RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000263012.10

NOMO3-201, Transcript of NODAL modulator 3, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene NOMO3, Length 3,911 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOMO3-201ENST00000263012 MCCC1Q96RQ3 725 aaPredicted RBP16.79■□□□□ 0.28
NOMO3-201ENST00000263012 MYEF2Q9P2K5 600 aaKnown RBP16.79■□□□□ 0.28
NOMO3-201ENST00000263012 WDR45Q9Y484 360 aa16.79■□□□□ 0.28
NOMO3-201ENST00000263012 FKBP7Q9Y680 259 aa16.79■□□□□ 0.28
NOMO3-201ENST00000263012 GKN3PP0CG01 181 aa16.79■□□□□ 0.28
NOMO3-201ENST00000263012 C4BPBP20851 252 aa16.79■□□□□ 0.28
NOMO3-201ENST00000263012 AHCYP23526 432 aa16.79■□□□□ 0.28
NOMO3-201ENST00000263012 ARL4DP49703 201 aa16.79■□□□□ 0.28
NOMO3-201ENST00000263012 ZNF155Q12901 538 aaPredicted RBP16.79■□□□□ 0.28
NOMO3-201ENST00000263012 DSG2Q14126 1118 aa16.79■□□□□ 0.28
NOMO3-201ENST00000263012 PLEKHS1Q5SXH7 462 aa16.79■□□□□ 0.28
NOMO3-201ENST00000263012 CCNJQ5T5M9 372 aa16.79■□□□□ 0.28
NOMO3-201ENST00000263012 MLIPQ5VWP3 458 aa16.79■□□□□ 0.28
NOMO3-201ENST00000263012 GRASPQ7Z6J2 395 aaPredicted RBP16.79■□□□□ 0.28
NOMO3-201ENST00000263012 PMEPA1Q969W9 287 aa16.79■□□□□ 0.28
NOMO3-201ENST00000263012 IGSF21Q96ID5 467 aa16.79■□□□□ 0.28
NOMO3-201ENST00000263012 SPACA7Q96KW9 195 aa16.79■□□□□ 0.28
NOMO3-201ENST00000263012 MRPS30Q9NP92 439 aaKnown RBP16.79■□□□□ 0.28
NOMO3-201ENST00000263012 PIP5K1CO60331 668 aa16.78■□□□□ 0.28
NOMO3-201ENST00000263012 FBXO45P0C2W1 286 aa16.78■□□□□ 0.28
NOMO3-201ENST00000263012 LHCGRP22888 699 aa16.78■□□□□ 0.28
NOMO3-201ENST00000263012 HLA-FP30511 346 aa16.78■□□□□ 0.28
NOMO3-201ENST00000263012 PNLIPRP1P54315 467 aa16.78■□□□□ 0.28
NOMO3-201ENST00000263012 CLDN2P57739 230 aa16.78■□□□□ 0.28
NOMO3-201ENST00000263012 CXCR4P61073 352 aa16.78■□□□□ 0.28
NOMO3-201ENST00000263012 ANKK1Q8NFD2 765 aa16.78■□□□□ 0.28
NOMO3-201ENST00000263012 PPP1R16AQ96I34 528 aa16.78■□□□□ 0.28
NOMO3-201ENST00000263012 RNF186Q9NXI6 227 aa16.78■□□□□ 0.28
NOMO3-201ENST00000263012 WSB2Q9NYS7 404 aaPredicted RBP16.78■□□□□ 0.28
NOMO3-201ENST00000263012 BAIAP2Q9UQB8 552 aa16.78■□□□□ 0.28
NOMO3-201ENST00000263012 SIM1P81133 766 aaPredicted RBP16.78■□□□□ 0.28
