RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000585685.5

APOC4-APOC2-201, Transcript of APOC4-APOC2 readthrough (NMD candidate), humanhuman

TSL 5

Gene APOC4-APOC2, Length 1,829 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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APOC4-APOC2-201ENST00000585685 NHSL1Q5SYE7 1610 aa19.94■□□□□ 0.78
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 HIP1O00291 1037 aa19.94■□□□□ 0.78
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 TTC14Q96N46 770 aa19.94■□□□□ 0.78
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 GRPEL1Q9HAV7 217 aa19.94■□□□□ 0.78
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 DDX49Q9Y6V7 483 aaKnown RBP19.94■□□□□ 0.78
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 BRD1O95696 1058 aa19.93■□□□□ 0.78
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 RFX5P48382 616 aaPredicted RBP19.93■□□□□ 0.78
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 PIP4K2AP48426 406 aaPredicted RBP19.93■□□□□ 0.78
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 KCNB2Q92953 911 aa19.93■□□□□ 0.78
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 RASEFQ8IZ41 740 aa19.92■□□□□ 0.78
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 CARD10Q9BWT7 1032 aa19.92■□□□□ 0.78
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 CCDC8Q9H0W5 538 aaPredicted RBP19.92■□□□□ 0.78
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 SNRKQ9NRH2 765 aa19.92■□□□□ 0.78
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