RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000460766.5

IMP4-208, Transcript of IMP4, U3 small nucleolar ribonucleoprotein, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene IMP4, Length 2,379 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IMP4-208ENST00000460766 RASEFQ8IZ41 740 aa24.73■■□□□ 1.55
IMP4-208ENST00000460766 GPATCH3Q96I76 525 aa24.73■■□□□ 1.55
IMP4-208ENST00000460766 PPP1R9BQ96SB3 815 aa24.73■■□□□ 1.55
IMP4-208ENST00000460766 ERC1Q8IUD2 1116 aa24.73■■□□□ 1.55
IMP4-208ENST00000460766 RBSNQ9H1K0 784 aa24.73■■□□□ 1.55
IMP4-208ENST00000460766 DDX58O95786 925 aaKnown RBP24.72■■□□□ 1.55
IMP4-208ENST00000460766 LINS1Q8NG48 757 aa24.72■■□□□ 1.55
IMP4-208ENST00000460766 GRM8O00222 908 aa24.72■■□□□ 1.55
IMP4-208ENST00000460766 MBD3O95983 291 aa24.72■■□□□ 1.55
IMP4-208ENST00000460766 AACSQ86V21 672 aa24.71■■□□□ 1.55
IMP4-208ENST00000460766 DDX21Q9NR30 783 aaKnown RBP eCLIP24.71■■□□□ 1.55
IMP4-208ENST00000460766 SYCE3A1L190 88 aa24.71■■□□□ 1.55
IMP4-208ENST00000460766 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP24.71■■□□□ 1.55
IMP4-208ENST00000460766 RUFY2Q8WXA3 655 aa24.71■■□□□ 1.55
IMP4-208ENST00000460766 SUCLG2Q96I99 432 aa24.71■■□□□ 1.55
IMP4-208ENST00000460766 ERBB3P21860 1342 aa24.7■■□□□ 1.55
IMP4-208ENST00000460766 LARP6Q9BRS8 491 aaKnown RBP24.7■■□□□ 1.54
IMP4-208ENST00000460766 AK2P54819 239 aa24.69■■□□□ 1.54
IMP4-208ENST00000460766 SLC39A6Q13433 755 aa24.69■■□□□ 1.54
IMP4-208ENST00000460766 TTC14Q96N46 770 aa24.69■■□□□ 1.54
IMP4-208ENST00000460766 BICC1Q9H694 974 aaKnown RBP24.69■■□□□ 1.54
IMP4-208ENST00000460766 WDR33Q9C0J8 1336 aaKnown RBP24.69■■□□□ 1.54
IMP4-208ENST00000460766 RAPGEF4Q8WZA2 1011 aa24.69■■□□□ 1.54
IMP4-208ENST00000460766 RIC3Q7Z5B4 369 aa24.68■■□□□ 1.54
IMP4-208ENST00000460766 NLRP2Q9NX02 1062 aa24.68■■□□□ 1.54
IMP4-208ENST00000460766 CASTP20810 708 aaKnown RBP24.67■■□□□ 1.54
IMP4-208ENST00000460766 PDIA6Q15084 440 aa24.67■■□□□ 1.54
IMP4-208ENST00000460766 ZNF790Q6PG37 636 aa24.67■■□□□ 1.54
IMP4-208ENST00000460766 LRSAM1Q6UWE0 723 aa24.67■■□□□ 1.54
IMP4-208ENST00000460766 KAZALD1Q96I82 304 aa24.67■■□□□ 1.54
IMP4-208ENST00000460766 MYL6BP14649 208 aa24.67■■□□□ 1.54
IMP4-208ENST00000460766 CPA1P15085 419 aa24.67■■□□□ 1.54
