RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000530295.5

NDUFS3-208, Transcript of NADH:ubiquinone oxidoreductase core subunit S3, human

TSL 3

Gene NDUFS3, Length 253 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
NDUFS3-208	ENST00000530295	FRG2C	A6NGY1	282 aa		13.57	□□□□□ -0.24
NDUFS3-208	ENST00000530295	OR6C70	A6NIJ9	312 aa		13.57	□□□□□ -0.24
NDUFS3-208	ENST00000530295	PHF1	O43189	567 aa	Predicted RBP	13.57	□□□□□ -0.24
NDUFS3-208	ENST00000530295	TLX2	O43763	284 aa	Predicted RBP	13.57	□□□□□ -0.24
NDUFS3-208	ENST00000530295	CD5L	O43866	347 aa		13.57	□□□□□ -0.24
NDUFS3-208	ENST00000530295	KERA	O60938	352 aa		13.57	□□□□□ -0.24
NDUFS3-208	ENST00000530295	NME6	O75414	186 aa	Predicted RBP	13.57	□□□□□ -0.24
NDUFS3-208	ENST00000530295	CBX7	O95931	251 aa		13.57	□□□□□ -0.24
NDUFS3-208	ENST00000530295	PCSK2	P16519	638 aa		13.57	□□□□□ -0.24
NDUFS3-208	ENST00000530295	HK1	P19367	917 aa		13.57	□□□□□ -0.24
NDUFS3-208	ENST00000530295	IDUA	P35475	653 aa		13.57	□□□□□ -0.24
NDUFS3-208	ENST00000530295	PPIC	P45877	212 aa		13.57	□□□□□ -0.24
NDUFS3-208	ENST00000530295	EEFSEC	P57772	596 aa	Known RBP	13.57	□□□□□ -0.24
NDUFS3-208	ENST00000530295	B3GALT5-AS1	P59052	145 aa		13.57	□□□□□ -0.24
NDUFS3-208	ENST00000530295	GPX6	P59796	221 aa		13.57	□□□□□ -0.24
NDUFS3-208	ENST00000530295	MRPS35	P82673	323 aa	Known RBP	13.57	□□□□□ -0.24
NDUFS3-208	ENST00000530295	DR1	Q01658	176 aa		13.57	□□□□□ -0.24
NDUFS3-208	ENST00000530295	OCRL	Q01968	901 aa		13.57	□□□□□ -0.24
NDUFS3-208	ENST00000530295	SLMAP	Q14BN4	828 aa		13.57	□□□□□ -0.24
NDUFS3-208	ENST00000530295	PON3	Q15166	354 aa		13.57	□□□□□ -0.24
NDUFS3-208	ENST00000530295	LTB4R	Q15722	352 aa		13.57	□□□□□ -0.24
NDUFS3-208	ENST00000530295	ZKSCAN8	Q15776	578 aa	Predicted RBP	13.57	□□□□□ -0.24
NDUFS3-208	ENST00000530295	TBC1D1	Q86TI0	1168 aa	Predicted RBP	13.57	□□□□□ -0.24
NDUFS3-208	ENST00000530295	WDR20	Q8TBZ3	569 aa		13.57	□□□□□ -0.24
NDUFS3-208	ENST00000530295	GTPBP3	Q969Y2	492 aa	Known RBP	13.57	□□□□□ -0.24
NDUFS3-208	ENST00000530295	TRMT61A	Q96FX7	289 aa	Known RBP	13.57	□□□□□ -0.24
NDUFS3-208	ENST00000530295	CPNE1	Q99829	537 aa		13.57	□□□□□ -0.24
NDUFS3-208	ENST00000530295	LRRC1	Q9BTT6	524 aa		13.57	□□□□□ -0.24
NDUFS3-208	ENST00000530295	DSN1	Q9H410	356 aa		13.57	□□□□□ -0.24
NDUFS3-208	ENST00000530295	IPPK	Q9H8X2	491 aa		13.57	□□□□□ -0.24
NDUFS3-208	ENST00000530295	RNF122	Q9H9V4	155 aa		13.57	□□□□□ -0.24
