RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000517309.5

PTDSS1-202, Transcript of phosphatidylserine synthase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTDSS1, Length 5,177 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTDSS1-202ENST00000517309 ZFYP08048 801 aaPredicted RBP20.36■□□□□ 0.85
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PTDSS1-202ENST00000517309 PDE4BQ07343 736 aa20.36■□□□□ 0.85
PTDSS1-202ENST00000517309 COPS6Q7L5N1 327 aa20.36■□□□□ 0.85
PTDSS1-202ENST00000517309 CCDC96Q2M329 555 aa20.35■□□□□ 0.85
PTDSS1-202ENST00000517309 HDAC1Q13547 482 aaPredicted RBP20.35■□□□□ 0.85
PTDSS1-202ENST00000517309 RHPN1Q8TCX5 695 aa20.35■□□□□ 0.85
PTDSS1-202ENST00000517309 CUL5Q93034 780 aa20.35■□□□□ 0.85
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PTDSS1-202ENST00000517309 ZNF219Q9P2Y4 722 aaPredicted RBP20.29■□□□□ 0.84
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PTDSS1-202ENST00000517309 PPP4R3BQ5MIZ7 849 aa20.29■□□□□ 0.84
PTDSS1-202ENST00000517309 ZNF771Q7L3S4 317 aaPredicted RBP20.29■□□□□ 0.84
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PTDSS1-202ENST00000517309 PPP4R3AQ6IN85 833 aa20.28■□□□□ 0.84
PTDSS1-202ENST00000517309 MYO1BO43795 1136 aa20.27■□□□□ 0.84
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PTDSS1-202ENST00000517309 KAT14Q9H8E8 782 aa20.27■□□□□ 0.84
PTDSS1-202ENST00000517309 MATR3P43243 847 aaKnown RBP eCLIP20.27■□□□□ 0.83
PTDSS1-202ENST00000517309 FEZ1Q99689 392 aa20.27■□□□□ 0.83
PTDSS1-202ENST00000517309 ZRANB1Q9UGI0 708 aa20.27■□□□□ 0.83
PTDSS1-202ENST00000517309 PCDH11XQ9BZA7 1347 aa20.27■□□□□ 0.83
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PTDSS1-202ENST00000517309 DNAI2Q9GZS0 605 aa20.26■□□□□ 0.83
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