RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000423339.2

CCDC82-202, Transcript of coiled-coil domain containing 82, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCDC82, Length 1,878 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC82-202ENST00000423339 SFSWAPQ12872 951 aaKnown RBP5.96□□□□□ -1.46
CCDC82-202ENST00000423339 PRR23CQ6ZRP0 262 aa5.96□□□□□ -1.46
CCDC82-202ENST00000423339 DEPDC4Q8N2C3 294 aa5.96□□□□□ -1.46
CCDC82-202ENST00000423339 EFCC1Q9HA90 598 aa5.96□□□□□ -1.46
CCDC82-202ENST00000423339 ANKIB1Q9P2G1 1089 aa5.95□□□□□ -1.46
CCDC82-202ENST00000423339 TFIP11Q9UBB9 837 aaKnown RBP5.95□□□□□ -1.46
CCDC82-202ENST00000423339 FSTP19883 344 aa5.94□□□□□ -1.46
CCDC82-202ENST00000423339 TXLNAP40222 546 aa5.94□□□□□ -1.46
CCDC82-202ENST00000423339 UBE2OQ9C0C9 1292 aaKnown RBP5.94□□□□□ -1.46
CCDC82-202ENST00000423339 PALM3A6NDB9 673 aaPredicted RBP5.94□□□□□ -1.46
CCDC82-202ENST00000423339 USP17L5A8MUK1 530 aa5.94□□□□□ -1.46
CCDC82-202ENST00000423339 EML1O00423 815 aa5.94□□□□□ -1.46
CCDC82-202ENST00000423339 GSC2O15499 205 aa5.94□□□□□ -1.46
CCDC82-202ENST00000423339 PTCD1O75127 700 aaKnown RBP5.94□□□□□ -1.46
CCDC82-202ENST00000423339 CD97P48960 835 aa5.94□□□□□ -1.46
CCDC82-202ENST00000423339 KCNQ4P56696 695 aa5.94□□□□□ -1.46
CCDC82-202ENST00000423339 NCOA4Q13772 614 aa5.94□□□□□ -1.46
CCDC82-202ENST00000423339 TEAD4Q15561 434 aa5.94□□□□□ -1.46
CCDC82-202ENST00000423339 NFATC2IPQ8NCF5 419 aa5.94□□□□□ -1.46
CCDC82-202ENST00000423339 KRTAP4-9Q9BYQ8 210 aa5.94□□□□□ -1.46
CCDC82-202ENST00000423339 PPP1R12CQ9BZL4 782 aa5.94□□□□□ -1.46
CCDC82-202ENST00000423339 SLC6A14Q9UN76 642 aa5.94□□□□□ -1.46
CCDC82-202ENST00000423339 KCNH4Q9UQ05 1017 aa5.94□□□□□ -1.46
CCDC82-202ENST00000423339 ATP9BO43861 1147 aa5.93□□□□□ -1.46
CCDC82-202ENST00000423339 IREB2P48200 963 aaKnown RBP5.93□□□□□ -1.46
CCDC82-202ENST00000423339 FBXO11Q86XK2 927 aa5.93□□□□□ -1.46
CCDC82-202ENST00000423339 TBC1D8BQ0IIM8 1120 aa5.92□□□□□ -1.46
CCDC82-202ENST00000423339 DMRTC2Q8IXT2 367 aaPredicted RBP5.92□□□□□ -1.46
CCDC82-202ENST00000423339 RHPN1Q8TCX5 695 aa5.92□□□□□ -1.46
CCDC82-202ENST00000423339 L3MBTL2Q969R5 705 aa5.92□□□□□ -1.46
CCDC82-202ENST00000423339 CEP63Q96MT8 703 aa5.92□□□□□ -1.46