NDUFS3-208	ENST00000530295	PSD3	Q9NYI0	1048 aa		13.57	□□□□□ -0.24
NDUFS3-208	ENST00000530295	PRODH2	Q9UF12	536 aa		13.57	□□□□□ -0.24
NDUFS3-208	ENST00000530295	MRPS18C	Q9Y3D5	142 aa	Known RBP	13.57	□□□□□ -0.24
NDUFS3-208	ENST00000530295	CAD	P27708	2225 aa		13.57	□□□□□ -0.24
NDUFS3-208	ENST00000530295		B4DXG7	233 aa		13.56	□□□□□ -0.24
NDUFS3-208	ENST00000530295		H3BML4	177 aa		13.56	□□□□□ -0.24
NDUFS3-208	ENST00000530295	FOXE1	O00358	373 aa	Predicted RBP	13.56	□□□□□ -0.24
NDUFS3-208	ENST00000530295	SCO2	O43819	266 aa		13.56	□□□□□ -0.24
NDUFS3-208	ENST00000530295	TMCC2	O75069	709 aa		13.56	□□□□□ -0.24
NDUFS3-208	ENST00000530295	TNFRSF21	O75509	655 aa		13.56	□□□□□ -0.24
NDUFS3-208	ENST00000530295	LTA4H	P09960	611 aa	Known RBP	13.56	□□□□□ -0.24
NDUFS3-208	ENST00000530295	MTHFD2	P13995	350 aa		13.56	□□□□□ -0.24
NDUFS3-208	ENST00000530295	GFAP	P14136	432 aa		13.56	□□□□□ -0.24
NDUFS3-208	ENST00000530295	CSNK2A2	P19784	350 aa	Predicted RBP	13.56	□□□□□ -0.24
NDUFS3-208	ENST00000530295	IL12B	P29460	328 aa		13.56	□□□□□ -0.24
NDUFS3-208	ENST00000530295	KRT20	P35900	424 aa		13.56	□□□□□ -0.24
NDUFS3-208	ENST00000530295	ACVR1B	P36896	505 aa		13.56	□□□□□ -0.24
NDUFS3-208	ENST00000530295	GP5	P40197	560 aa		13.56	□□□□□ -0.24
NDUFS3-208	ENST00000530295	EMD	P50402	254 aa		13.56	□□□□□ -0.24
NDUFS3-208	ENST00000530295	MAPK12	P53778	367 aa		13.56	□□□□□ -0.24
NDUFS3-208	ENST00000530295	DSCR4	P56555	118 aa	Predicted RBP	13.56	□□□□□ -0.24
NDUFS3-208	ENST00000530295	DUSP2	Q05923	314 aa		13.56	□□□□□ -0.24
NDUFS3-208	ENST00000530295	GTF2H2	Q13888	395 aa		13.56	□□□□□ -0.24
NDUFS3-208	ENST00000530295	FGFBP1	Q14512	234 aa		13.56	□□□□□ -0.24
NDUFS3-208	ENST00000530295	SGCB	Q16585	318 aa		13.56	□□□□□ -0.24
NDUFS3-208	ENST00000530295	PFKFB4	Q16877	469 aa		13.56	□□□□□ -0.24
NDUFS3-208	ENST00000530295	GTF2H2C	Q6P1K8	395 aa		13.56	□□□□□ -0.24
NDUFS3-208	ENST00000530295	LARP4	Q71RC2	724 aa	Known RBP eCLIP	13.56	□□□□□ -0.24
NDUFS3-208	ENST00000530295	CTAGE3P	Q8IX95	158 aa		13.56	□□□□□ -0.24
NDUFS3-208	ENST00000530295	PYROXD1	Q8WU10	500 aa		13.56	□□□□□ -0.24
NDUFS3-208	ENST00000530295	NXNL1	Q96CM4	212 aa		13.56	□□□□□ -0.24
NDUFS3-208	ENST00000530295	KLHL29	Q96CT2	875 aa		13.56	□□□□□ -0.24
NDUFS3-208	ENST00000530295	ZBED6CL	Q96FA7	236 aa	Predicted RBP	13.56	□□□□□ -0.24
NDUFS3-208	ENST00000530295	CDK15	Q96Q40	435 aa		13.56	□□□□□ -0.24
NDUFS3-208	ENST00000530295	MRPL1	Q9BYD6	325 aa	Known RBP	13.56	□□□□□ -0.24
