RNA–Protein interactions for RNA: YOR248W

YOR248W, Transcript of Dubious open reading frame, yeast

Gene YOR248W, Length 303 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YOR248W	YOR248W	YGR053C	P53234	283 aa		4.29	□□□□□ -1.72
YOR248W	YOR248W	SFB2	P53953	876 aa		4.29	□□□□□ -1.72
YOR248W	YOR248W	WHI4	Q07655	649 aa	Known RBP	4.29	□□□□□ -1.72
YOR248W	YOR248W	AIM39	Q08223	395 aa		4.29	□□□□□ -1.72
YOR248W	YOR248W	NPC2	Q12408	173 aa		4.29	□□□□□ -1.72
YOR248W	YOR248W	LAS17	Q12446	633 aa		4.29	□□□□□ -1.72
YOR248W	YOR248W	PIN4	P34217	668 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.28	□□□□□ -1.72	not detected
YOR248W	YOR248W	MBP1	P39678	833 aa		4.28	□□□□□ -1.72
YOR248W	YOR248W	SNF7	P39929	240 aa	Known RBP	4.27	□□□□□ -1.73
YOR248W	YOR248W	NCS6	P53088	359 aa		4.27	□□□□□ -1.73
YOR248W	YOR248W	GDE1	Q02979	1223 aa		4.27	□□□□□ -1.73
YOR248W	YOR248W	KAR4	P25583	335 aa		4.26	□□□□□ -1.73
YOR248W	YOR248W	CDC12	P32468	407 aa	Known RBP	4.26	□□□□□ -1.73
YOR248W	YOR248W	URM1	P40554	99 aa	Predicted RBP	4.26	□□□□□ -1.73
YOR248W	YOR248W	DUS3	Q06053	668 aa	Known RBP	4.25	□□□□□ -1.73
YOR248W	YOR248W	PPM2	Q08282	695 aa		4.25	□□□□□ -1.73
YOR248W	YOR248W	ENB1	Q08299	606 aa		4.25	□□□□□ -1.73
YOR248W	YOR248W	FAL1	Q12099	399 aa	Known RBP	4.25	□□□□□ -1.73
YOR248W	YOR248W	CAD1	P24813	409 aa	Known RBP	4.24	□□□□□ -1.73
YOR248W	YOR248W	OAR1	P35731	278 aa		4.24	□□□□□ -1.73
YOR248W	YOR248W	YPT53	P36019	220 aa		4.24	□□□□□ -1.73
YOR248W	YOR248W	MOH1	P38191	138 aa		4.24	□□□□□ -1.73
YOR248W	YOR248W	SRP1	Q02821	542 aa	Known RBP	4.24	□□□□□ -1.73
YOR248W	YOR248W	EFT1	P32324	842 aa	Known RBP	4.23	□□□□□ -1.73
YOR248W	YOR248W	ATG19	P35193	415 aa		4.23	□□□□□ -1.73
YOR248W	YOR248W	BUL1	P48524	976 aa		4.23	□□□□□ -1.73
YOR248W	YOR248W	YPR196W	Q06595	470 aa		4.23	□□□□□ -1.73
YOR248W	YOR248W	YLR040C	Q07988	224 aa		4.23	□□□□□ -1.73
YOR248W	YOR248W	AGP1	P25376	633 aa		4.22	□□□□□ -1.73
YOR248W	YOR248W	SBA1	P28707	216 aa	Known RBP	4.22	□□□□□ -1.73
YOR248W	YOR248W	RPC82	P32349	654 aa		4.22	□□□□□ -1.73
YOR248W	YOR248W	GYP7	P48365	746 aa		4.22	□□□□□ -1.73
YOR248W	YOR248W	UPC2	Q12151	913 aa		4.22	□□□□□ -1.73
YOR248W	YOR248W	VBA5	P36172	582 aa		4.21	□□□□□ -1.74
YOR248W	YOR248W	SUL1	P38359	859 aa		4.21	□□□□□ -1.74
YOR248W	YOR248W	YER158C	P40095	573 aa		4.21	□□□□□ -1.74
YOR248W	YOR248W	UBA2	P52488	636 aa		4.21	□□□□□ -1.74
YOR248W	YOR248W	CWC24	P53769	259 aa		4.21	□□□□□ -1.74
YOR248W	YOR248W	YOL073C	Q08232	322 aa		4.21	□□□□□ -1.74
YOR248W	YOR248W	GUP2	Q08929	609 aa		4.21	□□□□□ -1.74
YOR248W	YOR248W	YKL069W	P36088	180 aa		4.2	□□□□□ -1.74
YOR248W	YOR248W	TSL1	P38427	1098 aa	Known RBP	4.2	□□□□□ -1.74
YOR248W	YOR248W	KRI1	P42846	591 aa	Known RBP	4.2	□□□□□ -1.74
YOR248W	YOR248W	GUS1	P46655	708 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.2	□□□□□ -1.74	not detected
YOR248W	YOR248W	RAI1	P53063	387 aa	Known RBP	4.2	□□□□□ -1.74
YOR248W	YOR248W	YDR306C	Q06640	478 aa		4.2	□□□□□ -1.74
YOR248W	YOR248W	CLN2	P20438	545 aa		4.19	□□□□□ -1.74
YOR248W	YOR248W	PRI2	P20457	528 aa		4.19	□□□□□ -1.74
YOR248W	YOR248W	SED4	P25365	1065 aa		4.19	□□□□□ -1.74
