RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000636483.1

SPTAN1-232, Transcript of spectrin alpha, non-erythrocytic 1, humanhuman

TSL 5

Gene SPTAN1, Length 100 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTAN1-232ENST00000636483 WWC3Q9ULE0 1092 aa3.74□□□□□ -1.81
SPTAN1-232ENST00000636483 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa3.74□□□□□ -1.81
SPTAN1-232ENST00000636483 FAM187AA6NFU0 413 aa3.73□□□□□ -1.81
SPTAN1-232ENST00000636483 OPLAHO14841 1288 aa3.73□□□□□ -1.81
SPTAN1-232ENST00000636483 NDUFB5O43674 189 aa3.73□□□□□ -1.81
SPTAN1-232ENST00000636483 MICAL2O94851 1124 aa3.73□□□□□ -1.81
SPTAN1-232ENST00000636483 BMP1P13497 986 aa3.73□□□□□ -1.81
SPTAN1-232ENST00000636483 GTF2E1P29083 439 aaPredicted RBP3.73□□□□□ -1.81
SPTAN1-232ENST00000636483 ZAP70P43403 619 aa3.73□□□□□ -1.81
SPTAN1-232ENST00000636483 RTN1Q16799 776 aa3.73□□□□□ -1.81
SPTAN1-232ENST00000636483 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP3.73□□□□□ -1.81
SPTAN1-232ENST00000636483 GNASQ5JWF2 1037 aa3.73□□□□□ -1.81
SPTAN1-232ENST00000636483 LINC00528Q8N1L1 170 aa3.73□□□□□ -1.81
SPTAN1-232ENST00000636483 SUSD3Q96L08 255 aa3.73□□□□□ -1.81
SPTAN1-232ENST00000636483 FAM161BQ96MY7 647 aa3.73□□□□□ -1.81
SPTAN1-232ENST00000636483 RBCK1Q9BYM8 510 aa3.73□□□□□ -1.81
SPTAN1-232ENST00000636483 TREHO43280 583 aa3.72□□□□□ -1.81
SPTAN1-232ENST00000636483 UPP2O95045 317 aa3.72□□□□□ -1.81
SPTAN1-232ENST00000636483 IGHA2P01877 340 aa3.72□□□□□ -1.81
SPTAN1-232ENST00000636483 P4HBP07237 508 aaKnown RBP3.72□□□□□ -1.81
SPTAN1-232ENST00000636483 GPC1P35052 558 aa3.72□□□□□ -1.81
SPTAN1-232ENST00000636483 MAPK8P45983 427 aa3.72□□□□□ -1.81
SPTAN1-232ENST00000636483 HIRAP54198 1017 aaPredicted RBP3.72□□□□□ -1.81
SPTAN1-232ENST00000636483 DSC3Q14574 896 aa3.72□□□□□ -1.81
SPTAN1-232ENST00000636483 C8orf34Q49A92 452 aa3.72□□□□□ -1.81
SPTAN1-232ENST00000636483 EAPPQ56P03 285 aaPredicted RBP3.72□□□□□ -1.81
SPTAN1-232ENST00000636483 C1orf53Q5VUE5 145 aa3.72□□□□□ -1.81
SPTAN1-232ENST00000636483 ALKBH2Q6NS38 261 aa3.72□□□□□ -1.81
SPTAN1-232ENST00000636483 MRPL14Q6P1L8 145 aaKnown RBP3.72□□□□□ -1.81
SPTAN1-232ENST00000636483 NBPF10Q6P3W6 841 aaKnown RBP3.72□□□□□ -1.81
SPTAN1-232ENST00000636483 LRRC69Q6ZNQ3 347 aa3.72□□□□□ -1.81
