RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000513165.1

HOXC-AS3-202, HOXC cluster antisense RNA 3, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene HOXC-AS3, Length 533 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC-AS3-202ENST00000513165 TRIM35Q9UPQ4 493 aa22.06■■□□□ 1.12
HOXC-AS3-202ENST00000513165 LAMB4A4D0S4 1761 aa22.06■■□□□ 1.12
HOXC-AS3-202ENST00000513165 TPTE2Q6XPS3 522 aa22.05■■□□□ 1.12
HOXC-AS3-202ENST00000513165 NBPF5PQ86XG9 351 aaPredicted RBP22.05■■□□□ 1.12
HOXC-AS3-202ENST00000513165 NIP7Q9Y221 180 aaKnown RBP eCLIP22.05■■□□□ 1.12
HOXC-AS3-202ENST00000513165 CHL1O00533 1208 aa22.04■■□□□ 1.12
HOXC-AS3-202ENST00000513165 HLFQ16534 295 aa22.04■■□□□ 1.12
HOXC-AS3-202ENST00000513165 C9orf131Q5VYM1 1079 aa22.04■■□□□ 1.12
HOXC-AS3-202ENST00000513165 CCDC24Q8N4L8 307 aa22.04■■□□□ 1.12
HOXC-AS3-202ENST00000513165 DLEC1Q9Y238 1755 aa22.03■■□□□ 1.12
HOXC-AS3-202ENST00000513165 NGEFQ8N5V2 710 aa22.03■■□□□ 1.12
HOXC-AS3-202ENST00000513165 ZNF526Q8TF50 670 aaPredicted RBP22.03■■□□□ 1.12
HOXC-AS3-202ENST00000513165 ZNF622Q969S3 477 aaKnown RBP eCLIP22.03■■□□□ 1.12
HOXC-AS3-202ENST00000513165 SRGNP10124 158 aa22.02■■□□□ 1.12
HOXC-AS3-202ENST00000513165 MYL6BP14649 208 aa22.02■■□□□ 1.12
HOXC-AS3-202ENST00000513165 MAP3K15Q6ZN16 1313 aa22.02■■□□□ 1.12
HOXC-AS3-202ENST00000513165 ANKRD31Q8N7Z5 1873 aa22.01■■□□□ 1.11
HOXC-AS3-202ENST00000513165 KLRG2A4D1S0 409 aaPredicted RBP22.01■■□□□ 1.11
HOXC-AS3-202ENST00000513165 STYK1Q6J9G0 422 aa22.01■■□□□ 1.11
HOXC-AS3-202ENST00000513165 KIF6Q6ZMV9 814 aa22.01■■□□□ 1.11
HOXC-AS3-202ENST00000513165 CNKSR1Q969H4 720 aa22.01■■□□□ 1.11
HOXC-AS3-202ENST00000513165 TTLL7Q6ZT98 887 aa22■■□□□ 1.11
HOXC-AS3-202ENST00000513165 MASTLQ96GX5 879 aa22■■□□□ 1.11
HOXC-AS3-202ENST00000513165 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP21.99■■□□□ 1.11
HOXC-AS3-202ENST00000513165 EIF2S2P20042 333 aaKnown RBP21.99■■□□□ 1.11
HOXC-AS3-202ENST00000513165 PDIA6Q15084 440 aa21.99■■□□□ 1.11
HOXC-AS3-202ENST00000513165 RNF181Q9P0P0 153 aa21.99■■□□□ 1.11
HOXC-AS3-202ENST00000513165 LRP10Q7Z4F1 713 aa21.98■■□□□ 1.11
HOXC-AS3-202ENST00000513165 CFAP44Q96MT7 982 aa21.98■■□□□ 1.11
HOXC-AS3-202ENST00000513165 NYXQ9GZU5 481 aa21.98■■□□□ 1.11
HOXC-AS3-202ENST00000513165 KIF3CO14782 793 aa21.97■■□□□ 1.11
