 0.32
TTC28-AS1-212ENST00000433317 SUCLG2Q96I99 432 aa17.04■□□□□ 0.32
TTC28-AS1-212ENST00000433317 GTPBP4Q9BZE4 634 aaKnown RBP17.04■□□□□ 0.32
TTC28-AS1-212ENST00000433317 BICC1Q9H694 974 aaKnown RBP17.04■□□□□ 0.32
TTC28-AS1-212ENST00000433317 DBF4Q9UBU7 674 aaPredicted RBP17.04■□□□□ 0.32
TTC28-AS1-212ENST00000433317 TDRD7Q8NHU6 1098 aaKnown RBP17.04■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 76.6 ms