RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000233025.11

SPCS1-201, Transcript of signal peptidase complex subunit 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SPCS1, Length 1,082 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPCS1-201ENST00000233025 GPRC5DQ9NZD1 345 aa22.38■■□□□ 1.17
SPCS1-201ENST00000233025 HMOX1P09601 288 aa22.37■■□□□ 1.17
SPCS1-201ENST00000233025 POLR2AP24928 1970 aaKnown RBP22.37■■□□□ 1.17
SPCS1-201ENST00000233025 CC2D2BQ6DHV5 1058 aa22.36■■□□□ 1.17
SPCS1-201ENST00000233025 TPTE2Q6XPS3 522 aa22.36■■□□□ 1.17
SPCS1-201ENST00000233025 LARGE2Q8N3Y3 721 aa22.36■■□□□ 1.17
SPCS1-201ENST00000233025 SAGE1Q9NXZ1 904 aa22.36■■□□□ 1.17
SPCS1-201ENST00000233025 CRY2Q49AN0 593 aa22.35■■□□□ 1.17
SPCS1-201ENST00000233025 MORC1Q86VD1 984 aa22.35■■□□□ 1.17
SPCS1-201ENST00000233025 PGAP2Q9UHJ9 254 aa22.35■■□□□ 1.17
SPCS1-201ENST00000233025 ZNF652Q9Y2D9 606 aa22.35■■□□□ 1.17
SPCS1-201ENST00000233025 NUP98P52948 1817 aa22.34■■□□□ 1.17
SPCS1-201ENST00000233025 PIP4K2AP48426 406 aaPredicted RBP22.34■■□□□ 1.17
SPCS1-201ENST00000233025 FMNL2Q96PY5 1086 aa22.34■■□□□ 1.17
SPCS1-201ENST00000233025 ABCC12Q96J65 1359 aa22.34■■□□□ 1.17
SPCS1-201ENST00000233025 SLC51AQ86UW1 340 aa22.33■■□□□ 1.17
SPCS1-201ENST00000233025 ZNF408Q9H9D4 720 aa22.33■■□□□ 1.17
SPCS1-201ENST00000233025 NIP7Q9Y221 180 aaKnown RBP eCLIP22.33■■□□□ 1.17
SPCS1-201ENST00000233025 RIC1Q4ADV7 1423 aa22.32■■□□□ 1.16
SPCS1-201ENST00000233025 MKI67P46013 3256 aaKnown RBP22.32■■□□□ 1.16
SPCS1-201ENST00000233025 RGL2O15211 777 aa22.32■■□□□ 1.16
SPCS1-201ENST00000233025 IL17REQ8NFR9 667 aa22.32■■□□□ 1.16
SPCS1-201ENST00000233025 FAM155AB1AL88 458 aaPredicted RBP22.31■■□□□ 1.16
SPCS1-201ENST00000233025 TEFQ10587 303 aa22.31■■□□□ 1.16
SPCS1-201ENST00000233025 NIM1KQ8IY84 436 aa22.31■■□□□ 1.16
SPCS1-201ENST00000233025 POLR3GLQ9BT43 218 aa22.31■■□□□ 1.16
SPCS1-201ENST00000233025 PANK3Q9H999 370 aa22.31■■□□□ 1.16
SPCS1-201ENST00000233025 NPC1L1Q9UHC9 1359 aa22.3■■□□□ 1.16
SPCS1-201ENST00000233025 FAM177BA6PVY3 158 aa22.3■■□□□ 1.16
SPCS1-201ENST00000233025 GRIPAP1Q4V328 841 aa22.3■■□□□ 1.16
SPCS1-201ENST00000233025 HUNKP57058 714 aa22.29■■□□□ 1.16
SPCS1-201ENST00000233025 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP22.29■■□□□ 1.16
