RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000504936.1

PITX1-204, Transcript of paired like homeodomain 1, humanhuman

TSL 2

Gene PITX1, Length 770 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX1-204ENST00000504936 KIAA1551Q9HCM1 1747 aa24.61■■□□□ 1.53
PITX1-204ENST00000504936 SERPINB2P05120 415 aa24.61■■□□□ 1.53
PITX1-204ENST00000504936 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP24.61■■□□□ 1.53
PITX1-204ENST00000504936 TTLL7Q6ZT98 887 aa24.61■■□□□ 1.53
PITX1-204ENST00000504936 SETDB2Q96T68 719 aa24.61■■□□□ 1.53
PITX1-204ENST00000504936 ZBTB3Q9H5J0 574 aa24.61■■□□□ 1.53
PITX1-204ENST00000504936 ANKRD36CQ5JPF3 1778 aa24.61■■□□□ 1.53
PITX1-204ENST00000504936 CHD4Q14839 1912 aa24.61■■□□□ 1.53
PITX1-204ENST00000504936 AIMP1Q12904 312 aaKnown RBP24.6■■□□□ 1.53
PITX1-204ENST00000504936 PROSER3Q2NL68 480 aa24.6■■□□□ 1.53
PITX1-204ENST00000504936 CHPF2Q9P2E5 772 aa24.6■■□□□ 1.53
PITX1-204ENST00000504936 MAP3K15Q6ZN16 1313 aa24.6■■□□□ 1.53
PITX1-204ENST00000504936 WDR63Q8IWG1 891 aa24.59■■□□□ 1.53
PITX1-204ENST00000504936 BRCA1P38398 1863 aaKnown RBP24.58■■□□□ 1.53
PITX1-204ENST00000504936 DDX21Q9NR30 783 aaKnown RBP eCLIP24.58■■□□□ 1.53
PITX1-204ENST00000504936 NIP7Q9Y221 180 aaKnown RBP eCLIP24.58■■□□□ 1.53
PITX1-204ENST00000504936 CACNA1SQ13698 1873 aa24.58■■□□□ 1.52
PITX1-204ENST00000504936 ANKRD31Q8N7Z5 1873 aa24.58■■□□□ 1.52
PITX1-204ENST00000504936 PXDNLA1KZ92 1463 aa24.58■■□□□ 1.52
PITX1-204ENST00000504936 FAM177BA6PVY3 158 aa24.57■■□□□ 1.52
PITX1-204ENST00000504936 PDIA6Q15084 440 aa24.57■■□□□ 1.52
PITX1-204ENST00000504936 HLFQ16534 295 aa24.57■■□□□ 1.52
PITX1-204ENST00000504936 CLEC4GQ6UXB4 293 aa24.57■■□□□ 1.52
PITX1-204ENST00000504936 C8orf58Q8NAV2 365 aa24.57■■□□□ 1.52
PITX1-204ENST00000504936 FANCIQ9NVI1 1328 aa24.57■■□□□ 1.52
PITX1-204ENST00000504936 CNBD1Q8NA66 436 aa24.56■■□□□ 1.52
PITX1-204ENST00000504936 XAGE3Q8WTP9 111 aa24.56■■□□□ 1.52
PITX1-204ENST00000504936 DBF4Q9UBU7 674 aaPredicted RBP24.56■■□□□ 1.52
PITX1-204ENST00000504936 CACNA1FO60840 1977 aa24.56■■□□□ 1.52
PITX1-204ENST00000504936 A0A0G2JLW4 131 aa24.55■■□□□ 1.52
PITX1-204ENST00000504936 TGFB2P61812 414 aa24.55■■□□□ 1.52
PITX1-204ENST00000504936 NBPF5PQ86XG9 351 aaPredicted RBP24.55■■□□□ 1.52
PITX1-204ENST00000504936 ARFGEF2Q9Y6D5 1785 aa24.54■■□□□ 1.52
PITX1-204ENST00000504936 ERVV-1B6SEH8 477 aa24.54■■□□□ 1.52
PITX1-204ENST00000504936 ST5P78524 1137 aa24.54■■□□□ 1.52
PITX1-204ENST00000504936 COPS6Q7L5N1 327 aa24.54■■□□□ 1.52
PITX1-204ENST00000504936 CCDC24Q8N4L8 307 aa24.54■■□□□ 1.52
PITX1-204ENST00000504936 MYH16Q9H6N6 1097 aa24.54■■□□□ 1.52
PITX1-204ENST00000504936 DLEC1Q9Y238 1755 aa24.54■■□□□ 1.52
PITX1-204ENST00000504936 DPEP1P16444 411 aa24.53■■□□□ 1.52
PITX1-204ENST00000504936 GPTP24298 496 aa24.53■■□□□ 1.52
PITX1-204ENST00000504936 TSPYL6Q8N831 410 aa24.53■■□□□ 1.52
PITX1-204ENST00000504936 CHMP4AQ9BY43 222 aa24.53■■□□□ 1.52
PITX1-204ENST00000504936 UTRNP46939 3433 aa24.52■■□□□ 1.52
PITX1-204ENST00000504936 GTF2E1P29083 439 aaPredicted RBP24.52■■□□□ 1.52
PITX1-204ENST00000504936 GOLGA2Q08379 1002 aa24.52■■□□□ 1.52
PITX1-204ENST00000504936 TWISTNBQ3B726 338 aaPredicted RBP24.52■■□□□ 1.52
PITX1-204ENST00000504936 CCDC30Q5VVM6 783 aa24.52■■□□□ 1.52
PITX1-204ENST00000504936 HYPKQ9NX55 129 aa24.52■■□□□ 1.52
