RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000373779.7

PTPRU-202, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type U, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRU, Length 5,579 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRU-202ENST00000373779 J3KTA2 159 aa16.55■□□□□ 0.24
PTPRU-202ENST00000373779 KCNK5O95279 499 aa16.55■□□□□ 0.24
PTPRU-202ENST00000373779 LDOC1O95751 146 aaPredicted RBP16.55■□□□□ 0.24
PTPRU-202ENST00000373779 H2AFB2P0C5Z0 115 aa16.55■□□□□ 0.24
PTPRU-202ENST00000373779 PYCR1P32322 319 aa16.55■□□□□ 0.24
PTPRU-202ENST00000373779 ACVR1BP36896 505 aa16.55■□□□□ 0.24
PTPRU-202ENST00000373779 ELOAQ14241 798 aaKnown RBP16.55■□□□□ 0.24
PTPRU-202ENST00000373779 ENTHD1Q8IYW4 607 aa16.55■□□□□ 0.24
PTPRU-202ENST00000373779 FCAMRQ8WWV6 532 aa16.55■□□□□ 0.24
PTPRU-202ENST00000373779 RAB7BQ96AH8 199 aa16.55■□□□□ 0.24
PTPRU-202ENST00000373779 ISG20Q96AZ6 181 aaKnown RBP16.55■□□□□ 0.24
PTPRU-202ENST00000373779 HRASLS5Q96KN8 279 aa16.55■□□□□ 0.24
PTPRU-202ENST00000373779 ZNF717Q9BY31 904 aaPredicted RBP16.55■□□□□ 0.24
PTPRU-202ENST00000373779 MAFFQ9ULX9 164 aa16.55■□□□□ 0.24
PTPRU-202ENST00000373779 PPIEQ9UNP9 301 aaKnown RBP16.55■□□□□ 0.24
PTPRU-202ENST00000373779 MEIOCA2RUB1 952 aa16.54■□□□□ 0.24
PTPRU-202ENST00000373779 CTDSP2O14595 271 aa16.54■□□□□ 0.24
PTPRU-202ENST00000373779 IGLV3-25P01717 112 aa16.54■□□□□ 0.24
PTPRU-202ENST00000373779 NDUFAF5Q5TEU4 345 aa16.54■□□□□ 0.24
PTPRU-202ENST00000373779 BAIAP2L2Q6UXY1 529 aa16.54■□□□□ 0.24
PTPRU-202ENST00000373779 OR8K5Q8NH50 307 aa16.54■□□□□ 0.24
PTPRU-202ENST00000373779 OR51A7Q8NH64 312 aa16.54■□□□□ 0.24
PTPRU-202ENST00000373779 DEDD2Q8WXF8 326 aa16.54■□□□□ 0.24
PTPRU-202ENST00000373779 CPEB1Q9BZB8 566 aaKnown RBP16.54■□□□□ 0.24
PTPRU-202ENST00000373779 IGFBP6P24592 240 aaPredicted RBP16.54■□□□□ 0.24
PTPRU-202ENST00000373779 DNASE1P24855 282 aa16.54■□□□□ 0.24
PTPRU-202ENST00000373779 HBA1P69905 142 aa16.54■□□□□ 0.24
PTPRU-202ENST00000373779 ZNF776Q68DI1 518 aaPredicted RBP16.54■□□□□ 0.24
PTPRU-202ENST00000373779 MBOAT4Q96T53 435 aa16.54■□□□□ 0.24
PTPRU-202ENST00000373779 COL24A1Q17RW2 1714 aa16.54■□□□□ 0.24
PTPRU-202ENST00000373779 A0A1W2PPK0 400 aa16.54■□□□□ 0.24
