RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000470089.5

FBXO18-208, Transcript of F-box DNA helicase 1, humanhuman

TSL 5

Gene FBXO18, Length 979 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO18-208ENST00000470089 ANXA1P04083 346 aa38.15■■■■□ 3.7
FBXO18-208ENST00000470089 ZNF853P0CG23 659 aa38.15■■■■□ 3.7
FBXO18-208ENST00000470089 CALD1Q05682 793 aaKnown RBP38.15■■■■□ 3.7
FBXO18-208ENST00000470089 NUP98P52948 1817 aa38.15■■■■□ 3.7
FBXO18-208ENST00000470089 PDIA6Q15084 440 aa38.14■■■■□ 3.7
FBXO18-208ENST00000470089 PROSER3Q2NL68 480 aa38.14■■■■□ 3.7
FBXO18-208ENST00000470089 PRR5LQ6MZQ0 368 aa38.14■■■■□ 3.7
FBXO18-208ENST00000470089 IFT57Q9NWB7 429 aa38.14■■■■□ 3.7
FBXO18-208ENST00000470089 KIF6Q6ZMV9 814 aa38.13■■■■□ 3.69
FBXO18-208ENST00000470089 PIM2Q9P1W9 311 aa38.13■■■■□ 3.69
FBXO18-208ENST00000470089 NPHP1O15259 732 aa38.12■■■■□ 3.69
FBXO18-208ENST00000470089 GNAI1P63096 354 aa38.12■■■■□ 3.69
FBXO18-208ENST00000470089 NIP7Q9Y221 180 aaKnown RBP eCLIP38.12■■■■□ 3.69
FBXO18-208ENST00000470089 MAP3K15Q6ZN16 1313 aa38.12■■■■□ 3.69
FBXO18-208ENST00000470089 FAM9BQ8IZU0 186 aa38.11■■■■□ 3.69
FBXO18-208ENST00000470089 CNBD1Q8NA66 436 aa38.11■■■■□ 3.69
FBXO18-208ENST00000470089 ZBTB3Q9H5J0 574 aa38.11■■■■□ 3.69
FBXO18-208ENST00000470089 LRP10Q7Z4F1 713 aa38.1■■■■□ 3.69
FBXO18-208ENST00000470089 DLEC1Q9Y238 1755 aa38.09■■■■□ 3.69
FBXO18-208ENST00000470089 RGL2O15211 777 aa38.09■■■■□ 3.69
FBXO18-208ENST00000470089 ARFGEF1Q9Y6D6 1849 aa38.09■■■■□ 3.69
FBXO18-208ENST00000470089 ERVV-1B6SEH8 477 aa38.08■■■■□ 3.69
FBXO18-208ENST00000470089 DUSP27Q5VZP5 1158 aa38.08■■■■□ 3.69
FBXO18-208ENST00000470089 NBPF5PQ86XG9 351 aaPredicted RBP38.08■■■■□ 3.69
FBXO18-208ENST00000470089 C2CD5Q86YS7 1000 aa38.08■■■■□ 3.69
FBXO18-208ENST00000470089 FAM177BA6PVY3 158 aa38.07■■■■□ 3.68
FBXO18-208ENST00000470089 DALRD3Q5D0E6 543 aaKnown RBP38.07■■■■□ 3.68
FBXO18-208ENST00000470089 HDGFL1Q5TGJ6 251 aa38.07■■■■□ 3.68
FBXO18-208ENST00000470089 CCDC27Q2M243 656 aa38.06■■■■□ 3.68
FBXO18-208ENST00000470089 WWC1Q8IX03 1113 aa38.06■■■■□ 3.68
FBXO18-208ENST00000470089 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP38.06■■■■□ 3.68
FBXO18-208ENST00000470089 ST5P78524 1137 aa38.05■■■■□ 3.68