IMP4-208ENST00000460766 G3BP1Q13283 466 aaKnown RBP eCLIP24.67■■□□□ 1.54
IMP4-208ENST00000460766 NAP1L5Q96NT1 182 aaPredicted RBP24.67■■□□□ 1.54
IMP4-208ENST00000460766 GDPD2Q9HCC8 539 aa24.67■■□□□ 1.54
IMP4-208ENST00000460766 LIMCH1Q9UPQ0 1083 aa24.67■■□□□ 1.54
IMP4-208ENST00000460766 PTH1RQ03431 593 aa24.66■■□□□ 1.54
IMP4-208ENST00000460766 RUFY3Q7L099 469 aa24.66■■□□□ 1.54
IMP4-208ENST00000460766 EVI5LQ96CN4 794 aa24.66■■□□□ 1.54
IMP4-208ENST00000460766 SASH1O94885 1247 aa24.65■■□□□ 1.54
IMP4-208ENST00000460766 PRPF40BQ6NWY9 871 aaKnown RBP24.65■■□□□ 1.54
IMP4-208ENST00000460766 SIL1Q9H173 461 aa24.65■■□□□ 1.54
IMP4-208ENST00000460766 TNFRSF11AQ9Y6Q6 616 aaPredicted RBP24.65■■□□□ 1.54
IMP4-208ENST00000460766 UTYO14607 1347 aa24.65■■□□□ 1.54
IMP4-208ENST00000460766 IGKV5-2P06315 115 aa24.64■■□□□ 1.54
IMP4-208ENST00000460766 C1orf167Q5SNV9 1468 aa24.64■■□□□ 1.54
IMP4-208ENST00000460766 CCDC8Q9H0W5 538 aaPredicted RBP24.64■■□□□ 1.54
IMP4-208ENST00000460766 SLC52A2Q9HAB3 445 aa24.64■■□□□ 1.54
IMP4-208ENST00000460766 RPAP1Q9BWH6 1393 aaPredicted RBP24.64■■□□□ 1.53
IMP4-208ENST00000460766 NFATC2IPQ8NCF5 419 aa24.64■■□□□ 1.53
IMP4-208ENST00000460766 EAF2Q96CJ1 260 aaPredicted RBP24.64■■□□□ 1.53
IMP4-208ENST00000460766 CRYBG1Q9Y4K1 1723 aa24.63■■□□□ 1.53
IMP4-208ENST00000460766 NPHP3Q7Z494 1330 aa24.63■■□□□ 1.53
IMP4-208ENST00000460766 NEXNQ0ZGT2 675 aa24.63■■□□□ 1.53
IMP4-208ENST00000460766 JAKMIP1Q96N16 626 aaKnown RBP24.63■■□□□ 1.53
IMP4-208ENST00000460766 ZSCAN21Q9Y5A6 473 aaPredicted RBP24.63■■□□□ 1.53
IMP4-208ENST00000460766 CAMTA1Q9Y6Y1 1673 aa24.63■■□□□ 1.53
IMP4-208ENST00000460766 LARP1Q6PKG0 1096 aaKnown RBP24.62■■□□□ 1.53
IMP4-208ENST00000460766 TRPM3Q9HCF6 1732 aaPredicted RBP24.62■■□□□ 1.53
IMP4-208ENST00000460766 ADCK5Q3MIX3 580 aa24.62■■□□□ 1.53
IMP4-208ENST00000460766 USP48Q86UV5 1035 aa24.62■■□□□ 1.53
IMP4-208ENST00000460766 C19orf44Q9H6X5 657 aa24.62■■□□□ 1.53
IMP4-208ENST00000460766 TATP17735 454 aaPredicted RBP24.61■■□□□ 1.53
IMP4-208ENST00000460766 XAGE3Q8WTP9 111 aa24.61■■□□□ 1.53
IMP4-208ENST00000460766 GADD45BO75293 160 aaPredicted RBP24.61■■□□□ 1.53
IMP4-208ENST00000460766 KLHDC4Q8TBB5 520 aa24.61■■□□□ 1.53
