RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000613246.4

PTPRJ-207, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type J, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene PTPRJ, Length 7,851 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJ-207ENST00000613246 IVLP07476 585 aa21.34■■□□□ 1.01
PTPRJ-207ENST00000613246 METTL24Q5JXM2 366 aa21.34■■□□□ 1.01
PTPRJ-207ENST00000613246 SEPT14Q6ZU15 432 aa21.34■■□□□ 1.01
PTPRJ-207ENST00000613246 SLC12A7Q9Y666 1083 aa21.34■■□□□ 1.01
PTPRJ-207ENST00000613246 RANBP6O60518 1105 aaKnown RBP21.34■■□□□ 1.01
PTPRJ-207ENST00000613246 RSPH14Q9UHP6 348 aa21.33■■□□□ 1.01
PTPRJ-207ENST00000613246 GOLGA6L9A6NEM1 432 aa21.33■■□□□ 1.01
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PTPRJ-207ENST00000613246 CCDC12Q8WUD4 166 aaPredicted RBP21.33■■□□□ 1.01
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PTPRJ-207ENST00000613246 FHOD3Q2V2M9 1422 aa21.32■■□□□ 1
PTPRJ-207ENST00000613246 MCM6Q14566 821 aa21.32■■□□□ 1
PTPRJ-207ENST00000613246 STX1AQ16623 288 aa21.32■■□□□ 1
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PTPRJ-207ENST00000613246 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP21.31■■□□□ 1
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PTPRJ-207ENST00000613246 SELENOSQ9BQE4 189 aa21.31■■□□□ 1
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PTPRJ-207ENST00000613246 ARFGAP3Q9NP61 516 aa21.3■■□□□ 1
PTPRJ-207ENST00000613246 PDE3AQ14432 1141 aa21.3■■□□□ 1
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PTPRJ-207ENST00000613246 RNF216Q9NWF9 866 aaPredicted RBP21.3■■□□□ 1
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PTPRJ-207ENST00000613246 PAXBP1Q9Y5B6 917 aa21.3■■□□□ 1
PTPRJ-207ENST00000613246 STX6O43752 255 aa21.29■■□□□ 1
PTPRJ-207ENST00000613246 CCDC121Q6ZUS5 278 aa21.29■■□□□ 1
PTPRJ-207ENST00000613246 SPG7Q9UQ90 795 aa21.29■■□□□ 1
PTPRJ-207ENST00000613246 TMEM110-MUSTN1A8MSY1 372 aa21.29■■□□□ 1
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PTPRJ-207ENST00000613246 CCDC194A0A1B0GVG4 234 aa21.29■■□□□ 1
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PTPRJ-207ENST00000613246 NUTM1Q86Y26 1132 aa21.27■■□□□ 1
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PTPRJ-207ENST00000613246 IRX3P78415 501 aaPredicted RBP21.27■■□□□ 1
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PTPRJ-207ENST00000613246 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP21.26■□□□□ 0.99
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PTPRJ-207ENST00000613246 ATP2A1O14983 1001 aa21.24■□□□□ 0.99
PTPRJ-207ENST00000613246 HMGB1P09429 215 aaKnown RBP21.24■□□□□ 0.99
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