SPCS1-201ENST00000233025 CTU1Q7Z7A3 348 aaKnown RBP22.29■■□□□ 1.16
SPCS1-201ENST00000233025 ZC3H15Q8WU90 426 aaKnown RBP22.29■■□□□ 1.16
SPCS1-201ENST00000233025 GCC1Q96CN9 775 aa22.29■■□□□ 1.16
SPCS1-201ENST00000233025 USP16Q9Y5T5 823 aa22.29■■□□□ 1.16
SPCS1-201ENST00000233025 KCNQ3O43525 872 aa22.28■■□□□ 1.16
SPCS1-201ENST00000233025 HIRAP54198 1017 aaPredicted RBP22.28■■□□□ 1.16
SPCS1-201ENST00000233025 CDHR2Q9BYE9 1310 aa22.28■■□□□ 1.16
SPCS1-201ENST00000233025 LAMB4A4D0S4 1761 aa22.27■■□□□ 1.16
SPCS1-201ENST00000233025 CEMIPQ8WUJ3 1361 aa22.27■■□□□ 1.16
SPCS1-201ENST00000233025 HOXA10P31260 410 aaPredicted RBP22.27■■□□□ 1.16
SPCS1-201ENST00000233025 GMPSP49915 693 aaPredicted RBP22.27■■□□□ 1.16
SPCS1-201ENST00000233025 CXCL9Q07325 125 aa22.27■■□□□ 1.16
SPCS1-201ENST00000233025 CDC37L1Q7L3B6 337 aa22.27■■□□□ 1.16
SPCS1-201ENST00000233025 RNF186Q9NXI6 227 aa22.27■■□□□ 1.16
SPCS1-201ENST00000233025 PPIP5K2O43314 1243 aa22.26■■□□□ 1.15
SPCS1-201ENST00000233025 NBPF15Q8N660 670 aa22.26■■□□□ 1.15
SPCS1-201ENST00000233025 TRPM4Q8TD43 1214 aa22.26■■□□□ 1.15
SPCS1-201ENST00000233025 HPS5Q9UPZ3 1129 aa22.26■■□□□ 1.15
SPCS1-201ENST00000233025 KIF7Q2M1P5 1343 aa22.26■■□□□ 1.15
SPCS1-201ENST00000233025 PRAMEF22A3QJZ6 481 aa22.25■■□□□ 1.15
SPCS1-201ENST00000233025 TRPA1O75762 1119 aa22.25■■□□□ 1.15
SPCS1-201ENST00000233025 AOC3Q16853 763 aa22.25■■□□□ 1.15
SPCS1-201ENST00000233025 RGMBQ6NW40 437 aa22.25■■□□□ 1.15
SPCS1-201ENST00000233025 GNAT3A8MTJ3 354 aa22.24■■□□□ 1.15
SPCS1-201ENST00000233025 C1QBPQ07021 282 aaKnown RBP22.24■■□□□ 1.15
SPCS1-201ENST00000233025 HLFQ16534 295 aa22.24■■□□□ 1.15
SPCS1-201ENST00000233025 NBPF26B4DH59 902 aa22.23■■□□□ 1.15
SPCS1-201ENST00000233025 GTF2E1P29083 439 aaPredicted RBP22.23■■□□□ 1.15
SPCS1-201ENST00000233025 KIF23Q02241 960 aaPredicted RBP22.23■■□□□ 1.15
SPCS1-201ENST00000233025 HABP4Q5JVS0 413 aaKnown RBP22.23■■□□□ 1.15
SPCS1-201ENST00000233025 NBPF10Q6P3W6 841 aaKnown RBP22.23■■□□□ 1.15
SPCS1-201ENST00000233025 NUTM1Q86Y26 1132 aa22.23■■□□□ 1.15
SPCS1-201ENST00000233025 ZNRF3Q9ULT6 936 aa22.23■■□□□ 1.15
SPCS1-201ENST00000233025 PPEF1O14829 653 aaPredicted RBP22.22■■□□□ 1.15
SPCS1-201ENST00000233025 DLK2Q6UY11 383 aa22.22■■□□□ 1.15
