RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000635152.1

BRF1-222, Transcript of BRF1, RNA polymerase III transcription initiation factor subunit, human

TSL 2

Gene BRF1, Length 2,876 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
BRF1-222	ENST00000635152	JARID2	Q92833	1246 aa	Predicted RBP	15.85	■□□□□ 0.13
BRF1-222	ENST00000635152	RAD50	Q92878	1312 aa		15.85	■□□□□ 0.13
BRF1-222	ENST00000635152	NCAPD2	Q15021	1401 aa		15.85	■□□□□ 0.13
BRF1-222	ENST00000635152	C1orf167	Q5SNV9	1468 aa		15.85	■□□□□ 0.13
BRF1-222	ENST00000635152	LMO7	Q8WWI1	1683 aa		15.85	■□□□□ 0.13
BRF1-222	ENST00000635152	DTNB	O60941	627 aa		15.85	■□□□□ 0.13
BRF1-222	ENST00000635152	ATF3	P18847	181 aa		15.85	■□□□□ 0.13
BRF1-222	ENST00000635152	KAZALD1	Q96I82	304 aa		15.85	■□□□□ 0.13
BRF1-222	ENST00000635152	LSG1	Q9H089	658 aa	Known RBP	15.85	■□□□□ 0.13
BRF1-222	ENST00000635152	NSFL1C	Q9UNZ2	370 aa	Known RBP	15.85	■□□□□ 0.13
BRF1-222	ENST00000635152	SNX14	Q9Y5W7	946 aa		15.85	■□□□□ 0.13
BRF1-222	ENST00000635152	NASP	P49321	788 aa	Predicted RBP	15.84	■□□□□ 0.13
BRF1-222	ENST00000635152	PKNOX2	Q96KN3	472 aa		15.84	■□□□□ 0.13
BRF1-222	ENST00000635152	CCDC8	Q9H0W5	538 aa	Predicted RBP	15.84	■□□□□ 0.13
BRF1-222	ENST00000635152	ECHDC1	Q9NTX5	307 aa		15.84	■□□□□ 0.13
BRF1-222	ENST00000635152	HEG1	Q9ULI3	1381 aa		15.84	■□□□□ 0.13
BRF1-222	ENST00000635152	SLIT3	O75094	1523 aa		15.84	■□□□□ 0.13
BRF1-222	ENST00000635152	TUBGCP6	Q96RT7	1819 aa		15.84	■□□□□ 0.13
BRF1-222	ENST00000635152	SLC52A2	Q9HAB3	445 aa		15.84	■□□□□ 0.13
BRF1-222	ENST00000635152	TAT	P17735	454 aa	Predicted RBP	15.83	■□□□□ 0.13
BRF1-222	ENST00000635152	ZNF142	P52746	1687 aa	Predicted RBP	15.83	■□□□□ 0.13
BRF1-222	ENST00000635152	NPHP3	Q7Z494	1330 aa		15.83	■□□□□ 0.13
BRF1-222	ENST00000635152	TRIM44	Q96DX7	344 aa	Predicted RBP	15.83	■□□□□ 0.13
BRF1-222	ENST00000635152	N4BP2	Q86UW6	1770 aa	Predicted RBP	15.83	■□□□□ 0.12
BRF1-222	ENST00000635152	TTC41P	Q6P2S7	1318 aa		15.83	■□□□□ 0.12
BRF1-222	ENST00000635152	BRD1	O95696	1058 aa		15.83	■□□□□ 0.12
BRF1-222	ENST00000635152	IGKV5-2	P06315	115 aa		15.83	■□□□□ 0.12
BRF1-222	ENST00000635152	COPS6	Q7L5N1	327 aa		15.83	■□□□□ 0.12
BRF1-222	ENST00000635152	DDX54	Q8TDD1	881 aa	Known RBP	15.83	■□□□□ 0.12
BRF1-222	ENST00000635152	XAGE3	Q8WTP9	111 aa		15.83	■□□□□ 0.12
BRF1-222	ENST00000635152	ZNF496	Q96IT1	587 aa	Predicted RBP	15.83	■□□□□ 0.12
