RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000610517.1

VIS1.1-201, Transcript of viral integration site 1, humanhuman

BASIC

Gene VIS1, Length 203 nt, Biotype misc RNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VIS1.1-201ENST00000610517 R4GN57 208 aa3.41□□□□□ -1.86
VIS1.1-201ENST00000610517 NCAPD2Q15021 1401 aa3.41□□□□□ -1.86
VIS1.1-201ENST00000610517 LOC105371242A0A075B767 164 aa3.4□□□□□ -1.87
VIS1.1-201ENST00000610517 TRBV2A0A0J9YWF9 115 aa3.4□□□□□ -1.87
VIS1.1-201ENST00000610517 A0A0U1RQV5 110 aa3.4□□□□□ -1.87
VIS1.1-201ENST00000610517 MACROD2A1Z1Q3 448 aa3.4□□□□□ -1.87
VIS1.1-201ENST00000610517 ARHGAP42A6NI28 874 aa3.4□□□□□ -1.87
VIS1.1-201ENST00000610517 SDR42E2A6NKP2 422 aa3.4□□□□□ -1.87
VIS1.1-201ENST00000610517 K7EQM0 130 aa3.4□□□□□ -1.87
VIS1.1-201ENST00000610517 MAPK13O15264 365 aa3.4□□□□□ -1.87
VIS1.1-201ENST00000610517 ECI2O75521 394 aa3.4□□□□□ -1.87
VIS1.1-201ENST00000610517 POP4O95707 220 aaKnown RBP3.4□□□□□ -1.87
VIS1.1-201ENST00000610517 IGHV3-13P01766 116 aa3.4□□□□□ -1.87
VIS1.1-201ENST00000610517 CXCL10P02778 98 aa3.4□□□□□ -1.87
VIS1.1-201ENST00000610517 PGK2P07205 417 aa3.4□□□□□ -1.87
VIS1.1-201ENST00000610517 CSN3P07498 182 aa3.4□□□□□ -1.87
VIS1.1-201ENST00000610517 EPCAMP16422 314 aa3.4□□□□□ -1.87
VIS1.1-201ENST00000610517 RPL35AP18077 110 aaKnown RBP3.4□□□□□ -1.87
VIS1.1-201ENST00000610517 PKLRP30613 574 aa3.4□□□□□ -1.87
VIS1.1-201ENST00000610517 RFC2P35250 354 aa3.4□□□□□ -1.87
VIS1.1-201ENST00000610517 OR3A2P47893 321 aa3.4□□□□□ -1.87
VIS1.1-201ENST00000610517 ASCL1P50553 236 aa3.4□□□□□ -1.87
VIS1.1-201ENST00000610517 DNA2P51530 1060 aa3.4□□□□□ -1.87
VIS1.1-201ENST00000610517 MFAP3P55082 362 aa3.4□□□□□ -1.87
VIS1.1-201ENST00000610517 MTTPP55157 894 aa3.4□□□□□ -1.87
VIS1.1-201ENST00000610517 XIAPP98170 497 aa3.4□□□□□ -1.87
VIS1.1-201ENST00000610517 MYL7Q01449 175 aa3.4□□□□□ -1.87
VIS1.1-201ENST00000610517 CDH18Q13634 790 aa3.4□□□□□ -1.87
VIS1.1-201ENST00000610517 VEZF1Q14119 521 aa3.4□□□□□ -1.87
VIS1.1-201ENST00000610517 MTHFSDQ2M296 383 aaKnown RBP3.4□□□□□ -1.87
VIS1.1-201ENST00000610517 FILIP1LQ4L180 1135 aa3.4□□□□□ -1.87
VIS1.1-201ENST00000610517 FBXO48Q5FWF7 155 aa3.4□□□□□ -1.87
