RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000399312.2

MRPS6-201, Transcript of mitochondrial ribosomal protein S6, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene MRPS6, Length 990 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPS6-201ENST00000399312 JDP2Q8WYK2 163 aa20.38■□□□□ 0.85
MRPS6-201ENST00000399312 CRAMP1Q96RY5 1269 aa20.38■□□□□ 0.85
MRPS6-201ENST00000399312 HYPKQ9NX55 129 aa20.38■□□□□ 0.85
MRPS6-201ENST00000399312 WDR90Q96KV7 1748 aa20.38■□□□□ 0.85
MRPS6-201ENST00000399312 HSP90B1P14625 803 aaKnown RBP20.37■□□□□ 0.85
MRPS6-201ENST00000399312 HOXA10P31260 410 aaPredicted RBP20.37■□□□□ 0.85
MRPS6-201ENST00000399312 AIMP1Q12904 312 aaKnown RBP20.37■□□□□ 0.85
MRPS6-201ENST00000399312 SUSD4Q5VX71 490 aa20.37■□□□□ 0.85
MRPS6-201ENST00000399312 C7orf43Q8WVR3 580 aa20.37■□□□□ 0.85
MRPS6-201ENST00000399312 PSMD1Q99460 953 aa20.37■□□□□ 0.85
MRPS6-201ENST00000399312 IFT57Q9NWB7 429 aa20.37■□□□□ 0.85
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MRPS6-201ENST00000399312 NTSR2O95665 410 aa20.36■□□□□ 0.85
MRPS6-201ENST00000399312 PDIA6Q15084 440 aa20.36■□□□□ 0.85
MRPS6-201ENST00000399312 XAGE3Q8WTP9 111 aa20.36■□□□□ 0.85
MRPS6-201ENST00000399312 ABCC12Q96J65 1359 aa20.35■□□□□ 0.85
MRPS6-201ENST00000399312 TCIRG1Q13488 830 aa20.35■□□□□ 0.85
MRPS6-201ENST00000399312 NECTIN2Q92692 538 aa20.35■□□□□ 0.85
MRPS6-201ENST00000399312 ANKRD36CQ5JPF3 1778 aa20.35■□□□□ 0.85
MRPS6-201ENST00000399312 SH3TC1Q8TE82 1336 aa20.34■□□□□ 0.85
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MRPS6-201ENST00000399312 ANP32CO43423 234 aa20.34■□□□□ 0.85
MRPS6-201ENST00000399312 IARSP41252 1262 aaKnown RBP20.34■□□□□ 0.85
MRPS6-201ENST00000399312 SUPT20HQ8NEM7 779 aa20.34■□□□□ 0.85
MRPS6-201ENST00000399312 PLBD2Q8NHP8 589 aa20.34■□□□□ 0.85
MRPS6-201ENST00000399312 TRMT112Q9UI30 125 aaKnown RBP20.34■□□□□ 0.85
MRPS6-201ENST00000399312 CEP350Q5VT06 3117 aa20.33■□□□□ 0.85
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MRPS6-201ENST00000399312 SLC10A5Q5PT55 438 aa20.33■□□□□ 0.85
MRPS6-201ENST00000399312 DUSP27Q5VZP5 1158 aa20.33■□□□□ 0.85
MRPS6-201ENST00000399312 ANKRD13DQ6ZTN6 518 aa20.33■□□□□ 0.85
MRPS6-201ENST00000399312 TMC4Q7Z404 712 aa20.33■□□□□ 0.85
MRPS6-201ENST00000399312 LRP10Q7Z4F1 713 aa20.33■□□□□ 0.85
MRPS6-201ENST00000399312 VPS33BQ9H267 617 aa20.33■□□□□ 0.85
MRPS6-201ENST00000399312 CHPF2Q9P2E5 772 aa20.33■□□□□ 0.85
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MRPS6-201ENST00000399312 GOLGA2Q08379 1002 aa20.32■□□□□ 0.84
MRPS6-201ENST00000399312 PROSER3Q2NL68 480 aa20.32■□□□□ 0.84
MRPS6-201ENST00000399312 SYNE4Q8N205 404 aa20.32■□□□□ 0.84
MRPS6-201ENST00000399312 ZNF277Q9NRM2 450 aaPredicted RBP20.32■□□□□ 0.84
MRPS6-201ENST00000399312 MBIPQ9NS73 344 aa20.32■□□□□ 0.84
MRPS6-201ENST00000399312 SCN4AP35499 1836 aa20.32■□□□□ 0.84
MRPS6-201ENST00000399312 ANXA1P04083 346 aa20.31■□□□□ 0.84
MRPS6-201ENST00000399312 DDX46Q7L014 1031 aaKnown RBP20.31■□□□□ 0.84
MRPS6-201ENST00000399312 L3MBTL3Q96JM7 780 aaPredicted RBP20.31■□□□□ 0.84
MRPS6-201ENST00000399312 BBOX1O75936 387 aa20.3■□□□□ 0.84
MRPS6-201ENST00000399312 DDX58O95786 925 aaKnown RBP20.3■□□□□ 0.84
MRPS6-201ENST00000399312 NLRP10Q86W26 655 aa20.3■□□□□ 0.84
MRPS6-201ENST00000399312 DDNO94850 711 aaPredicted RBP20.29■□□□□ 0.84
