RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462494.5

ACTB-207, Transcript of actin beta, humanhuman

TSL 5

Gene ACTB, Length 2,245 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-207ENST00000462494 ECHDC1Q9NTX5 307 aa20.46■□□□□ 0.87
ACTB-207ENST00000462494 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP20.45■□□□□ 0.86
ACTB-207ENST00000462494 AACSQ86V21 672 aa20.45■□□□□ 0.86
ACTB-207ENST00000462494 HDAC5Q9UQL6 1122 aa20.45■□□□□ 0.86
ACTB-207ENST00000462494 SLIT3O75094 1523 aa20.44■□□□□ 0.86
ACTB-207ENST00000462494 HEG1Q9ULI3 1381 aa20.44■□□□□ 0.86
ACTB-207ENST00000462494 GRM8O00222 908 aa20.44■□□□□ 0.86
ACTB-207ENST00000462494 DDX58O95786 925 aaKnown RBP20.44■□□□□ 0.86
ACTB-207ENST00000462494 MBD3O95983 291 aa20.44■□□□□ 0.86
ACTB-207ENST00000462494 AK2P54819 239 aa20.44■□□□□ 0.86
ACTB-207ENST00000462494 SLC39A6Q13433 755 aa20.44■□□□□ 0.86
ACTB-207ENST00000462494 ERC1Q8IUD2 1116 aa20.44■□□□□ 0.86
ACTB-207ENST00000462494 SUCLG2Q96I99 432 aa20.44■□□□□ 0.86
ACTB-207ENST00000462494 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP20.44■□□□□ 0.86
ACTB-207ENST00000462494 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP20.43■□□□□ 0.86
ACTB-207ENST00000462494 LINS1Q8NG48 757 aa20.43■□□□□ 0.86
ACTB-207ENST00000462494 RUFY2Q8WXA3 655 aa20.43■□□□□ 0.86
ACTB-207ENST00000462494 BICC1Q9H694 974 aaKnown RBP20.43■□□□□ 0.86
ACTB-207ENST00000462494 GDPD2Q9HCC8 539 aa20.43■□□□□ 0.86
ACTB-207ENST00000462494 OVOS2A0A0G2JMS6 1433 aa20.43■□□□□ 0.86
ACTB-207ENST00000462494 CPA1P15085 419 aa20.43■□□□□ 0.86
ACTB-207ENST00000462494 WDR33Q9C0J8 1336 aaKnown RBP20.42■□□□□ 0.86
ACTB-207ENST00000462494 MYL6BP14649 208 aa20.42■□□□□ 0.86
ACTB-207ENST00000462494 CASTP20810 708 aaKnown RBP20.42■□□□□ 0.86
ACTB-207ENST00000462494 LRSAM1Q6UWE0 723 aa20.42■□□□□ 0.86
ACTB-207ENST00000462494 RIC3Q7Z5B4 369 aa20.42■□□□□ 0.86
ACTB-207ENST00000462494 TTC14Q96N46 770 aa20.42■□□□□ 0.86
ACTB-207ENST00000462494 DDX21Q9NR30 783 aaKnown RBP eCLIP20.42■□□□□ 0.86
ACTB-207ENST00000462494 NLRP2Q9NX02 1062 aa20.42■□□□□ 0.86
ACTB-207ENST00000462494 PTH1RQ03431 593 aa20.41■□□□□ 0.86
ACTB-207ENST00000462494 G3BP1Q13283 466 aaKnown RBP eCLIP20.41■□□□□ 0.861e-23■□□□□ 10.8
ACTB-207ENST00000462494 RAPGEF4Q8WZA2 1011 aa20.41■□□□□ 0.86
ACTB-207ENST00000462494 SIL1Q9H173 461 aa20.41■□□□□ 0.86
ACTB-207ENST00000462494 ERBB3P21860 1342 aa20.41■□□□□ 0.86
ACTB-207ENST00000462494 RUFY3Q7L099 469 aa20.41■□□□□ 0.86
ACTB-207ENST00000462494 KAZALD1Q96I82 304 aa20.41■□□□□ 0.86
ACTB-207ENST00000462494 LIMCH1Q9UPQ0 1083 aa20.41■□□□□ 0.86
ACTB-207ENST00000462494 PDIA6Q15084 440 aa20.4■□□□□ 0.86
ACTB-207ENST00000462494 PRPF40BQ6NWY9 871 aaKnown RBP20.4■□□□□ 0.86
ACTB-207ENST00000462494 ZNF790Q6PG37 636 aa20.4■□□□□ 0.86
ACTB-207ENST00000462494 CCDC8Q9H0W5 538 aaPredicted RBP20.4■□□□□ 0.86
ACTB-207ENST00000462494 TNFRSF11AQ9Y6Q6 616 aaPredicted RBP20.4■□□□□ 0.86
ACTB-207ENST00000462494 EVI5LQ96CN4 794 aa20.39■□□□□ 0.86
ACTB-207ENST00000462494 SASH1O94885 1247 aa20.39■□□□□ 0.85
ACTB-207ENST00000462494 JAKMIP1Q96N16 626 aaKnown RBP20.39■□□□□ 0.85
ACTB-207ENST00000462494 RGPD5Q99666 1765 aa20.38■□□□□ 0.85
ACTB-207ENST00000462494 RPAP1Q9BWH6 1393 aaPredicted RBP20.38■□□□□ 0.85
ACTB-207ENST00000462494 GADD45BO75293 160 aaPredicted RBP20.38■□□□□ 0.85
ACTB-207ENST00000462494 TPRNQ4KMQ1 711 aa20.38■□□□□ 0.85