VIS1.1-201ENST00000610517 PRAMEF20Q5VT98 475 aa3.4□□□□□ -1.87
VIS1.1-201ENST00000610517 NCR3LG1Q68D85 454 aa3.4□□□□□ -1.87
VIS1.1-201ENST00000610517 OR4A47Q6IF82 309 aa3.4□□□□□ -1.87
VIS1.1-201ENST00000610517 METAP1DQ6UB28 335 aaPredicted RBP3.4□□□□□ -1.87
VIS1.1-201ENST00000610517 ASPGQ86U10 573 aa3.4□□□□□ -1.87
VIS1.1-201ENST00000610517 FAM9CQ8IZT9 166 aa3.4□□□□□ -1.87
VIS1.1-201ENST00000610517 LINC00612Q8N6U2 182 aa3.4□□□□□ -1.87
VIS1.1-201ENST00000610517 SAP25Q8TEE9 199 aa3.4□□□□□ -1.87
VIS1.1-201ENST00000610517 LIPHQ8WWY8 451 aa3.4□□□□□ -1.87
VIS1.1-201ENST00000610517 STARD8Q92502 1023 aa3.4□□□□□ -1.87
VIS1.1-201ENST00000610517 RASL10AQ92737 203 aa3.4□□□□□ -1.87
VIS1.1-201ENST00000610517 AGAP4Q96P64 663 aa3.4□□□□□ -1.87
VIS1.1-201ENST00000610517 ZNF607Q96SK3 696 aa3.4□□□□□ -1.87
VIS1.1-201ENST00000610517 CPNE1Q99829 537 aa3.4□□□□□ -1.87
VIS1.1-201ENST00000610517 TDRD1Q9BXT4 1180 aaKnown RBP3.4□□□□□ -1.87
VIS1.1-201ENST00000610517 HOXD1Q9GZZ0 328 aa3.4□□□□□ -1.87
VIS1.1-201ENST00000610517 ACTR8Q9H981 624 aa3.4□□□□□ -1.87
VIS1.1-201ENST00000610517 CDH20Q9HBT6 801 aa3.4□□□□□ -1.87
VIS1.1-201ENST00000610517 PIGVQ9NUD9 493 aa3.4□□□□□ -1.87
VIS1.1-201ENST00000610517 HYPKQ9NX55 129 aa3.4□□□□□ -1.87
VIS1.1-201ENST00000610517 RAB20Q9NX57 234 aa3.4□□□□□ -1.87
VIS1.1-201ENST00000610517 IL20RAQ9UHF4 553 aa3.4□□□□□ -1.87
VIS1.1-201ENST00000610517 SLC24A2Q9UI40 661 aa3.4□□□□□ -1.87
VIS1.1-201ENST00000610517 TEKT2Q9UIF3 430 aa3.4□□□□□ -1.87
VIS1.1-201ENST00000610517 PLA2G4CQ9UP65 541 aa3.4□□□□□ -1.87
VIS1.1-201ENST00000610517 ENTPD4Q9Y227 616 aa3.4□□□□□ -1.87
VIS1.1-201ENST00000610517 MAB21L2Q9Y586 359 aa3.4□□□□□ -1.87
VIS1.1-201ENST00000610517 AP4B1Q9Y6B7 739 aa3.4□□□□□ -1.87
VIS1.1-201ENST00000610517 FAM230AA0A1W2PPH8 454 aa3.39□□□□□ -1.87
VIS1.1-201ENST00000610517 SRRM5B3KS81 715 aa3.39□□□□□ -1.87
VIS1.1-201ENST00000610517 G3V2L1 256 aa3.39□□□□□ -1.87
VIS1.1-201ENST00000610517 CASC3O15234 703 aaKnown RBP3.39□□□□□ -1.87
VIS1.1-201ENST00000610517 OGTO15294 1046 aa3.39□□□□□ -1.87
VIS1.1-201ENST00000610517 CLDN3O15551 220 aa3.39□□□□□ -1.87
VIS1.1-201ENST00000610517 RRP8O43159 456 aaKnown RBP3.39□□□□□ -1.87
