RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000515130.6

MFSD8-208, Transcript of major facilitator superfamily domain containing 8, human

TSL 5

Gene MFSD8, Length 3,314 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MFSD8-208	ENST00000515130	FOSB	P53539	338 aa		13.82	□□□□□ -0.2
MFSD8-208	ENST00000515130	AK2	P54819	239 aa		13.82	□□□□□ -0.2
MFSD8-208	ENST00000515130	CUL4A	Q13619	759 aa		13.82	□□□□□ -0.2
MFSD8-208	ENST00000515130	TTC21A	Q8NDW8	1320 aa		13.82	□□□□□ -0.2
MFSD8-208	ENST00000515130	KCNQ3	O43525	872 aa		13.82	□□□□□ -0.2
MFSD8-208	ENST00000515130	TPD52L1	Q16890	204 aa	Predicted RBP	13.82	□□□□□ -0.2
MFSD8-208	ENST00000515130	ZBTB9	Q96C00	473 aa		13.82	□□□□□ -0.2
MFSD8-208	ENST00000515130	SYTL4	Q96C24	671 aa	Predicted RBP	13.82	□□□□□ -0.2
MFSD8-208	ENST00000515130	TECPR2	O15040	1411 aa		13.81	□□□□□ -0.2
MFSD8-208	ENST00000515130	LETM1	O95202	739 aa	Predicted RBP	13.81	□□□□□ -0.2
MFSD8-208	ENST00000515130	TNNT1	P13805	278 aa		13.81	□□□□□ -0.2
MFSD8-208	ENST00000515130	UBE2H	P62256	183 aa		13.81	□□□□□ -0.2
MFSD8-208	ENST00000515130	TFIP11	Q9UBB9	837 aa	Known RBP	13.81	□□□□□ -0.2
MFSD8-208	ENST00000515130	CAST	P20810	708 aa	Known RBP	13.81	□□□□□ -0.2
MFSD8-208	ENST00000515130	NCBP1	Q09161	790 aa	Known RBP	13.81	□□□□□ -0.2
MFSD8-208	ENST00000515130	TEF	Q10587	303 aa		13.81	□□□□□ -0.2
MFSD8-208	ENST00000515130	NCBP3	Q53F19	620 aa	Known RBP	13.81	□□□□□ -0.2
MFSD8-208	ENST00000515130	CDC42BPG	Q6DT37	1551 aa		13.81	□□□□□ -0.2
MFSD8-208	ENST00000515130	PIK3R4	Q99570	1358 aa		13.81	□□□□□ -0.2
MFSD8-208	ENST00000515130	GOLGA6L4	A6NEF3	574 aa		13.8	□□□□□ -0.2
MFSD8-208	ENST00000515130	GNAT3	A8MTJ3	354 aa		13.8	□□□□□ -0.2
MFSD8-208	ENST00000515130	GOLGA6L6	A8MZA4	724 aa		13.8	□□□□□ -0.2
MFSD8-208	ENST00000515130	ZNF853	P0CG23	659 aa		13.8	□□□□□ -0.2
MFSD8-208	ENST00000515130	BRPF1	P55201	1214 aa	Predicted RBP	13.8	□□□□□ -0.2
MFSD8-208	ENST00000515130	RASEF	Q8IZ41	740 aa		13.8	□□□□□ -0.2
MFSD8-208	ENST00000515130	STK31	Q9BXU1	1019 aa		13.8	□□□□□ -0.2
MFSD8-208	ENST00000515130	AXIN2	Q9Y2T1	843 aa		13.8	□□□□□ -0.2
MFSD8-208	ENST00000515130		A0A087WWV3	80 aa		13.8	□□□□□ -0.2
MFSD8-208	ENST00000515130	UVSSA	Q2YD98	709 aa		13.8	□□□□□ -0.2
MFSD8-208	ENST00000515130	TRMT1	Q9NXH9	659 aa	Known RBP	13.8	□□□□□ -0.2
MFSD8-208	ENST00000515130	TAOK2	Q9UL54	1235 aa		13.8	□□□□□ -0.2
MFSD8-208	ENST00000515130	GJB2	P29033	226 aa		13.8	□□□□□ -0.2
