RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000479153.1

SUMO3-206, Transcript of small ubiquitin-like modifier 3, human

TSL 2

Gene SUMO3, Length 1,736 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SUMO3-206	ENST00000479153	FBXO34	Q9NWN3	711 aa		12.1	□□□□□ -0.47
SUMO3-206	ENST00000479153	NPFFR2	Q9Y5X5	522 aa		12.1	□□□□□ -0.47
SUMO3-206	ENST00000479153		A8MVJ9	347 aa		12.09	□□□□□ -0.47
SUMO3-206	ENST00000479153	MKRN2OS	H3BPM6	223 aa		12.09	□□□□□ -0.47
SUMO3-206	ENST00000479153	REM1	O75628	298 aa		12.09	□□□□□ -0.47
SUMO3-206	ENST00000479153	IGKV1D-16	P01601	117 aa		12.09	□□□□□ -0.47
SUMO3-206	ENST00000479153	PDGFA	P04085	211 aa		12.09	□□□□□ -0.47
SUMO3-206	ENST00000479153	PPIB	P23284	216 aa	Known RBP	12.09	□□□□□ -0.47
SUMO3-206	ENST00000479153	TRHR	P34981	398 aa	Predicted RBP	12.09	□□□□□ -0.47
SUMO3-206	ENST00000479153	DSTN	P60981	165 aa		12.09	□□□□□ -0.47
SUMO3-206	ENST00000479153	PSME3	P61289	254 aa		12.09	□□□□□ -0.47
SUMO3-206	ENST00000479153	POU6F2	P78424	691 aa	Predicted RBP	12.09	□□□□□ -0.47
SUMO3-206	ENST00000479153	MRPS22	P82650	360 aa	Known RBP	12.09	□□□□□ -0.47
SUMO3-206	ENST00000479153	OC90	Q02509	493 aa	Predicted RBP	12.09	□□□□□ -0.47
SUMO3-206	ENST00000479153	SYPL1	Q16563	259 aa		12.09	□□□□□ -0.47
SUMO3-206	ENST00000479153	SLC34A3	Q8N130	599 aa		12.09	□□□□□ -0.47
SUMO3-206	ENST00000479153	ARMC10	Q8N2F6	343 aa		12.09	□□□□□ -0.47
SUMO3-206	ENST00000479153	BCORP1	Q8N888	145 aa		12.09	□□□□□ -0.47
SUMO3-206	ENST00000479153	OR10A6	Q8NH74	314 aa		12.09	□□□□□ -0.47
SUMO3-206	ENST00000479153	MAL2	Q969L2	176 aa		12.09	□□□□□ -0.47
SUMO3-206	ENST00000479153	ABHD17A	Q96GS6	310 aa		12.09	□□□□□ -0.47
SUMO3-206	ENST00000479153	GPATCH1	Q9BRR8	931 aa	Known RBP	12.09	□□□□□ -0.47
SUMO3-206	ENST00000479153	RAD21L1	Q9H4I0	556 aa		12.09	□□□□□ -0.47
SUMO3-206	ENST00000479153	DUSP22	Q9NRW4	184 aa		12.09	□□□□□ -0.47
SUMO3-206	ENST00000479153	GMPR2	Q9P2T1	348 aa	Known RBP	12.09	□□□□□ -0.47
SUMO3-206	ENST00000479153	PACSIN3	Q9UKS6	424 aa		12.09	□□□□□ -0.47
SUMO3-206	ENST00000479153	EPG5	Q9HCE0	2579 aa		12.09	□□□□□ -0.47
SUMO3-206	ENST00000479153	PRAMEF27	A3QJZ7	478 aa		12.08	□□□□□ -0.47
SUMO3-206	ENST00000479153	DUXA	A6NLW8	204 aa		12.08	□□□□□ -0.47
SUMO3-206	ENST00000479153	T	O15178	435 aa		12.08	□□□□□ -0.47
SUMO3-206	ENST00000479153	ACOX3	O15254	700 aa		12.08	□□□□□ -0.47
