RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000335523.7

VSTM2B-201, Transcript of V-set and transmembrane domain containing 2B, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene VSTM2B, Length 1,488 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VSTM2B-201ENST00000335523 SUCLG2Q96I99 432 aa24.38■■□□□ 1.49
VSTM2B-201ENST00000335523 RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 228 aaKnown RBP24.37■■□□□ 1.49
VSTM2B-201ENST00000335523 PHF14O94880 888 aa24.37■■□□□ 1.49
VSTM2B-201ENST00000335523 PCCAP05165 728 aaPredicted RBP24.37■■□□□ 1.49
VSTM2B-201ENST00000335523 ZBTB38Q8NAP3 1195 aaPredicted RBP24.37■■□□□ 1.49
VSTM2B-201ENST00000335523 TAF1LQ8IZX4 1826 aa24.36■■□□□ 1.49
VSTM2B-201ENST00000335523 CASP7P55210 303 aa24.36■■□□□ 1.49
VSTM2B-201ENST00000335523 USPL1Q5W0Q7 1092 aa24.36■■□□□ 1.49
VSTM2B-201ENST00000335523 SMIM5Q71RC9 77 aa24.36■■□□□ 1.49
VSTM2B-201ENST00000335523 TFCP2L1Q9NZI6 479 aa24.36■■□□□ 1.49
VSTM2B-201ENST00000335523 NIP7Q9Y221 180 aaKnown RBP eCLIP24.36■■□□□ 1.49
VSTM2B-201ENST00000335523 MTX1Q13505 466 aa24.35■■□□□ 1.49
VSTM2B-201ENST00000335523 PPP1R42Q7Z4L9 355 aa24.35■■□□□ 1.49
VSTM2B-201ENST00000335523 SMC5Q8IY18 1101 aa24.35■■□□□ 1.49
VSTM2B-201ENST00000335523 FLAD1Q8NFF5 587 aa24.35■■□□□ 1.49
VSTM2B-201ENST00000335523 JARID2Q92833 1246 aaPredicted RBP24.35■■□□□ 1.49
VSTM2B-201ENST00000335523 TRMT112Q9UI30 125 aaKnown RBP24.35■■□□□ 1.49
VSTM2B-201ENST00000335523 AMIGO3Q86WK7 504 aa24.34■■□□□ 1.49
VSTM2B-201ENST00000335523 AKT1S1Q96B36 256 aa24.34■■□□□ 1.49
VSTM2B-201ENST00000335523 DCTPP1Q9H773 170 aa24.34■■□□□ 1.49
VSTM2B-201ENST00000335523 SRGAP3O43295 1099 aa24.33■■□□□ 1.49
VSTM2B-201ENST00000335523 SSH3Q8TE77 659 aa24.33■■□□□ 1.49
VSTM2B-201ENST00000335523 KAZALD1Q96I82 304 aa24.33■■□□□ 1.49
VSTM2B-201ENST00000335523 UTP14AQ9BVJ6 771 aaKnown RBP24.33■■□□□ 1.49
VSTM2B-201ENST00000335523 BICC1Q9H694 974 aaKnown RBP24.33■■□□□ 1.49
VSTM2B-201ENST00000335523 SRP68Q9UHB9 627 aaKnown RBP24.33■■□□□ 1.49
VSTM2B-201ENST00000335523 USP42Q9H9J4 1324 aaKnown RBP24.33■■□□□ 1.49
VSTM2B-201ENST00000335523 PNMA6EA0A0J9YXQ4 647 aa24.32■■□□□ 1.48
VSTM2B-201ENST00000335523 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP24.32■■□□□ 1.48
VSTM2B-201ENST00000335523 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP24.32■■□□□ 1.48
