RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000233331.11

INO80B-201, Transcript of INO80 complex subunit B, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene INO80B, Length 1,261 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
INO80B-201ENST00000233331 CHMP6Q96FZ7 201 aa27.91■■■□□ 2.06
INO80B-201ENST00000233331 NEUROD4Q9HD90 331 aa27.91■■■□□ 2.06
INO80B-201ENST00000233331 DKKL1Q9UK85 242 aa27.91■■■□□ 2.06
INO80B-201ENST00000233331 MAST4O15021 2626 aa27.9■■■□□ 2.06
INO80B-201ENST00000233331 SDHDO14521 159 aa27.9■■■□□ 2.06
INO80B-201ENST00000233331 UTS2O95399 124 aa27.9■■■□□ 2.06
INO80B-201ENST00000233331 HOXD4P09016 255 aaPredicted RBP27.9■■■□□ 2.06
INO80B-201ENST00000233331 CHRNB4P30926 498 aa27.9■■■□□ 2.06
INO80B-201ENST00000233331 SRD5A2P31213 254 aa27.9■■■□□ 2.06
INO80B-201ENST00000233331 CCT3P49368 545 aaKnown RBP27.9■■■□□ 2.06
INO80B-201ENST00000233331 CLK3P49761 638 aaKnown RBP27.9■■■□□ 2.06
INO80B-201ENST00000233331 TP53BP2Q13625 1128 aa27.9■■■□□ 2.06
INO80B-201ENST00000233331 NHSL2Q5HYW2 709 aa27.9■■■□□ 2.06
INO80B-201ENST00000233331 GALNT10Q86SR1 603 aa27.9■■■□□ 2.06
INO80B-201ENST00000233331 COX18Q8N8Q8 333 aa27.9■■■□□ 2.06
INO80B-201ENST00000233331 OR56A1Q8NGH5 318 aa27.9■■■□□ 2.06
INO80B-201ENST00000233331 PSMA8Q8TAA3 256 aa27.9■■■□□ 2.06
INO80B-201ENST00000233331 ABTB1Q969K4 478 aaPredicted RBP27.9■■■□□ 2.06
INO80B-201ENST00000233331 ARGLU1Q9NWB6 273 aaPredicted RBP27.9■■■□□ 2.06
INO80B-201ENST00000233331 CAMK2AQ9UQM7 478 aa27.9■■■□□ 2.06
INO80B-201ENST00000233331 HDAC3O15379 428 aa27.89■■■□□ 2.06
INO80B-201ENST00000233331 HMGN2P05204 90 aaKnown RBP27.89■■■□□ 2.06
INO80B-201ENST00000233331 PTGER4P35408 488 aa27.89■■■□□ 2.06
INO80B-201ENST00000233331 SOAT1P35610 550 aa27.89■■■□□ 2.06
INO80B-201ENST00000233331 DCST1Q5T197 706 aa27.89■■■□□ 2.06
INO80B-201ENST00000233331 OR4F3Q6IEY1 312 aa27.89■■■□□ 2.06
INO80B-201ENST00000233331 PM20D2Q8IYS1 436 aa27.89■■■□□ 2.06
INO80B-201ENST00000233331 PRDM14Q9GZV8 571 aa27.89■■■□□ 2.06
INO80B-201ENST00000233331 SDHAF3Q9NRP4 125 aa27.89■■■□□ 2.06
INO80B-201ENST00000233331 TAS2R10Q9NYW0 307 aa27.89■■■□□ 2.06
INO80B-201ENST00000233331 TRPC5OSA6NMA1 111 aa27.88■■■□□ 2.05
INO80B-201ENST00000233331 FAM90A27PA6NNH2 459 aa27.88■■■□□ 2.05
INO80B-201ENST00000233331 OCRLQ01968 901 aa27.88■■■□□ 2.05
INO80B-201ENST00000233331 GRAMD1BQ3KR37 738 aa27.88■■■□□ 2.05
INO80B-201ENST00000233331 OGFOD2Q6N063 350 aa27.88■■■□□ 2.05
INO80B-201ENST00000233331 FIGNL1Q6PIW4 674 aa27.88■■■□□ 2.05
INO80B-201ENST00000233331 IFNEQ86WN2 208 aa27.88■■■□□ 2.05
INO80B-201ENST00000233331 SFXN5Q8TD22 340 aa27.88■■■□□ 2.05
INO80B-201ENST00000233331 ATP6V1G3Q96LB4 118 aa27.88■■■□□ 2.05
INO80B-201ENST00000233331 TBL1XR1Q9BZK7 514 aa27.88■■■□□ 2.05
INO80B-201ENST00000233331 RTN4RQ9BZR6 473 aa27.88■■■□□ 2.05
INO80B-201ENST00000233331 NAV2Q8IVL1 2488 aa27.87■■■□□ 2.05
INO80B-201ENST00000233331 B4DXG7 233 aa27.87■■■□□ 2.05
INO80B-201ENST00000233331 HNRNPRO43390 633 aaKnown RBP27.87■■■□□ 2.05
INO80B-201ENST00000233331 KCNK2O95069 426 aa27.87■■■□□ 2.05
INO80B-201ENST00000233331 ACTL6AO96019 429 aa27.87■■■□□ 2.05
INO80B-201ENST00000233331 TCEA1P23193 301 aaKnown RBP27.87■■■□□ 2.05
INO80B-201ENST00000233331 HBA1P69905 142 aa27.87■■■□□ 2.05
INO80B-201ENST00000233331 ACSF3Q4G176 576 aaPredicted RBP27.87■■■□□ 2.05