BRF1-222	ENST00000635152	G3BP1	Q13283	466 aa	Known RBP eCLIP	15.82	■□□□□ 0.12
BRF1-222	ENST00000635152	TPRN	Q4KMQ1	711 aa		15.82	■□□□□ 0.12
BRF1-222	ENST00000635152	GDPD2	Q9HCC8	539 aa		15.82	■□□□□ 0.12
BRF1-222	ENST00000635152	SASH1	O94885	1247 aa		15.82	■□□□□ 0.12
BRF1-222	ENST00000635152	PHKG2	P15735	406 aa		15.82	■□□□□ 0.12
BRF1-222	ENST00000635152	PTH1R	Q03431	593 aa		15.82	■□□□□ 0.12
BRF1-222	ENST00000635152	INTS4	Q96HW7	963 aa	Known RBP	15.82	■□□□□ 0.12
BRF1-222	ENST00000635152	MYD88	Q99836	296 aa		15.82	■□□□□ 0.12
BRF1-222	ENST00000635152	EAF2	Q96CJ1	260 aa	Predicted RBP	15.81	■□□□□ 0.12
BRF1-222	ENST00000635152	GPATCH3	Q96I76	525 aa		15.81	■□□□□ 0.12
BRF1-222	ENST00000635152	TLR7	Q9NYK1	1049 aa	Known RBP	15.81	■□□□□ 0.12
BRF1-222	ENST00000635152	USP16	Q9Y5T5	823 aa		15.81	■□□□□ 0.12
BRF1-222	ENST00000635152	AK2	P54819	239 aa		15.81	■□□□□ 0.12
BRF1-222	ENST00000635152	ERC1	Q8IUD2	1116 aa		15.81	■□□□□ 0.12
BRF1-222	ENST00000635152	PHRF1	Q9P1Y6	1649 aa	Known RBP	15.81	■□□□□ 0.12
BRF1-222	ENST00000635152	CAST	P20810	708 aa	Known RBP	15.81	■□□□□ 0.12
BRF1-222	ENST00000635152	NEXN	Q0ZGT2	675 aa		15.81	■□□□□ 0.12
BRF1-222	ENST00000635152	PRIM1	P49642	420 aa	Known RBP	15.8	■□□□□ 0.12
BRF1-222	ENST00000635152	PRPF40B	Q6NWY9	871 aa	Known RBP	15.8	■□□□□ 0.12
BRF1-222	ENST00000635152	TMEM63C	Q9P1W3	806 aa		15.8	■□□□□ 0.12
BRF1-222	ENST00000635152	HDAC5	Q9UQL6	1122 aa		15.8	■□□□□ 0.12
BRF1-222	ENST00000635152	LARP1	Q6PKG0	1096 aa	Known RBP	15.8	■□□□□ 0.12
BRF1-222	ENST00000635152	TTC5	Q8N0Z6	440 aa		15.8	■□□□□ 0.12
BRF1-222	ENST00000635152	BOLA2	Q9H3K6	86 aa		15.8	■□□□□ 0.12
BRF1-222	ENST00000635152	USP42	Q9H9J4	1324 aa	Known RBP	15.79	■□□□□ 0.12
BRF1-222	ENST00000635152	KDM6A	O15550	1401 aa	Predicted RBP	15.79	■□□□□ 0.12
BRF1-222	ENST00000635152	ZNF445	P59923	1031 aa		15.79	■□□□□ 0.12
BRF1-222	ENST00000635152	EPHA10	Q5JZY3	1008 aa		15.79	■□□□□ 0.12
BRF1-222	ENST00000635152	IFNL2	Q8IZJ0	200 aa		15.79	■□□□□ 0.12
BRF1-222	ENST00000635152	TMEM94	Q12767	1356 aa		15.79	■□□□□ 0.12
BRF1-222	ENST00000635152	ERBB4	Q15303	1308 aa		15.79	■□□□□ 0.12
BRF1-222	ENST00000635152	SYCE3	A1L190	88 aa		15.79	■□□□□ 0.12
BRF1-222	ENST00000635152	NEURL1B	A8MQ27	555 aa		15.79	■□□□□ 0.12
BRF1-222	ENST00000635152	ADCK5	Q3MIX3	580 aa		15.79	■□□□□ 0.12
BRF1-222	ENST00000635152	RUFY2	Q8WXA3	655 aa		15.79	■□□□□ 0.12