NOMO3-201ENST00000263012 SLC36A4Q6YBV0 504 aa16.78■□□□□ 0.28
NOMO3-201ENST00000263012 NUDT18Q6ZVK8 323 aa16.78■□□□□ 0.28
NOMO3-201ENST00000263012 METTL3Q86U44 580 aaKnown RBP16.78■□□□□ 0.28
NOMO3-201ENST00000263012 HOMEZQ8IX15 550 aa16.78■□□□□ 0.28
NOMO3-201ENST00000263012 C12orf76Q8N812 135 aaPredicted RBP16.78■□□□□ 0.28
NOMO3-201ENST00000263012 SAMD8Q96LT4 415 aa16.78■□□□□ 0.28
NOMO3-201ENST00000263012 NDRG4Q9ULP0 352 aaKnown RBP16.78■□□□□ 0.28
NOMO3-201ENST00000263012 COL5A3P25940 1745 aaPredicted RBP16.78■□□□□ 0.28
NOMO3-201ENST00000263012 PLATP00750 562 aa16.78■□□□□ 0.28
NOMO3-201ENST00000263012 HK1P19367 917 aa16.78■□□□□ 0.28
NOMO3-201ENST00000263012 IDSP22304 550 aa16.78■□□□□ 0.28
NOMO3-201ENST00000263012 EDNRAP25101 427 aa16.78■□□□□ 0.28
NOMO3-201ENST00000263012 NRIP1P48552 1158 aa16.78■□□□□ 0.28
NOMO3-201ENST00000263012 TIAL1Q01085 375 aaKnown RBP eCLIP16.78■□□□□ 0.28
NOMO3-201ENST00000263012 VEZF1Q14119 521 aa16.78■□□□□ 0.28
NOMO3-201ENST00000263012 CCDC58Q4VC31 144 aa16.78■□□□□ 0.28
NOMO3-201ENST00000263012 SYT9Q86SS6 491 aa16.78■□□□□ 0.28
NOMO3-201ENST00000263012 RASSF5Q8WWW0 418 aa16.78■□□□□ 0.28
NOMO3-201ENST00000263012 CCDC115Q96NT0 180 aa16.78■□□□□ 0.28
NOMO3-201ENST00000263012 DPAGT1Q9H3H5 408 aa16.78■□□□□ 0.28
NOMO3-201ENST00000263012 DDX31Q9H8H2 851 aaKnown RBP16.78■□□□□ 0.28
NOMO3-201ENST00000263012 CUEDC1Q9NWM3 386 aaPredicted RBP16.78■□□□□ 0.28
NOMO3-201ENST00000263012 OR52A4PA6NMU1 304 aa16.77■□□□□ 0.28
NOMO3-201ENST00000263012 UQCRC2P22695 453 aa16.77■□□□□ 0.28
NOMO3-201ENST00000263012 GRK5P34947 590 aa16.77■□□□□ 0.28
NOMO3-201ENST00000263012 DEFB134Q4QY38 66 aa16.77■□□□□ 0.28
NOMO3-201ENST00000263012 C4orf46Q504U0 113 aa16.77■□□□□ 0.28
NOMO3-201ENST00000263012 WDR45BQ5MNZ6 344 aa16.77■□□□□ 0.28
NOMO3-201ENST00000263012 PIP5KL1Q5T9C9 394 aa16.77■□□□□ 0.28
NOMO3-201ENST00000263012 EID2BQ96D98 161 aa16.77■□□□□ 0.28
NOMO3-201ENST00000263012 TRIB3Q96RU7 358 aa16.77■□□□□ 0.28
NOMO3-201ENST00000263012 TDP1Q9NUW8 608 aa16.77■□□□□ 0.28
NOMO3-201ENST00000263012 USP36Q9P275 1121 aaKnown RBP16.77■□□□□ 0.28
NOMO3-201ENST00000263012 MEIS3P1A6NDR6 274 aa16.77■□□□□ 0.28
NOMO3-201ENST00000263012 BLOC1S5-TXNDC5H3BN57 136 aa16.77■□□□□ 0.28
