RNA–Protein interactions for RNA: YJL188C

BUD19, Transcript of Dubious open reading frame, yeast

Gene BUD19, Length 309 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
BUD19	YJL188C	SPE1	P08432	466 aa		5.03	□□□□□ -1.6
BUD19	YJL188C	CDC12	P32468	407 aa	Known RBP	5.03	□□□□□ -1.6
BUD19	YJL188C	ABD1	P32783	436 aa	Predicted RBP	5.03	□□□□□ -1.6
BUD19	YJL188C	DEF1	P35732	738 aa	Known RBP	5.03	□□□□□ -1.6
BUD19	YJL188C	URM1	P40554	99 aa	Predicted RBP	5.03	□□□□□ -1.6
BUD19	YJL188C	AIM21	P40563	679 aa		5.03	□□□□□ -1.6
BUD19	YJL188C	GYP7	P48365	746 aa		5.03	□□□□□ -1.6
BUD19	YJL188C	EXG2	P52911	562 aa		5.03	□□□□□ -1.6
BUD19	YJL188C	ENB1	Q08299	606 aa		5.03	□□□□□ -1.6
BUD19	YJL188C	GUP2	Q08929	609 aa		5.03	□□□□□ -1.6
BUD19	YJL188C	PHO23	P50947	330 aa		5.02	□□□□□ -1.61
BUD19	YJL188C	SNU71	P53207	620 aa	Known RBP	5.02	□□□□□ -1.61
BUD19	YJL188C	CTF4	Q01454	927 aa		5.02	□□□□□ -1.61
BUD19	YJL188C	OPI10	Q08202	246 aa		5.02	□□□□□ -1.61
BUD19	YJL188C	MRP8	P35719	219 aa		5.01	□□□□□ -1.61
BUD19	YJL188C	VBA5	P36172	582 aa		5.01	□□□□□ -1.61
BUD19	YJL188C	GUS1	P46655	708 aa	Known RBP RIP-Chip data	5.01	□□□□□ -1.61	not detected
BUD19	YJL188C	TPO2	P53283	614 aa		5.01	□□□□□ -1.61
BUD19	YJL188C	DUS3	Q06053	668 aa	Known RBP	5.01	□□□□□ -1.61
BUD19	YJL188C	ESC2	Q06340	456 aa		5.01	□□□□□ -1.61
BUD19	YJL188C	AIM39	Q08223	395 aa		5.01	□□□□□ -1.61
BUD19	YJL188C	PFK1	P16861	987 aa	Known RBP	5	□□□□□ -1.61
BUD19	YJL188C	SRP101	P32916	621 aa		5	□□□□□ -1.61
BUD19	YJL188C	MBP1	P39678	833 aa		5	□□□□□ -1.61
BUD19	YJL188C	SUN4	P53616	420 aa		5	□□□□□ -1.61
BUD19	YJL188C	JIP5	Q06214	492 aa	Predicted RBP	5	□□□□□ -1.61
BUD19	YJL188C	KCS1	Q12494	1050 aa		5	□□□□□ -1.61
BUD19	YJL188C	ADE8	P04161	214 aa		4.99	□□□□□ -1.61
BUD19	YJL188C	PBY1	P38254	753 aa		4.99	□□□□□ -1.61
BUD19	YJL188C	NCS6	P53088	359 aa		4.99	□□□□□ -1.61
BUD19	YJL188C	YBR238C	P38330	731 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
BUD19	YJL188C	YER158C	P40095	573 aa		4.98	□□□□□ -1.61
BUD19	YJL188C	GIS1	Q03833	894 aa		4.98	□□□□□ -1.61
BUD19	YJL188C	YPR196W	Q06595	470 aa		4.98	□□□□□ -1.61
BUD19	YJL188C	NPC2	Q12408	173 aa		4.98	□□□□□ -1.61
BUD19	YJL188C	CDC48	P25694	835 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
BUD19	YJL188C	CHS7	P38843	316 aa		4.97	□□□□□ -1.61
BUD19	YJL188C	MSS4	P38994	779 aa		4.97	□□□□□ -1.61
BUD19	YJL188C	SIT1	P39980	628 aa		4.97	□□□□□ -1.61
BUD19	YJL188C	IRR1	P40541	1150 aa		4.97	□□□□□ -1.61
BUD19	YJL188C	RAI1	P53063	387 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
BUD19	YJL188C	PPH3	P32345	308 aa		4.96	□□□□□ -1.62
BUD19	YJL188C	NPP2	P39997	493 aa		4.96	□□□□□ -1.62
BUD19	YJL188C	YKE2	P52553	114 aa		4.96	□□□□□ -1.62
BUD19	YJL188C	SLI1	P53304	468 aa		4.96	□□□□□ -1.62
BUD19	YJL188C	SFB2	P53953	876 aa		4.96	□□□□□ -1.62
BUD19	YJL188C	VPS30	Q02948	557 aa		4.96	□□□□□ -1.62
BUD19	YJL188C	YDR306C	Q06640	478 aa		4.96	□□□□□ -1.62
BUD19	YJL188C	TAD3	Q9URQ3	322 aa		4.96	□□□□□ -1.62
BUD19	YJL188C	HRR25	P29295	494 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
BUD19	YJL188C	TSL1	P38427	1098 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
BUD19	YJL188C	PRP9	P19736	530 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