VSTM2B-201ENST00000335523 HSP90B1P14625 803 aaKnown RBP24.32■■□□□ 1.48
VSTM2B-201ENST00000335523 POLA2Q14181 598 aa24.32■■□□□ 1.48
VSTM2B-201ENST00000335523 FAM89AQ96GI7 184 aa24.32■■□□□ 1.48
VSTM2B-201ENST00000335523 BCL2L12Q9HB09 334 aa24.32■■□□□ 1.48
VSTM2B-201ENST00000335523 UBN2Q6ZU65 1347 aa24.31■■□□□ 1.48
VSTM2B-201ENST00000335523 CDHR2Q9BYE9 1310 aa24.31■■□□□ 1.48
VSTM2B-201ENST00000335523 SUSD4Q5VX71 490 aa24.31■■□□□ 1.48
VSTM2B-201ENST00000335523 SETDB2Q96T68 719 aa24.31■■□□□ 1.48
VSTM2B-201ENST00000335523 ZNF827Q17R98 1081 aa24.3■■□□□ 1.48
VSTM2B-201ENST00000335523 RABL6Q3YEC7 729 aaPredicted RBP24.3■■□□□ 1.48
VSTM2B-201ENST00000335523 PLA2G12BQ9BX93 195 aa24.3■■□□□ 1.48
VSTM2B-201ENST00000335523 EPHA10Q5JZY3 1008 aa24.29■■□□□ 1.48
VSTM2B-201ENST00000335523 ZBTB47Q9UFB7 747 aaPredicted RBP24.29■■□□□ 1.48
VSTM2B-201ENST00000335523 SH3TC1Q8TE82 1336 aa24.29■■□□□ 1.48
VSTM2B-201ENST00000335523 SRCAPQ6ZRS2 3230 aa24.29■■□□□ 1.48
VSTM2B-201ENST00000335523 NUP98P52948 1817 aa24.28■■□□□ 1.48
VSTM2B-201ENST00000335523 AFDNP55196 1824 aaKnown RBP24.28■■□□□ 1.48
VSTM2B-201ENST00000335523 TBC1D9BQ66K14 1250 aa24.28■■□□□ 1.48
VSTM2B-201ENST00000335523 STK32BQ9NY57 414 aa24.28■■□□□ 1.48
VSTM2B-201ENST00000335523 IRS4O14654 1257 aaPredicted RBP24.27■■□□□ 1.48
VSTM2B-201ENST00000335523 FOXO4P98177 505 aa24.27■■□□□ 1.48
VSTM2B-201ENST00000335523 BICDL1Q6ZP65 573 aa24.27■■□□□ 1.48
VSTM2B-201ENST00000335523 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa24.27■■□□□ 1.48
VSTM2B-201ENST00000335523 FAM177BA6PVY3 158 aa24.26■■□□□ 1.47
VSTM2B-201ENST00000335523 HSP90AB4PQ58FF6 505 aa24.26■■□□□ 1.47
VSTM2B-201ENST00000335523 ANKRD45Q5TZF3 282 aa24.26■■□□□ 1.47
VSTM2B-201ENST00000335523 LMBR1LQ6UX01 489 aa24.26■■□□□ 1.47
VSTM2B-201ENST00000335523 NYXQ9GZU5 481 aa24.26■■□□□ 1.47
VSTM2B-201ENST00000335523 NUCB1Q02818 461 aa24.26■■□□□ 1.47
VSTM2B-201ENST00000335523 MSH5O43196 834 aa24.25■■□□□ 1.47
VSTM2B-201ENST00000335523 PDE8AO60658 829 aa24.25■■□□□ 1.47
VSTM2B-201ENST00000335523 SURF6O75683 361 aaKnown RBP24.25■■□□□ 1.47
VSTM2B-201ENST00000335523 NTSR2O95665 410 aa24.25■■□□□ 1.47
VSTM2B-201ENST00000335523 GYS1P13807 737 aa24.25■■□□□ 1.47
VSTM2B-201ENST00000335523 SLC15A2Q16348 729 aa24.25■■□□□ 1.47
