RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000453216.1

TRAM2-AS1-201, Transcript of TRAM2 antisense RNA 1 (head to head), humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene TRAM2-AS1, Length 664 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 NPFFR2Q9Y5X5 522 aa24.05■■□□□ 1.44
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TRAM2-AS1-201ENST00000453216 POC1B-GALNT4F8VUJ3 575 aa24.04■■□□□ 1.44
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TRAM2-AS1-201ENST00000453216 NT5EP21589 574 aa24.04■■□□□ 1.44
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TRAM2-AS1-201ENST00000453216 METTL4Q8N3J2 472 aa24.04■■□□□ 1.44
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TRAM2-AS1-201ENST00000453216 LIX1LQ8IVB5 337 aa24.03■■□□□ 1.44
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TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ZNF180Q9UJW8 692 aa24.03■■□□□ 1.44
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SLC12A4Q9UP95 1085 aa24.03■■□□□ 1.44
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 MYBPHQ13203 477 aa24.02■■□□□ 1.44
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SLC25A35Q3KQZ1 300 aa24.02■■□□□ 1.44
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TRAM2-AS1-201ENST00000453216 RPS27LQ71UM5 84 aaKnown RBP24.02■■□□□ 1.44
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TRAM2-AS1-201ENST00000453216 MYRIPQ8NFW9 859 aa24.02■■□□□ 1.44
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 UHMK1Q8TAS1 419 aaKnown RBP24.02■■□□□ 1.44
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SPPL2AQ8TCT8 520 aa24.02■■□□□ 1.44
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TRPC4APQ8TEL6 797 aa24.02■■□□□ 1.44
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ZNF483Q8TF39 744 aaPredicted RBP24.02■■□□□ 1.44
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 DCAKDQ8WVC6 231 aa24.02■■□□□ 1.44
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ADIPOR1Q96A54 375 aa24.02■■□□□ 1.44
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 RILPQ96NA2 401 aa24.02■■□□□ 1.44
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SECISBP2Q96T21 854 aaKnown RBP24.02■■□□□ 1.44
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 FARSBQ9NSD9 589 aaKnown RBP24.02■■□□□ 1.44
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PCDHA9Q9Y5H5 950 aa24.02■■□□□ 1.44
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 A0A1B0GTL3 188 aa24.01■■□□□ 1.43
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 C1orf226A1L170 272 aa24.01■■□□□ 1.43
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SNX4O95219 450 aa24.01■■□□□ 1.43
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PDYNP01213 254 aa24.01■■□□□ 1.43
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 DEKP35659 375 aaKnown RBP24.01■■□□□ 1.43
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 RPP38P78345 283 aaKnown RBP24.01■■□□□ 1.43
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CES4AQ5XG92 561 aa24.01■■□□□ 1.43
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 BICRALQ6AI39 1079 aa24.01■■□□□ 1.43
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SLC48A1Q6P1K1 146 aa24.01■■□□□ 1.43
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 C17orf47Q8NEP4 570 aa24.01■■□□□ 1.43
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SELENOMQ8WWX9 145 aa24.01■■□□□ 1.43
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ANGPTL4Q9BY76 406 aa24.01■■□□□ 1.43
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SNX6Q9UNH7 406 aa24.01■■□□□ 1.43
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 A0A087WUV0 522 aaPredicted RBP24■■□□□ 1.43
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 C15orf38-AP3S2A0A0A6YYH1 394 aa24■■□□□ 1.43
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 GOLGA6L10A6NI86 522 aa24■■□□□ 1.43
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 A8MT66 165 aa24■■□□□ 1.43
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PPP6CO00743 305 aa24■■□□□ 1.43
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TRAPPC6AO75865 159 aa24■■□□□ 1.43
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TSPAN8P19075 237 aa24■■□□□ 1.43
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 MASP1P48740 699 aa24■■□□□ 1.43
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CDH13P55290 713 aa24■■□□□ 1.43
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 DUSP8Q13202 625 aa24■■□□□ 1.43
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 LETMD1Q6P1Q0 360 aa24■■□□□ 1.43
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 WDR53Q7Z5U6 358 aaPredicted RBP24■■□□□ 1.43
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PACS2Q86VP3 889 aa24■■□□□ 1.43
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TMEM200AQ86VY9 491 aa24■■□□□ 1.43
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PRR22Q8IZ63 422 aa24■■□□□ 1.43
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 VWA5B2Q8N398 1253 aa24■■□□□ 1.43
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 MNS1Q8NEH6 495 aa24■■□□□ 1.43
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ZNF592Q92610 1267 aa24■■□□□ 1.43
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 BRF2Q9HAW0 419 aa24■■□□□ 1.43
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 NMRK1Q9NWW6 199 aa24■■□□□ 1.43
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CES1P1Q9UKY3 287 aa24■■□□□ 1.43
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SNRPAP09012 282 aaKnown RBP23.99■■□□□ 1.43
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 KRT15P19012 456 aa23.99■■□□□ 1.43
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 S1PR1P21453 382 aa23.99■■□□□ 1.43
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 GPX3P22352 226 aa23.99■■□□□ 1.43
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ECHS1P30084 290 aa23.99■■□□□ 1.43
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 GALNT1Q10472 559 aaPredicted RBP23.99■■□□□ 1.43
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TESK1Q15569 626 aa23.99■■□□□ 1.43
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 C1QTNF3Q9BXJ4 246 aa23.99■■□□□ 1.43
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 BRINP2Q9C0B6 783 aa23.99■■□□□ 1.43
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TRPS1Q9UHF7 1281 aa23.99■■□□□ 1.43
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PSME2Q9UL46 239 aa23.99■■□□□ 1.43
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 HSPB2A8KAH6 182 aa23.98■■□□□ 1.43
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ERAL1O75616 437 aaKnown RBP23.98■■□□□ 1.43
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SBK3P0C264 359 aa23.98■■□□□ 1.43
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ABCD3P28288 659 aa23.98■■□□□ 1.43
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 FEN1P39748 380 aaKnown RBP23.98■■□□□ 1.43
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CASP3P42574 277 aa23.98■■□□□ 1.43
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CDK9P50750 372 aaKnown RBP23.98■■□□□ 1.43
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 DLX5P56178 289 aa23.98■■□□□ 1.43
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