RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000641643.1

SYT6-210, Transcript of synaptotagmin 6, humanhuman

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Gene SYT6, Length 1,587 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Exosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT6-210ENST00000641643 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa29.07■■■□□ 2.24
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SYT6-210ENST00000641643 KCNA3P22001 575 aa29.07■■■□□ 2.24
SYT6-210ENST00000641643 HLFQ16534 295 aa29.07■■■□□ 2.24
SYT6-210ENST00000641643 PRR5LQ6MZQ0 368 aa29.07■■■□□ 2.24
SYT6-210ENST00000641643 NRXN2Q9P2S2 1712 aa29.07■■■□□ 2.24
SYT6-210ENST00000641643 MAP3K15Q6ZN16 1313 aa29.06■■■□□ 2.24
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SYT6-210ENST00000641643 ZNF853P0CG23 659 aa29.06■■■□□ 2.24
SYT6-210ENST00000641643 ST5P78524 1137 aa29.06■■■□□ 2.24
SYT6-210ENST00000641643 CCDC27Q2M243 656 aa29.06■■■□□ 2.24
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SYT6-210ENST00000641643 H0YIN7 160 aa29.04■■■□□ 2.24
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SYT6-210ENST00000641643 C2CD5Q86YS7 1000 aa29.04■■■□□ 2.24
SYT6-210ENST00000641643 BRIP1Q9BX63 1249 aa29.04■■■□□ 2.24
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SYT6-210ENST00000641643 ZBTB3Q9H5J0 574 aa29.03■■■□□ 2.24
SYT6-210ENST00000641643 ANXA1P04083 346 aa29.02■■■□□ 2.24
SYT6-210ENST00000641643 TPTE2Q6XPS3 522 aa29.02■■■□□ 2.24
SYT6-210ENST00000641643 WWC1Q8IX03 1113 aa29.02■■■□□ 2.24
SYT6-210ENST00000641643 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa29.02■■■□□ 2.24
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SYT6-210ENST00000641643 LRP10Q7Z4F1 713 aa29■■■□□ 2.23
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SYT6-210ENST00000641643 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP28.99■■■□□ 2.23
SYT6-210ENST00000641643 COPS6Q7L5N1 327 aa28.98■■■□□ 2.23
SYT6-210ENST00000641643 GIGYF2Q6Y7W6 1299 aaKnown RBP28.97■■■□□ 2.23
SYT6-210ENST00000641643 TTLL6Q8N841 843 aa28.97■■■□□ 2.23
SYT6-210ENST00000641643 ZNF784Q8NCA9 323 aaPredicted RBP28.97■■■□□ 2.23
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SYT6-210ENST00000641643 CHMP4AQ9BY43 222 aa28.95■■■□□ 2.22
SYT6-210ENST00000641643 ATP10DQ9P241 1426 aa28.94■■■□□ 2.22
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SYT6-210ENST00000641643 PARP10Q53GL7 1025 aa28.9■■■□□ 2.22
SYT6-210ENST00000641643 ANKRD31Q8N7Z5 1873 aa28.89■■■□□ 2.22
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SYT6-210ENST00000641643 PPP1R42Q7Z4L9 355 aa28.89■■■□□ 2.22
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SYT6-210ENST00000641643 CNKSR1Q969H4 720 aa28.89■■■□□ 2.22
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SYT6-210ENST00000641643 SRGNP10124 158 aa28.88■■■□□ 2.21
SYT6-210ENST00000641643 STYK1Q6J9G0 422 aa28.88■■■□□ 2.21
SYT6-210ENST00000641643 CCDC30Q5VVM6 783 aa28.88■■■□□ 2.21
SYT6-210ENST00000641643 SUSD4Q5VX71 490 aa28.88■■■□□ 2.21
SYT6-210ENST00000641643 ANKRD13DQ6ZTN6 518 aa28.87■■■□□ 2.21
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SYT6-210ENST00000641643 TSPYL6Q8N831 410 aa28.85■■■□□ 2.21
SYT6-210ENST00000641643 PLBD2Q8NHP8 589 aa28.85■■■□□ 2.21
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SYT6-210ENST00000641643 ZNF219Q9P2Y4 722 aaPredicted RBP28.83■■■□□ 2.21
SYT6-210ENST00000641643 NTSR2O95665 410 aa28.82■■■□□ 2.2
SYT6-210ENST00000641643 GOLGA2Q08379 1002 aa28.82■■■□□ 2.2
SYT6-210ENST00000641643 FANCIQ9NVI1 1328 aa28.81■■■□□ 2.2
SYT6-210ENST00000641643 C21orf2O43822 256 aa28.81■■■□□ 2.2
SYT6-210ENST00000641643 PRPF40BQ6NWY9 871 aaKnown RBP28.81■■■□□ 2.2
SYT6-210ENST00000641643 RIC3Q7Z5B4 369 aa28.81■■■□□ 2.2
SYT6-210ENST00000641643 STK31Q9BXU1 1019 aa28.81■■■□□ 2.2
SYT6-210ENST00000641643 COL11A2P13942 1736 aaPredicted RBP28.81■■■□□ 2.2
SYT6-210ENST00000641643 ABCC12Q96J65 1359 aa28.81■■■□□ 2.2
SYT6-210ENST00000641643 C9orf131Q5VYM1 1079 aa28.8■■■□□ 2.2
SYT6-210ENST00000641643 NLRP10Q86W26 655 aa28.8■■■□□ 2.2
SYT6-210ENST00000641643 PHAXQ9H814 394 aaKnown RBP28.8■■■□□ 2.2
SYT6-210ENST00000641643 ADCY9O60503 1353 aa28.8■■■□□ 2.2
SYT6-210ENST00000641643 ALDH1B1P30837 517 aa28.79■■■□□ 2.2
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