VSTM2B-201ENST00000335523 RAB11FIP3O75154 756 aa24.24■■□□□ 1.47
VSTM2B-201ENST00000335523 GTF2E1P29083 439 aaPredicted RBP24.24■■□□□ 1.47
VSTM2B-201ENST00000335523 R3HDM1Q15032 1099 aaKnown RBP24.24■■□□□ 1.47
VSTM2B-201ENST00000335523 TPTE2Q6XPS3 522 aa24.24■■□□□ 1.47
VSTM2B-201ENST00000335523 CHD1LQ86WJ1 897 aa24.24■■□□□ 1.47
VSTM2B-201ENST00000335523 COL23A1Q86Y22 540 aaPredicted RBP24.24■■□□□ 1.47
VSTM2B-201ENST00000335523 SYNE4Q8N205 404 aa24.24■■□□□ 1.47
VSTM2B-201ENST00000335523 NOP58Q9Y2X3 529 aaKnown RBP24.24■■□□□ 1.47
VSTM2B-201ENST00000335523 CHMP3Q9Y3E7 222 aa24.24■■□□□ 1.47
VSTM2B-201ENST00000335523 NBPF5PQ86XG9 351 aaPredicted RBP24.23■■□□□ 1.47
VSTM2B-201ENST00000335523 ANKRD36CQ5JPF3 1778 aa24.23■■□□□ 1.47
VSTM2B-201ENST00000335523 UBR3Q6ZT12 1888 aa24.22■■□□□ 1.47
VSTM2B-201ENST00000335523 BCORQ6W2J9 1755 aa24.22■■□□□ 1.47
VSTM2B-201ENST00000335523 CSF1RP07333 972 aa24.22■■□□□ 1.47
VSTM2B-201ENST00000335523 EXOC6BQ9Y2D4 811 aa24.22■■□□□ 1.47
VSTM2B-201ENST00000335523 NFIXQ14938 502 aa24.21■■□□□ 1.47
VSTM2B-201ENST00000335523 NLGN1Q8N2Q7 840 aa24.21■■□□□ 1.47
VSTM2B-201ENST00000335523 SCN7AQ01118 1682 aa24.21■■□□□ 1.47
VSTM2B-201ENST00000335523 PSDA5PKW4 1024 aaPredicted RBP24.2■■□□□ 1.47
VSTM2B-201ENST00000335523 G3BP1Q13283 466 aaKnown RBP eCLIP24.2■■□□□ 1.47
VSTM2B-201ENST00000335523 OS9Q13438 667 aaPredicted RBP24.2■■□□□ 1.47
VSTM2B-201ENST00000335523 COPRSQ9NQ92 184 aa24.2■■□□□ 1.47
VSTM2B-201ENST00000335523 HCLS1P14317 486 aaPredicted RBP24.19■■□□□ 1.46
VSTM2B-201ENST00000335523 CTSWP56202 376 aa24.19■■□□□ 1.46
VSTM2B-201ENST00000335523 CCDC57Q2TAC2 916 aa24.19■■□□□ 1.46
VSTM2B-201ENST00000335523 SLC10A5Q5PT55 438 aa24.19■■□□□ 1.46
VSTM2B-201ENST00000335523 NUTM1Q86Y26 1132 aa24.19■■□□□ 1.46
VSTM2B-201ENST00000335523 ERC1Q8IUD2 1116 aa24.19■■□□□ 1.46
VSTM2B-201ENST00000335523 TTLL11Q8NHH1 800 aa24.19■■□□□ 1.46
VSTM2B-201ENST00000335523 CARMIL3Q8ND23 1372 aa24.19■■□□□ 1.46
VSTM2B-201ENST00000335523 PNPLA7Q6ZV29 1317 aa24.19■■□□□ 1.46
VSTM2B-201ENST00000335523 APBB1O00213 710 aa24.19■■□□□ 1.46
VSTM2B-201ENST00000335523 LRRCC1Q9C099 1032 aa24.19■■□□□ 1.46
VSTM2B-201ENST00000335523 LNPKQ9C0E8 428 aa24.19■■□□□ 1.46
VSTM2B-201ENST00000335523 LRP5O75197 1615 aa24.19■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 15.4 ms