RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000461219.5

SCAF8-204, Transcript of SR-related CTD associated factor 8, humanhuman

TSL 5

Gene SCAF8, Length 677 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAF8-204ENST00000461219 KRT24Q2M2I5 525 aa26.59■■□□□ 1.85
SCAF8-204ENST00000461219 CNBD1Q8NA66 436 aa26.59■■□□□ 1.85
SCAF8-204ENST00000461219 HDGFL1Q5TGJ6 251 aa26.58■■□□□ 1.85
SCAF8-204ENST00000461219 NBPF5PQ86XG9 351 aaPredicted RBP26.58■■□□□ 1.85
SCAF8-204ENST00000461219 NIP7Q9Y221 180 aaKnown RBP eCLIP26.58■■□□□ 1.85
SCAF8-204ENST00000461219 HOXB7P09629 217 aa26.57■■□□□ 1.84
SCAF8-204ENST00000461219 CCDC27Q2M243 656 aa26.57■■□□□ 1.84
SCAF8-204ENST00000461219 PIM2Q9P1W9 311 aa26.57■■□□□ 1.84
SCAF8-204ENST00000461219 MAP3K15Q6ZN16 1313 aa26.57■■□□□ 1.84
SCAF8-204ENST00000461219 DUSP27Q5VZP5 1158 aa26.56■■□□□ 1.84
SCAF8-204ENST00000461219 ZBTB3Q9H5J0 574 aa26.56■■□□□ 1.84
SCAF8-204ENST00000461219 ARFGEF1Q9Y6D6 1849 aa26.55■■□□□ 1.84
SCAF8-204ENST00000461219 FAM177BA6PVY3 158 aa26.55■■□□□ 1.84
SCAF8-204ENST00000461219 ERVV-1B6SEH8 477 aa26.55■■□□□ 1.84
SCAF8-204ENST00000461219 RGL2O15211 777 aa26.55■■□□□ 1.84
SCAF8-204ENST00000461219 ZNF853P0CG23 659 aa26.55■■□□□ 1.84
SCAF8-204ENST00000461219 GTF2E1P29083 439 aaPredicted RBP26.55■■□□□ 1.84
SCAF8-204ENST00000461219 CHRNA5P30532 468 aa26.55■■□□□ 1.84
SCAF8-204ENST00000461219 TTLL7Q6ZT98 887 aa26.55■■□□□ 1.84
SCAF8-204ENST00000461219 WWC1Q8IX03 1113 aa26.55■■□□□ 1.84
SCAF8-204ENST00000461219 DLEC1Q9Y238 1755 aa26.55■■□□□ 1.84
SCAF8-204ENST00000461219 ANKRD31Q8N7Z5 1873 aa26.55■■□□□ 1.84
SCAF8-204ENST00000461219 H0YIN7 160 aa26.54■■□□□ 1.84
SCAF8-204ENST00000461219 ANXA1P04083 346 aa26.54■■□□□ 1.84
SCAF8-204ENST00000461219 AIMP1Q12904 312 aaKnown RBP26.54■■□□□ 1.84
SCAF8-204ENST00000461219 HLFQ16534 295 aa26.54■■□□□ 1.84
SCAF8-204ENST00000461219 GOLGB1Q14789 3259 aaKnown RBP26.53■■□□□ 1.84
SCAF8-204ENST00000461219 PDE6BP35913 854 aa26.53■■□□□ 1.84
SCAF8-204ENST00000461219 DALRD3Q5D0E6 543 aaKnown RBP26.53■■□□□ 1.84
SCAF8-204ENST00000461219 PRR5LQ6MZQ0 368 aa26.53■■□□□ 1.84
SCAF8-204ENST00000461219 C2CD5Q86YS7 1000 aa26.53■■□□□ 1.84
SCAF8-204ENST00000461219 CCDC24Q8N4L8 307 aa26.53■■□□□ 1.84