MFSD8-208	ENST00000515130	AIMP1	Q12904	312 aa	Known RBP	13.8	□□□□□ -0.2
MFSD8-208	ENST00000515130	STRN4	Q9NRL3	753 aa		13.8	□□□□□ -0.2
MFSD8-208	ENST00000515130	LRRFIP2	Q9Y608	721 aa	Known RBP	13.8	□□□□□ -0.2
MFSD8-208	ENST00000515130	TCHH	Q07283	1943 aa		13.8	□□□□□ -0.2
MFSD8-208	ENST00000515130	RGPD8	O14715	1765 aa	Predicted RBP	13.79	□□□□□ -0.2
MFSD8-208	ENST00000515130	KIF20A	O95235	890 aa		13.79	□□□□□ -0.2
MFSD8-208	ENST00000515130	F13A1	P00488	732 aa		13.79	□□□□□ -0.2
MFSD8-208	ENST00000515130	GNAI2	P04899	355 aa		13.79	□□□□□ -0.2
MFSD8-208	ENST00000515130	KCNJ4	P48050	445 aa		13.79	□□□□□ -0.2
MFSD8-208	ENST00000515130	CEBPZ	Q03701	1054 aa	Known RBP	13.79	□□□□□ -0.2
MFSD8-208	ENST00000515130	ANKRD24	Q8TF21	1146 aa		13.79	□□□□□ -0.2
MFSD8-208	ENST00000515130	ST7	Q9NRC1	585 aa		13.79	□□□□□ -0.2
MFSD8-208	ENST00000515130	SPTLC3	Q9NUV7	552 aa		13.79	□□□□□ -0.2
MFSD8-208	ENST00000515130	NPHP4	O75161	1426 aa	Predicted RBP	13.79	□□□□□ -0.2
MFSD8-208	ENST00000515130	GTF2E1	P29083	439 aa	Predicted RBP	13.79	□□□□□ -0.2
MFSD8-208	ENST00000515130	IL17RE	Q8NFR9	667 aa		13.79	□□□□□ -0.2
MFSD8-208	ENST00000515130	ZNF330	Q9Y3S2	320 aa	Predicted RBP	13.79	□□□□□ -0.2
MFSD8-208	ENST00000515130	AATK	Q6ZMQ8	1374 aa		13.79	□□□□□ -0.2
MFSD8-208	ENST00000515130	RPAP1	Q9BWH6	1393 aa	Predicted RBP	13.79	□□□□□ -0.2
MFSD8-208	ENST00000515130	CEP170B	Q9Y4F5	1589 aa	Predicted RBP	13.79	□□□□□ -0.2
MFSD8-208	ENST00000515130	PPFIA3	O75145	1194 aa		13.79	□□□□□ -0.2
MFSD8-208	ENST00000515130	CCDC192	P0DO97	292 aa		13.79	□□□□□ -0.2
MFSD8-208	ENST00000515130	GTF2F1	P35269	517 aa	Known RBP eCLIP	13.79	□□□□□ -0.2
MFSD8-208	ENST00000515130	KNDC1	Q76NI1	1749 aa		13.78	□□□□□ -0.2
MFSD8-208	ENST00000515130	STK3	Q13188	491 aa		13.78	□□□□□ -0.2
MFSD8-208	ENST00000515130	SLC39A6	Q13433	755 aa		13.78	□□□□□ -0.2
MFSD8-208	ENST00000515130	CCDC112	Q8NEF3	446 aa		13.78	□□□□□ -0.2
MFSD8-208	ENST00000515130	INTS4	Q96HW7	963 aa	Known RBP	13.78	□□□□□ -0.2
MFSD8-208	ENST00000515130	DIP2A	Q14689	1571 aa		13.78	□□□□□ -0.2
MFSD8-208	ENST00000515130	LIG1	P18858	919 aa		13.78	□□□□□ -0.2
MFSD8-208	ENST00000515130	ARID5B	Q14865	1188 aa		13.78	□□□□□ -0.2
MFSD8-208	ENST00000515130	ANO6	Q4KMQ2	910 aa		13.78	□□□□□ -0.2
MFSD8-208	ENST00000515130	SBNO1	A3KN83	1393 aa		13.77	□□□□□ -0.2
MFSD8-208	ENST00000515130	TMEM94	Q12767	1356 aa		13.77	□□□□□ -0.2