VIS1.1-201ENST00000610517 PPIP5K2O43314 1243 aa3.39□□□□□ -1.87
VIS1.1-201ENST00000610517 BUB1O43683 1085 aa3.39□□□□□ -1.87
VIS1.1-201ENST00000610517 PRAF2O60831 178 aa3.39□□□□□ -1.87
VIS1.1-201ENST00000610517 MFN2O95140 757 aa3.39□□□□□ -1.87
VIS1.1-201ENST00000610517 BAG3O95817 575 aa3.39□□□□□ -1.87
VIS1.1-201ENST00000610517 ATP1B1P05026 303 aa3.39□□□□□ -1.87
VIS1.1-201ENST00000610517 S100A9P06702 114 aaKnown RBP3.39□□□□□ -1.87
VIS1.1-201ENST00000610517 PABPC4LP0CB38 370 aaKnown RBP3.39□□□□□ -1.87
VIS1.1-201ENST00000610517 STAG3L3P0CL85 134 aa3.39□□□□□ -1.87
VIS1.1-201ENST00000610517 DLATP10515 647 aaKnown RBP3.39□□□□□ -1.87
VIS1.1-201ENST00000610517 B4GALT1P15291 398 aa3.39□□□□□ -1.87
VIS1.1-201ENST00000610517 ATP6V1C1P21283 382 aa3.39□□□□□ -1.87
VIS1.1-201ENST00000610517 PCMT1P22061 227 aa3.39□□□□□ -1.87
VIS1.1-201ENST00000610517 CCT6AP40227 531 aaKnown RBP3.39□□□□□ -1.87
VIS1.1-201ENST00000610517 SOX3P41225 446 aa3.39□□□□□ -1.87
VIS1.1-201ENST00000610517 SLC11A1P49279 550 aa3.39□□□□□ -1.87
VIS1.1-201ENST00000610517 AIF1P55008 147 aa3.39□□□□□ -1.87
VIS1.1-201ENST00000610517 PRMT2P55345 433 aa3.39□□□□□ -1.87
VIS1.1-201ENST00000610517 CTAG1AP78358 180 aa3.39□□□□□ -1.87
VIS1.1-201ENST00000610517 FUT7Q11130 342 aa3.39□□□□□ -1.87
VIS1.1-201ENST00000610517 ABRQ12979 859 aa3.39□□□□□ -1.87
VIS1.1-201ENST00000610517 SRSF9Q13242 221 aaKnown RBP eCLIP3.39□□□□□ -1.87
VIS1.1-201ENST00000610517 SRSF5Q13243 272 aaKnown RBP3.39□□□□□ -1.87
VIS1.1-201ENST00000610517 ARHGAP19Q14CB8 494 aa3.39□□□□□ -1.87
VIS1.1-201ENST00000610517 RCN1Q15293 331 aa3.39□□□□□ -1.87
VIS1.1-201ENST00000610517 MAPK11Q15759 364 aa3.39□□□□□ -1.87
VIS1.1-201ENST00000610517 CDO1Q16878 200 aa3.39□□□□□ -1.87
VIS1.1-201ENST00000610517 CASC4Q6P4E1 433 aa3.39□□□□□ -1.87
VIS1.1-201ENST00000610517 GDPGP1Q6ZNW5 385 aa3.39□□□□□ -1.87
VIS1.1-201ENST00000610517 PHLDB2Q86SQ0 1253 aa3.39□□□□□ -1.87
VIS1.1-201ENST00000610517 SIAH3Q8IW03 269 aa3.39□□□□□ -1.87
VIS1.1-201ENST00000610517 OFCC1Q8IZS5 231 aa3.39□□□□□ -1.87
VIS1.1-201ENST00000610517 CCDC63Q8NA47 563 aa3.39□□□□□ -1.87
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 53.8 ms