RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000377078.2

USP11-202, Transcript of ubiquitin specific peptidase 11, humanhuman

TSL 5

Gene USP11, Length 1,077 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP11-202ENST00000377078 HYPKQ9NX55 129 aa22.23■■□□□ 1.15
USP11-202ENST00000377078 FER1L6Q2WGJ9 1857 aa22.22■■□□□ 1.15
USP11-202ENST00000377078 GLTPD2A6NH11 291 aa22.22■■□□□ 1.15
USP11-202ENST00000377078 RTKN2Q8IZC4 609 aa22.22■■□□□ 1.15
USP11-202ENST00000377078 HSPA6P17066 643 aa22.21■■□□□ 1.15
USP11-202ENST00000377078 PRELPP51888 382 aa22.21■■□□□ 1.15
USP11-202ENST00000377078 CCDC184Q52MB2 194 aa22.21■■□□□ 1.15
USP11-202ENST00000377078 C7orf43Q8WVR3 580 aa22.21■■□□□ 1.15
USP11-202ENST00000377078 RBM17Q96I25 401 aaKnown RBP22.21■■□□□ 1.15
USP11-202ENST00000377078 NLRP3Q96P20 1036 aa22.21■■□□□ 1.15
USP11-202ENST00000377078 RRAGCQ9HB90 399 aa22.21■■□□□ 1.15
USP11-202ENST00000377078 TNRC6CQ9HCJ0 1690 aaKnown RBP22.2■■□□□ 1.15
USP11-202ENST00000377078 TIAM2Q8IVF5 1701 aa22.2■■□□□ 1.14
USP11-202ENST00000377078 TCIRG1Q13488 830 aa22.2■■□□□ 1.14
USP11-202ENST00000377078 CC2D2BQ6DHV5 1058 aa22.2■■□□□ 1.14
USP11-202ENST00000377078 PLBD2Q8NHP8 589 aa22.2■■□□□ 1.14
USP11-202ENST00000377078 RBM46Q8TBY0 533 aaKnown RBP22.2■■□□□ 1.14
USP11-202ENST00000377078 TMX4Q9H1E5 349 aaPredicted RBP22.2■■□□□ 1.14
USP11-202ENST00000377078 HOXA10P31260 410 aaPredicted RBP22.19■■□□□ 1.14
USP11-202ENST00000377078 FKBP4Q02790 459 aaKnown RBP eCLIP22.19■■□□□ 1.14
USP11-202ENST00000377078 CCDC27Q2M243 656 aa22.19■■□□□ 1.14
USP11-202ENST00000377078 ANKRD13DQ6ZTN6 518 aa22.19■■□□□ 1.14
USP11-202ENST00000377078 NLRP10Q86W26 655 aa22.19■■□□□ 1.14
USP11-202ENST00000377078 CCDC88AQ3V6T2 1871 aa22.19■■□□□ 1.14
USP11-202ENST00000377078 VEGFAP15692 232 aaPredicted RBP22.18■■□□□ 1.14
USP11-202ENST00000377078 GRIPAP1Q4V328 841 aa22.18■■□□□ 1.14
USP11-202ENST00000377078 TRMT112Q9UI30 125 aaKnown RBP22.18■■□□□ 1.14
USP11-202ENST00000377078 SLC10A5Q5PT55 438 aa22.17■■□□□ 1.14
USP11-202ENST00000377078 CRAMP1Q96RY5 1269 aa22.17■■□□□ 1.14
USP11-202ENST00000377078 ANKRD36CQ5JPF3 1778 aa22.17■■□□□ 1.14
USP11-202ENST00000377078 SH3TC1Q8TE82 1336 aa22.16■■□□□ 1.14
USP11-202ENST00000377078 ELL2O00472 640 aaPredicted RBP22.16■■□□□ 1.14
USP11-202ENST00000377078 GOLGA2Q08379 1002 aa22.16■■□□□ 1.14
USP11-202ENST00000377078 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP22.16■■□□□ 1.14
USP11-202ENST00000377078 CEP350Q5VT06 3117 aa22.15■■□□□ 1.14
USP11-202ENST00000377078 FSTL1Q12841 308 aa22.15■■□□□ 1.14
USP11-202ENST00000377078 CCDC30Q5VVM6 783 aa22.15■■□□□ 1.14
USP11-202ENST00000377078 DICER1Q9UPY3 1922 aaKnown RBP22.15■■□□□ 1.14
USP11-202ENST00000377078 PPEF1O14829 653 aaPredicted RBP22.14■■□□□ 1.13
USP11-202ENST00000377078 RIC3Q7Z5B4 369 aa22.14■■□□□ 1.13
USP11-202ENST00000377078 WWC1Q8IX03 1113 aa22.14■■□□□ 1.13
USP11-202ENST00000377078 APLP1P51693 650 aa22.13■■□□□ 1.13
USP11-202ENST00000377078 PSMD1Q99460 953 aa22.13■■□□□ 1.13
USP11-202ENST00000377078 ZNF277Q9NRM2 450 aaPredicted RBP22.13■■□□□ 1.13
USP11-202ENST00000377078 IL16Q14005 1332 aa22.12■■□□□ 1.13
USP11-202ENST00000377078 DDX58O95786 925 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
USP11-202ENST00000377078 OLFM4Q6UX06 510 aa22.12■■□□□ 1.13
USP11-202ENST00000377078 SYNE4Q8N205 404 aa22.12■■□□□ 1.13
USP11-202ENST00000377078 C8orf58Q8NAV2 365 aa22.12■■□□□ 1.13