FBXO18-208ENST00000470089 BRIP1Q9BX63 1249 aa38.05■■■■□ 3.68
FBXO18-208ENST00000470089 COL11A2P13942 1736 aaPredicted RBP38.04■■■■□ 3.68
FBXO18-208ENST00000470089 H0YIN7 160 aa38.04■■■■□ 3.68
FBXO18-208ENST00000470089 HOXB7P09629 217 aa38.04■■■■□ 3.68
FBXO18-208ENST00000470089 CHPF2Q9P2E5 772 aa38.04■■■■□ 3.68
FBXO18-208ENST00000470089 DDX21Q9NR30 783 aaKnown RBP eCLIP38.03■■■■□ 3.68
FBXO18-208ENST00000470089 ELL2O00472 640 aaPredicted RBP38.02■■■■□ 3.68
FBXO18-208ENST00000470089 PDE6BP35913 854 aa38.02■■■■□ 3.68
FBXO18-208ENST00000470089 AIMP1Q12904 312 aaKnown RBP38.02■■■■□ 3.68
FBXO18-208ENST00000470089 ARHGAP27Q6ZUM4 889 aa38.02■■■■□ 3.68
FBXO18-208ENST00000470089 COPS6Q7L5N1 327 aa38.01■■■■□ 3.68
FBXO18-208ENST00000470089 ZNF784Q8NCA9 323 aaPredicted RBP38.01■■■■□ 3.68
FBXO18-208ENST00000470089 XAGE3Q8WTP9 111 aa38.01■■■■□ 3.68
FBXO18-208ENST00000470089 GPTP24298 496 aa38■■■■□ 3.67
FBXO18-208ENST00000470089 ATP10DQ9P241 1426 aa38■■■■□ 3.67
FBXO18-208ENST00000470089 TPTE2Q6XPS3 522 aa37.99■■■■□ 3.67
FBXO18-208ENST00000470089 TSR2Q969E8 191 aaKnown RBP37.99■■■■□ 3.67
FBXO18-208ENST00000470089 GIGYF2Q6Y7W6 1299 aaKnown RBP37.98■■■■□ 3.67
FBXO18-208ENST00000470089 C8orf58Q8NAV2 365 aa37.98■■■■□ 3.67
FBXO18-208ENST00000470089 ZNF622Q969S3 477 aaKnown RBP eCLIP37.97■■■■□ 3.671e-8■■□□□ 13.4
FBXO18-208ENST00000470089 UBN2Q6ZU65 1347 aa37.96■■■■□ 3.67
FBXO18-208ENST00000470089 TTLL6Q8N841 843 aa37.96■■■■□ 3.67
FBXO18-208ENST00000470089 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP37.95■■■■□ 3.67
FBXO18-208ENST00000470089 DBF4Q9UBU7 674 aaPredicted RBP37.95■■■■□ 3.67
FBXO18-208ENST00000470089 CACNA1SQ13698 1873 aa37.94■■■■□ 3.66
FBXO18-208ENST00000470089 GTF2E1P29083 439 aaPredicted RBP37.94■■■■□ 3.66
FBXO18-208ENST00000470089 ZNF34Q8IZ26 560 aa37.94■■■■□ 3.66
FBXO18-208ENST00000470089 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa37.94■■■■□ 3.66
FBXO18-208ENST00000470089 ANKRD36CQ5JPF3 1778 aa37.93■■■■□ 3.66
FBXO18-208ENST00000470089 NUTM1Q86Y26 1132 aa37.92■■■■□ 3.66
FBXO18-208ENST00000470089 IL16Q14005 1332 aa37.91■■■■□ 3.66
FBXO18-208ENST00000470089 SUSD4Q5VX71 490 aa37.91■■■■□ 3.66
FBXO18-208ENST00000470089 TSPYL6Q8N831 410 aa37.91■■■■□ 3.66
FBXO18-208ENST00000470089 NYXQ9GZU5 481 aa37.91■■■■□ 3.66