YOR248W	YOR248W	STE14	P32584	239 aa		4.19	□□□□□ -1.74
YOR248W	YOR248W	MAD1	P40957	749 aa		4.19	□□□□□ -1.74
YOR248W	YOR248W	VPS16	Q03308	798 aa		4.19	□□□□□ -1.74
YOR248W	YOR248W	ERG4	P25340	473 aa		4.18	□□□□□ -1.74
YOR248W	YOR248W	NPP1	P25353	742 aa		4.18	□□□□□ -1.74
YOR248W	YOR248W	YKR078W	P36158	585 aa	Known RBP	4.18	□□□□□ -1.74
YOR248W	YOR248W	SLU7	Q02775	382 aa	Known RBP	4.18	□□□□□ -1.74
YOR248W	YOR248W	YML122C	Q03207	126 aa		4.18	□□□□□ -1.74
YOR248W	YOR248W	OPI10	Q08202	246 aa		4.18	□□□□□ -1.74
YOR248W	YOR248W	PIN2	Q12057	282 aa		4.18	□□□□□ -1.74
YOR248W	YOR248W	NOT3	P06102	836 aa	Known RBP	4.17	□□□□□ -1.74
YOR248W	YOR248W	CDC48	P25694	835 aa	Known RBP	4.17	□□□□□ -1.74
YOR248W	YOR248W	PPH3	P32345	308 aa		4.17	□□□□□ -1.74
YOR248W	YOR248W	KTR4	P38131	464 aa		4.17	□□□□□ -1.74
YOR248W	YOR248W	SSL1	Q04673	461 aa	Predicted RBP	4.17	□□□□□ -1.74
YOR248W	YOR248W	TRM13	Q12383	476 aa		4.17	□□□□□ -1.74
YOR248W	YOR248W	TRP4	P07285	380 aa	Predicted RBP	4.16	□□□□□ -1.74
YOR248W	YOR248W	AFR1	P33304	620 aa		4.16	□□□□□ -1.74
YOR248W	YOR248W	YKE2	P52553	114 aa		4.16	□□□□□ -1.74
YOR248W	YOR248W	NPL3	Q01560	414 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.16	□□□□□ -1.74	not detected
YOR248W	YOR248W	YMR206W	Q03695	313 aa		4.16	□□□□□ -1.74
YOR248W	YOR248W	SHE9	Q04172	456 aa		4.16	□□□□□ -1.74
YOR248W	YOR248W	JIP5	Q06214	492 aa	Predicted RBP	4.16	□□□□□ -1.74
YOR248W	YOR248W	YBR238C	P38330	731 aa	Known RBP	4.15	□□□□□ -1.75
YOR248W	YOR248W	STB4	P50104	949 aa		4.15	□□□□□ -1.75
YOR248W	YOR248W	TMN2	Q04562	672 aa		4.15	□□□□□ -1.75
YOR248W	YOR248W	AAR2	P32357	355 aa	Predicted RBP	4.14	□□□□□ -1.75
YOR248W	YOR248W	RPD3	P32561	433 aa		4.14	□□□□□ -1.75
YOR248W	YOR248W	STE13	P33894	931 aa		4.14	□□□□□ -1.75
YOR248W	YOR248W	YRO2	P38079	344 aa		4.14	□□□□□ -1.75
YOR248W	YOR248W	ERT1	P38140	529 aa		4.14	□□□□□ -1.75
YOR248W	YOR248W	OMS1	Q06668	471 aa		4.14	□□□□□ -1.75
YOR248W	YOR248W	MCH5	Q08777	521 aa		4.14	□□□□□ -1.75
YOR248W	YOR248W	ADE8	P04161	214 aa		4.13	□□□□□ -1.75
YOR248W	YOR248W	SEC21	P32074	935 aa	Known RBP	4.13	□□□□□ -1.75
YOR248W	YOR248W	ERG5	P54781	538 aa		4.13	□□□□□ -1.75
YOR248W	YOR248W	RNT1	Q02555	471 aa		4.13	□□□□□ -1.75
YOR248W	YOR248W	MUK1	Q02866	612 aa		4.13	□□□□□ -1.75
YOR248W	YOR248W	ALG7	P07286	448 aa		4.12	□□□□□ -1.75
YOR248W	YOR248W	NAP1	P25293	417 aa	Known RBP	4.12	□□□□□ -1.75
YOR248W	YOR248W	MRP8	P35719	219 aa		4.12	□□□□□ -1.75
YOR248W	YOR248W	VPS30	Q02948	557 aa		4.12	□□□□□ -1.75
YOR248W	YOR248W	PEX19	Q07418	342 aa		4.12	□□□□□ -1.75
YOR248W	YOR248W	PPR1	P07272	904 aa	Predicted RBP	4.11	□□□□□ -1.75
YOR248W	YOR248W	FBP1	P09201	348 aa		4.11	□□□□□ -1.75
YOR248W	YOR248W	PBY1	P38254	753 aa		4.11	□□□□□ -1.75
YOR248W	YOR248W	SDP1	P40479	209 aa		4.11	□□□□□ -1.75
YOR248W	YOR248W	YIL108W	P40483	696 aa	Known RBP	4.11	□□□□□ -1.75
YOR248W	YOR248W	ACF2	Q12168	779 aa		4.11	□□□□□ -1.75
YOR248W	YOR248W	RFA1	P22336	621 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
YOR248W	YOR248W	STE5	P32917	917 aa		4.1	□□□□□ -1.75

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