RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000515965.1

RNU6-377P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 377, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-377P, Length 102 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-377P-201ENST00000515965 GOT2P00505 430 aaKnown RBP2.05□□□□□ -2.08
RNU6-377P-201ENST00000515965 PIGRP01833 764 aa2.05□□□□□ -2.08
RNU6-377P-201ENST00000515965 SNRPCP09234 159 aaKnown RBP2.05□□□□□ -2.08
RNU6-377P-201ENST00000515965 HOXB7P09629 217 aa2.05□□□□□ -2.08
RNU6-377P-201ENST00000515965 HSD17B1P14061 328 aa2.05□□□□□ -2.08
RNU6-377P-201ENST00000515965 UCP1P25874 307 aa2.05□□□□□ -2.08
RNU6-377P-201ENST00000515965 CALML3P27482 149 aa2.05□□□□□ -2.08
RNU6-377P-201ENST00000515965 PTPN4P29074 926 aa2.05□□□□□ -2.08
RNU6-377P-201ENST00000515965 NPY2RP49146 381 aa2.05□□□□□ -2.08
RNU6-377P-201ENST00000515965 NUMBP49757 651 aa2.05□□□□□ -2.08
RNU6-377P-201ENST00000515965 CSRP3P50461 194 aa2.05□□□□□ -2.08
RNU6-377P-201ENST00000515965 SGSHP51688 502 aa2.05□□□□□ -2.08
RNU6-377P-201ENST00000515965 VCPP55072 806 aaKnown RBP2.05□□□□□ -2.08
RNU6-377P-201ENST00000515965 NLRP11P59045 1033 aaKnown RBP2.05□□□□□ -2.08
RNU6-377P-201ENST00000515965 GSTO1P78417 241 aa2.05□□□□□ -2.08
RNU6-377P-201ENST00000515965 ABRAXAS2Q15018 415 aa2.05□□□□□ -2.08
RNU6-377P-201ENST00000515965 Q1RN00 199 aa2.05□□□□□ -2.08
RNU6-377P-201ENST00000515965 ZNF699Q32M78 642 aa2.05□□□□□ -2.08
RNU6-377P-201ENST00000515965 C14orf28Q4W4Y0 310 aa2.05□□□□□ -2.08
RNU6-377P-201ENST00000515965 CMPK2Q5EBM0 449 aa2.05□□□□□ -2.08
RNU6-377P-201ENST00000515965 TCHHL1Q5QJ38 904 aaPredicted RBP2.05□□□□□ -2.08
RNU6-377P-201ENST00000515965 FAM219BQ5XKK7 198 aa2.05□□□□□ -2.08
RNU6-377P-201ENST00000515965 TATDN1Q6P1N9 297 aa2.05□□□□□ -2.08
RNU6-377P-201ENST00000515965 OLFM4Q6UX06 510 aa2.05□□□□□ -2.08
RNU6-377P-201ENST00000515965 BAIAP2L2Q6UXY1 529 aa2.05□□□□□ -2.08
RNU6-377P-201ENST00000515965 MIER3Q7Z3K6 550 aa2.05□□□□□ -2.08
RNU6-377P-201ENST00000515965 BNIPLQ7Z465 357 aa2.05□□□□□ -2.08
RNU6-377P-201ENST00000515965 LUZP1Q86V48 1076 aa2.05□□□□□ -2.08
RNU6-377P-201ENST00000515965 RANBP3LQ86VV4 465 aaPredicted RBP2.05□□□□□ -2.08
RNU6-377P-201ENST00000515965 HPS6Q86YV9 775 aa2.05□□□□□ -2.08
RNU6-377P-201ENST00000515965 BATF2Q8N1L9 274 aa2.05□□□□□ -2.08