CCDC82-202ENST00000423339 BRD7Q9NPI1 651 aa5.92□□□□□ -1.46
CCDC82-202ENST00000423339 PARP3Q9Y6F1 533 aa5.92□□□□□ -1.46
CCDC82-202ENST00000423339 USP17L3A6NCW0 530 aa5.92□□□□□ -1.46
CCDC82-202ENST00000423339 USP17L4A6NCW7 530 aa5.92□□□□□ -1.46
CCDC82-202ENST00000423339 TMEM229AB2RXF0 380 aa5.92□□□□□ -1.46
CCDC82-202ENST00000423339 RGS9O75916 674 aaPredicted RBP5.92□□□□□ -1.46
CCDC82-202ENST00000423339 NOS3P29474 1203 aa5.92□□□□□ -1.46
CCDC82-202ENST00000423339 AFF1P51825 1210 aaKnown RBP5.92□□□□□ -1.46
CCDC82-202ENST00000423339 GP2P55259 537 aaKnown RBP5.92□□□□□ -1.46
CCDC82-202ENST00000423339 EML3Q32P44 896 aa5.92□□□□□ -1.46
CCDC82-202ENST00000423339 USP17L2Q6R6M4 530 aa5.92□□□□□ -1.46
CCDC82-202ENST00000423339 IGF2-ASQ6U949 168 aa5.92□□□□□ -1.46
CCDC82-202ENST00000423339 USP17L1Q7RTZ2 530 aa5.92□□□□□ -1.46
CCDC82-202ENST00000423339 MAFBQ9Y5Q3 323 aaPredicted RBP5.92□□□□□ -1.46
CCDC82-202ENST00000423339 LMOD1P29536 600 aaPredicted RBP5.91□□□□□ -1.46
CCDC82-202ENST00000423339 NOS2P35228 1153 aa5.91□□□□□ -1.46
CCDC82-202ENST00000423339 PCSK7Q16549 785 aa5.91□□□□□ -1.46
CCDC82-202ENST00000423339 RAB44Q7Z6P3 723 aaPredicted RBP5.91□□□□□ -1.46
CCDC82-202ENST00000423339 NUDT8Q8WV74 236 aa5.91□□□□□ -1.46
CCDC82-202ENST00000423339 BHMTQ93088 406 aa5.91□□□□□ -1.46
CCDC82-202ENST00000423339 SCHIP1Q9P0W5 487 aaPredicted RBP5.91□□□□□ -1.46
CCDC82-202ENST00000423339 ZNF232Q9UNY5 417 aa5.91□□□□□ -1.46
CCDC82-202ENST00000423339 USP3Q9Y6I4 520 aa5.91□□□□□ -1.46
CCDC82-202ENST00000423339 OAS3Q9Y6K5 1087 aaKnown RBP5.91□□□□□ -1.46
CCDC82-202ENST00000423339 KIAA1324LA8MWY0 1029 aaPredicted RBP5.9□□□□□ -1.46
CCDC82-202ENST00000423339 RFX1P22670 979 aa5.9□□□□□ -1.46
CCDC82-202ENST00000423339 PSAPL1Q6NUJ1 521 aa5.9□□□□□ -1.46
CCDC82-202ENST00000423339 LZTS3O60299 673 aaPredicted RBP5.9□□□□□ -1.47
CCDC82-202ENST00000423339 CFAP70Q5T0N1 1121 aa5.9□□□□□ -1.47
CCDC82-202ENST00000423339 MSL1Q68DK7 614 aa5.9□□□□□ -1.47
CCDC82-202ENST00000423339 PLEKHM2Q8IWE5 1019 aa5.9□□□□□ -1.47
CCDC82-202ENST00000423339 CCDC82Q8N4S0 544 aa5.9□□□□□ -1.47
CCDC82-202ENST00000423339 NOD1Q9Y239 953 aa5.9□□□□□ -1.47
CCDC82-202ENST00000423339 C1orf53Q5VUE5 145 aa5.89□□□□□ -1.47
CCDC82-202ENST00000423339 ILDR2Q71H61 639 aa5.89□□□□□ -1.47
