RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000443528.5

ACTB-206, Transcript of actin beta, humanhuman

TSL 4

Gene ACTB, Length 569 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-206ENST00000443528 TMEM114B3SHH9 223 aa14.57□□□□□ -0.08
ACTB-206ENST00000443528 TCP11X1B4DZS4 312 aa14.57□□□□□ -0.08
ACTB-206ENST00000443528 HSPA4LO95757 839 aa14.57□□□□□ -0.08
ACTB-206ENST00000443528 SP1P08047 785 aa14.57□□□□□ -0.08
ACTB-206ENST00000443528 NT5EP21589 574 aa14.57□□□□□ -0.08
ACTB-206ENST00000443528 SSTR4P31391 388 aa14.57□□□□□ -0.08
ACTB-206ENST00000443528 PTGER1P34995 402 aa14.57□□□□□ -0.08
ACTB-206ENST00000443528 SSR4P51571 173 aa14.57□□□□□ -0.08
ACTB-206ENST00000443528 SLC18A1P54219 525 aa14.57□□□□□ -0.08
ACTB-206ENST00000443528 C2orf80Q0P641 193 aa14.57□□□□□ -0.08
ACTB-206ENST00000443528 FUT7Q11130 342 aa14.57□□□□□ -0.08
ACTB-206ENST00000443528 INAQ16352 499 aa14.57□□□□□ -0.08
ACTB-206ENST00000443528 PRICKLE4Q2TBC4 344 aa14.57□□□□□ -0.08
ACTB-206ENST00000443528 XKR7Q5GH72 579 aa14.57□□□□□ -0.08
ACTB-206ENST00000443528 AGBL2Q5U5Z8 902 aa14.57□□□□□ -0.08
ACTB-206ENST00000443528 FAM111BQ6SJ93 734 aa14.57□□□□□ -0.08
ACTB-206ENST00000443528 TMEM156Q8N614 296 aa14.57□□□□□ -0.08
ACTB-206ENST00000443528 GALNT11Q8NCW6 608 aa14.57□□□□□ -0.08
ACTB-206ENST00000443528 OR5L2Q8NGL0 311 aa14.57□□□□□ -0.08
ACTB-206ENST00000443528 NUBPLQ8TB37 319 aa14.57□□□□□ -0.08
ACTB-206ENST00000443528 EXOSC8Q96B26 276 aaKnown RBP14.57□□□□□ -0.08
ACTB-206ENST00000443528 RASL10BQ96S79 203 aa14.57□□□□□ -0.08
ACTB-206ENST00000443528 SORT1Q99523 831 aa14.57□□□□□ -0.08
ACTB-206ENST00000443528 PAIP2Q9BPZ3 127 aaKnown RBP14.57□□□□□ -0.08
ACTB-206ENST00000443528 KLHL1Q9NR64 748 aa14.57□□□□□ -0.08
ACTB-206ENST00000443528 EHD3Q9NZN3 535 aa14.57□□□□□ -0.08
ACTB-206ENST00000443528 ZNF780BQ9Y6R6 833 aa14.57□□□□□ -0.08
ACTB-206ENST00000443528 SHANK1Q9Y566 2161 aa14.56□□□□□ -0.08
ACTB-206ENST00000443528 VPS4BO75351 444 aa14.56□□□□□ -0.08
ACTB-206ENST00000443528 SLC25A12O75746 678 aa14.56□□□□□ -0.08
ACTB-206ENST00000443528 OR6B1O95007 311 aa14.56□□□□□ -0.08
ACTB-206ENST00000443528 CD46P15529 392 aa14.56□□□□□ -0.08
ACTB-206ENST00000443528 DDCP20711 480 aa14.56□□□□□ -0.08
ACTB-206ENST00000443528 GRK2P25098 689 aa14.56□□□□□ -0.08
ACTB-206ENST00000443528 SOX3P41225 446 aa14.56□□□□□ -0.08
ACTB-206ENST00000443528 UQCRFS1P47985 274 aa14.56□□□□□ -0.08
ACTB-206ENST00000443528 SLC1A6P48664 564 aa14.56□□□□□ -0.08
ACTB-206ENST00000443528 MAP4K2Q12851 820 aa14.56□□□□□ -0.08
ACTB-206ENST00000443528 EBPQ15125 230 aaKnown RBP14.56□□□□□ -0.08
ACTB-206ENST00000443528 LTB4RQ15722 352 aa14.56□□□□□ -0.08
ACTB-206ENST00000443528 CEBPEQ15744 281 aa14.56□□□□□ -0.08
ACTB-206ENST00000443528 MPEG1Q2M385 716 aa14.56□□□□□ -0.08
ACTB-206ENST00000443528 GALNTL6Q49A17 601 aa14.56□□□□□ -0.08
ACTB-206ENST00000443528 PIGGQ5H8A4 983 aa14.56□□□□□ -0.08
ACTB-206ENST00000443528 HHATQ5VTY9 493 aa14.56□□□□□ -0.08
ACTB-206ENST00000443528 ZNF324BQ6AW86 544 aaPredicted RBP14.56□□□□□ -0.08
ACTB-206ENST00000443528 SLC25A25Q6KCM7 469 aa14.56□□□□□ -0.08
ACTB-206ENST00000443528 RNF111Q6ZNA4 994 aa14.56□□□□□ -0.08
ACTB-206ENST00000443528 LRRC25Q8N386 305 aaPredicted RBP14.56□□□□□ -0.08
