RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000405333.5

ODC1-202, Transcript of ornithine decarboxylase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene ODC1, Length 1,943 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODC1-202ENST00000405333 NLRP10Q86W26 655 aa25.09■■□□□ 1.61
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ODC1-202ENST00000405333 SMARCA5O60264 1052 aaPredicted RBP25.08■■□□□ 1.6
ODC1-202ENST00000405333 TXNRD1Q16881 649 aa25.08■■□□□ 1.6
ODC1-202ENST00000405333 FAM89AQ96GI7 184 aa25.08■■□□□ 1.6
ODC1-202ENST00000405333 ZNF34Q8IZ26 560 aa25.07■■□□□ 1.6
ODC1-202ENST00000405333 PHF14O94880 888 aa25.06■■□□□ 1.6
ODC1-202ENST00000405333 HSP90AB3PQ58FF7 597 aa25.06■■□□□ 1.6
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ODC1-202ENST00000405333 SRP68Q9UHB9 627 aaKnown RBP25.06■■□□□ 1.6
ODC1-202ENST00000405333 PA2G4Q9UQ80 394 aaKnown RBP25.06■■□□□ 1.6
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ODC1-202ENST00000405333 FOXO4P98177 505 aa25.05■■□□□ 1.6
ODC1-202ENST00000405333 SLC27A3Q5K4L6 730 aa25.05■■□□□ 1.6
ODC1-202ENST00000405333 HDAC5Q9UQL6 1122 aa25.05■■□□□ 1.6
ODC1-202ENST00000405333 C4AP0C0L4 1744 aa25.05■■□□□ 1.6
ODC1-202ENST00000405333 AK7Q96M32 723 aa25.04■■□□□ 1.6
ODC1-202ENST00000405333 UBR3Q6ZT12 1888 aa25.04■■□□□ 1.6
ODC1-202ENST00000405333 SCN7AQ01118 1682 aa25.04■■□□□ 1.6
ODC1-202ENST00000405333 SURF6O75683 361 aaKnown RBP25.04■■□□□ 1.6
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ODC1-202ENST00000405333 FAM177BA6PVY3 158 aa25.03■■□□□ 1.6
ODC1-202ENST00000405333 C16orf71Q8IYS4 520 aaPredicted RBP25.03■■□□□ 1.6
ODC1-202ENST00000405333 ZBTB38Q8NAP3 1195 aaPredicted RBP25.03■■□□□ 1.6
ODC1-202ENST00000405333 PLSCR1O15162 318 aa25.02■■□□□ 1.6
ODC1-202ENST00000405333 PCCAP05165 728 aaPredicted RBP25.02■■□□□ 1.6
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ODC1-202ENST00000405333 USPL1Q5W0Q7 1092 aa25.02■■□□□ 1.6
ODC1-202ENST00000405333 SUSD4Q5VX71 490 aa25.02■■□□□ 1.6
ODC1-202ENST00000405333 LMBR1LQ6UX01 489 aa25.02■■□□□ 1.6
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ODC1-202ENST00000405333 BICDL1Q6ZP65 573 aa24.98■■□□□ 1.59
ODC1-202ENST00000405333 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa24.98■■□□□ 1.59
ODC1-202ENST00000405333 CHMP3Q9Y3E7 222 aa24.98■■□□□ 1.59
ODC1-202ENST00000405333 RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 228 aaKnown RBP24.98■■□□□ 1.59
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ODC1-202ENST00000405333 SIL1Q9H173 461 aa24.98■■□□□ 1.59
ODC1-202ENST00000405333 ZNF652Q9Y2D9 606 aa24.98■■□□□ 1.59
ODC1-202ENST00000405333 ZPR1O75312 459 aa24.97■■□□□ 1.59
ODC1-202ENST00000405333 CLEC4GQ6UXB4 293 aa24.97■■□□□ 1.59
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ODC1-202ENST00000405333 ZNF827Q17R98 1081 aa24.96■■□□□ 1.59
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ODC1-202ENST00000405333 UTP14AQ9BVJ6 771 aaKnown RBP24.94■■□□□ 1.58
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ODC1-202ENST00000405333 OS9Q13438 667 aaPredicted RBP24.94■■□□□ 1.58
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ODC1-202ENST00000405333 PARP10Q53GL7 1025 aa24.93■■□□□ 1.58
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ODC1-202ENST00000405333 EN1Q05925 392 aaPredicted RBP24.92■■□□□ 1.58
ODC1-202ENST00000405333 FAM161AQ3B820 660 aa24.92■■□□□ 1.58
ODC1-202ENST00000405333 DDX60Q8IY21 1712 aaKnown RBP24.92■■□□□ 1.58
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ODC1-202ENST00000405333 SH3TC1Q8TE82 1336 aa24.92■■□□□ 1.58
ODC1-202ENST00000405333 RAB11FIP3O75154 756 aa24.92■■□□□ 1.58
ODC1-202ENST00000405333 ZNF594Q96JF6 807 aaPredicted RBP24.92■■□□□ 1.58
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ODC1-202ENST00000405333 RGPD3A6NKT7 1758 aaPredicted RBP24.91■■□□□ 1.58
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ODC1-202ENST00000405333 AKT1S1Q96B36 256 aa24.9■■□□□ 1.58
ODC1-202ENST00000405333 CSF1RP07333 972 aa24.9■■□□□ 1.58
ODC1-202ENST00000405333 ADRA2BP18089 450 aa24.9■■□□□ 1.58
ODC1-202ENST00000405333 CTSWP56202 376 aa24.9■■□□□ 1.58
ODC1-202ENST00000405333 TSHZ3Q63HK5 1081 aa24.9■■□□□ 1.58
ODC1-202ENST00000405333 KIF1BPQ96EK5 621 aa24.9■■□□□ 1.58
ODC1-202ENST00000405333 SSFA2P28290 1259 aa24.89■■□□□ 1.58
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ODC1-202ENST00000405333 GREM2Q9H772 168 aa24.89■■□□□ 1.58
ODC1-202ENST00000405333 TFCP2L1Q9NZI6 479 aa24.89■■□□□ 1.58
ODC1-202ENST00000405333 G3BP1Q13283 466 aaKnown RBP eCLIP24.88■■□□□ 1.57
ODC1-202ENST00000405333 COL24A1Q17RW2 1714 aa24.88■■□□□ 1.57
ODC1-202ENST00000405333 C8orf34Q49A92 452 aa24.88■■□□□ 1.57
ODC1-202ENST00000405333 CAMKK2Q96RR4 588 aa24.88■■□□□ 1.57
ODC1-202ENST00000405333 RGL2O15211 777 aa24.88■■□□□ 1.57
ODC1-202ENST00000405333 PDE8AO60658 829 aa24.88■■□□□ 1.57
ODC1-202ENST00000405333 ERFEQ4G0M1 354 aa24.88■■□□□ 1.57
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