NOMO3-201ENST00000263012 SOCS5O75159 536 aa16.77■□□□□ 0.28
NOMO3-201ENST00000263012 TGM1P22735 817 aa16.77■□□□□ 0.28
NOMO3-201ENST00000263012 MPIP34949 423 aa16.77■□□□□ 0.28
NOMO3-201ENST00000263012 SUOXP51687 545 aa16.77■□□□□ 0.28
NOMO3-201ENST00000263012 SNTB2Q13425 540 aaKnown RBP16.77■□□□□ 0.28
NOMO3-201ENST00000263012 BRAT1Q6PJG6 821 aa16.77■□□□□ 0.28
NOMO3-201ENST00000263012 GET4Q7L5D6 327 aaPredicted RBP16.77■□□□□ 0.28
NOMO3-201ENST00000263012 SLC38A5Q8WUX1 472 aa16.77■□□□□ 0.28
NOMO3-201ENST00000263012 EFHD2Q96C19 240 aaPredicted RBP16.77■□□□□ 0.28
NOMO3-201ENST00000263012 TMEM27Q9HBJ8 222 aa16.77■□□□□ 0.28
NOMO3-201ENST00000263012 ANKHQ9HCJ1 492 aa16.77■□□□□ 0.28
NOMO3-201ENST00000263012 HCN3Q9P1Z3 774 aa16.77■□□□□ 0.28
NOMO3-201ENST00000263012 POLR1DQ9Y2S0 133 aa16.77■□□□□ 0.28
NOMO3-201ENST00000263012 AK6Q9Y3D8 172 aaKnown RBP16.77■□□□□ 0.28
NOMO3-201ENST00000263012 ALG5Q9Y673 324 aa16.77■□□□□ 0.28
NOMO3-201ENST00000263012 EFCAB14O75071 495 aa16.77■□□□□ 0.27
NOMO3-201ENST00000263012 MNDAP41218 407 aa16.77■□□□□ 0.27
NOMO3-201ENST00000263012 STAT5AP42229 794 aa16.77■□□□□ 0.27
NOMO3-201ENST00000263012 KHKP50053 298 aa16.77■□□□□ 0.27
NOMO3-201ENST00000263012 GPR19Q15760 415 aa16.77■□□□□ 0.27
NOMO3-201ENST00000263012 ZNF385BQ569K4 471 aa16.77■□□□□ 0.27
NOMO3-201ENST00000263012 ZDHHC20Q5W0Z9 365 aa16.77■□□□□ 0.27
NOMO3-201ENST00000263012 TRIM46Q7Z4K8 759 aa16.77■□□□□ 0.27
NOMO3-201ENST00000263012 CHST4Q8NCG5 386 aa16.77■□□□□ 0.27
NOMO3-201ENST00000263012 SPRYD4Q8WW59 207 aaPredicted RBP16.77■□□□□ 0.27
NOMO3-201ENST00000263012 EPYCQ99645 322 aa16.77■□□□□ 0.27
NOMO3-201ENST00000263012 TTLL2Q9BWV7 592 aa16.77■□□□□ 0.27
NOMO3-201ENST00000263012 DPH1Q9BZG8 443 aa16.77■□□□□ 0.27
NOMO3-201ENST00000263012 FZD3Q9NPG1 666 aa16.77■□□□□ 0.27
NOMO3-201ENST00000263012 PRDM9Q9NQV7 894 aa16.77■□□□□ 0.27
NOMO3-201ENST00000263012 SRRDQ9UH36 339 aa16.77■□□□□ 0.27
NOMO3-201ENST00000263012 TPRP12270 2363 aaKnown RBP16.77■□□□□ 0.27
NOMO3-201ENST00000263012 A0A1W2PQ45 241 aaPredicted RBP16.77■□□□□ 0.27
NOMO3-201ENST00000263012 A0A1W2PQY0 241 aa16.77■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.7 ms