RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000457748.1

GTF3C2-208, Transcript of general transcription factor IIIC subunit 2, human

TSL 5

Gene GTF3C2, Length 557 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
GTF3C2-208	ENST00000457748	PCYOX1L	Q8NBM8	494 aa		11.64	□□□□□ -0.55
GTF3C2-208	ENST00000457748	KAT2A	Q92830	837 aa		11.64	□□□□□ -0.55
GTF3C2-208	ENST00000457748	CCDC115	Q96NT0	180 aa		11.64	□□□□□ -0.55
GTF3C2-208	ENST00000457748	TUBB6	Q9BUF5	446 aa		11.64	□□□□□ -0.55
GTF3C2-208	ENST00000457748	OR8D2	Q9GZM6	311 aa		11.64	□□□□□ -0.55
GTF3C2-208	ENST00000457748	CXorf21	Q9HAI6	301 aa		11.64	□□□□□ -0.55
GTF3C2-208	ENST00000457748	DDX18	Q9NVP1	670 aa	Known RBP	11.64	□□□□□ -0.55
GTF3C2-208	ENST00000457748	SDAD1	Q9NVU7	687 aa	Known RBP eCLIP	11.64	□□□□□ -0.55
GTF3C2-208	ENST00000457748	TAS2R9	Q9NYW1	312 aa		11.64	□□□□□ -0.55
GTF3C2-208	ENST00000457748	VPS4A	Q9UN37	437 aa		11.64	□□□□□ -0.55
GTF3C2-208	ENST00000457748	HS3ST3B1	Q9Y662	390 aa		11.64	□□□□□ -0.55
GTF3C2-208	ENST00000457748	CACNA1B	Q00975	2339 aa		11.64	□□□□□ -0.55
GTF3C2-208	ENST00000457748	CCDC88C	Q9P219	2028 aa		11.64	□□□□□ -0.55
GTF3C2-208	ENST00000457748	LOC102723996	A0A087X1L8	192 aa		11.63	□□□□□ -0.55
GTF3C2-208	ENST00000457748	IGHV3-20	A0A0C4DH32	117 aa		11.63	□□□□□ -0.55
GTF3C2-208	ENST00000457748		A0A1W2PS29	197 aa		11.63	□□□□□ -0.55
GTF3C2-208	ENST00000457748	SAGE2P	A6NJ88	616 aa		11.63	□□□□□ -0.55
GTF3C2-208	ENST00000457748	BCAS2	O75934	225 aa	Predicted RBP	11.63	□□□□□ -0.55
GTF3C2-208	ENST00000457748	KCNH1	O95259	989 aa		11.63	□□□□□ -0.55
GTF3C2-208	ENST00000457748	PRKAR1A	P10644	381 aa		11.63	□□□□□ -0.55
GTF3C2-208	ENST00000457748	ESRRA	P11474	423 aa	Predicted RBP	11.63	□□□□□ -0.55
GTF3C2-208	ENST00000457748	ICAM2	P13598	275 aa		11.63	□□□□□ -0.55
GTF3C2-208	ENST00000457748	CHI3L1	P36222	383 aa	Predicted RBP	11.63	□□□□□ -0.55
GTF3C2-208	ENST00000457748	EIF2S3	P41091	472 aa	Known RBP	11.63	□□□□□ -0.55
GTF3C2-208	ENST00000457748	FRK	P42685	505 aa	Predicted RBP	11.63	□□□□□ -0.55
GTF3C2-208	ENST00000457748	ZFP36L2	P47974	494 aa	Known RBP	11.63	□□□□□ -0.55
GTF3C2-208	ENST00000457748	TRPC1	P48995	793 aa		11.63	□□□□□ -0.55
GTF3C2-208	ENST00000457748	MNAT1	P51948	309 aa		11.63	□□□□□ -0.55
GTF3C2-208	ENST00000457748	EFNA3	P52797	238 aa		11.63	□□□□□ -0.55
GTF3C2-208	ENST00000457748	WNT3	P56703	355 aa		11.63	□□□□□ -0.55
