RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000477112.1

DDX17-208, Transcript of DEAD-box helicase 17, human

TSL 2

Gene DDX17, Length 654 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
DDX17-208	ENST00000477112	MDFI	Q99750	246 aa		4.95	□□□□□ -1.62
DDX17-208	ENST00000477112	STRN4	Q9NRL3	753 aa		4.95	□□□□□ -1.62
DDX17-208	ENST00000477112	PTCD1	O75127	700 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
DDX17-208	ENST00000477112	IREB2	P48200	963 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
DDX17-208	ENST00000477112	TNFRSF25	Q93038	417 aa		4.94	□□□□□ -1.62
DDX17-208	ENST00000477112	SAMD5	Q5TGI4	173 aa		4.93	□□□□□ -1.62
DDX17-208	ENST00000477112	BICDL1	Q6ZP65	573 aa		4.93	□□□□□ -1.62
DDX17-208	ENST00000477112	AK7	Q96M32	723 aa		4.93	□□□□□ -1.62
DDX17-208	ENST00000477112	HMX1	Q9NP08	348 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
DDX17-208	ENST00000477112	FBXO45	P0C2W1	286 aa		4.92	□□□□□ -1.62
DDX17-208	ENST00000477112	BRPF1	P55201	1214 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
DDX17-208	ENST00000477112	C20orf204	Q6ZNR8	217 aa		4.92	□□□□□ -1.62
DDX17-208	ENST00000477112	ZIC5	Q96T25	663 aa		4.92	□□□□□ -1.62
DDX17-208	ENST00000477112	KRTAP17-1	Q9BYP8	105 aa		4.92	□□□□□ -1.62
DDX17-208	ENST00000477112	ZNF330	Q9Y3S2	320 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
DDX17-208	ENST00000477112	CCDC180	Q9P1Z9	1646 aa		4.91	□□□□□ -1.62
DDX17-208	ENST00000477112	EFS	O43281	561 aa		4.91	□□□□□ -1.62
DDX17-208	ENST00000477112	C8A	P07357	584 aa		4.91	□□□□□ -1.62
DDX17-208	ENST00000477112	USP17L8	P0C7I0	530 aa		4.91	□□□□□ -1.62
DDX17-208	ENST00000477112	FMR1NB	Q8N0W7	255 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
DDX17-208	ENST00000477112	SLC24A3	Q9HC58	644 aa		4.91	□□□□□ -1.62
DDX17-208	ENST00000477112	JPH1	Q9HDC5	661 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
DDX17-208	ENST00000477112	KIAA1324L	A8MWY0	1029 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
DDX17-208	ENST00000477112	MED26	O95402	600 aa		4.9	□□□□□ -1.63
DDX17-208	ENST00000477112	OGFOD2	Q6N063	350 aa		4.9	□□□□□ -1.63
DDX17-208	ENST00000477112	DMRTC2	Q8IXT2	367 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
DDX17-208	ENST00000477112	ETNK1	Q9HBU6	452 aa		4.9	□□□□□ -1.63
DDX17-208	ENST00000477112	NEUROD4	Q9HD90	331 aa		4.9	□□□□□ -1.63
DDX17-208	ENST00000477112	GSC2	O15499	205 aa		4.89	□□□□□ -1.63
DDX17-208	ENST00000477112	NOS3	P29474	1203 aa		4.89	□□□□□ -1.63
DDX17-208	ENST00000477112	GRIK1	P39086	918 aa		4.89	□□□□□ -1.63
DDX17-208	ENST00000477112	LCE4A	Q5TA78	99 aa		4.89	□□□□□ -1.63
DDX17-208	ENST00000477112	HOMEZ	Q8IX15	550 aa		4.89	□□□□□ -1.63
DDX17-208	ENST00000477112	CCER1	Q8TC90	406 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
DDX17-208	ENST00000477112	MEGF10	Q96KG7	1140 aa		4.89	□□□□□ -1.63
DDX17-208	ENST00000477112	ZDHHC3	Q9NYG2	299 aa		4.89	□□□□□ -1.63
DDX17-208	ENST00000477112	WNT11	O96014	354 aa		4.88	□□□□□ -1.63
DDX17-208	ENST00000477112	RANGAP1	P46060	587 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
DDX17-208	ENST00000477112	TBC1D8B	Q0IIM8	1120 aa		4.88	□□□□□ -1.63
DDX17-208	ENST00000477112	NUDT8	Q8WV74	236 aa		4.88	□□□□□ -1.63
DDX17-208	ENST00000477112	SLC30A3	Q99726	388 aa		4.88	□□□□□ -1.63
DDX17-208	ENST00000477112	CDCA7	Q9BWT1	371 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
DDX17-208	ENST00000477112	TGFB1	P01137	390 aa		4.87	□□□□□ -1.63
DDX17-208	ENST00000477112	PDE4D	Q08499	809 aa		4.87	□□□□□ -1.63
DDX17-208	ENST00000477112	SPEM2	Q0P670	501 aa		4.87	□□□□□ -1.63
DDX17-208	ENST00000477112	USP4	Q13107	963 aa		4.87	□□□□□ -1.63
DDX17-208	ENST00000477112	SKIV2L	Q15477	1246 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
DDX17-208	ENST00000477112	INTS5	Q6P9B9	1019 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