MFSD8-208	ENST00000515130	SETD1A	O15047	1707 aa	Known RBP	13.77	□□□□□ -0.2
MFSD8-208	ENST00000515130	KAT6B	Q8WYB5	2073 aa		13.77	□□□□□ -0.2
MFSD8-208	ENST00000515130	SURF6	O75683	361 aa	Known RBP	13.77	□□□□□ -0.2
MFSD8-208	ENST00000515130	OS9	Q13438	667 aa	Predicted RBP	13.77	□□□□□ -0.2
MFSD8-208	ENST00000515130	C1orf141	Q5JVX7	400 aa		13.77	□□□□□ -0.2
MFSD8-208	ENST00000515130	RUFY3	Q7L099	469 aa		13.77	□□□□□ -0.2
MFSD8-208	ENST00000515130	JAKMIP1	Q96N16	626 aa	Known RBP	13.77	□□□□□ -0.2
MFSD8-208	ENST00000515130	FILIP1	Q7Z7B0	1213 aa		13.77	□□□□□ -0.21
MFSD8-208	ENST00000515130	C19orf44	Q9H6X5	657 aa		13.77	□□□□□ -0.21
MFSD8-208	ENST00000515130	CDK12	Q9NYV4	1490 aa	Predicted RBP	13.77	□□□□□ -0.21
MFSD8-208	ENST00000515130	OVOS2	A0A0J9YW53	1432 aa		13.77	□□□□□ -0.21
MFSD8-208	ENST00000515130	OVOS2	Q6IE36	1432 aa		13.77	□□□□□ -0.21
MFSD8-208	ENST00000515130	HDGFL1	Q5TGJ6	251 aa		13.77	□□□□□ -0.21
MFSD8-208	ENST00000515130	KIF20B	Q96Q89	1820 aa		13.76	□□□□□ -0.21
MFSD8-208	ENST00000515130	PHAX	Q9H814	394 aa	Known RBP	13.76	□□□□□ -0.21
MFSD8-208	ENST00000515130	SNX14	Q9Y5W7	946 aa		13.76	□□□□□ -0.21
MFSD8-208	ENST00000515130	PRAMEF22	A3QJZ6	481 aa		13.76	□□□□□ -0.21
MFSD8-208	ENST00000515130	PRPF40B	Q6NWY9	871 aa	Known RBP	13.76	□□□□□ -0.21
MFSD8-208	ENST00000515130	NUP62CL	Q9H1M0	184 aa		13.76	□□□□□ -0.21
MFSD8-208	ENST00000515130	CHL1	O00533	1208 aa		13.75	□□□□□ -0.21
MFSD8-208	ENST00000515130	BICD2	Q8TD16	824 aa		13.75	□□□□□ -0.21
MFSD8-208	ENST00000515130	DNAJC25	Q9H1X3	360 aa		13.75	□□□□□ -0.21
MFSD8-208	ENST00000515130	TNMD	Q9H2S6	317 aa		13.75	□□□□□ -0.21
MFSD8-208	ENST00000515130	DACT1	Q9NYF0	836 aa		13.75	□□□□□ -0.21
MFSD8-208	ENST00000515130	TYRO3	Q06418	890 aa		13.75	□□□□□ -0.21
MFSD8-208	ENST00000515130	ZNF335	Q9H4Z2	1342 aa	Predicted RBP	13.75	□□□□□ -0.21
MFSD8-208	ENST00000515130	RGS12	O14924	1447 aa		13.75	□□□□□ -0.21
MFSD8-208	ENST00000515130	MAP3K11	Q16584	847 aa		13.75	□□□□□ -0.21
MFSD8-208	ENST00000515130	ANKRD7	Q92527	254 aa		13.74	□□□□□ -0.21
MFSD8-208	ENST00000515130	LIMCH1	Q9UPQ0	1083 aa		13.74	□□□□□ -0.21
MFSD8-208	ENST00000515130	ZSCAN21	Q9Y5A6	473 aa	Predicted RBP	13.74	□□□□□ -0.21
MFSD8-208	ENST00000515130	ARHGAP23	Q9P227	1491 aa		13.74	□□□□□ -0.21
MFSD8-208	ENST00000515130	USP32	Q8NFA0	1604 aa		13.74	□□□□□ -0.21
MFSD8-208	ENST00000515130	ADCK5	Q3MIX3	580 aa		13.74	□□□□□ -0.21

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 92.7 ms