BUD19	YJL188C	SED4	P25365	1065 aa		4.94	□□□□□ -1.62
BUD19	YJL188C	AAR2	P32357	355 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
BUD19	YJL188C	CCM1	P48237	864 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
BUD19	YJL188C	KIN4	Q01919	800 aa		4.94	□□□□□ -1.62
BUD19	YJL188C	UPC2	Q12151	913 aa		4.94	□□□□□ -1.62
BUD19	YJL188C	KAR4	P25583	335 aa		4.93	□□□□□ -1.62
BUD19	YJL188C	KTR4	P38131	464 aa		4.93	□□□□□ -1.62
BUD19	YJL188C	VAC8	P39968	578 aa		4.93	□□□□□ -1.62
BUD19	YJL188C	PRI2	P20457	528 aa		4.92	□□□□□ -1.62
BUD19	YJL188C	EFT1	P32324	842 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
BUD19	YJL188C	CDC11	P32458	415 aa		4.92	□□□□□ -1.62
BUD19	YJL188C	YKL069W	P36088	180 aa		4.92	□□□□□ -1.62
BUD19	YJL188C	SPF1	P39986	1215 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
BUD19	YJL188C	NOT3	P06102	836 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
BUD19	YJL188C	TRP4	P07285	380 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
BUD19	YJL188C	RAD53	P22216	821 aa		4.91	□□□□□ -1.62
BUD19	YJL188C	STE13	P33894	931 aa		4.91	□□□□□ -1.62
BUD19	YJL188C	OAR1	P35731	278 aa		4.91	□□□□□ -1.62
BUD19	YJL188C	YRO2	P38079	344 aa		4.91	□□□□□ -1.62
BUD19	YJL188C	ALD6	P54115	500 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
BUD19	YJL188C	TDA5	Q06417	326 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
BUD19	YJL188C	STE14	P32584	239 aa		4.9	□□□□□ -1.63
BUD19	YJL188C	LCD1	Q04377	747 aa		4.9	□□□□□ -1.63
BUD19	YJL188C	WHI4	Q07655	649 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
BUD19	YJL188C	FBP1	P09201	348 aa		4.89	□□□□□ -1.63
BUD19	YJL188C	CAD1	P24813	409 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
BUD19	YJL188C	RFA1	P22336	621 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
BUD19	YJL188C	NPP1	P25353	742 aa		4.88	□□□□□ -1.63
BUD19	YJL188C	SPO75	Q07798	868 aa		4.88	□□□□□ -1.63
BUD19	YJL188C	WRS1	Q12109	432 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
BUD19	YJL188C	LAS17	Q12446	633 aa		4.88	□□□□□ -1.63
BUD19	YJL188C	AFR1	P33304	620 aa		4.87	□□□□□ -1.63
BUD19	YJL188C	REC104	P33323	182 aa		4.87	□□□□□ -1.63
BUD19	YJL188C	MOH1	P38191	138 aa		4.87	□□□□□ -1.63
BUD19	YJL188C	SDP1	P40479	209 aa		4.87	□□□□□ -1.63
BUD19	YJL188C	UTP8	P53276	713 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
BUD19	YJL188C	ERG4	P25340	473 aa		4.86	□□□□□ -1.63
BUD19	YJL188C	HBS1	P32769	611 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
BUD19	YJL188C	STE5	P32917	917 aa		4.86	□□□□□ -1.63
BUD19	YJL188C	TYE7	P33122	291 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
BUD19	YJL188C	YBR184W	P38299	523 aa		4.86	□□□□□ -1.63
BUD19	YJL188C	RNT1	Q02555	471 aa		4.86	□□□□□ -1.63
BUD19	YJL188C	BUL2	Q03758	920 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
BUD19	YJL188C	YOL073C	Q08232	322 aa		4.86	□□□□□ -1.63
BUD19	YJL188C	PPM2	Q08282	695 aa		4.86	□□□□□ -1.63
BUD19	YJL188C	PAM1	P37304	830 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
BUD19	YJL188C	SUL1	P38359	859 aa		4.85	□□□□□ -1.63
BUD19	YJL188C	JSN1	P47135	1091 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.85	□□□□□ -1.63	not detected

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