RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000258083.2

PRADC1-201, Transcript of protease associated domain containing 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PRADC1, Length 1,083 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRADC1-201ENST00000258083 NLRP10Q86W26 655 aa28.84■■■□□ 2.21
PRADC1-201ENST00000258083 C8orf58Q8NAV2 365 aa28.84■■■□□ 2.21
PRADC1-201ENST00000258083 PLBD2Q8NHP8 589 aa28.84■■■□□ 2.21
PRADC1-201ENST00000258083 TAOK3Q9H2K8 898 aa28.84■■■□□ 2.21
PRADC1-201ENST00000258083 NMRK2Q9NPI5 230 aa28.84■■■□□ 2.21
PRADC1-201ENST00000258083 UTP14AQ9BVJ6 771 aaKnown RBP28.83■■■□□ 2.21
PRADC1-201ENST00000258083 ANKRD13DQ6ZTN6 518 aa28.82■■■□□ 2.2
PRADC1-201ENST00000258083 IL16Q14005 1332 aa28.82■■■□□ 2.2
PRADC1-201ENST00000258083 KDM2BQ8NHM5 1336 aa28.82■■■□□ 2.2
PRADC1-201ENST00000258083 ANKRD36CQ5JPF3 1778 aa28.82■■■□□ 2.2
PRADC1-201ENST00000258083 CCDC93Q567U6 631 aa28.81■■■□□ 2.2
PRADC1-201ENST00000258083 CACNA1SQ13698 1873 aa28.8■■■□□ 2.2
PRADC1-201ENST00000258083 CEP350Q5VT06 3117 aa28.8■■■□□ 2.2
PRADC1-201ENST00000258083 SNED1Q8TER0 1413 aa28.8■■■□□ 2.2
PRADC1-201ENST00000258083 ELL2O00472 640 aaPredicted RBP28.8■■■□□ 2.2
PRADC1-201ENST00000258083 C3orf67Q6ZVT6 689 aa28.8■■■□□ 2.2
PRADC1-201ENST00000258083 ISCA1Q9BUE6 129 aa28.79■■■□□ 2.2
PRADC1-201ENST00000258083 GLTPD2A6NH11 291 aa28.78■■■□□ 2.2
PRADC1-201ENST00000258083 CRAMP1Q96RY5 1269 aa28.78■■■□□ 2.2
PRADC1-201ENST00000258083 CCDC88AQ3V6T2 1871 aa28.77■■■□□ 2.2
PRADC1-201ENST00000258083 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa28.77■■■□□ 2.2
PRADC1-201ENST00000258083 TSPYL6Q8N831 410 aa28.77■■■□□ 2.2
PRADC1-201ENST00000258083 TSR2Q969E8 191 aaKnown RBP28.77■■■□□ 2.2
PRADC1-201ENST00000258083 NLRP3Q96P20 1036 aa28.77■■■□□ 2.2
PRADC1-201ENST00000258083 CHMP4AQ9BY43 222 aa28.77■■■□□ 2.2
PRADC1-201ENST00000258083 TIAM2Q8IVF5 1701 aa28.77■■■□□ 2.2
PRADC1-201ENST00000258083 TOMM70O94826 608 aa28.76■■■□□ 2.19
PRADC1-201ENST00000258083 OLFM4Q6UX06 510 aa28.76■■■□□ 2.19
PRADC1-201ENST00000258083 RTKN2Q8IZC4 609 aa28.76■■■□□ 2.19
PRADC1-201ENST00000258083 RPGRQ92834 1020 aaKnown RBP28.76■■■□□ 2.19
PRADC1-201ENST00000258083 DICER1Q9UPY3 1922 aaKnown RBP28.76■■■□□ 2.19
PRADC1-201ENST00000258083 FKBP4Q02790 459 aaKnown RBP eCLIP28.75■■■□□ 2.19