HOXC-AS3-202ENST00000513165 LMNB1P20700 586 aa21.97■■□□□ 1.11
HOXC-AS3-202ENST00000513165 GIGYF2Q6Y7W6 1299 aaKnown RBP21.97■■□□□ 1.11
HOXC-AS3-202ENST00000513165 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP21.97■■□□□ 1.11
HOXC-AS3-202ENST00000513165 ZC3H4Q9UPT8 1303 aaKnown RBP21.97■■□□□ 1.11
HOXC-AS3-202ENST00000513165 SBF1O95248 1867 aa21.96■■□□□ 1.11
HOXC-AS3-202ENST00000513165 APAF1O14727 1248 aa21.96■■□□□ 1.11
HOXC-AS3-202ENST00000513165 GTF2E1P29083 439 aaPredicted RBP21.96■■□□□ 1.11
HOXC-AS3-202ENST00000513165 C21orf2O43822 256 aa21.95■■□□□ 1.1
HOXC-AS3-202ENST00000513165 HOXB7P09629 217 aa21.95■■□□□ 1.1
HOXC-AS3-202ENST00000513165 NPR1P16066 1061 aa21.95■■□□□ 1.1
HOXC-AS3-202ENST00000513165 RASSF7Q02833 373 aa21.95■■□□□ 1.1
HOXC-AS3-202ENST00000513165 ZNF34Q8IZ26 560 aa21.95■■□□□ 1.1
HOXC-AS3-202ENST00000513165 ZBTB3Q9H5J0 574 aa21.95■■□□□ 1.1
HOXC-AS3-202ENST00000513165 FAM177BA6PVY3 158 aa21.94■■□□□ 1.1
HOXC-AS3-202ENST00000513165 CALD1Q05682 793 aaKnown RBP21.94■■□□□ 1.1
HOXC-AS3-202ENST00000513165 SOGA3Q5TF21 947 aa21.94■■□□□ 1.1
HOXC-AS3-202ENST00000513165 NUP98P52948 1817 aa21.94■■□□□ 1.1
HOXC-AS3-202ENST00000513165 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa21.93■■□□□ 1.1
HOXC-AS3-202ENST00000513165 NFKBIEO00221 500 aa21.93■■□□□ 1.1
HOXC-AS3-202ENST00000513165 ZNF853P0CG23 659 aa21.93■■□□□ 1.1
HOXC-AS3-202ENST00000513165 PRPF40BQ6NWY9 871 aaKnown RBP21.93■■□□□ 1.1
HOXC-AS3-202ENST00000513165 KDM2BQ8NHM5 1336 aa21.93■■□□□ 1.1
HOXC-AS3-202ENST00000513165 DDX21Q9NR30 783 aaKnown RBP eCLIP21.93■■□□□ 1.1
HOXC-AS3-202ENST00000513165 COL11A2P13942 1736 aaPredicted RBP21.92■■□□□ 1.1
HOXC-AS3-202ENST00000513165 IBTKQ9P2D0 1353 aaPredicted RBP21.92■■□□□ 1.1
HOXC-AS3-202ENST00000513165 PRELPP51888 382 aa21.92■■□□□ 1.1
HOXC-AS3-202ENST00000513165 PROSER3Q2NL68 480 aa21.92■■□□□ 1.1
HOXC-AS3-202ENST00000513165 LTBP3Q9NS15 1303 aa21.91■■□□□ 1.1
HOXC-AS3-202ENST00000513165 ALDH1B1P30837 517 aa21.91■■□□□ 1.1
HOXC-AS3-202ENST00000513165 KRT24Q2M2I5 525 aa21.91■■□□□ 1.1
HOXC-AS3-202ENST00000513165 PARP10Q53GL7 1025 aa21.91■■□□□ 1.1
HOXC-AS3-202ENST00000513165 SUSD4Q5VX71 490 aa21.91■■□□□ 1.1
HOXC-AS3-202ENST00000513165 COPS6Q7L5N1 327 aa21.91■■□□□ 1.1
HOXC-AS3-202ENST00000513165 C7orf43Q8WVR3 580 aa21.91■■□□□ 1.1