IMP4-208ENST00000460766 SYAP1Q96A49 352 aaPredicted RBP24.61■■□□□ 1.53
IMP4-208ENST00000460766 PDRG1Q9NUG6 133 aa24.61■■□□□ 1.53
IMP4-208ENST00000460766 TLR7Q9NYK1 1049 aaKnown RBP24.61■■□□□ 1.53
IMP4-208ENST00000460766 SMC3Q9UQE7 1217 aa24.61■■□□□ 1.53
IMP4-208ENST00000460766 PHKG2P15735 406 aa24.6■■□□□ 1.53
IMP4-208ENST00000460766 COPS6Q7L5N1 327 aa24.6■■□□□ 1.53
IMP4-208ENST00000460766 ZSCAN30Q86W11 494 aa24.6■■□□□ 1.53
IMP4-208ENST00000460766 DDX17Q92841 729 aaKnown RBP24.6■■□□□ 1.53
IMP4-208ENST00000460766 FAM227BQ96M60 508 aa24.6■■□□□ 1.53
IMP4-208ENST00000460766 MYD88Q99836 296 aa24.6■■□□□ 1.53
IMP4-208ENST00000460766 KDM6AO15550 1401 aaPredicted RBP24.6■■□□□ 1.53
IMP4-208ENST00000460766 CCDC171Q6TFL3 1326 aa24.59■■□□□ 1.53
IMP4-208ENST00000460766 NEURL1BA8MQ27 555 aa24.59■■□□□ 1.53
IMP4-208ENST00000460766 LARGE1O95461 756 aa24.59■■□□□ 1.53
IMP4-208ENST00000460766 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa24.59■■□□□ 1.53
IMP4-208ENST00000460766 KCNJ4P48050 445 aa24.59■■□□□ 1.53
IMP4-208ENST00000460766 CYP46A1Q9Y6A2 500 aa24.59■■□□□ 1.53
IMP4-208ENST00000460766 SIPA1L3O60292 1781 aaPredicted RBP24.59■■□□□ 1.53
IMP4-208ENST00000460766 STX6O43752 255 aa24.59■■□□□ 1.53
IMP4-208ENST00000460766 ZSCAN22P10073 491 aaPredicted RBP24.59■■□□□ 1.53
IMP4-208ENST00000460766 SYT1P21579 422 aa24.59■■□□□ 1.53
IMP4-208ENST00000460766 ZKSCAN1P17029 563 aaPredicted RBP24.58■■□□□ 1.53
IMP4-208ENST00000460766 GCKRQ14397 625 aa24.58■■□□□ 1.53
IMP4-208ENST00000460766 VPS53Q5VIR6 699 aa24.58■■□□□ 1.53
IMP4-208ENST00000460766 RNF214Q8ND24 703 aa24.58■■□□□ 1.53
IMP4-208ENST00000460766 DDX54Q8TDD1 881 aaKnown RBP24.58■■□□□ 1.53
IMP4-208ENST00000460766 ZNF496Q96IT1 587 aaPredicted RBP24.58■■□□□ 1.53
IMP4-208ENST00000460766 BOLA2Q9H3K6 86 aa24.58■■□□□ 1.53
IMP4-208ENST00000460766 NMIQ13287 307 aaPredicted RBP24.58■■□□□ 1.52
IMP4-208ENST00000460766 CCDC83Q8IWF9 413 aa24.58■■□□□ 1.52
IMP4-208ENST00000460766 LMTK3Q96Q04 1460 aa24.58■■□□□ 1.52
IMP4-208ENST00000460766 HIP1O00291 1037 aa24.57■■□□□ 1.52
IMP4-208ENST00000460766 ZSWIM6Q9HCJ5 1215 aa24.57■■□□□ 1.52
IMP4-208ENST00000460766 RBM8AQ9Y5S9 174 aaKnown RBP24.57■■□□□ 1.52
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