SUMO3-206	ENST00000479153	KCNK2	O95069	426 aa		12.08	□□□□□ -0.47
SUMO3-206	ENST00000479153	GPX2	P18283	190 aa		12.08	□□□□□ -0.47
SUMO3-206	ENST00000479153	MNAT1	P51948	309 aa		12.08	□□□□□ -0.47
SUMO3-206	ENST00000479153	SLC7A2	P52569	658 aa		12.08	□□□□□ -0.47
SUMO3-206	ENST00000479153	FBXW4	P57775	412 aa		12.08	□□□□□ -0.47
SUMO3-206	ENST00000479153	FUT5	Q11128	374 aa		12.08	□□□□□ -0.47
SUMO3-206	ENST00000479153	MFAP5	Q13361	173 aa		12.08	□□□□□ -0.47
SUMO3-206	ENST00000479153	DCST2	Q5T1A1	773 aa		12.08	□□□□□ -0.47
SUMO3-206	ENST00000479153	C8orf82	Q6P1X6	216 aa	Predicted RBP	12.08	□□□□□ -0.47
SUMO3-206	ENST00000479153	LYPD8	Q6UX82	237 aa		12.08	□□□□□ -0.47
SUMO3-206	ENST00000479153	HACD2	Q6Y1H2	254 aa		12.08	□□□□□ -0.47
SUMO3-206	ENST00000479153	C16orf62	Q7Z3J2	963 aa		12.08	□□□□□ -0.47
SUMO3-206	ENST00000479153	ZAR1	Q86SH2	424 aa		12.08	□□□□□ -0.47
SUMO3-206	ENST00000479153	RBM15B	Q8NDT2	890 aa	Known RBP	12.08	□□□□□ -0.47
SUMO3-206	ENST00000479153	FAM13C	Q8NE31	585 aa		12.08	□□□□□ -0.47
SUMO3-206	ENST00000479153	TMEM125	Q96AQ2	219 aa		12.08	□□□□□ -0.47
SUMO3-206	ENST00000479153	ADO	Q96SZ5	270 aa		12.08	□□□□□ -0.47
SUMO3-206	ENST00000479153	SMAD5	Q99717	465 aa	Known RBP	12.08	□□□□□ -0.47
SUMO3-206	ENST00000479153	HOPX	Q9BPY8	73 aa	Predicted RBP	12.08	□□□□□ -0.47
SUMO3-206	ENST00000479153	ECSIT	Q9BQ95	431 aa		12.08	□□□□□ -0.47
SUMO3-206	ENST00000479153	BTBD2	Q9BX70	525 aa		12.08	□□□□□ -0.47
SUMO3-206	ENST00000479153	KAT8	Q9H7Z6	458 aa	Known RBP	12.08	□□□□□ -0.47
SUMO3-206	ENST00000479153	HPF1	Q9NWY4	346 aa		12.08	□□□□□ -0.47
SUMO3-206	ENST00000479153	CMTM6	Q9NX76	183 aa		12.08	□□□□□ -0.47
SUMO3-206	ENST00000479153	GIN1	Q9NXP7	522 aa		12.08	□□□□□ -0.47
SUMO3-206	ENST00000479153	ABI3	Q9P2A4	366 aa		12.08	□□□□□ -0.47
SUMO3-206	ENST00000479153	USP22	Q9UPT9	525 aa		12.08	□□□□□ -0.47
SUMO3-206	ENST00000479153	CSAG2	Q9Y5P2	127 aa		12.08	□□□□□ -0.47
SUMO3-206	ENST00000479153	NPIPA5	A0A0B4J1W7	369 aa		12.08	□□□□□ -0.48
SUMO3-206	ENST00000479153	TTC36	A6NLP5	189 aa		12.08	□□□□□ -0.48
SUMO3-206	ENST00000479153	NPIPA7	E9PJI5	369 aa		12.08	□□□□□ -0.48
SUMO3-206	ENST00000479153	UGT2B11	O75310	529 aa		12.08	□□□□□ -0.48
SUMO3-206	ENST00000479153	NPIPA8	P0DM63	369 aa		12.08	□□□□□ -0.48
SUMO3-206	ENST00000479153	IL12B	P29460	328 aa		12.08	□□□□□ -0.48
SUMO3-206	ENST00000479153	KRT20	P35900	424 aa		12.08	□□□□□ -0.48
