RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000365200.1

RNU6-1175P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 1175, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-1175P, Length 107 nt, Biotype snRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-1175P-201ENST00000365200 CD163Q86VB7 1156 aa4.6□□□□□ -1.67
RNU6-1175P-201ENST00000365200 ANKMY2Q8IV38 441 aa4.6□□□□□ -1.67
RNU6-1175P-201ENST00000365200 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP4.6□□□□□ -1.67
RNU6-1175P-201ENST00000365200 HINFPQ9BQA5 517 aa4.6□□□□□ -1.67
RNU6-1175P-201ENST00000365200 PLVAPQ9BX97 442 aa4.6□□□□□ -1.67
RNU6-1175P-201ENST00000365200 VRTNQ9H8Y1 702 aa4.6□□□□□ -1.67
RNU6-1175P-201ENST00000365200 EFCC1Q9HA90 598 aa4.6□□□□□ -1.67
RNU6-1175P-201ENST00000365200 PRDM6Q9NQX0 595 aa4.6□□□□□ -1.67
RNU6-1175P-201ENST00000365200 K7ELQ4 463 aaPredicted RBP4.59□□□□□ -1.67
RNU6-1175P-201ENST00000365200 LMOD1P29536 600 aaPredicted RBP4.59□□□□□ -1.67
RNU6-1175P-201ENST00000365200 ADH7P40394 386 aa4.59□□□□□ -1.67
RNU6-1175P-201ENST00000365200 CHRNA4P43681 627 aa4.59□□□□□ -1.67
RNU6-1175P-201ENST00000365200 RTN1Q16799 776 aa4.59□□□□□ -1.67
RNU6-1175P-201ENST00000365200 NGLY1Q96IV0 654 aa4.59□□□□□ -1.67
RNU6-1175P-201ENST00000365200 TGFBR3LH3BV60 316 aa4.58□□□□□ -1.68
RNU6-1175P-201ENST00000365200 M0R082 166 aa4.58□□□□□ -1.68
RNU6-1175P-201ENST00000365200 ALBP02768 609 aa4.58□□□□□ -1.68
RNU6-1175P-201ENST00000365200 PRRT3Q5FWE3 981 aa4.58□□□□□ -1.68
RNU6-1175P-201ENST00000365200 RAB44Q7Z6P3 723 aaPredicted RBP4.58□□□□□ -1.68
RNU6-1175P-201ENST00000365200 MICALL1Q8N3F8 863 aa4.58□□□□□ -1.68
RNU6-1175P-201ENST00000365200 ZNF417Q8TAU3 575 aa4.58□□□□□ -1.68
RNU6-1175P-201ENST00000365200 BHMTQ93088 406 aa4.58□□□□□ -1.68
RNU6-1175P-201ENST00000365200 ZNF587Q96SQ5 575 aaPredicted RBP4.58□□□□□ -1.68
RNU6-1175P-201ENST00000365200 STARD13Q9Y3M8 1113 aa4.58□□□□□ -1.68
RNU6-1175P-201ENST00000365200 FOXO3O43524 673 aa4.57□□□□□ -1.68
RNU6-1175P-201ENST00000365200 COL9A3Q14050 684 aaPredicted RBP4.57□□□□□ -1.68
RNU6-1175P-201ENST00000365200 C20orf204Q6ZNR8 217 aa4.57□□□□□ -1.68
RNU6-1175P-201ENST00000365200 ARXQ96QS3 562 aa4.57□□□□□ -1.68
RNU6-1175P-201ENST00000365200 LGR5O75473 907 aa4.56□□□□□ -1.68
RNU6-1175P-201ENST00000365200 FURINP09958 794 aa4.56□□□□□ -1.68
RNU6-1175P-201ENST00000365200 NID1P14543 1247 aa4.56□□□□□ -1.68