BRF1-222	ENST00000635152	FAM227B	Q96M60	508 aa		15.79	■□□□□ 0.12
BRF1-222	ENST00000635152	RGPD5	Q99666	1765 aa		15.79	■□□□□ 0.12
BRF1-222	ENST00000635152	OVOS2	A0A0G2JMS6	1433 aa		15.78	■□□□□ 0.12
BRF1-222	ENST00000635152	CYP27B1	O15528	508 aa		15.78	■□□□□ 0.12
BRF1-222	ENST00000635152	RUFY3	Q7L099	469 aa		15.78	■□□□□ 0.12
BRF1-222	ENST00000635152	ANP32B	Q92688	251 aa	Known RBP	15.78	■□□□□ 0.12
BRF1-222	ENST00000635152	IL17RA	Q96F46	866 aa		15.78	■□□□□ 0.12
BRF1-222	ENST00000635152	EPB41L2	O43491	1005 aa	Known RBP	15.78	■□□□□ 0.12
BRF1-222	ENST00000635152	KCNJ4	P48050	445 aa		15.78	■□□□□ 0.12
BRF1-222	ENST00000635152	JAKMIP1	Q96N16	626 aa	Known RBP	15.78	■□□□□ 0.12
BRF1-222	ENST00000635152	TTC14	Q96N46	770 aa		15.78	■□□□□ 0.12
BRF1-222	ENST00000635152	RBSN	Q9H1K0	784 aa		15.78	■□□□□ 0.12
BRF1-222	ENST00000635152	ADAMTSL3	P82987	1691 aa		15.78	■□□□□ 0.12
BRF1-222	ENST00000635152	MEGF6	O75095	1541 aa		15.78	■□□□□ 0.12
BRF1-222	ENST00000635152	ESPN	B1AK53	854 aa		15.77	■□□□□ 0.12
BRF1-222	ENST00000635152	ATP5J2-PTCD1	G3V325	749 aa		15.77	■□□□□ 0.12
BRF1-222	ENST00000635152	PTCD1	O75127	700 aa	Known RBP	15.77	■□□□□ 0.12
BRF1-222	ENST00000635152	GCKR	Q14397	625 aa		15.77	■□□□□ 0.12
BRF1-222	ENST00000635152	ANKRD13D	Q6ZTN6	518 aa		15.77	■□□□□ 0.12
BRF1-222	ENST00000635152	EVI5L	Q96CN4	794 aa		15.77	■□□□□ 0.12
BRF1-222	ENST00000635152	LARGE1	O95461	756 aa		15.76	■□□□□ 0.11
BRF1-222	ENST00000635152	LIMCH1	Q9UPQ0	1083 aa		15.76	■□□□□ 0.11
BRF1-222	ENST00000635152	TRPM3	Q9HCF6	1732 aa	Predicted RBP	15.76	■□□□□ 0.11
BRF1-222	ENST00000635152	UTY	O14607	1347 aa		15.76	■□□□□ 0.11
BRF1-222	ENST00000635152	SNRPA1	P09661	255 aa	Known RBP	15.76	■□□□□ 0.11
BRF1-222	ENST00000635152	NMI	Q13287	307 aa	Predicted RBP	15.76	■□□□□ 0.11
BRF1-222	ENST00000635152	EDC3	Q96F86	508 aa	Known RBP	15.76	■□□□□ 0.11
BRF1-222	ENST00000635152	METTL22	Q9BUU2	404 aa	Predicted RBP	15.76	■□□□□ 0.11
BRF1-222	ENST00000635152	GADD45B	O75293	160 aa	Predicted RBP	15.75	■□□□□ 0.11
BRF1-222	ENST00000635152	UBE3B	Q7Z3V4	1068 aa		15.75	■□□□□ 0.11
BRF1-222	ENST00000635152	FSD1	Q9BTV5	496 aa		15.75	■□□□□ 0.11
BRF1-222	ENST00000635152	WDR33	Q9C0J8	1336 aa	Known RBP	15.75	■□□□□ 0.11
BRF1-222	ENST00000635152	CLCN1	P35523	988 aa		15.75	■□□□□ 0.11
BRF1-222	ENST00000635152	CABP4	P57796	275 aa		15.75	■□□□□ 0.11

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