SCAF8-204ENST00000461219 DDX21Q9NR30 783 aaKnown RBP eCLIP26.53■■□□□ 1.84
SCAF8-204ENST00000461219 CACNA1SQ13698 1873 aa26.53■■□□□ 1.84
SCAF8-204ENST00000461219 ELL2O00472 640 aaPredicted RBP26.52■■□□□ 1.84
SCAF8-204ENST00000461219 TPTE2Q6XPS3 522 aa26.52■■□□□ 1.84
SCAF8-204ENST00000461219 CHMP4AQ9BY43 222 aa26.52■■□□□ 1.84
SCAF8-204ENST00000461219 CHPF2Q9P2E5 772 aa26.52■■□□□ 1.84
SCAF8-204ENST00000461219 PROSER3Q2NL68 480 aa26.51■■□□□ 1.83
SCAF8-204ENST00000461219 DBF4Q9UBU7 674 aaPredicted RBP26.51■■□□□ 1.83
SCAF8-204ENST00000461219 ANKRD36CQ5JPF3 1778 aa26.51■■□□□ 1.83
SCAF8-204ENST00000461219 PDIA6Q15084 440 aa26.5■■□□□ 1.83
SCAF8-204ENST00000461219 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP26.5■■□□□ 1.83
SCAF8-204ENST00000461219 BRIP1Q9BX63 1249 aa26.5■■□□□ 1.83
SCAF8-204ENST00000461219 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa26.5■■□□□ 1.83
SCAF8-204ENST00000461219 COPS6Q7L5N1 327 aa26.49■■□□□ 1.83
SCAF8-204ENST00000461219 XAGE3Q8WTP9 111 aa26.49■■□□□ 1.83
SCAF8-204ENST00000461219 TSR2Q969E8 191 aaKnown RBP26.49■■□□□ 1.83
SCAF8-204ENST00000461219 NYXQ9GZU5 481 aa26.49■■□□□ 1.83
SCAF8-204ENST00000461219 GPTP24298 496 aa26.48■■□□□ 1.83
SCAF8-204ENST00000461219 ARHGAP27Q6ZUM4 889 aa26.48■■□□□ 1.83
SCAF8-204ENST00000461219 ZNF622Q969S3 477 aaKnown RBP eCLIP26.48■■□□□ 1.838e-8■■□□□ 12.3
SCAF8-204ENST00000461219 IL16Q14005 1332 aa26.47■■□□□ 1.83
SCAF8-204ENST00000461219 UTRNP46939 3433 aa26.47■■□□□ 1.83
SCAF8-204ENST00000461219 KCNA3P22001 575 aa26.47■■□□□ 1.83
SCAF8-204ENST00000461219 GIGYF2Q6Y7W6 1299 aaKnown RBP26.47■■□□□ 1.83
SCAF8-204ENST00000461219 HYPKQ9NX55 129 aa26.47■■□□□ 1.83
SCAF8-204ENST00000461219 ATP10DQ9P241 1426 aa26.47■■□□□ 1.83
SCAF8-204ENST00000461219 COL11A2P13942 1736 aaPredicted RBP26.46■■□□□ 1.83
SCAF8-204ENST00000461219 WDR63Q8IWG1 891 aa26.46■■□□□ 1.83
SCAF8-204ENST00000461219 HSP90AB3PQ58FF7 597 aa26.45■■□□□ 1.82
SCAF8-204ENST00000461219 TTLL6Q8N841 843 aa26.45■■□□□ 1.82
SCAF8-204ENST00000461219 C8orf58Q8NAV2 365 aa26.45■■□□□ 1.82
SCAF8-204ENST00000461219 CCER2I3L3R5 266 aa26.44■■□□□ 1.82
SCAF8-204ENST00000461219 CCDC30Q5VVM6 783 aa26.44■■□□□ 1.82
SCAF8-204ENST00000461219 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP26.43■■□□□ 1.82