FBXO18-208ENST00000470089 TNRC6CQ9HCJ0 1690 aaKnown RBP37.89■■■■□ 3.66
FBXO18-208ENST00000470089 SRGNP10124 158 aa37.89■■■■□ 3.66
FBXO18-208ENST00000470089 ABCC12Q96J65 1359 aa37.89■■■■□ 3.66
FBXO18-208ENST00000470089 ERFEQ4G0M1 354 aa37.88■■■■□ 3.65
FBXO18-208ENST00000470089 HYPKQ9NX55 129 aa37.88■■■■□ 3.65
FBXO18-208ENST00000470089 ADCY9O60503 1353 aa37.86■■■■□ 3.65
FBXO18-208ENST00000470089 MASTLQ96GX5 879 aa37.86■■■■□ 3.65
FBXO18-208ENST00000470089 ZNF219Q9P2Y4 722 aaPredicted RBP37.86■■■■□ 3.65
FBXO18-208ENST00000470089 SLX4Q8IY92 1834 aa37.86■■■■□ 3.65
FBXO18-208ENST00000470089 IBTKQ9P2D0 1353 aaPredicted RBP37.85■■■■□ 3.65
FBXO18-208ENST00000470089 STYK1Q6J9G0 422 aa37.85■■■■□ 3.65
FBXO18-208ENST00000470089 WDR63Q8IWG1 891 aa37.85■■■■□ 3.65
FBXO18-208ENST00000470089 NTSR2O95665 410 aa37.84■■■■□ 3.65
FBXO18-208ENST00000470089 PARP10Q53GL7 1025 aa37.84■■■■□ 3.65
FBXO18-208ENST00000470089 ARFGEF2Q9Y6D5 1785 aa37.83■■■■□ 3.65
FBXO18-208ENST00000470089 HSP90AB3PQ58FF7 597 aa37.83■■■■□ 3.65
FBXO18-208ENST00000470089 ANKRD13DQ6ZTN6 518 aa37.83■■■■□ 3.65
FBXO18-208ENST00000470089 PPP1R42Q7Z4L9 355 aa37.83■■■■□ 3.65
FBXO18-208ENST00000470089 PLBD2Q8NHP8 589 aa37.83■■■■□ 3.65
FBXO18-208ENST00000470089 CNKSR1Q969H4 720 aa37.83■■■■□ 3.65
FBXO18-208ENST00000470089 KLRG2A4D1S0 409 aaPredicted RBP37.82■■■■□ 3.64
FBXO18-208ENST00000470089 TCIRG1Q13488 830 aa37.82■■■■□ 3.64
FBXO18-208ENST00000470089 PHAXQ9H814 394 aaKnown RBP37.82■■■■□ 3.64
FBXO18-208ENST00000470089 FANCIQ9NVI1 1328 aa37.82■■■■□ 3.64
FBXO18-208ENST00000470089 SBF1O95248 1867 aa37.81■■■■□ 3.64
FBXO18-208ENST00000470089 C21orf2O43822 256 aa37.81■■■■□ 3.64
FBXO18-208ENST00000470089 RASSF7Q02833 373 aa37.81■■■■□ 3.64
FBXO18-208ENST00000470089 CCDC30Q5VVM6 783 aa37.81■■■■□ 3.64
FBXO18-208ENST00000470089 NPR1P16066 1061 aa37.8■■■■□ 3.64
FBXO18-208ENST00000470089 TWISTNBQ3B726 338 aaPredicted RBP37.79■■■■□ 3.64
FBXO18-208ENST00000470089 C9orf131Q5VYM1 1079 aa37.79■■■■□ 3.64
FBXO18-208ENST00000470089 PRPF40BQ6NWY9 871 aaKnown RBP37.79■■■■□ 3.64
FBXO18-208ENST00000470089 ZNF428Q96B54 188 aa37.79■■■■□ 3.64
FBXO18-208ENST00000470089 UTP14AQ9BVJ6 771 aaKnown RBP37.79■■■■□ 3.64
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.7 ms