SPCS1-201ENST00000233025 RPGRQ92834 1020 aaKnown RBP22.22■■□□□ 1.15
SPCS1-201ENST00000233025 VPS33BQ9H267 617 aa22.21■■□□□ 1.15
SPCS1-201ENST00000233025 IBTKQ9P2D0 1353 aaPredicted RBP22.21■■□□□ 1.15
SPCS1-201ENST00000233025 LAMB2P55268 1798 aa22.2■■□□□ 1.14
SPCS1-201ENST00000233025 BTBD11A6QL63 1104 aa22.2■■□□□ 1.14
SPCS1-201ENST00000233025 USP48Q86UV5 1035 aa22.2■■□□□ 1.14
SPCS1-201ENST00000233025 GAS2L2Q8NHY3 880 aa22.2■■□□□ 1.14
SPCS1-201ENST00000233025 CCDC102AQ96A19 550 aa22.2■■□□□ 1.14
SPCS1-201ENST00000233025 CRAMP1Q96RY5 1269 aa22.2■■□□□ 1.14
SPCS1-201ENST00000233025 NYXQ9GZU5 481 aa22.2■■□□□ 1.14
SPCS1-201ENST00000233025 COL3A1P02461 1466 aaPredicted RBP22.2■■□□□ 1.14
SPCS1-201ENST00000233025 HTTP42858 3142 aa22.2■■□□□ 1.14
SPCS1-201ENST00000233025 SHTN1A0MZ66 631 aa22.19■■□□□ 1.14
SPCS1-201ENST00000233025 GBA2Q9HCG7 927 aaPredicted RBP22.19■■□□□ 1.14
SPCS1-201ENST00000233025 CEP290O15078 2479 aa22.18■■□□□ 1.14
SPCS1-201ENST00000233025 KIAA0100Q14667 2235 aaKnown RBP22.18■■□□□ 1.14
SPCS1-201ENST00000233025 TCERG1O14776 1098 aaKnown RBP22.17■■□□□ 1.14
SPCS1-201ENST00000233025 DIAPH1O60610 1272 aaKnown RBP22.17■■□□□ 1.14
SPCS1-201ENST00000233025 SLC10A3P09131 477 aa22.17■■□□□ 1.14
SPCS1-201ENST00000233025 SNRPA1P09661 255 aaKnown RBP22.17■■□□□ 1.14
SPCS1-201ENST00000233025 CSRNP1Q96S65 589 aa22.17■■□□□ 1.14
SPCS1-201ENST00000233025 RTFDC1Q9BY42 306 aaPredicted RBP22.17■■□□□ 1.14
SPCS1-201ENST00000233025 SZT2Q5T011 3432 aa22.16■■□□□ 1.14
SPCS1-201ENST00000233025 ZNF157P51786 506 aaPredicted RBP22.16■■□□□ 1.14
SPCS1-201ENST00000233025 PKN2Q16513 984 aaKnown RBP22.16■■□□□ 1.14
SPCS1-201ENST00000233025 RBM17Q96I25 401 aaKnown RBP22.16■■□□□ 1.14
SPCS1-201ENST00000233025 BCL2L13Q9BXK5 485 aa22.16■■□□□ 1.14
SPCS1-201ENST00000233025 ANKRD36CQ5JPF3 1778 aa22.15■■□□□ 1.14
SPCS1-201ENST00000233025 RBBP6Q7Z6E9 1792 aaKnown RBP22.15■■□□□ 1.14
SPCS1-201ENST00000233025 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP22.15■■□□□ 1.14
SPCS1-201ENST00000233025 CNOT7Q9UIV1 285 aaKnown RBP22.15■■□□□ 1.14
SPCS1-201ENST00000233025 DUOX1Q9NRD9 1551 aa22.15■■□□□ 1.14
SPCS1-201ENST00000233025 TRIOBPQ9H2D6 2365 aa22.14■■□□□ 1.14
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