GTF3C2-208	ENST00000457748	AP2B1	P63010	937 aa		11.63	□□□□□ -0.55
GTF3C2-208	ENST00000457748	PHC1	P78364	1004 aa		11.63	□□□□□ -0.55
GTF3C2-208	ENST00000457748	PRR5	P85299	388 aa		11.63	□□□□□ -0.55
GTF3C2-208	ENST00000457748	DUSP2	Q05923	314 aa		11.63	□□□□□ -0.55
GTF3C2-208	ENST00000457748	ART3	Q13508	389 aa		11.63	□□□□□ -0.55
GTF3C2-208	ENST00000457748	IL10RA	Q13651	578 aa		11.63	□□□□□ -0.55
GTF3C2-208	ENST00000457748	NFYC	Q13952	458 aa		11.63	□□□□□ -0.55
GTF3C2-208	ENST00000457748	KRT72	Q14CN4	511 aa		11.63	□□□□□ -0.55
GTF3C2-208	ENST00000457748	LTB4R	Q15722	352 aa		11.63	□□□□□ -0.55
GTF3C2-208	ENST00000457748	EXT1	Q16394	746 aa		11.63	□□□□□ -0.55
GTF3C2-208	ENST00000457748	MPEG1	Q2M385	716 aa		11.63	□□□□□ -0.55
GTF3C2-208	ENST00000457748	SPRED3	Q2MJR0	410 aa		11.63	□□□□□ -0.55
GTF3C2-208	ENST00000457748	BHLHB9	Q6PI77	547 aa		11.63	□□□□□ -0.55
GTF3C2-208	ENST00000457748	SLC2A7	Q6PXP3	512 aa		11.63	□□□□□ -0.55
GTF3C2-208	ENST00000457748	KIRREL2	Q6UWL6	708 aa		11.63	□□□□□ -0.55
GTF3C2-208	ENST00000457748	ZNF621	Q6ZSS3	439 aa		11.63	□□□□□ -0.55
GTF3C2-208	ENST00000457748	PPP1R32	Q7Z5V6	425 aa		11.63	□□□□□ -0.55
GTF3C2-208	ENST00000457748	MRGPRE	Q86SM8	312 aa		11.63	□□□□□ -0.55
GTF3C2-208	ENST00000457748	CLECL1	Q8IZS7	167 aa		11.63	□□□□□ -0.55
GTF3C2-208	ENST00000457748	FITM2	Q8N6M3	262 aa		11.63	□□□□□ -0.55
GTF3C2-208	ENST00000457748	MORN4	Q8NDC4	146 aa		11.63	□□□□□ -0.55
GTF3C2-208	ENST00000457748	DNAJB8	Q8NHS0	232 aa		11.63	□□□□□ -0.55
GTF3C2-208	ENST00000457748	SUN3	Q8TAQ9	357 aa		11.63	□□□□□ -0.55
GTF3C2-208	ENST00000457748	ZNF675	Q8TD23	568 aa		11.63	□□□□□ -0.55
GTF3C2-208	ENST00000457748	PTPMT1	Q8WUK0	201 aa	Predicted RBP	11.63	□□□□□ -0.55
GTF3C2-208	ENST00000457748	MOAP1	Q96BY2	351 aa		11.63	□□□□□ -0.55
GTF3C2-208	ENST00000457748	ZNF700	Q9H0M5	742 aa		11.63	□□□□□ -0.55
GTF3C2-208	ENST00000457748	EFCAB1	Q9HAE3	211 aa		11.63	□□□□□ -0.55
GTF3C2-208	ENST00000457748	SLAMF7	Q9NQ25	335 aa		11.63	□□□□□ -0.55
GTF3C2-208	ENST00000457748	GID8	Q9NWU2	228 aa		11.63	□□□□□ -0.55
GTF3C2-208	ENST00000457748	P4HTM	Q9NXG6	502 aa		11.63	□□□□□ -0.55
GTF3C2-208	ENST00000457748	PTGFRN	Q9P2B2	879 aa		11.63	□□□□□ -0.55
GTF3C2-208	ENST00000457748	BCAP29	Q9UHQ4	241 aa		11.63	□□□□□ -0.55
GTF3C2-208	ENST00000457748	TAGLN3	Q9UI15	199 aa		11.63	□□□□□ -0.55
GTF3C2-208	ENST00000457748	FBXL4	Q9UKA2	621 aa		11.63	□□□□□ -0.55
GTF3C2-208	ENST00000457748	CLDN16	Q9Y5I7	305 aa		11.63	□□□□□ -0.55