RNU6-1175P-201ENST00000365200 EPB42P16452 691 aa4.56□□□□□ -1.68
RNU6-1175P-201ENST00000365200 CFAP70Q5T0N1 1121 aa4.56□□□□□ -1.68
RNU6-1175P-201ENST00000365200 GSX2Q9BZM3 304 aa4.56□□□□□ -1.68
RNU6-1175P-201ENST00000365200 UBE2OQ9C0C9 1292 aaKnown RBP4.56□□□□□ -1.68
RNU6-1175P-201ENST00000365200 DMGDHQ9UI17 866 aaKnown RBP4.56□□□□□ -1.68
RNU6-1175P-201ENST00000365200 BCS1LQ9Y276 419 aa4.56□□□□□ -1.68
RNU6-1175P-201ENST00000365200 LILRB5O75023 590 aa4.55□□□□□ -1.68
RNU6-1175P-201ENST00000365200 APBA3O96018 575 aa4.55□□□□□ -1.68
RNU6-1175P-201ENST00000365200 WEE1P30291 646 aa4.55□□□□□ -1.68
RNU6-1175P-201ENST00000365200 GATA4P43694 442 aa4.55□□□□□ -1.68
RNU6-1175P-201ENST00000365200 TRIM28Q13263 835 aaKnown RBP4.55□□□□□ -1.68
RNU6-1175P-201ENST00000365200 CCINQ13939 588 aa4.55□□□□□ -1.68
RNU6-1175P-201ENST00000365200 C8orf86Q6ZUL3 223 aa4.55□□□□□ -1.68
RNU6-1175P-201ENST00000365200 VTI1AQ96AJ9 217 aa4.55□□□□□ -1.68
RNU6-1175P-201ENST00000365200 PNMA5Q96PV4 448 aa4.55□□□□□ -1.68
RNU6-1175P-201ENST00000365200 SLC6A14Q9UN76 642 aa4.55□□□□□ -1.68
RNU6-1175P-201ENST00000365200 GTF3C5Q9Y5Q8 519 aaPredicted RBP4.55□□□□□ -1.68
RNU6-1175P-201ENST00000365200 IDH3AP50213 366 aa4.54□□□□□ -1.68
RNU6-1175P-201ENST00000365200 TBC1D8BQ0IIM8 1120 aa4.54□□□□□ -1.68
RNU6-1175P-201ENST00000365200 FAM200AQ8TCP9 573 aa4.54□□□□□ -1.68
RNU6-1175P-201ENST00000365200 MYO19Q96H55 970 aa4.54□□□□□ -1.68
RNU6-1175P-201ENST00000365200 NACC1Q96RE7 527 aa4.54□□□□□ -1.68
RNU6-1175P-201ENST00000365200 QTRT2Q9H974 415 aaKnown RBP4.54□□□□□ -1.68
RNU6-1175P-201ENST00000365200 C11orf16Q9NQ32 467 aa4.54□□□□□ -1.68
RNU6-1175P-201ENST00000365200 UTP3Q9NQZ2 479 aaKnown RBP eCLIP4.54□□□□□ -1.68
RNU6-1175P-201ENST00000365200 KLK14Q9P0G3 267 aa4.54□□□□□ -1.68
RNU6-1175P-201ENST00000365200 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP4.54□□□□□ -1.68
RNU6-1175P-201ENST00000365200 FAM229AH3BQW9 127 aa4.53□□□□□ -1.68
RNU6-1175P-201ENST00000365200 NFKB1P19838 968 aa4.53□□□□□ -1.68
RNU6-1175P-201ENST00000365200 GRNP28799 593 aaKnown RBP4.53□□□□□ -1.68
RNU6-1175P-201ENST00000365200 INPP5BP32019 993 aa4.53□□□□□ -1.68
RNU6-1175P-201ENST00000365200 ARSDP51689 593 aa4.53□□□□□ -1.68
RNU6-1175P-201ENST00000365200 DGKZQ13574 1117 aa4.53□□□□□ -1.68
RNU6-1175P-201ENST00000365200 DOC2BQ14184 412 aa4.53□□□□□ -1.68
RNU6-1175P-201ENST00000365200 PCSK7Q16549 785 aa4.53□□□□□ -1.68