DDX17-208	ENST00000477112	STAU1	O95793	577 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
DDX17-208	ENST00000477112	NR1H3	Q13133	447 aa		4.86	□□□□□ -1.63
DDX17-208	ENST00000477112	FBLN7	Q53RD9	439 aa		4.86	□□□□□ -1.63
DDX17-208	ENST00000477112	FBXO31	Q5XUX0	539 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
DDX17-208	ENST00000477112	POU5F2	Q8N7G0	328 aa		4.86	□□□□□ -1.63
DDX17-208	ENST00000477112	IGFLR1	Q9H665	355 aa		4.86	□□□□□ -1.63
DDX17-208	ENST00000477112	CABP1	Q9NZU7	370 aa		4.86	□□□□□ -1.63
DDX17-208	ENST00000477112	IGLV1-40	P01703	118 aa		4.85	□□□□□ -1.63
DDX17-208	ENST00000477112	SFSWAP	Q12872	951 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
DDX17-208	ENST00000477112	IGF2-AS	Q6U949	168 aa		4.85	□□□□□ -1.63
DDX17-208	ENST00000477112	LRRC69	Q6ZNQ3	347 aa		4.85	□□□□□ -1.63
DDX17-208	ENST00000477112	RAB44	Q7Z6P3	723 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
DDX17-208	ENST00000477112	FBXO11	Q86XK2	927 aa		4.85	□□□□□ -1.63
DDX17-208	ENST00000477112	DTWD1	Q8N5C7	304 aa		4.85	□□□□□ -1.63
DDX17-208	ENST00000477112	PROCA1	Q8NCQ7	364 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
DDX17-208	ENST00000477112	ASIC4	Q96FT7	647 aa		4.85	□□□□□ -1.63
DDX17-208	ENST00000477112	UBE2O	Q9C0C9	1292 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
DDX17-208	ENST00000477112	ADGRE2	Q9UHX3	823 aa		4.85	□□□□□ -1.63
DDX17-208	ENST00000477112	RGS9	O75916	674 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
DDX17-208	ENST00000477112	AFF1	P51825	1210 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
DDX17-208	ENST00000477112	SMTN	P53814	917 aa		4.84	□□□□□ -1.63
DDX17-208	ENST00000477112	CCDC85A	Q96PX6	553 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
DDX17-208	ENST00000477112	TRIM34	Q9BYJ4	488 aa		4.84	□□□□□ -1.63
DDX17-208	ENST00000477112	ADAMTS4	O75173	837 aa		4.83	□□□□□ -1.64
DDX17-208	ENST00000477112	INHA	P05111	366 aa		4.83	□□□□□ -1.64
DDX17-208	ENST00000477112	GDF10	P55107	478 aa		4.83	□□□□□ -1.64
DDX17-208	ENST00000477112	KRTAP5-3	Q6L8H2	238 aa		4.83	□□□□□ -1.64
DDX17-208	ENST00000477112	PSAPL1	Q6NUJ1	521 aa		4.83	□□□□□ -1.64
DDX17-208	ENST00000477112	SIRT1	Q96EB6	747 aa		4.83	□□□□□ -1.64
DDX17-208	ENST00000477112	DDRGK1	Q96HY6	314 aa		4.83	□□□□□ -1.64
DDX17-208	ENST00000477112	GNL3	Q9BVP2	549 aa	Known RBP eCLIP	4.83	□□□□□ -1.64
DDX17-208	ENST00000477112	AKTIP	Q9H8T0	292 aa		4.83	□□□□□ -1.64
DDX17-208	ENST00000477112	RAX	Q9Y2V3	346 aa		4.83	□□□□□ -1.64
DDX17-208	ENST00000477112	SPINK2	P20155	84 aa		4.82	□□□□□ -1.64
DDX17-208	ENST00000477112	DZIP1L	Q8IYY4	767 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
DDX17-208	ENST00000477112	BHMT	Q93088	406 aa		4.82	□□□□□ -1.64
DDX17-208	ENST00000477112	STOML1	Q9UBI4	398 aa		4.82	□□□□□ -1.64
DDX17-208	ENST00000477112	SLC6A14	Q9UN76	642 aa		4.82	□□□□□ -1.64
DDX17-208	ENST00000477112	DOLK	Q9UPQ8	538 aa		4.82	□□□□□ -1.64
DDX17-208	ENST00000477112	CDK2AP1	O14519	115 aa		4.81	□□□□□ -1.64
DDX17-208	ENST00000477112	MSL1	Q68DK7	614 aa		4.81	□□□□□ -1.64
DDX17-208	ENST00000477112	KDM4C	Q9H3R0	1056 aa		4.81	□□□□□ -1.64
DDX17-208	ENST00000477112	SERTAD1	Q9UHV2	236 aa		4.81	□□□□□ -1.64
DDX17-208	ENST00000477112	PARP3	Q9Y6F1	533 aa		4.81	□□□□□ -1.64
DDX17-208	ENST00000477112	EIF5B	O60841	1220 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
DDX17-208	ENST00000477112	SH3D19	Q5HYK7	790 aa		4.8	□□□□□ -1.64
DDX17-208	ENST00000477112	DTX1	Q86Y01	620 aa		4.8	□□□□□ -1.64
DDX17-208	ENST00000477112	CEP126	Q9P2H0	1117 aa		4.8	□□□□□ -1.64
DDX17-208	ENST00000477112	OXLD1	Q5BKU9	147 aa		4.79	□□□□□ -1.64
DDX17-208	ENST00000477112	WFDC8	Q8IUA0	241 aa		4.79	□□□□□ -1.64
DDX17-208	ENST00000477112	IL27	Q8NEV9	243 aa		4.79	□□□□□ -1.64
DDX17-208	ENST00000477112	CEP63	Q96MT8	703 aa		4.79	□□□□□ -1.64

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 99.5 ms