RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000415046.6

PTPRK-209, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, humanhuman

TSL 5

Gene PTPRK, Length 1,029 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRK-209ENST00000415046 KCNH4Q9UQ05 1017 aa8.59□□□□□ -1.03
PTPRK-209ENST00000415046 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP8.58□□□□□ -1.04
PTPRK-209ENST00000415046 ALAS2P22557 587 aa8.58□□□□□ -1.04
PTPRK-209ENST00000415046 NEUROD1Q13562 356 aa8.58□□□□□ -1.04
PTPRK-209ENST00000415046 RTN1Q16799 776 aa8.58□□□□□ -1.04
PTPRK-209ENST00000415046 IER5Q5VY09 327 aa8.58□□□□□ -1.04
PTPRK-209ENST00000415046 BTLAQ7Z6A9 289 aa8.58□□□□□ -1.04
PTPRK-209ENST00000415046 TRIM11Q96F44 468 aa8.58□□□□□ -1.04
PTPRK-209ENST00000415046 NGLY1Q96IV0 654 aa8.58□□□□□ -1.04
PTPRK-209ENST00000415046 UNC13AQ9UPW8 1703 aa8.57□□□□□ -1.04
PTPRK-209ENST00000415046 NACADO15069 1562 aa8.57□□□□□ -1.04
PTPRK-209ENST00000415046 RAB44Q7Z6P3 723 aaPredicted RBP8.57□□□□□ -1.04
PTPRK-209ENST00000415046 LGR5O75473 907 aa8.56□□□□□ -1.04
PTPRK-209ENST00000415046 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP8.56□□□□□ -1.04
PTPRK-209ENST00000415046 TGFBR3LH3BV60 316 aa8.55□□□□□ -1.04
PTPRK-209ENST00000415046 ADH7P40394 386 aa8.55□□□□□ -1.04
PTPRK-209ENST00000415046 FOXO3O43524 673 aa8.54□□□□□ -1.04
PTPRK-209ENST00000415046 WEE1P30291 646 aa8.54□□□□□ -1.04
PTPRK-209ENST00000415046 PRDM6Q9NQX0 595 aa8.54□□□□□ -1.04
PTPRK-209ENST00000415046 DMGDHQ9UI17 866 aaKnown RBP8.54□□□□□ -1.04
PTPRK-209ENST00000415046 BCS1LQ9Y276 419 aa8.54□□□□□ -1.04
PTPRK-209ENST00000415046 STARD13Q9Y3M8 1113 aa8.54□□□□□ -1.04
PTPRK-209ENST00000415046 C1QTNF9BB2RNN3 333 aa8.53□□□□□ -1.04
PTPRK-209ENST00000415046 CD163Q86VB7 1156 aa8.53□□□□□ -1.04
PTPRK-209ENST00000415046 PLVAPQ9BX97 442 aa8.53□□□□□ -1.04
PTPRK-209ENST00000415046 EFCC1Q9HA90 598 aa8.53□□□□□ -1.04
PTPRK-209ENST00000415046 M0R082 166 aa8.52□□□□□ -1.05
PTPRK-209ENST00000415046 ADAM23O75077 832 aa8.52□□□□□ -1.05
PTPRK-209ENST00000415046 ALBP02768 609 aa8.52□□□□□ -1.05
PTPRK-209ENST00000415046 CHRNA4P43681 627 aa8.52□□□□□ -1.05
PTPRK-209ENST00000415046 BAG6P46379 1132 aa8.52□□□□□ -1.05
PTPRK-209ENST00000415046 COL9A3Q14050 684 aaPredicted RBP8.52□□□□□ -1.05
PTPRK-209ENST00000415046 ZNF417Q8TAU3 575 aa8.52□□□□□ -1.05
PTPRK-209ENST00000415046 BHMTQ93088 406 aa8.52□□□□□ -1.05
PTPRK-209ENST00000415046 ZNF587Q96SQ5 575 aaPredicted RBP8.52□□□□□ -1.05
PTPRK-209ENST00000415046 SPATA31C1P0DKV0 1188 aa8.51□□□□□ -1.05
PTPRK-209ENST00000415046 MICALL1Q8N3F8 863 aa8.51□□□□□ -1.05
PTPRK-209ENST00000415046 FAM200AQ8TCP9 573 aa8.51□□□□□ -1.05
PTPRK-209ENST00000415046 QTRT2Q9H974 415 aaKnown RBP8.51□□□□□ -1.05
PTPRK-209ENST00000415046 SPDYE3A6NKU9 549 aa8.5□□□□□ -1.05
PTPRK-209ENST00000415046 C20orf204Q6ZNR8 217 aa8.5□□□□□ -1.05
PTPRK-209ENST00000415046 MYO19Q96H55 970 aa8.5□□□□□ -1.05
PTPRK-209ENST00000415046 KLK14Q9P0G3 267 aa8.5□□□□□ -1.05
PTPRK-209ENST00000415046 NOVA2Q9UNW9 492 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
PTPRK-209ENST00000415046 GRNP28799 593 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
PTPRK-209ENST00000415046 GSX2Q9BZM3 304 aa8.49□□□□□ -1.05
PTPRK-209ENST00000415046 NID1P14543 1247 aa8.48□□□□□ -1.05
PTPRK-209ENST00000415046 EPB42P16452 691 aa8.48□□□□□ -1.05
PTPRK-209ENST00000415046 RFX1P22670 979 aa8.48□□□□□ -1.05