INO80B-201ENST00000233331 EXOSC6Q5RKV6 272 aaKnown RBP27.87■■■□□ 2.05
INO80B-201ENST00000233331 MARCH3Q86UD3 253 aa27.87■■■□□ 2.05
INO80B-201ENST00000233331 WDR75Q8IWA0 830 aaKnown RBP27.87■■■□□ 2.05
INO80B-201ENST00000233331 CLECL1Q8IZS7 167 aa27.87■■■□□ 2.05
INO80B-201ENST00000233331 OR5AK3PQ8NH89 298 aa27.87■■■□□ 2.05
INO80B-201ENST00000233331 MARVELD3Q96A59 401 aa27.87■■■□□ 2.05
INO80B-201ENST00000233331 MOAP1Q96BY2 351 aa27.87■■■□□ 2.05
INO80B-201ENST00000233331 DSN1Q9H410 356 aa27.87■■■□□ 2.05
INO80B-201ENST00000233331 GOLGA8QA0A0J9YX86 632 aa27.86■■■□□ 2.05
INO80B-201ENST00000233331 GOLGA8OA6NCC3 632 aa27.86■■■□□ 2.05
INO80B-201ENST00000233331 AHRRA9YTQ3 701 aa27.86■■■□□ 2.05
INO80B-201ENST00000233331 GOLGA8NF8WBI6 632 aa27.86■■■□□ 2.05
INO80B-201ENST00000233331 SLCO1B7G3V0H7 640 aa27.86■■■□□ 2.05
INO80B-201ENST00000233331 C19orf84I3L1E1 186 aa27.86■■■□□ 2.05
INO80B-201ENST00000233331 ALDOCP09972 364 aaKnown RBP27.86■■■□□ 2.05
INO80B-201ENST00000233331 DPP4P27487 766 aa27.86■■■□□ 2.05
INO80B-201ENST00000233331 EPHA3P29320 983 aa27.86■■■□□ 2.05
INO80B-201ENST00000233331 KIR3DL1P43629 444 aa27.86■■■□□ 2.05
INO80B-201ENST00000233331 POU6F2P78424 691 aaPredicted RBP27.86■■■□□ 2.05
INO80B-201ENST00000233331 TTMPQ5BVD1 217 aa27.86■■■□□ 2.05
INO80B-201ENST00000233331 CDC73Q6P1J9 531 aa27.86■■■□□ 2.05
INO80B-201ENST00000233331 HDXQ7Z353 690 aa27.86■■■□□ 2.05
INO80B-201ENST00000233331 FADS6Q8N9I5 356 aa27.86■■■□□ 2.05
INO80B-201ENST00000233331 OR2M3Q8NG83 312 aa27.86■■■□□ 2.05
INO80B-201ENST00000233331 CDS1Q92903 461 aa27.86■■■□□ 2.05
INO80B-201ENST00000233331 WDYHV1Q96HA8 205 aa27.86■■■□□ 2.05
INO80B-201ENST00000233331 STACQ99469 402 aa27.86■■■□□ 2.05
INO80B-201ENST00000233331 ACTRT3Q9BYD9 372 aa27.86■■■□□ 2.05
INO80B-201ENST00000233331 WDR55Q9H6Y2 383 aaPredicted RBP27.86■■■□□ 2.05
INO80B-201ENST00000233331 DUSP22Q9NRW4 184 aa27.86■■■□□ 2.05
INO80B-201ENST00000233331 MED11Q9P086 117 aa27.86■■■□□ 2.05
INO80B-201ENST00000233331 FAF1Q9UNN5 650 aaPredicted RBP27.86■■■□□ 2.05
INO80B-201ENST00000233331 MED12Q93074 2177 aa27.85■■■□□ 2.05
INO80B-201ENST00000233331 A0A0G2JNJ9 132 aa27.85■■■□□ 2.05
INO80B-201ENST00000233331 ANKRD28O15084 1053 aa27.85■■■□□ 2.05
INO80B-201ENST00000233331 ADH7P40394 386 aa27.85■■■□□ 2.05
INO80B-201ENST00000233331 CLNS1AP54105 237 aaKnown RBP27.85■■■□□ 2.05
INO80B-201ENST00000233331 DSCR4P56555 118 aaPredicted RBP27.85■■■□□ 2.05
INO80B-201ENST00000233331 NME5P56597 212 aa27.85■■■□□ 2.05
INO80B-201ENST00000233331 WNT3P56703 355 aa27.85■■■□□ 2.05
INO80B-201ENST00000233331 CPEB4Q17RY0 729 aaKnown RBP eCLIP27.85■■■□□ 2.05
INO80B-201ENST00000233331 CCNJQ5T5M9 372 aa27.85■■■□□ 2.05
INO80B-201ENST00000233331 ZAR1Q86SH2 424 aa27.85■■■□□ 2.05
INO80B-201ENST00000233331 OR8J2Q8NGG1 315 aa27.85■■■□□ 2.05
INO80B-201ENST00000233331 LILRB4Q8NHJ6 448 aa27.85■■■□□ 2.05
INO80B-201ENST00000233331 FAM110BQ8TC76 370 aa27.85■■■□□ 2.05
INO80B-201ENST00000233331 SFXN2Q96NB2 322 aa27.85■■■□□ 2.05
INO80B-201ENST00000233331 BTBD2Q9BX70 525 aa27.85■■■□□ 2.05
INO80B-201ENST00000233331 PIGUQ9H490 435 aa27.85■■■□□ 2.05
INO80B-201ENST00000233331 GPATCH2Q9NW75 528 aa27.85■■■□□ 2.05
INO80B-201ENST00000233331 Q9UFV3 132 aa27.85■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.6 ms