NDUFS3-208	ENST00000530295	ANKRA2	Q9H9E1	313 aa		13.56	□□□□□ -0.24
NDUFS3-208	ENST00000530295	PPP4R1L	Q9P1A2	415 aa		13.56	□□□□□ -0.24
NDUFS3-208	ENST00000530295	ZNF639	Q9UID6	485 aa		13.56	□□□□□ -0.24
NDUFS3-208	ENST00000530295	CLEC4A	Q9UMR7	237 aa		13.56	□□□□□ -0.24
NDUFS3-208	ENST00000530295	GPR55	Q9Y2T6	319 aa	Predicted RBP	13.56	□□□□□ -0.24
NDUFS3-208	ENST00000530295	ZNF337	Q9Y3M9	751 aa		13.56	□□□□□ -0.24
NDUFS3-208	ENST00000530295	PCDHA9	Q9Y5H5	950 aa		13.56	□□□□□ -0.24
NDUFS3-208	ENST00000530295		E7ESA3	106 aa		13.55	□□□□□ -0.24
NDUFS3-208	ENST00000530295	T	O15178	435 aa		13.55	□□□□□ -0.24
NDUFS3-208	ENST00000530295	AQP8	O94778	261 aa		13.55	□□□□□ -0.24
NDUFS3-208	ENST00000530295	SEC31A	O94979	1220 aa	Known RBP	13.55	□□□□□ -0.24
NDUFS3-208	ENST00000530295	SEMA3D	O95025	777 aa		13.55	□□□□□ -0.24
NDUFS3-208	ENST00000530295	ATP1B1	P05026	303 aa		13.55	□□□□□ -0.24
NDUFS3-208	ENST00000530295	PPP3CB	P16298	524 aa		13.55	□□□□□ -0.24
NDUFS3-208	ENST00000530295	CDKN1A	P38936	164 aa		13.55	□□□□□ -0.24
NDUFS3-208	ENST00000530295	ALDH9A1	P49189	494 aa		13.55	□□□□□ -0.24
NDUFS3-208	ENST00000530295	CORO7	P57737	925 aa		13.55	□□□□□ -0.24
NDUFS3-208	ENST00000530295	STX5	Q13190	355 aa		13.55	□□□□□ -0.24
NDUFS3-208	ENST00000530295	EFR3A	Q14156	821 aa		13.55	□□□□□ -0.24
NDUFS3-208	ENST00000530295	SGO1	Q5FBB7	561 aa		13.55	□□□□□ -0.24
NDUFS3-208	ENST00000530295	TTC19	Q6DKK2	380 aa	Predicted RBP	13.55	□□□□□ -0.24
NDUFS3-208	ENST00000530295	SLC48A1	Q6P1K1	146 aa		13.55	□□□□□ -0.24
NDUFS3-208	ENST00000530295	FAM214B	Q7L5A3	538 aa		13.55	□□□□□ -0.24
NDUFS3-208	ENST00000530295	GOLGA7	Q7Z5G4	137 aa		13.55	□□□□□ -0.24
NDUFS3-208	ENST00000530295	RAB3IL1	Q8TBN0	382 aa		13.55	□□□□□ -0.24
NDUFS3-208	ENST00000530295	ATP6V1E2	Q96A05	226 aa		13.55	□□□□□ -0.24
NDUFS3-208	ENST00000530295	EFHD2	Q96C19	240 aa	Predicted RBP	13.55	□□□□□ -0.24
NDUFS3-208	ENST00000530295	SLC35A4	Q96G79	324 aa		13.55	□□□□□ -0.24
NDUFS3-208	ENST00000530295	PRRG4	Q9BZD6	226 aa		13.55	□□□□□ -0.24
NDUFS3-208	ENST00000530295	PFDN4	Q9NQP4	134 aa		13.55	□□□□□ -0.24
NDUFS3-208	ENST00000530295	AHSP	Q9NZD4	102 aa		13.55	□□□□□ -0.24
NDUFS3-208	ENST00000530295	MED11	Q9P086	117 aa		13.55	□□□□□ -0.24
NDUFS3-208	ENST00000530295	CES1P1	Q9UKY3	287 aa		13.55	□□□□□ -0.24
NDUFS3-208	ENST00000530295	C1orf226	A1L170	272 aa		13.54	□□□□□ -0.24

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