USP11-202ENST00000377078 SMC1BQ8NDV3 1235 aa22.12■■□□□ 1.13
USP11-202ENST00000377078 HCLS1P14317 486 aaPredicted RBP22.11■■□□□ 1.13
USP11-202ENST00000377078 IARSP41252 1262 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
USP11-202ENST00000377078 C3orf67Q6ZVT6 689 aa22.11■■□□□ 1.13
USP11-202ENST00000377078 DDX46Q7L014 1031 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
USP11-202ENST00000377078 JDP2Q8WYK2 163 aa22.1■■□□□ 1.13
USP11-202ENST00000377078 TSR2Q969E8 191 aaKnown RBP22.1■■□□□ 1.13
USP11-202ENST00000377078 ISCA1Q9BUE6 129 aa22.1■■□□□ 1.13
USP11-202ENST00000377078 STK31Q9BXU1 1019 aa22.1■■□□□ 1.13
USP11-202ENST00000377078 ATP5J2-PTCD1G3V325 749 aa22.09■■□□□ 1.13
USP11-202ENST00000377078 TCERG1O14776 1098 aaKnown RBP22.09■■□□□ 1.13
USP11-202ENST00000377078 BBOX1O75936 387 aa22.09■■□□□ 1.13
USP11-202ENST00000377078 HSP90B1P14625 803 aaKnown RBP22.09■■□□□ 1.13
USP11-202ENST00000377078 TRIM28Q13263 835 aaKnown RBP22.09■■□□□ 1.13
USP11-202ENST00000377078 WDR90Q96KV7 1748 aa22.09■■□□□ 1.13
USP11-202ENST00000377078 IQCA1LA6NCM1 817 aa22.08■■□□□ 1.13
USP11-202ENST00000377078 ATP6V0A2Q9Y487 856 aa22.08■■□□□ 1.13
USP11-202ENST00000377078 ABCC4O15439 1325 aa22.07■■□□□ 1.12
USP11-202ENST00000377078 DDNO94850 711 aaPredicted RBP22.07■■□□□ 1.12
USP11-202ENST00000377078 PHAXQ9H814 394 aaKnown RBP22.07■■□□□ 1.12
USP11-202ENST00000377078 TMC4Q7Z404 712 aa22.06■■□□□ 1.12
USP11-202ENST00000377078 WDR63Q8IWG1 891 aa22.06■■□□□ 1.12
USP11-202ENST00000377078 TWISTNBQ3B726 338 aaPredicted RBP22.05■■□□□ 1.12
USP11-202ENST00000377078 FAM9BQ8IZU0 186 aa22.05■■□□□ 1.12
USP11-202ENST00000377078 LARGE2Q8N3Y3 721 aa22.05■■□□□ 1.12
USP11-202ENST00000377078 TSPYL6Q8N831 410 aa22.05■■□□□ 1.12
USP11-202ENST00000377078 SUPT20HQ8NEM7 779 aa22.05■■□□□ 1.12
USP11-202ENST00000377078 FAM89AQ96GI7 184 aa22.05■■□□□ 1.12
USP11-202ENST00000377078 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP22.05■■□□□ 1.12
USP11-202ENST00000377078 SNED1Q8TER0 1413 aa22.05■■□□□ 1.12
USP11-202ENST00000377078 EIF6P56537 245 aaKnown RBP22.04■■□□□ 1.12
USP11-202ENST00000377078 GRAPQ13588 217 aa22.04■■□□□ 1.12
USP11-202ENST00000377078 GRAPLQ8TC17 118 aaPredicted RBP22.04■■□□□ 1.12
USP11-202ENST00000377078 ZNF428Q96B54 188 aa22.04■■□□□ 1.12
USP11-202ENST00000377078 MYD88Q99836 296 aa22.04■■□□□ 1.12
USP11-202ENST00000377078 FZD9O00144 591 aa22.03■■□□□ 1.12
USP11-202ENST00000377078 SP8Q8IXZ3 490 aa22.03■■□□□ 1.12
USP11-202ENST00000377078 ZBTB38Q8NAP3 1195 aaPredicted RBP22.03■■□□□ 1.12
USP11-202ENST00000377078 CCDC191Q8NCU4 936 aa22.03■■□□□ 1.12
USP11-202ENST00000377078 L3MBTL3Q96JM7 780 aaPredicted RBP22.03■■□□□ 1.12
USP11-202ENST00000377078 VPS33BQ9H267 617 aa22.03■■□□□ 1.12
USP11-202ENST00000377078 POTECB2RU33 542 aa22.02■■□□□ 1.12
USP11-202ENST00000377078 IRS4O14654 1257 aaPredicted RBP22.02■■□□□ 1.12
USP11-202ENST00000377078 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP22.02■■□□□ 1.12
USP11-202ENST00000377078 DPP8Q6V1X1 898 aaPredicted RBP22.02■■□□□ 1.12
USP11-202ENST00000377078 CWC25Q9NXE8 425 aaPredicted RBP22.02■■□□□ 1.12
USP11-202ENST00000377078 FANCIQ9NVI1 1328 aa22.02■■□□□ 1.12
USP11-202ENST00000377078 PPIP5K2O43314 1243 aa22.01■■□□□ 1.11
USP11-202ENST00000377078 NEXNQ0ZGT2 675 aa22.01■■□□□ 1.11
USP11-202ENST00000377078 SF3B3Q15393 1217 aaKnown RBP22.01■■□□□ 1.11
USP11-202ENST00000377078 NIM1KQ8IY84 436 aa22.01■■□□□ 1.11
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