RNU6-377P-201ENST00000515965 ARL14Q8N4G2 192 aa2.05□□□□□ -2.08
RNU6-377P-201ENST00000515965 CCNYQ8ND76 341 aa2.05□□□□□ -2.08
RNU6-377P-201ENST00000515965 TYMSOSQ8TAI1 123 aa2.05□□□□□ -2.08
RNU6-377P-201ENST00000515965 MGARPQ8TDB4 240 aa2.05□□□□□ -2.08
RNU6-377P-201ENST00000515965 U2AF1L4Q8WU68 220 aaKnown RBP2.05□□□□□ -2.08
RNU6-377P-201ENST00000515965 DLX4Q92988 240 aaPredicted RBP2.05□□□□□ -2.08
RNU6-377P-201ENST00000515965 BIRC7Q96CA5 298 aa2.05□□□□□ -2.08
RNU6-377P-201ENST00000515965 RUFY1Q96T51 708 aa2.05□□□□□ -2.08
RNU6-377P-201ENST00000515965 FAM173AQ9BQD7 235 aa2.05□□□□□ -2.08
RNU6-377P-201ENST00000515965 DDX47Q9H0S4 455 aaKnown RBP2.05□□□□□ -2.08
RNU6-377P-201ENST00000515965 ABCG4Q9H172 646 aa2.05□□□□□ -2.08
RNU6-377P-201ENST00000515965 RNF41Q9H4P4 317 aaPredicted RBP2.05□□□□□ -2.08
RNU6-377P-201ENST00000515965 ALG9Q9H6U8 611 aa2.05□□□□□ -2.08
RNU6-377P-201ENST00000515965 GPR83Q9NYM4 423 aa2.05□□□□□ -2.08
RNU6-377P-201ENST00000515965 TAS2R16Q9NYV7 291 aa2.05□□□□□ -2.08
RNU6-377P-201ENST00000515965 NDUFA13Q9P0J0 144 aa2.05□□□□□ -2.08
RNU6-377P-201ENST00000515965 SENP1Q9P0U3 644 aa2.05□□□□□ -2.08
RNU6-377P-201ENST00000515965 DHRS4-AS1Q9P1J3 65 aa2.05□□□□□ -2.08
RNU6-377P-201ENST00000515965 MBD2Q9UBB5 411 aa2.05□□□□□ -2.08
RNU6-377P-201ENST00000515965 MIOXQ9UGB7 285 aa2.05□□□□□ -2.08
RNU6-377P-201ENST00000515965 CCPG1Q9ULG6 757 aa2.05□□□□□ -2.08
RNU6-377P-201ENST00000515965 ZNF175Q9Y473 711 aa2.05□□□□□ -2.08
RNU6-377P-201ENST00000515965 RALGAPA1Q6GYQ0 2036 aa2.05□□□□□ -2.08
RNU6-377P-201ENST00000515965 ATRXP46100 2492 aa2.05□□□□□ -2.08
RNU6-377P-201ENST00000515965 TRIM49BA6NDI0 452 aa2.04□□□□□ -2.08
RNU6-377P-201ENST00000515965 ZNF487B1APH4 448 aa2.04□□□□□ -2.08
RNU6-377P-201ENST00000515965 K7ERI5 159 aa2.04□□□□□ -2.08
RNU6-377P-201ENST00000515965 EI24O14681 340 aa2.04□□□□□ -2.08
RNU6-377P-201ENST00000515965 PHOX2AO14813 284 aa2.04□□□□□ -2.08
RNU6-377P-201ENST00000515965 STK17BO94768 372 aa2.04□□□□□ -2.08
RNU6-377P-201ENST00000515965 TOXO94900 526 aa2.04□□□□□ -2.08
RNU6-377P-201ENST00000515965 UBE4BO95155 1302 aa2.04□□□□□ -2.08
RNU6-377P-201ENST00000515965 NUDT14O95848 222 aa2.04□□□□□ -2.08
RNU6-377P-201ENST00000515965 IGHV3-9P01782 118 aa2.04□□□□□ -2.08
RNU6-377P-201ENST00000515965 GNSP15586 552 aa2.04□□□□□ -2.08