ACTB-207ENST00000462494 USP48Q86UV5 1035 aa20.38■□□□□ 0.85
ACTB-207ENST00000462494 NFATC2IPQ8NCF5 419 aa20.38■□□□□ 0.85
ACTB-207ENST00000462494 EAF2Q96CJ1 260 aaPredicted RBP20.38■□□□□ 0.85
ACTB-207ENST00000462494 IGKV5-2P06315 115 aa20.38■□□□□ 0.85
ACTB-207ENST00000462494 ZSCAN21Q9Y5A6 473 aaPredicted RBP20.38■□□□□ 0.85
ACTB-207ENST00000462494 NEXNQ0ZGT2 675 aa20.37■□□□□ 0.85
ACTB-207ENST00000462494 ADCK5Q3MIX3 580 aa20.37■□□□□ 0.85
ACTB-207ENST00000462494 KLHDC4Q8TBB5 520 aa20.37■□□□□ 0.85
ACTB-207ENST00000462494 DDX54Q8TDD1 881 aaKnown RBP20.37■□□□□ 0.85
ACTB-207ENST00000462494 SLC52A2Q9HAB3 445 aa20.37■□□□□ 0.85
ACTB-207ENST00000462494 SMC3Q9UQE7 1217 aa20.37■□□□□ 0.85
ACTB-207ENST00000462494 CRYBG1Q9Y4K1 1723 aa20.37■□□□□ 0.85
ACTB-207ENST00000462494 KCNJ4P48050 445 aa20.37■□□□□ 0.85
ACTB-207ENST00000462494 LARP1Q6PKG0 1096 aaKnown RBP20.37■□□□□ 0.85
ACTB-207ENST00000462494 RNF214Q8ND24 703 aa20.37■□□□□ 0.85
ACTB-207ENST00000462494 TLR7Q9NYK1 1049 aaKnown RBP20.37■□□□□ 0.85
ACTB-207ENST00000462494 UTYO14607 1347 aa20.36■□□□□ 0.85
ACTB-207ENST00000462494 DTNBO60941 627 aa20.36■□□□□ 0.85
ACTB-207ENST00000462494 ZSCAN30Q86W11 494 aa20.36■□□□□ 0.85
ACTB-207ENST00000462494 XAGE3Q8WTP9 111 aa20.36■□□□□ 0.85
ACTB-207ENST00000462494 DDX17Q92841 729 aaKnown RBP20.36■□□□□ 0.85
ACTB-207ENST00000462494 SYAP1Q96A49 352 aaPredicted RBP20.36■□□□□ 0.85
ACTB-207ENST00000462494 FAM227BQ96M60 508 aa20.36■□□□□ 0.85
ACTB-207ENST00000462494 PDRG1Q9NUG6 133 aa20.36■□□□□ 0.85
ACTB-207ENST00000462494 TRPM3Q9HCF6 1732 aaPredicted RBP20.36■□□□□ 0.85
ACTB-207ENST00000462494 SIPA1L3O60292 1781 aaPredicted RBP20.35■□□□□ 0.85
ACTB-207ENST00000462494 LARGE1O95461 756 aa20.35■□□□□ 0.85
ACTB-207ENST00000462494 TATP17735 454 aaPredicted RBP20.35■□□□□ 0.85
ACTB-207ENST00000462494 COPS6Q7L5N1 327 aa20.35■□□□□ 0.85
ACTB-207ENST00000462494 MYD88Q99836 296 aa20.35■□□□□ 0.85
ACTB-207ENST00000462494 BOLA2Q9H3K6 86 aa20.35■□□□□ 0.85
ACTB-207ENST00000462494 NPHP3Q7Z494 1330 aa20.35■□□□□ 0.85
ACTB-207ENST00000462494 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa20.35■□□□□ 0.85
ACTB-207ENST00000462494 ZSCAN22P10073 491 aaPredicted RBP20.35■□□□□ 0.85
ACTB-207ENST00000462494 PIP4K2AP48426 406 aaPredicted RBP20.35■□□□□ 0.85
ACTB-207ENST00000462494 CCDC83Q8IWF9 413 aa20.35■□□□□ 0.85
ACTB-207ENST00000462494 CYP46A1Q9Y6A2 500 aa20.35■□□□□ 0.85
ACTB-207ENST00000462494 C1orf167Q5SNV9 1468 aa20.35■□□□□ 0.85
ACTB-207ENST00000462494 CAMTA1Q9Y6Y1 1673 aa20.34■□□□□ 0.85
ACTB-207ENST00000462494 STX6O43752 255 aa20.34■□□□□ 0.85
ACTB-207ENST00000462494 SYT1P21579 422 aa20.34■□□□□ 0.85
ACTB-207ENST00000462494 MSNP26038 577 aaKnown RBP20.34■□□□□ 0.85
ACTB-207ENST00000462494 NMIQ13287 307 aaPredicted RBP20.34■□□□□ 0.85
ACTB-207ENST00000462494 C19orf44Q9H6X5 657 aa20.34■□□□□ 0.85
ACTB-207ENST00000462494 CNPY2Q9Y2B0 182 aa20.34■□□□□ 0.85
ACTB-207ENST00000462494 CCDC171Q6TFL3 1326 aa20.34■□□□□ 0.85
ACTB-207ENST00000462494 NEURL1BA8MQ27 555 aa20.34■□□□□ 0.85
ACTB-207ENST00000462494 PHKG2P15735 406 aa20.34■□□□□ 0.85
ACTB-207ENST00000462494 JARID2Q92833 1246 aaPredicted RBP20.34■□□□□ 0.85
ACTB-207ENST00000462494 ZKSCAN1P17029 563 aaPredicted RBP20.33■□□□□ 0.85
ACTB-207ENST00000462494 VPS53Q5VIR6 699 aa20.33■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 121.5 ms