RNU6-1175P-201ENST00000365200 C11orf91Q3C1V1 193 aa4.53□□□□□ -1.68
RNU6-1175P-201ENST00000365200 IGFLR1Q9H665 355 aa4.53□□□□□ -1.68
RNU6-1175P-201ENST00000365200 JPH1Q9HDC5 661 aaPredicted RBP4.53□□□□□ -1.68
RNU6-1175P-201ENST00000365200 DNAJB12Q9NXW2 375 aaKnown RBP4.53□□□□□ -1.68
RNU6-1175P-201ENST00000365200 MICAL2O94851 1124 aa4.52□□□□□ -1.69
RNU6-1175P-201ENST00000365200 MAP3K6O95382 1288 aa4.52□□□□□ -1.69
RNU6-1175P-201ENST00000365200 RFX1P22670 979 aa4.52□□□□□ -1.69
RNU6-1175P-201ENST00000365200 SWI5Q1ZZU3 235 aa4.52□□□□□ -1.69
RNU6-1175P-201ENST00000365200 CDCA8Q53HL2 280 aa4.52□□□□□ -1.69
RNU6-1175P-201ENST00000365200 TRAPPC3LQ5T215 181 aa4.52□□□□□ -1.69
RNU6-1175P-201ENST00000365200 PSAPL1Q6NUJ1 521 aa4.52□□□□□ -1.69
RNU6-1175P-201ENST00000365200 NUDT8Q8WV74 236 aa4.52□□□□□ -1.69
RNU6-1175P-201ENST00000365200 NOVA2Q9UNW9 492 aaKnown RBP4.52□□□□□ -1.69
RNU6-1175P-201ENST00000365200 A0A0A0MRY4 1105 aa4.51□□□□□ -1.69
RNU6-1175P-201ENST00000365200 C9orf172C9J069 976 aa4.51□□□□□ -1.69
RNU6-1175P-201ENST00000365200 RGS9O75916 674 aaPredicted RBP4.51□□□□□ -1.69
RNU6-1175P-201ENST00000365200 ELOAQ14241 798 aaKnown RBP4.51□□□□□ -1.69
RNU6-1175P-201ENST00000365200 GRIK4Q16099 956 aa4.51□□□□□ -1.69
RNU6-1175P-201ENST00000365200 SEMA6BQ9H3T3 888 aa4.51□□□□□ -1.69
RNU6-1175P-201ENST00000365200 FRRS1LQ9P0K9 344 aa4.51□□□□□ -1.69
RNU6-1175P-201ENST00000365200 NAGPAQ9UK23 515 aa4.51□□□□□ -1.69
RNU6-1175P-201ENST00000365200 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP4.5□□□□□ -1.69
RNU6-1175P-201ENST00000365200 EGFRP00533 1210 aa4.5□□□□□ -1.69
RNU6-1175P-201ENST00000365200 ELNP15502 786 aa4.5□□□□□ -1.69
RNU6-1175P-201ENST00000365200 ITGB7P26010 798 aa4.5□□□□□ -1.69
RNU6-1175P-201ENST00000365200 AFF1P51825 1210 aaKnown RBP4.5□□□□□ -1.69
RNU6-1175P-201ENST00000365200 RAC1P63000 192 aa4.5□□□□□ -1.69
RNU6-1175P-201ENST00000365200 GPLD1P80108 840 aa4.5□□□□□ -1.69
RNU6-1175P-201ENST00000365200 FKBP5Q13451 457 aaPredicted RBP4.5□□□□□ -1.69
RNU6-1175P-201ENST00000365200 RSPO4Q2I0M5 234 aaPredicted RBP4.5□□□□□ -1.69
RNU6-1175P-201ENST00000365200 ILDR2Q71H61 639 aa4.5□□□□□ -1.69
RNU6-1175P-201ENST00000365200 DHX32Q7L7V1 743 aaKnown RBP4.5□□□□□ -1.69
RNU6-1175P-201ENST00000365200 FAM35AQ86V20 835 aa4.5□□□□□ -1.69
RNU6-1175P-201ENST00000365200 TRPM4Q8TD43 1214 aa4.5□□□□□ -1.69
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 50.1 ms