PRADC1-201ENST00000258083 TRIM28Q13263 835 aaKnown RBP28.75■■■□□ 2.19
PRADC1-201ENST00000258083 SH3TC1Q8TE82 1336 aa28.74■■■□□ 2.19
PRADC1-201ENST00000258083 CCDC30Q5VVM6 783 aa28.74■■■□□ 2.19
PRADC1-201ENST00000258083 CC2D2BQ6DHV5 1058 aa28.74■■■□□ 2.19
PRADC1-201ENST00000258083 RBM17Q96I25 401 aaKnown RBP28.74■■■□□ 2.19
PRADC1-201ENST00000258083 PHAXQ9H814 394 aaKnown RBP28.74■■■□□ 2.19
PRADC1-201ENST00000258083 TRMT112Q9UI30 125 aaKnown RBP28.74■■■□□ 2.19
PRADC1-201ENST00000258083 WDR63Q8IWG1 891 aa28.73■■■□□ 2.19
PRADC1-201ENST00000258083 SYNE4Q8N205 404 aa28.73■■■□□ 2.19
PRADC1-201ENST00000258083 RRAGCQ9HB90 399 aa28.72■■■□□ 2.19
PRADC1-201ENST00000258083 PSMD1Q99460 953 aa28.71■■■□□ 2.19
PRADC1-201ENST00000258083 HCLS1P14317 486 aaPredicted RBP28.7■■■□□ 2.18
PRADC1-201ENST00000258083 GOLGA2Q08379 1002 aa28.7■■■□□ 2.18
PRADC1-201ENST00000258083 RBM46Q8TBY0 533 aaKnown RBP28.7■■■□□ 2.18
PRADC1-201ENST00000258083 ATP5J2-PTCD1G3V325 749 aa28.69■■■□□ 2.18
PRADC1-201ENST00000258083 GRIPAP1Q4V328 841 aa28.69■■■□□ 2.18
PRADC1-201ENST00000258083 HSPA6P17066 643 aa28.68■■■□□ 2.18
PRADC1-201ENST00000258083 TWISTNBQ3B726 338 aaPredicted RBP28.68■■■□□ 2.18
PRADC1-201ENST00000258083 DPY19L2Q6NUT2 758 aa28.68■■■□□ 2.18
PRADC1-201ENST00000258083 RIC3Q7Z5B4 369 aa28.68■■■□□ 2.18
PRADC1-201ENST00000258083 FAM9BQ8IZU0 186 aa28.68■■■□□ 2.18
PRADC1-201ENST00000258083 ZNF277Q9NRM2 450 aaPredicted RBP28.68■■■□□ 2.18
PRADC1-201ENST00000258083 ABCC4O15439 1325 aa28.68■■■□□ 2.18
PRADC1-201ENST00000258083 FANCIQ9NVI1 1328 aa28.68■■■□□ 2.18
PRADC1-201ENST00000258083 PPEF1O14829 653 aaPredicted RBP28.67■■■□□ 2.18
PRADC1-201ENST00000258083 POTECB2RU33 542 aa28.66■■■□□ 2.18
PRADC1-201ENST00000258083 VEGFAP15692 232 aaPredicted RBP28.66■■■□□ 2.18
PRADC1-201ENST00000258083 WDR90Q96KV7 1748 aa28.66■■■□□ 2.18
PRADC1-201ENST00000258083 SLC51AQ86UW1 340 aa28.65■■■□□ 2.18
PRADC1-201ENST00000258083 FAM89AQ96GI7 184 aa28.65■■■□□ 2.18
PRADC1-201ENST00000258083 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP28.65■■■□□ 2.18
PRADC1-201ENST00000258083 LAMB2P55268 1798 aa28.65■■■□□ 2.18
PRADC1-201ENST00000258083 IARSP41252 1262 aaKnown RBP28.64■■■□□ 2.18
PRADC1-201ENST00000258083 C16orf71Q8IYS4 520 aaPredicted RBP28.64■■■□□ 2.18