PTPRU-202ENST00000373779 UGT2B10P36537 528 aa16.54■□□□□ 0.24
PTPRU-202ENST00000373779 ISL1P61371 349 aa16.54■□□□□ 0.24
PTPRU-202ENST00000373779 SNRPD2P62316 118 aaKnown RBP16.54■□□□□ 0.24
PTPRU-202ENST00000373779 SWI5Q1ZZU3 235 aa16.54■□□□□ 0.24
PTPRU-202ENST00000373779 AAK1Q2M2I8 961 aa16.54■□□□□ 0.24
PTPRU-202ENST00000373779 C2orf27AQ580R0 203 aa16.54■□□□□ 0.24
PTPRU-202ENST00000373779 STEAP3Q658P3 488 aa16.54■□□□□ 0.24
PTPRU-202ENST00000373779 PRAMEF17Q5VTA0 474 aa16.54■□□□□ 0.24
PTPRU-202ENST00000373779 AFMIDQ63HM1 303 aa16.54■□□□□ 0.24
PTPRU-202ENST00000373779 LRRC25Q8N386 305 aaPredicted RBP16.54■□□□□ 0.24
PTPRU-202ENST00000373779 HAVCR1Q96D42 359 aa16.54■□□□□ 0.24
PTPRU-202ENST00000373779 DPH7Q9BTV6 452 aa16.54■□□□□ 0.24
PTPRU-202ENST00000373779 SORBS1Q9BX66 1292 aaKnown RBP16.54■□□□□ 0.24
PTPRU-202ENST00000373779 AMBRA1Q9C0C7 1298 aa16.54■□□□□ 0.24
PTPRU-202ENST00000373779 ACTR6Q9GZN1 396 aa16.54■□□□□ 0.24
PTPRU-202ENST00000373779 A0A0X1KG70 313 aa16.54■□□□□ 0.24
PTPRU-202ENST00000373779 A0A1W2PQ09 198 aa16.54■□□□□ 0.24
PTPRU-202ENST00000373779 HMX3A6NHT5 357 aa16.54■□□□□ 0.24
PTPRU-202ENST00000373779 PCP4L1A6NKN8 68 aa16.54■□□□□ 0.24
PTPRU-202ENST00000373779 GNSP15586 552 aa16.54■□□□□ 0.24
PTPRU-202ENST00000373779 FSHRP23945 695 aa16.54■□□□□ 0.24
PTPRU-202ENST00000373779 CASP3P42574 277 aa16.54■□□□□ 0.24
PTPRU-202ENST00000373779 MAGEA2P43356 314 aa16.54■□□□□ 0.24
PTPRU-202ENST00000373779 SLC25A25Q6KCM7 469 aa16.54■□□□□ 0.24
PTPRU-202ENST00000373779 SPNS2Q8IVW8 549 aa16.54■□□□□ 0.24
PTPRU-202ENST00000373779 NRMQ8IXM6 262 aa16.54■□□□□ 0.24
PTPRU-202ENST00000373779 ACTL8Q9H568 366 aa16.54■□□□□ 0.24
PTPRU-202ENST00000373779 SNAPC5O75971 98 aa16.53■□□□□ 0.24
PTPRU-202ENST00000373779 SGSHP51688 502 aa16.53■□□□□ 0.24
PTPRU-202ENST00000373779 ELAVL3Q14576 367 aaKnown RBP16.53■□□□□ 0.24
PTPRU-202ENST00000373779 FLYWCH1Q4VC44 716 aa16.53■□□□□ 0.24
PTPRU-202ENST00000373779 TCEAL8Q8IYN2 117 aa16.53■□□□□ 0.24
PTPRU-202ENST00000373779 NUDT8Q8WV74 236 aa16.53■□□□□ 0.24
PTPRU-202ENST00000373779 SLC6A16Q9GZN6 736 aa16.53■□□□□ 0.24
PTPRU-202ENST00000373779 ASIC5Q9NY37 505 aa16.53■□□□□ 0.24
PTPRU-202ENST00000373779 ARFGEF1Q9Y6D6 1849 aa16.53■□□□□ 0.24