SUMO3-206	ENST00000479153	PIGA	P37287	484 aa		12.08	□□□□□ -0.48
SUMO3-206	ENST00000479153	CD96	P40200	585 aa		12.08	□□□□□ -0.48
SUMO3-206	ENST00000479153	CD97	P48960	835 aa		12.08	□□□□□ -0.48
SUMO3-206	ENST00000479153	ARG2	P78540	354 aa		12.08	□□□□□ -0.48
SUMO3-206	ENST00000479153	FADD	Q13158	208 aa		12.08	□□□□□ -0.48
SUMO3-206	ENST00000479153	TUBA3C	Q13748	450 aa		12.08	□□□□□ -0.48
SUMO3-206	ENST00000479153	DECR1	Q16698	335 aa		12.08	□□□□□ -0.48
SUMO3-206	ENST00000479153	CYP51A1	Q16850	503 aa		12.08	□□□□□ -0.48
SUMO3-206	ENST00000479153	CYP27C1	Q4G0S4	372 aa		12.08	□□□□□ -0.48
SUMO3-206	ENST00000479153	GPAT3	Q53EU6	434 aa		12.08	□□□□□ -0.48
SUMO3-206	ENST00000479153	ATAD3B	Q5T9A4	648 aa		12.08	□□□□□ -0.48
SUMO3-206	ENST00000479153	SPINK14	Q6IE38	97 aa		12.08	□□□□□ -0.48
SUMO3-206	ENST00000479153	TUBA3E	Q6PEY2	450 aa		12.08	□□□□□ -0.48
SUMO3-206	ENST00000479153	OPN5	Q6U736	354 aa		12.08	□□□□□ -0.48
SUMO3-206	ENST00000479153	IFNE	Q86WN2	208 aa		12.08	□□□□□ -0.48
SUMO3-206	ENST00000479153	SLC15A3	Q8IY34	581 aa		12.08	□□□□□ -0.48
SUMO3-206	ENST00000479153	DEFB107A	Q8IZN7	70 aa		12.08	□□□□□ -0.48
SUMO3-206	ENST00000479153	CYP4Z2P	Q8N1L4	340 aa		12.08	□□□□□ -0.48
SUMO3-206	ENST00000479153	ANKFN1	Q8N957	763 aa		12.08	□□□□□ -0.48
SUMO3-206	ENST00000479153	OR8J3	Q8NGG0	315 aa		12.08	□□□□□ -0.48
SUMO3-206	ENST00000479153	SPACA9	Q96E40	222 aa	Predicted RBP	12.08	□□□□□ -0.48
SUMO3-206	ENST00000479153	SIGLEC12	Q96PQ1	595 aa		12.08	□□□□□ -0.48
SUMO3-206	ENST00000479153	UTP23	Q9BRU9	249 aa	Known RBP	12.08	□□□□□ -0.48
SUMO3-206	ENST00000479153	ZNF71	Q9NQZ8	489 aa	Predicted RBP	12.08	□□□□□ -0.48
SUMO3-206	ENST00000479153	EXD2	Q9NVH0	621 aa		12.08	□□□□□ -0.48
SUMO3-206	ENST00000479153	CORO2B	Q9UQ03	480 aa		12.08	□□□□□ -0.48
SUMO3-206	ENST00000479153	TP53TG5	Q9Y2B4	290 aa		12.08	□□□□□ -0.48
SUMO3-206	ENST00000479153	L3MBTL1	Q9Y468	752 aa		12.08	□□□□□ -0.48
SUMO3-206	ENST00000479153	PCDHGB3	Q9Y5G1	929 aa		12.08	□□□□□ -0.48
SUMO3-206	ENST00000479153	PCDHGA9	Q9Y5G4	932 aa	Known RBP	12.08	□□□□□ -0.48
SUMO3-206	ENST00000479153	EBAG9	O00559	213 aa		12.07	□□□□□ -0.48
SUMO3-206	ENST00000479153	NME4	O00746	187 aa		12.07	□□□□□ -0.48
SUMO3-206	ENST00000479153	ASNA1	O43681	348 aa		12.07	□□□□□ -0.48
SUMO3-206	ENST00000479153	TSPAN2	O60636	221 aa		12.07	□□□□□ -0.48

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