GTF3C2-208	ENST00000457748	TPR	P12270	2363 aa	Known RBP	11.62	□□□□□ -0.55
GTF3C2-208	ENST00000457748		A0A096LPI6	279 aa		11.62	□□□□□ -0.55
GTF3C2-208	ENST00000457748	IGHV1-45	A0A0A0MS14	117 aa		11.62	□□□□□ -0.55
GTF3C2-208	ENST00000457748	TMEM8B	A6NDV4	472 aa		11.62	□□□□□ -0.55
GTF3C2-208	ENST00000457748	CCT8L1P	A6NM43	557 aa		11.62	□□□□□ -0.55
GTF3C2-208	ENST00000457748	CAPN14	A8MX76	684 aa		11.62	□□□□□ -0.55
GTF3C2-208	ENST00000457748	SOCS6	O14544	535 aa		11.62	□□□□□ -0.55
GTF3C2-208	ENST00000457748	MRAS	O14807	208 aa		11.62	□□□□□ -0.55
GTF3C2-208	ENST00000457748	EMC8	O43402	210 aa		11.62	□□□□□ -0.55
GTF3C2-208	ENST00000457748	COQ9	O75208	318 aa		11.62	□□□□□ -0.55
GTF3C2-208	ENST00000457748	ERN1	O75460	977 aa	Known RBP	11.62	□□□□□ -0.55
GTF3C2-208	ENST00000457748	HP	P00738	406 aa		11.62	□□□□□ -0.55
GTF3C2-208	ENST00000457748	COX6A1	P12074	109 aa		11.62	□□□□□ -0.55
GTF3C2-208	ENST00000457748	PTGER1	P34995	402 aa		11.62	□□□□□ -0.55
GTF3C2-208	ENST00000457748	MC3R	P41968	323 aa		11.62	□□□□□ -0.55
GTF3C2-208	ENST00000457748	CCT3	P49368	545 aa	Known RBP	11.62	□□□□□ -0.55
GTF3C2-208	ENST00000457748	CDK9	P50750	372 aa	Known RBP	11.62	□□□□□ -0.55
GTF3C2-208	ENST00000457748	RRAD	P55042	308 aa		11.62	□□□□□ -0.55
GTF3C2-208	ENST00000457748	HBA1	P69905	142 aa		11.62	□□□□□ -0.55
GTF3C2-208	ENST00000457748	MXRA7	P84157	204 aa		11.62	□□□□□ -0.55
GTF3C2-208	ENST00000457748	GABPB1	Q06547	395 aa	Predicted RBP	11.62	□□□□□ -0.55
GTF3C2-208	ENST00000457748	MAP4K2	Q12851	820 aa		11.62	□□□□□ -0.55
GTF3C2-208	ENST00000457748	ATP1A4	Q13733	1029 aa		11.62	□□□□□ -0.55
GTF3C2-208	ENST00000457748	TLR1	Q15399	786 aa		11.62	□□□□□ -0.55
GTF3C2-208	ENST00000457748	PRICKLE4	Q2TBC4	344 aa		11.62	□□□□□ -0.55
GTF3C2-208	ENST00000457748	BTBD16	Q32M84	506 aa		11.62	□□□□□ -0.55
GTF3C2-208	ENST00000457748	ZNF628	Q5EBL2	1059 aa		11.62	□□□□□ -0.55
GTF3C2-208	ENST00000457748	COQ5	Q5HYK3	327 aa		11.62	□□□□□ -0.55
GTF3C2-208	ENST00000457748	FAM91A1	Q658Y4	838 aa		11.62	□□□□□ -0.55
GTF3C2-208	ENST00000457748	CPZ	Q66K79	652 aa		11.62	□□□□□ -0.55
GTF3C2-208	ENST00000457748	REP15	Q6BDI9	236 aa		11.62	□□□□□ -0.55
GTF3C2-208	ENST00000457748	FAM111B	Q6SJ93	734 aa		11.62	□□□□□ -0.55
GTF3C2-208	ENST00000457748	ANGPTL8	Q6UXH0	198 aa		11.62	□□□□□ -0.55
GTF3C2-208	ENST00000457748	DNAJC14	Q6Y2X3	702 aa	Predicted RBP	11.62	□□□□□ -0.55

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