SCAF8-204ENST00000461219 PPP1R42Q7Z4L9 355 aa26.43■■□□□ 1.82
SCAF8-204ENST00000461219 PARP10Q53GL7 1025 aa26.42■■□□□ 1.82
SCAF8-204ENST00000461219 LRP10Q7Z4F1 713 aa26.42■■□□□ 1.82
SCAF8-204ENST00000461219 STK31Q9BXU1 1019 aa26.42■■□□□ 1.82
SCAF8-204ENST00000461219 ARFGEF2Q9Y6D5 1785 aa26.41■■□□□ 1.82
SCAF8-204ENST00000461219 CACNA1FO60840 1977 aa26.4■■□□□ 1.82
SCAF8-204ENST00000461219 GOLGA2Q08379 1002 aa26.4■■□□□ 1.82
SCAF8-204ENST00000461219 TWISTNBQ3B726 338 aaPredicted RBP26.4■■□□□ 1.82
SCAF8-204ENST00000461219 ANKRD13DQ6ZTN6 518 aa26.4■■□□□ 1.82
SCAF8-204ENST00000461219 NUTM1Q86Y26 1132 aa26.4■■□□□ 1.82
SCAF8-204ENST00000461219 ZNF34Q8IZ26 560 aa26.4■■□□□ 1.82
SCAF8-204ENST00000461219 PLBD2Q8NHP8 589 aa26.39■■□□□ 1.82
SCAF8-204ENST00000461219 CNKSR1Q969H4 720 aa26.39■■□□□ 1.82
SCAF8-204ENST00000461219 MASTLQ96GX5 879 aa26.39■■□□□ 1.82
SCAF8-204ENST00000461219 MYH16Q9H6N6 1097 aa26.39■■□□□ 1.82
SCAF8-204ENST00000461219 UBN2Q6ZU65 1347 aa26.39■■□□□ 1.81
SCAF8-204ENST00000461219 FANCIQ9NVI1 1328 aa26.39■■□□□ 1.81
SCAF8-204ENST00000461219 SUSD4Q5VX71 490 aa26.38■■□□□ 1.81
SCAF8-204ENST00000461219 RIC3Q7Z5B4 369 aa26.38■■□□□ 1.81
SCAF8-204ENST00000461219 TSPYL6Q8N831 410 aa26.38■■□□□ 1.81
SCAF8-204ENST00000461219 CCDC88AQ3V6T2 1871 aa26.38■■□□□ 1.81
SCAF8-204ENST00000461219 IBTKQ9P2D0 1353 aaPredicted RBP26.37■■□□□ 1.81
SCAF8-204ENST00000461219 ERFEQ4G0M1 354 aa26.37■■□□□ 1.81
SCAF8-204ENST00000461219 STYK1Q6J9G0 422 aa26.37■■□□□ 1.81
SCAF8-204ENST00000461219 UTP14AQ9BVJ6 771 aaKnown RBP26.37■■□□□ 1.81
SCAF8-204ENST00000461219 ZNF219Q9P2Y4 722 aaPredicted RBP26.37■■□□□ 1.81
SCAF8-204ENST00000461219 DDX58O95786 925 aaKnown RBP26.36■■□□□ 1.81
SCAF8-204ENST00000461219 TCIRG1Q13488 830 aa26.36■■□□□ 1.81
SCAF8-204ENST00000461219 ZNF784Q8NCA9 323 aaPredicted RBP26.36■■□□□ 1.81
SCAF8-204ENST00000461219 SRGNP10124 158 aa26.35■■□□□ 1.81
SCAF8-204ENST00000461219 NPR1P16066 1061 aa26.35■■□□□ 1.81
SCAF8-204ENST00000461219 SLX4Q8IY92 1834 aa26.35■■□□□ 1.81
SCAF8-204ENST00000461219 TNRC6CQ9HCJ0 1690 aaKnown RBP26.34■■□□□ 1.81
SCAF8-204ENST00000461219 SBF1O95248 1867 aa26.34■■□□□ 1.81
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