RNU6-377P-201ENST00000515965 STMN1P16949 149 aa2.04□□□□□ -2.08
RNU6-377P-201ENST00000515965 MATKP42679 507 aa2.04□□□□□ -2.08
RNU6-377P-201ENST00000515965 SLC7A2P52569 658 aa2.04□□□□□ -2.08
RNU6-377P-201ENST00000515965 HAND2P61296 217 aa2.04□□□□□ -2.08
RNU6-377P-201ENST00000515965 TRA2BP62995 288 aaKnown RBP2.04□□□□□ -2.08
RNU6-377P-201ENST00000515965 NAAAQ02083 359 aa2.04□□□□□ -2.08
RNU6-377P-201ENST00000515965 ZNF85Q03923 595 aa2.04□□□□□ -2.08
RNU6-377P-201ENST00000515965 GAMTQ14353 236 aa2.04□□□□□ -2.08
RNU6-377P-201ENST00000515965 LRIT3Q3SXY7 679 aa2.04□□□□□ -2.08
RNU6-377P-201ENST00000515965 ACSF3Q4G176 576 aaPredicted RBP2.04□□□□□ -2.08
RNU6-377P-201ENST00000515965 GPRASP1Q5JY77 1395 aa2.04□□□□□ -2.08
RNU6-377P-201ENST00000515965 FAM159AQ6UWV7 190 aa2.04□□□□□ -2.08
RNU6-377P-201ENST00000515965 CWC27Q6UX04 472 aaKnown RBP2.04□□□□□ -2.08
RNU6-377P-201ENST00000515965 DPY19L2P2Q6ZN68 376 aa2.04□□□□□ -2.08
RNU6-377P-201ENST00000515965 TAF8Q7Z7C8 310 aa2.04□□□□□ -2.08
RNU6-377P-201ENST00000515965 AMZ2Q86W34 360 aa2.04□□□□□ -2.08
RNU6-377P-201ENST00000515965 ELMOD2Q8IZ81 293 aa2.04□□□□□ -2.08
RNU6-377P-201ENST00000515965 LRRC17Q8N6Y2 441 aa2.04□□□□□ -2.08
RNU6-377P-201ENST00000515965 ZNF397Q8NF99 534 aaPredicted RBP2.04□□□□□ -2.08
RNU6-377P-201ENST00000515965 NEK11Q8NG66 645 aa2.04□□□□□ -2.08
RNU6-377P-201ENST00000515965 TBCKQ8TEA7 893 aa2.04□□□□□ -2.08
RNU6-377P-201ENST00000515965 SLC13A3Q8WWT9 602 aa2.04□□□□□ -2.08
RNU6-377P-201ENST00000515965 CRYGNQ8WXF5 182 aa2.04□□□□□ -2.08
RNU6-377P-201ENST00000515965 RBM18Q96H35 190 aaKnown RBP2.04□□□□□ -2.08
RNU6-377P-201ENST00000515965 DEFB118Q96PH6 123 aa2.04□□□□□ -2.08
RNU6-377P-201ENST00000515965 RANBP9Q96S59 729 aa2.04□□□□□ -2.08
RNU6-377P-201ENST00000515965 APOL2Q9BQE5 337 aa2.04□□□□□ -2.08
RNU6-377P-201ENST00000515965 SPXQ9BT56 116 aa2.04□□□□□ -2.08
RNU6-377P-201ENST00000515965 NDUFAF3Q9BU61 184 aa2.04□□□□□ -2.08
RNU6-377P-201ENST00000515965 NLNQ9BYT8 704 aa2.04□□□□□ -2.08
RNU6-377P-201ENST00000515965 TRIM9Q9C026 710 aa2.04□□□□□ -2.08
RNU6-377P-201ENST00000515965 SIRPDQ9H106 197 aa2.04□□□□□ -2.08
RNU6-377P-201ENST00000515965 SYTL2Q9HCH5 934 aa2.04□□□□□ -2.08
RNU6-377P-201ENST00000515965 SLC7A10Q9NS82 523 aa2.04□□□□□ -2.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 51.6 ms