PTPRK-209ENST00000415046 INPP5BP32019 993 aa8.48□□□□□ -1.05
PTPRK-209ENST00000415046 IDH3AP50213 366 aa8.48□□□□□ -1.05
PTPRK-209ENST00000415046 DGKZQ13574 1117 aa8.48□□□□□ -1.05
PTPRK-209ENST00000415046 CCINQ13939 588 aa8.48□□□□□ -1.05
PTPRK-209ENST00000415046 CDCA8Q53HL2 280 aa8.48□□□□□ -1.05
PTPRK-209ENST00000415046 UBE2OQ9C0C9 1292 aaKnown RBP8.48□□□□□ -1.05
PTPRK-209ENST00000415046 SLC6A14Q9UN76 642 aa8.48□□□□□ -1.05
PTPRK-209ENST00000415046 MYO15BQ96JP2 1530 aa8.48□□□□□ -1.05
PTPRK-209ENST00000415046 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa8.48□□□□□ -1.05
PTPRK-209ENST00000415046 K7ELQ4 463 aaPredicted RBP8.47□□□□□ -1.05
PTPRK-209ENST00000415046 ELOAQ14241 798 aaKnown RBP8.47□□□□□ -1.05
PTPRK-209ENST00000415046 SWI5Q1ZZU3 235 aa8.47□□□□□ -1.05
PTPRK-209ENST00000415046 PRRT3Q5FWE3 981 aa8.47□□□□□ -1.05
PTPRK-209ENST00000415046 C8orf86Q6ZUL3 223 aa8.47□□□□□ -1.05
PTPRK-209ENST00000415046 VTI1AQ96AJ9 217 aa8.47□□□□□ -1.05
PTPRK-209ENST00000415046 ZMIZ1Q9ULJ6 1067 aa8.47□□□□□ -1.05
PTPRK-209ENST00000415046 GTF3C5Q9Y5Q8 519 aaPredicted RBP8.47□□□□□ -1.05
PTPRK-209ENST00000415046 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP8.47□□□□□ -1.05
PTPRK-209ENST00000415046 NFKB1P19838 968 aa8.46□□□□□ -1.06
PTPRK-209ENST00000415046 ARSDP51689 593 aa8.46□□□□□ -1.06
PTPRK-209ENST00000415046 TBC1D8BQ0IIM8 1120 aa8.46□□□□□ -1.06
PTPRK-209ENST00000415046 PNMA5Q96PV4 448 aa8.46□□□□□ -1.06
PTPRK-209ENST00000415046 DNAJB12Q9NXW2 375 aaKnown RBP8.46□□□□□ -1.06
PTPRK-209ENST00000415046 FKBP5Q13451 457 aaPredicted RBP8.45□□□□□ -1.06
PTPRK-209ENST00000415046 C11orf91Q3C1V1 193 aa8.45□□□□□ -1.06
PTPRK-209ENST00000415046 C11orf16Q9NQ32 467 aa8.45□□□□□ -1.06
PTPRK-209ENST00000415046 NAGPAQ9UK23 515 aa8.45□□□□□ -1.06
PTPRK-209ENST00000415046 LILRB5O75023 590 aa8.44□□□□□ -1.06
PTPRK-209ENST00000415046 FURINP09958 794 aa8.44□□□□□ -1.06
PTPRK-209ENST00000415046 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP8.44□□□□□ -1.06
PTPRK-209ENST00000415046 UTP3Q9NQZ2 479 aaKnown RBP eCLIP8.44□□□□□ -1.06
PTPRK-209ENST00000415046 SCRIBQ14160 1630 aa8.43□□□□□ -1.06
PTPRK-209ENST00000415046 MICAL2O94851 1124 aa8.43□□□□□ -1.06
PTPRK-209ENST00000415046 MAP3K6O95382 1288 aa8.43□□□□□ -1.06
PTPRK-209ENST00000415046 FAM69CQ0P6D2 419 aa8.43□□□□□ -1.06
PTPRK-209ENST00000415046 OCLNQ16625 522 aa8.43□□□□□ -1.06
PTPRK-209ENST00000415046 IGFLR1Q9H665 355 aa8.43□□□□□ -1.06
PTPRK-209ENST00000415046 LRFN2Q9ULH4 789 aa8.43□□□□□ -1.06
PTPRK-209ENST00000415046 FAM229AH3BQW9 127 aa8.42□□□□□ -1.06
PTPRK-209ENST00000415046 STK32AQ8WU08 396 aa8.42□□□□□ -1.06
PTPRK-209ENST00000415046 JPH1Q9HDC5 661 aaPredicted RBP8.42□□□□□ -1.06
PTPRK-209ENST00000415046 TRBV21OR9-2A0A075B6F4 123 aaPredicted RBP8.41□□□□□ -1.06
PTPRK-209ENST00000415046 APBA3O96018 575 aa8.41□□□□□ -1.06
PTPRK-209ENST00000415046 GATA4P43694 442 aa8.41□□□□□ -1.06
PTPRK-209ENST00000415046 TRIM28Q13263 835 aaKnown RBP8.41□□□□□ -1.06
PTPRK-209ENST00000415046 PSAPL1Q6NUJ1 521 aa8.41□□□□□ -1.06
PTPRK-209ENST00000415046 IFT43Q96FT9 208 aa8.41□□□□□ -1.06
PTPRK-209ENST00000415046 PRIMPOLQ96LW4 560 aa8.41□□□□□ -1.06
PTPRK-209ENST00000415046 ZFATQ9P243 1243 aa8.41□□□□□ -1.06
PTPRK-209ENST00000415046 PRMT3O60678 531 aa8.4□□□□□ -1.06
PTPRK-209ENST00000415046 ATG7O95352 703 aa8.4□□□□□ -1.06
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