SPTAN1-232ENST00000636483 LYSMD3Q7Z3D4 306 aa3.72□□□□□ -1.81
SPTAN1-232ENST00000636483 TRIM46Q7Z4K8 759 aa3.72□□□□□ -1.81
SPTAN1-232ENST00000636483 RGL4Q8IZJ4 473 aa3.72□□□□□ -1.81
SPTAN1-232ENST00000636483 NBPF15Q8N660 670 aa3.72□□□□□ -1.81
SPTAN1-232ENST00000636483 RNF217Q8TC41 542 aa3.72□□□□□ -1.81
SPTAN1-232ENST00000636483 RHPN1Q8TCX5 695 aa3.72□□□□□ -1.81
SPTAN1-232ENST00000636483 NUDT16Q96DE0 195 aaKnown RBP3.72□□□□□ -1.81
SPTAN1-232ENST00000636483 HSH2DQ96JZ2 352 aa3.72□□□□□ -1.81
SPTAN1-232ENST00000636483 ZIC5Q96T25 663 aa3.72□□□□□ -1.81
SPTAN1-232ENST00000636483 TTLL8A6PVC2 850 aa3.71□□□□□ -1.82
SPTAN1-232ENST00000636483 SOBPA7XYQ1 873 aa3.71□□□□□ -1.82
SPTAN1-232ENST00000636483 SPATA31C2B4DYI2 1134 aa3.71□□□□□ -1.82
SPTAN1-232ENST00000636483 GPR182O15218 404 aa3.71□□□□□ -1.82
SPTAN1-232ENST00000636483 PDGFAP04085 211 aa3.71□□□□□ -1.82
SPTAN1-232ENST00000636483 MSX1P28360 303 aa3.71□□□□□ -1.82
SPTAN1-232ENST00000636483 EHHADHQ08426 723 aa3.71□□□□□ -1.82
SPTAN1-232ENST00000636483 ARSJQ5FYB0 599 aaPredicted RBP3.71□□□□□ -1.82
SPTAN1-232ENST00000636483 BICDL1Q6ZP65 573 aa3.71□□□□□ -1.82
SPTAN1-232ENST00000636483 CMTR1Q8N1G2 835 aaKnown RBP3.71□□□□□ -1.82
SPTAN1-232ENST00000636483 ABTB2Q8N961 1025 aa3.71□□□□□ -1.82
SPTAN1-232ENST00000636483 ZFP42Q96MM3 310 aa3.71□□□□□ -1.82
SPTAN1-232ENST00000636483 TIMMDC1Q9NPL8 285 aa3.71□□□□□ -1.82
SPTAN1-232ENST00000636483 DMGDHQ9UI17 866 aaKnown RBP3.71□□□□□ -1.82
SPTAN1-232ENST00000636483 DACH1Q9UI36 760 aa3.71□□□□□ -1.82
SPTAN1-232ENST00000636483 GFRA3O60609 400 aa3.7□□□□□ -1.82
SPTAN1-232ENST00000636483 LDHBP07195 334 aaKnown RBP3.7□□□□□ -1.82
SPTAN1-232ENST00000636483 MZF1P28698 734 aaPredicted RBP3.7□□□□□ -1.82
SPTAN1-232ENST00000636483 CITED4Q96RK1 184 aa3.7□□□□□ -1.82
SPTAN1-232ENST00000636483 FAM129BQ96TA1 746 aa3.7□□□□□ -1.82
SPTAN1-232ENST00000636483 GAS2L1Q99501 681 aaPredicted RBP3.7□□□□□ -1.82
SPTAN1-232ENST00000636483 BACH2Q9BYV9 841 aa3.7□□□□□ -1.82
SPTAN1-232ENST00000636483 ZCCHC2Q9C0B9 1178 aaKnown RBP3.7□□□□□ -1.82
SPTAN1-232ENST00000636483 RUBCNLQ9H714 662 aa3.7□□□□□ -1.82
SPTAN1-232ENST00000636483 GPAMQ9HCL2 828 aa3.7□□□□□ -1.82
SPTAN1-232ENST00000636483 NEUROD4Q9HD90 331 aa3.7□□□□□ -1.82