CCDC82-202ENST00000423339 ZDHHC1Q8WTX9 485 aa5.89□□□□□ -1.47
CCDC82-202ENST00000423339 CCDC97Q96F63 343 aaPredicted RBP5.89□□□□□ -1.47
CCDC82-202ENST00000423339 MEGF10Q96KG7 1140 aa5.89□□□□□ -1.47
CCDC82-202ENST00000423339 MKRN1Q9UHC7 482 aaKnown RBP5.89□□□□□ -1.47
CCDC82-202ENST00000423339 CHMP3Q9Y3E7 222 aa5.89□□□□□ -1.47
CCDC82-202ENST00000423339 SERTM1A2A2V5 107 aa5.88□□□□□ -1.47
CCDC82-202ENST00000423339 GTF2IP78347 998 aa5.88□□□□□ -1.47
CCDC82-202ENST00000423339 DCAF11Q8TEB1 546 aa5.88□□□□□ -1.47
CCDC82-202ENST00000423339 ARID3AQ99856 593 aa5.88□□□□□ -1.47
CCDC82-202ENST00000423339 IGFLR1Q9H665 355 aa5.88□□□□□ -1.47
CCDC82-202ENST00000423339 PCDHGA11Q9Y5H2 935 aa5.88□□□□□ -1.47
CCDC82-202ENST00000423339 GRIK1P39086 918 aa5.88□□□□□ -1.47
CCDC82-202ENST00000423339 CDCA8Q53HL2 280 aa5.88□□□□□ -1.47
CCDC82-202ENST00000423339 INTS5Q6P9B9 1019 aaKnown RBP5.88□□□□□ -1.47
CCDC82-202ENST00000423339 WFDC8Q8IUA0 241 aa5.88□□□□□ -1.47
CCDC82-202ENST00000423339 SERPINA10Q9UK55 444 aa5.88□□□□□ -1.47
CCDC82-202ENST00000423339 CLDN10P78369 228 aa5.87□□□□□ -1.47
CCDC82-202ENST00000423339 HIF1AQ16665 826 aa5.87□□□□□ -1.47
CCDC82-202ENST00000423339 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP5.87□□□□□ -1.47
CCDC82-202ENST00000423339 AKTIPQ9H8T0 292 aa5.87□□□□□ -1.47
CCDC82-202ENST00000423339 DNAJB12Q9NXW2 375 aaKnown RBP5.87□□□□□ -1.47
CCDC82-202ENST00000423339 PSME1Q06323 249 aa5.86□□□□□ -1.47
CCDC82-202ENST00000423339 DZIP1LQ8IYY4 767 aaKnown RBP5.86□□□□□ -1.47
CCDC82-202ENST00000423339 OGFOD1Q8N543 542 aa5.86□□□□□ -1.47
CCDC82-202ENST00000423339 C7orf43Q8WVR3 580 aa5.86□□□□□ -1.47
CCDC82-202ENST00000423339 PNMA5Q96PV4 448 aa5.86□□□□□ -1.47
CCDC82-202ENST00000423339 FRRS1LQ9P0K9 344 aa5.86□□□□□ -1.47
CCDC82-202ENST00000423339 KIAA1024Q9UPX6 916 aa5.86□□□□□ -1.47
CCDC82-202ENST00000423339 SFI1A8K8P3 1242 aa5.85□□□□□ -1.47
CCDC82-202ENST00000423339 ZBTB7BO15156 539 aaPredicted RBP5.85□□□□□ -1.47
CCDC82-202ENST00000423339 RASA1P20936 1047 aa5.85□□□□□ -1.47
CCDC82-202ENST00000423339 TYRO3Q06418 890 aa5.85□□□□□ -1.47
CCDC82-202ENST00000423339 TRIM50Q86XT4 487 aa5.85□□□□□ -1.47
CCDC82-202ENST00000423339 VRTNQ9H8Y1 702 aa5.85□□□□□ -1.47
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 149 ms