PITX1-204ENST00000504936 PRR5LQ6MZQ0 368 aa24.51■■□□□ 1.51
PITX1-204ENST00000504936 LRP10Q7Z4F1 713 aa24.51■■□□□ 1.51
PITX1-204ENST00000504936 COL11A2P13942 1736 aaPredicted RBP24.51■■□□□ 1.51
PITX1-204ENST00000504936 ARFGEF1Q9Y6D6 1849 aa24.5■■□□□ 1.51
PITX1-204ENST00000504936 RGL2O15211 777 aa24.5■■□□□ 1.51
PITX1-204ENST00000504936 CHRNA5P30532 468 aa24.5■■□□□ 1.51
PITX1-204ENST00000504936 STK31Q9BXU1 1019 aa24.5■■□□□ 1.51
PITX1-204ENST00000504936 BCS1LQ9Y276 419 aa24.5■■□□□ 1.51
PITX1-204ENST00000504936 ATP10DQ9P241 1426 aa24.5■■□□□ 1.51
PITX1-204ENST00000504936 TCERG1O14776 1098 aaKnown RBP24.49■■□□□ 1.51
PITX1-204ENST00000504936 YBX3P16989 372 aaKnown RBP eCLIP24.49■■□□□ 1.513e-11■□□□□ 8.8
PITX1-204ENST00000504936 GIGYF2Q6Y7W6 1299 aaKnown RBP24.49■■□□□ 1.51
PITX1-204ENST00000504936 EXOSC9Q06265 439 aaKnown RBP24.48■■□□□ 1.51
PITX1-204ENST00000504936 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP24.48■■□□□ 1.51
PITX1-204ENST00000504936 HSP90AB3PQ58FF7 597 aa24.47■■□□□ 1.51
PITX1-204ENST00000504936 TPTE2Q6XPS3 522 aa24.47■■□□□ 1.51
PITX1-204ENST00000504936 C2CD5Q86YS7 1000 aa24.47■■□□□ 1.51
PITX1-204ENST00000504936 GRIN3BO60391 1043 aa24.46■■□□□ 1.51
PITX1-204ENST00000504936 NYXQ9GZU5 481 aa24.46■■□□□ 1.51
PITX1-204ENST00000504936 PIM2Q9P1W9 311 aa24.46■■□□□ 1.51
PITX1-204ENST00000504936 H0YIN7 160 aa24.45■■□□□ 1.5
PITX1-204ENST00000504936 PDE6BP35913 854 aa24.45■■□□□ 1.5
PITX1-204ENST00000504936 PHAXQ9H814 394 aaKnown RBP24.45■■□□□ 1.5
PITX1-204ENST00000504936 UBN2Q6ZU65 1347 aa24.44■■□□□ 1.5
PITX1-204ENST00000504936 ZNF521Q96K83 1311 aa24.44■■□□□ 1.5
PITX1-204ENST00000504936 ANKRD13DQ6ZTN6 518 aa24.44■■□□□ 1.5
PITX1-204ENST00000504936 RIC3Q7Z5B4 369 aa24.44■■□□□ 1.5
PITX1-204ENST00000504936 PLBD2Q8NHP8 589 aa24.44■■□□□ 1.5
PITX1-204ENST00000504936 BRIP1Q9BX63 1249 aa24.44■■□□□ 1.5
PITX1-204ENST00000504936 TNRC6CQ9HCJ0 1690 aaKnown RBP24.43■■□□□ 1.5
PITX1-204ENST00000504936 PARP10Q53GL7 1025 aa24.43■■□□□ 1.5
PITX1-204ENST00000504936 DALRD3Q5D0E6 543 aaKnown RBP24.43■■□□□ 1.5
PITX1-204ENST00000504936 PPP1R42Q7Z4L9 355 aa24.43■■□□□ 1.5
PITX1-204ENST00000504936 NUTM1Q86Y26 1132 aa24.43■■□□□ 1.5
PITX1-204ENST00000504936 ZNF622Q969S3 477 aaKnown RBP eCLIP24.43■■□□□ 1.5
PITX1-204ENST00000504936 E9PSI1 815 aa24.42■■□□□ 1.5
PITX1-204ENST00000504936 DDX58O95786 925 aaKnown RBP24.42■■□□□ 1.5
PITX1-204ENST00000504936 SUSD4Q5VX71 490 aa24.41■■□□□ 1.5
PITX1-204ENST00000504936 ZNF34Q8IZ26 560 aa24.41■■□□□ 1.5
PITX1-204ENST00000504936 ZNF428Q96B54 188 aa24.41■■□□□ 1.5
PITX1-204ENST00000504936 KCNA3P22001 575 aa24.4■■□□□ 1.5
PITX1-204ENST00000504936 YY1P25490 414 aa24.4■■□□□ 1.5
PITX1-204ENST00000504936 TCIRG1Q13488 830 aa24.4■■□□□ 1.5
PITX1-204ENST00000504936 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa24.4■■□□□ 1.5
PITX1-204ENST00000504936 ABCC12Q96J65 1359 aa24.4■■□□□ 1.5
PITX1-204ENST00000504936 IBTKQ9P2D0 1353 aaPredicted RBP24.4■■□□□ 1.5
PITX1-204ENST00000504936 ERFEQ4G0M1 354 aa24.39■■□□□ 1.49
PITX1-204ENST00000504936 UTP14AQ9BVJ6 771 aaKnown RBP24.39■■□□□ 1.49
PITX1-204ENST00000504936 ATP5J2-PTCD1G3V325 749 aa24.38■■□□□ 1.49
PITX1-204ENST00000504936 VAMP4O75379 141 aa24.38■■□□□ 1.49
PITX1-204ENST00000504936 SLC4A2P04920 1241 aa24.38■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.6 ms