ACTB-206ENST00000443528 HORMAD2Q8N7B1 307 aa14.56□□□□□ -0.08
ACTB-206ENST00000443528 ZNF781Q8N8C0 355 aa14.56□□□□□ -0.08
ACTB-206ENST00000443528 ZNF615Q8N8J6 731 aa14.56□□□□□ -0.08
ACTB-206ENST00000443528 ADCY4Q8NFM4 1077 aa14.56□□□□□ -0.08
ACTB-206ENST00000443528 CDC26Q8NHZ8 85 aa14.56□□□□□ -0.08
ACTB-206ENST00000443528 FAR1Q8WVX9 515 aa14.56□□□□□ -0.08
ACTB-206ENST00000443528 CTHRC1Q96CG8 243 aa14.56□□□□□ -0.08
ACTB-206ENST00000443528 SLC35C2Q9NQQ7 365 aa14.56□□□□□ -0.08
ACTB-206ENST00000443528 SDAD1Q9NVU7 687 aaKnown RBP eCLIP14.56□□□□□ -0.082e-13■□□□□ 11
ACTB-206ENST00000443528 MAT2BQ9NZL9 334 aa14.56□□□□□ -0.08
ACTB-206ENST00000443528 GIMAP2Q9UG22 337 aa14.56□□□□□ -0.08
ACTB-206ENST00000443528 ZNF639Q9UID6 485 aa14.56□□□□□ -0.08
ACTB-206ENST00000443528 VPS4AQ9UN37 437 aa14.56□□□□□ -0.08
ACTB-206ENST00000443528 WBP11Q9Y2W2 641 aaKnown RBP14.56□□□□□ -0.08
ACTB-206ENST00000443528 ATP6AP2A0A1C7CYW4 349 aa14.55□□□□□ -0.08
ACTB-206ENST00000443528 OR6C76A6NM76 312 aa14.55□□□□□ -0.08
ACTB-206ENST00000443528 SKAP2O75563 359 aaPredicted RBP14.55□□□□□ -0.08
ACTB-206ENST00000443528 ATP6AP2O75787 350 aa14.55□□□□□ -0.08
ACTB-206ENST00000443528 RASAL1O95294 804 aa14.55□□□□□ -0.08
ACTB-206ENST00000443528 NADKO95544 446 aaPredicted RBP14.55□□□□□ -0.08
ACTB-206ENST00000443528 JUNP05412 331 aaKnown RBP14.55□□□□□ -0.08
ACTB-206ENST00000443528 SDC1P18827 310 aa14.55□□□□□ -0.08
ACTB-206ENST00000443528 GNLYP22749 145 aa14.55□□□□□ -0.08
ACTB-206ENST00000443528 RPL38P63173 70 aaKnown RBP14.55□□□□□ -0.08
ACTB-206ENST00000443528 PMP22Q01453 160 aa14.55□□□□□ -0.08
ACTB-206ENST00000443528 KCNC4Q03721 635 aa14.55□□□□□ -0.08
ACTB-206ENST00000443528 SRSF11Q05519 484 aaKnown RBP14.55□□□□□ -0.08
ACTB-206ENST00000443528 BST1Q10588 318 aa14.55□□□□□ -0.08
ACTB-206ENST00000443528 DUSP8Q13202 625 aa14.55□□□□□ -0.08
ACTB-206ENST00000443528 STX3Q13277 289 aa14.55□□□□□ -0.08
ACTB-206ENST00000443528 FAM180AQ6UWF9 173 aa14.55□□□□□ -0.08
ACTB-206ENST00000443528 IL20RBQ6UXL0 311 aa14.55□□□□□ -0.08
ACTB-206ENST00000443528 IKBIPQ70UQ0 350 aa14.55□□□□□ -0.08
ACTB-206ENST00000443528 GALNTL5Q7Z4T8 443 aa14.55□□□□□ -0.08
ACTB-206ENST00000443528 MDGA2Q7Z553 956 aa14.55□□□□□ -0.08
ACTB-206ENST00000443528 ATCAYQ86WG3 371 aa14.55□□□□□ -0.08
ACTB-206ENST00000443528 TICAM1Q8IUC6 712 aa14.55□□□□□ -0.08
ACTB-206ENST00000443528 CCDC116Q8IYX3 515 aa14.55□□□□□ -0.08
ACTB-206ENST00000443528 CYP4Z2PQ8N1L4 340 aa14.55□□□□□ -0.08
ACTB-206ENST00000443528 VWA5B2Q8N398 1253 aa14.55□□□□□ -0.08
ACTB-206ENST00000443528 SIMC1Q8NDZ2 872 aa14.55□□□□□ -0.08
ACTB-206ENST00000443528 MGARPQ8TDB4 240 aa14.55□□□□□ -0.08
ACTB-206ENST00000443528 ASB15Q8WXK1 588 aa14.55□□□□□ -0.08
ACTB-206ENST00000443528 C5orf34Q96MH7 638 aa14.55□□□□□ -0.08
ACTB-206ENST00000443528 CCT7Q99832 543 aa14.55□□□□□ -0.08
ACTB-206ENST00000443528 BRINP2Q9C0B6 783 aa14.55□□□□□ -0.08
ACTB-206ENST00000443528 WWTR1Q9GZV5 400 aa14.55□□□□□ -0.08
ACTB-206ENST00000443528 OR10A5Q9H207 317 aa14.55□□□□□ -0.08
ACTB-206ENST00000443528 AGPAT4Q9NRZ5 378 aa14.55□□□□□ -0.08
ACTB-206ENST00000443528 ARGLU1Q9NWB6 273 aaPredicted RBP14.55□□□□□ -0.08
ACTB-206ENST00000443528 TAS2R7Q9NYW3 318 aa14.55□□□□□ -0.08
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