RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000348333.7

TNFRSF25-201, Transcript of TNF receptor superfamily member 25, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene TNFRSF25, Length 1,119 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF25-201ENST00000348333 DUSP27Q5VZP5 1158 aa29.62■■■□□ 2.33
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TNFRSF25-201ENST00000348333 SOGA3Q5TF21 947 aa29.61■■■□□ 2.33
TNFRSF25-201ENST00000348333 DDX60Q8IY21 1712 aaKnown RBP29.61■■■□□ 2.33
TNFRSF25-201ENST00000348333 PARP10Q53GL7 1025 aa29.6■■■□□ 2.33
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TNFRSF25-201ENST00000348333 IL16Q14005 1332 aa29.33■■■□□ 2.29
TNFRSF25-201ENST00000348333 FANCIQ9NVI1 1328 aa29.32■■■□□ 2.28
TNFRSF25-201ENST00000348333 BBOX1O75936 387 aa29.32■■■□□ 2.28
TNFRSF25-201ENST00000348333 TWISTNBQ3B726 338 aaPredicted RBP29.32■■■□□ 2.28
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TNFRSF25-201ENST00000348333 IRS4O14654 1257 aaPredicted RBP29.31■■■□□ 2.28
TNFRSF25-201ENST00000348333 PPIP5K2O43314 1243 aa29.31■■■□□ 2.28
TNFRSF25-201ENST00000348333 SF3B3Q15393 1217 aaKnown RBP29.31■■■□□ 2.28
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