MRPS6-201ENST00000399312 CHADLQ6NUI6 762 aa20.29■□□□□ 0.84
MRPS6-201ENST00000399312 PNMA8AQ86V59 439 aaPredicted RBP20.29■□□□□ 0.84
MRPS6-201ENST00000399312 ZNF853P0CG23 659 aa20.28■□□□□ 0.84
MRPS6-201ENST00000399312 LMOD1P29536 600 aaPredicted RBP20.28■□□□□ 0.84
MRPS6-201ENST00000399312 CCDC30Q5VVM6 783 aa20.28■□□□□ 0.84
MRPS6-201ENST00000399312 RIC3Q7Z5B4 369 aa20.28■□□□□ 0.84
MRPS6-201ENST00000399312 GPC2Q8N158 579 aa20.28■□□□□ 0.84
MRPS6-201ENST00000399312 LARGE2Q8N3Y3 721 aa20.28■□□□□ 0.84
MRPS6-201ENST00000399312 HACL1Q9UJ83 578 aa20.28■□□□□ 0.84
MRPS6-201ENST00000399312 ATP6V0A2Q9Y487 856 aa20.28■□□□□ 0.84
MRPS6-201ENST00000399312 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP20.27■□□□□ 0.84
MRPS6-201ENST00000399312 KRT24Q2M2I5 525 aa20.27■□□□□ 0.84
MRPS6-201ENST00000399312 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP20.27■□□□□ 0.84
MRPS6-201ENST00000399312 LDHDQ86WU2 507 aa20.27■□□□□ 0.84
MRPS6-201ENST00000399312 NIM1KQ8IY84 436 aa20.27■□□□□ 0.84
MRPS6-201ENST00000399312 FZD9O00144 591 aa20.26■□□□□ 0.83
MRPS6-201ENST00000399312 CCDC27Q2M243 656 aa20.26■□□□□ 0.83
MRPS6-201ENST00000399312 KLRG1Q96E93 195 aa20.26■□□□□ 0.83
MRPS6-201ENST00000399312 STK31Q9BXU1 1019 aa20.26■□□□□ 0.83
MRPS6-201ENST00000399312 MRS2Q9HD23 443 aa20.25■□□□□ 0.83
MRPS6-201ENST00000399312 TRIM28Q13263 835 aaKnown RBP20.24■□□□□ 0.83
MRPS6-201ENST00000399312 GRAPQ13588 217 aa20.24■□□□□ 0.83
MRPS6-201ENST00000399312 DPP8Q6V1X1 898 aaPredicted RBP20.24■□□□□ 0.83
MRPS6-201ENST00000399312 SP8Q8IXZ3 490 aa20.24■□□□□ 0.83
MRPS6-201ENST00000399312 GRAPLQ8TC17 118 aaPredicted RBP20.24■□□□□ 0.83
MRPS6-201ENST00000399312 ABCC4O15439 1325 aa20.24■□□□□ 0.83
MRPS6-201ENST00000399312 POTECB2RU33 542 aa20.23■□□□□ 0.83
MRPS6-201ENST00000399312 PPIP5K2O43314 1243 aa20.23■□□□□ 0.83
MRPS6-201ENST00000399312 HCLS1P14317 486 aaPredicted RBP20.23■□□□□ 0.83
MRPS6-201ENST00000399312 OLFM4Q6UX06 510 aa20.23■□□□□ 0.83
MRPS6-201ENST00000399312 ISCA1Q9BUE6 129 aa20.23■□□□□ 0.83
MRPS6-201ENST00000399312 TAF1DQ9H5J8 278 aaPredicted RBP20.23■□□□□ 0.83
MRPS6-201ENST00000399312 TCERG1O14776 1098 aaKnown RBP20.22■□□□□ 0.83
MRPS6-201ENST00000399312 MPNDQ8N594 471 aa20.22■□□□□ 0.83
MRPS6-201ENST00000399312 DNAJC5GQ8N7S2 189 aa20.22■□□□□ 0.83
MRPS6-201ENST00000399312 CLEC11AQ9Y240 323 aa20.22■□□□□ 0.83
MRPS6-201ENST00000399312 IL16Q14005 1332 aa20.22■□□□□ 0.83
MRPS6-201ENST00000399312 EPHX2P34913 555 aa20.21■□□□□ 0.83
MRPS6-201ENST00000399312 NEXNQ0ZGT2 675 aa20.21■□□□□ 0.83
MRPS6-201ENST00000399312 EAPPQ56P03 285 aaPredicted RBP20.21■□□□□ 0.83
MRPS6-201ENST00000399312 GJA3Q9Y6H8 435 aa20.21■□□□□ 0.83
MRPS6-201ENST00000399312 ZNF541Q9H0D2 1346 aa20.21■□□□□ 0.83
MRPS6-201ENST00000399312 ELL2O00472 640 aaPredicted RBP20.2■□□□□ 0.82
MRPS6-201ENST00000399312 CCDC191Q8NCU4 936 aa20.2■□□□□ 0.82
MRPS6-201ENST00000399312 CREBZFQ9NS37 354 aa20.2■□□□□ 0.82
MRPS6-201ENST00000399312 SNED1Q8TER0 1413 aa20.19■□□□□ 0.82
MRPS6-201ENST00000399312 LAMB2P55268 1798 aa20.19■□□□□ 0.82
MRPS6-201ENST00000399312 ATP5J2-PTCD1G3V325 749 aa20.19■□□□□ 0.82
MRPS6-201ENST00000399312 SF3B3Q15393 1217 aaKnown RBP20.19■□□□□ 0.82
MRPS6-201ENST00000399312 ZBTB38Q8NAP3 1195 aaPredicted RBP20.19■□□□□ 0.82
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