PRADC1-201ENST00000258083 ATP6V0A2Q9Y487 856 aa28.64■■■□□ 2.18
PRADC1-201ENST00000258083 BBOX1O75936 387 aa28.63■■■□□ 2.17
PRADC1-201ENST00000258083 DDX58O95786 925 aaKnown RBP28.63■■■□□ 2.17
PRADC1-201ENST00000258083 SF3B3Q15393 1217 aaKnown RBP28.63■■■□□ 2.17
PRADC1-201ENST00000258083 DDX60Q8IY21 1712 aaKnown RBP28.63■■■□□ 2.17
PRADC1-201ENST00000258083 FSTL1Q12841 308 aa28.62■■■□□ 2.17
PRADC1-201ENST00000258083 CCDC191Q8NCU4 936 aa28.62■■■□□ 2.17
PRADC1-201ENST00000258083 ZNF428Q96B54 188 aa28.62■■■□□ 2.17
PRADC1-201ENST00000258083 METTL22Q9BUU2 404 aaPredicted RBP28.62■■■□□ 2.17
PRADC1-201ENST00000258083 STK31Q9BXU1 1019 aa28.62■■■□□ 2.17
PRADC1-201ENST00000258083 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP28.62■■■□□ 2.17
PRADC1-201ENST00000258083 ZBTB38Q8NAP3 1195 aaPredicted RBP28.61■■■□□ 2.17
PRADC1-201ENST00000258083 MYD88Q99836 296 aa28.61■■■□□ 2.17
PRADC1-201ENST00000258083 FZD9O00144 591 aa28.6■■■□□ 2.17
PRADC1-201ENST00000258083 DDNO94850 711 aaPredicted RBP28.6■■■□□ 2.17
PRADC1-201ENST00000258083 GRAPQ13588 217 aa28.6■■■□□ 2.17
PRADC1-201ENST00000258083 KSR2Q6VAB6 950 aa28.6■■■□□ 2.17
PRADC1-201ENST00000258083 DDX46Q7L014 1031 aaKnown RBP28.6■■■□□ 2.17
PRADC1-201ENST00000258083 GRAPLQ8TC17 118 aaPredicted RBP28.6■■■□□ 2.17
PRADC1-201ENST00000258083 VAMP4O75379 141 aa28.59■■■□□ 2.17
PRADC1-201ENST00000258083 SP8Q8IXZ3 490 aa28.59■■■□□ 2.17
PRADC1-201ENST00000258083 L3MBTL3Q96JM7 780 aaPredicted RBP28.59■■■□□ 2.17
PRADC1-201ENST00000258083 ZNF521Q96K83 1311 aa28.59■■■□□ 2.17
PRADC1-201ENST00000258083 PI4KAP2A4QPH2 592 aa28.58■■■□□ 2.17
PRADC1-201ENST00000258083 IRS4O14654 1257 aaPredicted RBP28.58■■■□□ 2.17
PRADC1-201ENST00000258083 PI4KAP1Q8N8J0 262 aa28.58■■■□□ 2.17
PRADC1-201ENST00000258083 RTFDC1Q9BY42 306 aaPredicted RBP28.58■■■□□ 2.17
PRADC1-201ENST00000258083 MAP3K2Q9Y2U5 619 aa28.58■■■□□ 2.17
PRADC1-201ENST00000258083 COL4A5P29400 1685 aa28.58■■■□□ 2.16
PRADC1-201ENST00000258083 TCERG1O14776 1098 aaKnown RBP28.57■■■□□ 2.16
PRADC1-201ENST00000258083 SLC4A2P04920 1241 aa28.57■■■□□ 2.16
PRADC1-201ENST00000258083 PCCAP05165 728 aaPredicted RBP28.57■■■□□ 2.16
PRADC1-201ENST00000258083 G2E3Q7L622 706 aa28.57■■■□□ 2.16
PRADC1-201ENST00000258083 ZNF541Q9H0D2 1346 aa28.57■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 48 ms