PTPRU-202ENST00000373779 GOLGA4Q13439 2230 aaKnown RBP16.53■□□□□ 0.24
PTPRU-202ENST00000373779 SSTR4P31391 388 aa16.53■□□□□ 0.24
PTPRU-202ENST00000373779 WDR5P61964 334 aaKnown RBP16.53■□□□□ 0.24
PTPRU-202ENST00000373779 MAP4K2Q12851 820 aa16.53■□□□□ 0.24
PTPRU-202ENST00000373779 PLBD1Q6P4A8 553 aa16.53■□□□□ 0.24
PTPRU-202ENST00000373779 SLC46A3Q7Z3Q1 461 aa16.53■□□□□ 0.24
PTPRU-202ENST00000373779 ASPGQ86U10 573 aa16.53■□□□□ 0.24
PTPRU-202ENST00000373779 L3MBTL4Q8NA19 623 aa16.53■□□□□ 0.24
PTPRU-202ENST00000373779 SLC25A36Q96CQ1 311 aa16.53■□□□□ 0.24
PTPRU-202ENST00000373779 EXO5Q9H790 373 aa16.53■□□□□ 0.24
PTPRU-202ENST00000373779 TLR9Q9NR96 1032 aa16.53■□□□□ 0.24
PTPRU-202ENST00000373779 MSRAQ9UJ68 235 aa16.53■□□□□ 0.24
PTPRU-202ENST00000373779 SHANK3Q9BYB0 1731 aa16.53■□□□□ 0.24
PTPRU-202ENST00000373779 BLOC1S5-TXNDC5H3BN57 136 aa16.53■□□□□ 0.24
PTPRU-202ENST00000373779 PRODHO43272 600 aa16.53■□□□□ 0.24
PTPRU-202ENST00000373779 TRIM3O75382 744 aaPredicted RBP16.53■□□□□ 0.24
PTPRU-202ENST00000373779 PIM1P11309 404 aaPredicted RBP16.53■□□□□ 0.24
PTPRU-202ENST00000373779 ZNF267Q14586 743 aaPredicted RBP16.53■□□□□ 0.24
PTPRU-202ENST00000373779 KDM4DQ6B0I6 523 aa16.53■□□□□ 0.24
PTPRU-202ENST00000373779 FAM83FQ8NEG4 500 aaPredicted RBP16.53■□□□□ 0.24
PTPRU-202ENST00000373779 DNAJA4Q8WW22 397 aaPredicted RBP16.53■□□□□ 0.24
PTPRU-202ENST00000373779 TAPBPLQ9BX59 468 aa16.53■□□□□ 0.24
PTPRU-202ENST00000373779 B3GNT4Q9C0J1 378 aa16.53■□□□□ 0.24
PTPRU-202ENST00000373779 ST6GALNAC1Q9NSC7 600 aaPredicted RBP16.53■□□□□ 0.24
PTPRU-202ENST00000373779 GRXCR1A8MXD5 290 aa16.53■□□□□ 0.24
PTPRU-202ENST00000373779 EPCAMP16422 314 aa16.53■□□□□ 0.24
PTPRU-202ENST00000373779 CXCR1P25024 350 aa16.53■□□□□ 0.24
PTPRU-202ENST00000373779 RNF144AP50876 292 aaPredicted RBP16.53■□□□□ 0.24
PTPRU-202ENST00000373779 THEM6Q8WUY1 208 aa16.53■□□□□ 0.24
PTPRU-202ENST00000373779 HSPA12BQ96MM6 686 aa16.53■□□□□ 0.24
PTPRU-202ENST00000373779 TRPV4Q9HBA0 871 aa16.53■□□□□ 0.24
PTPRU-202ENST00000373779 FBXL21Q9UKT6 434 aa16.53■□□□□ 0.24
PTPRU-202ENST00000373779 FXYD1O00168 92 aa16.52■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 58.1 ms