SPTAN1-232ENST00000636483 PARP2Q9UGN5 583 aa3.7□□□□□ -1.82
SPTAN1-232ENST00000636483 SOS2Q07890 1332 aaPredicted RBP3.7□□□□□ -1.82
SPTAN1-232ENST00000636483 A0A1W2PNR3 127 aa3.69□□□□□ -1.82
SPTAN1-232ENST00000636483 ATP4AP20648 1035 aa3.69□□□□□ -1.82
SPTAN1-232ENST00000636483 GRNP28799 593 aaKnown RBP3.69□□□□□ -1.82
SPTAN1-232ENST00000636483 INPP5BP32019 993 aa3.69□□□□□ -1.82
SPTAN1-232ENST00000636483 IDH3AP50213 366 aa3.69□□□□□ -1.82
SPTAN1-232ENST00000636483 ORC1Q13415 861 aa3.69□□□□□ -1.82
SPTAN1-232ENST00000636483 SCARF1Q14162 830 aa3.69□□□□□ -1.82
SPTAN1-232ENST00000636483 NBPF1Q3BBV0 1214 aa3.69□□□□□ -1.82
SPTAN1-232ENST00000636483 C9orf131Q5VYM1 1079 aa3.69□□□□□ -1.82
SPTAN1-232ENST00000636483 GJD3Q8N144 294 aa3.69□□□□□ -1.82
SPTAN1-232ENST00000636483 PIK3R5Q8WYR1 880 aa3.69□□□□□ -1.82
SPTAN1-232ENST00000636483 DUSP9Q99956 384 aaKnown RBP3.69□□□□□ -1.82
SPTAN1-232ENST00000636483 DNMT3LQ9UJW3 386 aa3.69□□□□□ -1.82
SPTAN1-232ENST00000636483 PNMA6FA0A0J9YX94 578 aa3.68□□□□□ -1.82
SPTAN1-232ENST00000636483 ST8SIA5O15466 376 aa3.68□□□□□ -1.82
SPTAN1-232ENST00000636483 AVPP01185 164 aa3.68□□□□□ -1.82
SPTAN1-232ENST00000636483 TATP17735 454 aaPredicted RBP3.68□□□□□ -1.82
SPTAN1-232ENST00000636483 FMR1Q06787 632 aaKnown RBP eCLIP3.68□□□□□ -1.82
SPTAN1-232ENST00000636483 PDE3BQ13370 1112 aa3.68□□□□□ -1.82
SPTAN1-232ENST00000636483 TSNAXIP1Q2TAA8 658 aa3.68□□□□□ -1.82
SPTAN1-232ENST00000636483 PKDCCQ504Y2 493 aa3.68□□□□□ -1.82
SPTAN1-232ENST00000636483 LDLRAD1Q5T700 205 aa3.68□□□□□ -1.82
SPTAN1-232ENST00000636483 USPL1Q5W0Q7 1092 aa3.68□□□□□ -1.82
SPTAN1-232ENST00000636483 BTLAQ7Z6A9 289 aa3.68□□□□□ -1.82
SPTAN1-232ENST00000636483 TTC16Q8NEE8 873 aa3.68□□□□□ -1.82
SPTAN1-232ENST00000636483 DMRTB1Q96MA1 342 aa3.68□□□□□ -1.82
SPTAN1-232ENST00000636483 IGSF5Q9NSI5 407 aa3.68□□□□□ -1.82
SPTAN1-232ENST00000636483 ZDHHC3Q9NYG2 299 aa3.68□□□□□ -1.82
SPTAN1-232ENST00000636483 ANKIB1Q9P2G1 1089 aa3.68□□□□□ -1.82
SPTAN1-232ENST00000636483 FOXD3Q9UJU5 478 aaPredicted RBP3.68□□□□□ -1.82
SPTAN1-232ENST00000636483 RTCBQ9Y3I0 505 aaKnown RBP3.68□□□□□ -1.82
SPTAN1-232ENST00000636483 KCNMB2Q9Y691 235 aa3.68□□□□□ -1.82
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 47.7 ms