HOXC-AS3-202ENST00000513165 NMRK2Q9NPI5 230 aa21.91■■□□□ 1.1
HOXC-AS3-202ENST00000513165 ZNF219Q9P2Y4 722 aaPredicted RBP21.91■■□□□ 1.1
HOXC-AS3-202ENST00000513165 UBN2Q6ZU65 1347 aa21.9■■□□□ 1.1
HOXC-AS3-202ENST00000513165 TOMM70O94826 608 aa21.9■■□□□ 1.1
HOXC-AS3-202ENST00000513165 ANXA1P04083 346 aa21.9■■□□□ 1.1
HOXC-AS3-202ENST00000513165 GPTP24298 496 aa21.9■■□□□ 1.1
HOXC-AS3-202ENST00000513165 CCDC184Q52MB2 194 aa21.9■■□□□ 1.1
HOXC-AS3-202ENST00000513165 PPP1R42Q7Z4L9 355 aa21.9■■□□□ 1.1
HOXC-AS3-202ENST00000513165 NECTIN2Q92692 538 aa21.9■■□□□ 1.1
HOXC-AS3-202ENST00000513165 MBIPQ9NS73 344 aa21.9■■□□□ 1.1
HOXC-AS3-202ENST00000513165 IFT57Q9NWB7 429 aa21.9■■□□□ 1.1
HOXC-AS3-202ENST00000513165 SLX4Q8IY92 1834 aa21.9■■□□□ 1.1
HOXC-AS3-202ENST00000513165 ANP32CO43423 234 aa21.89■■□□□ 1.09
HOXC-AS3-202ENST00000513165 GNAI1P63096 354 aa21.89■■□□□ 1.09
HOXC-AS3-202ENST00000513165 CRY2Q49AN0 593 aa21.89■■□□□ 1.09
HOXC-AS3-202ENST00000513165 ERFEQ4G0M1 354 aa21.89■■□□□ 1.09
HOXC-AS3-202ENST00000513165 HSP90AB3PQ58FF7 597 aa21.89■■□□□ 1.09
HOXC-AS3-202ENST00000513165 NUTM1Q86Y26 1132 aa21.89■■□□□ 1.09
HOXC-AS3-202ENST00000513165 HDGFL1Q5TGJ6 251 aa21.88■■□□□ 1.09
HOXC-AS3-202ENST00000513165 XAGE3Q8WTP9 111 aa21.88■■□□□ 1.09
HOXC-AS3-202ENST00000513165 TAOK3Q9H2K8 898 aa21.88■■□□□ 1.09
HOXC-AS3-202ENST00000513165 DBF4Q9UBU7 674 aaPredicted RBP21.88■■□□□ 1.09
HOXC-AS3-202ENST00000513165 RIC1Q4ADV7 1423 aa21.88■■□□□ 1.09
HOXC-AS3-202ENST00000513165 GLTPD2A6NH11 291 aa21.87■■□□□ 1.09
HOXC-AS3-202ENST00000513165 NTSR2O95665 410 aa21.87■■□□□ 1.09
HOXC-AS3-202ENST00000513165 AIMP1Q12904 312 aaKnown RBP21.87■■□□□ 1.09
HOXC-AS3-202ENST00000513165 DUSP27Q5VZP5 1158 aa21.87■■□□□ 1.09
HOXC-AS3-202ENST00000513165 FER1L6Q2WGJ9 1857 aa21.87■■□□□ 1.09
HOXC-AS3-202ENST00000513165 HOXA10P31260 410 aaPredicted RBP21.86■■□□□ 1.09
HOXC-AS3-202ENST00000513165 CCDC93Q567U6 631 aa21.86■■□□□ 1.09
HOXC-AS3-202ENST00000513165 UTP14AQ9BVJ6 771 aaKnown RBP21.86■■□□□ 1.09
HOXC-AS3-202ENST00000513165 CHPF2Q9P2E5 772 aa21.86■■□□□ 1.09
HOXC-AS3-202ENST00000513165 ARFGEF2Q9Y6D5 1785 aa21.86■■□□□ 1.09
HOXC-AS3-202ENST00000513165 ABCC12Q96J65 1359 aa21.86■■□□□ 1.09
HOXC-AS3-202ENST00000513165 RNF123Q5XPI4 1314 aa21.85■■□□□ 1.09
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