RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000460289.5

PTPN4-208, Transcript of protein tyrosine phosphatase, non-receptor type 4, humanhuman

TSL 4

Gene PTPN4, Length 577 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN4-208ENST00000460289 ERVV-1B6SEH8 477 aa29.98■■■□□ 2.39
PTPN4-208ENST00000460289 H0YIN7 160 aa29.98■■■□□ 2.39
PTPN4-208ENST00000460289 PDE6BP35913 854 aa29.98■■■□□ 2.39
PTPN4-208ENST00000460289 KIF6Q6ZMV9 814 aa29.98■■■□□ 2.39
PTPN4-208ENST00000460289 BCORQ6W2J9 1755 aa29.98■■■□□ 2.39
PTPN4-208ENST00000460289 C2CD5Q86YS7 1000 aa29.97■■■□□ 2.39
PTPN4-208ENST00000460289 NIP7Q9Y221 180 aaKnown RBP eCLIP29.97■■■□□ 2.39
PTPN4-208ENST00000460289 ST5P78524 1137 aa29.96■■■□□ 2.39
PTPN4-208ENST00000460289 ARHGAP27Q6ZUM4 889 aa29.96■■■□□ 2.39
PTPN4-208ENST00000460289 NBPF5PQ86XG9 351 aaPredicted RBP29.96■■■□□ 2.39
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PTPN4-208ENST00000460289 MAP3K15Q6ZN16 1313 aa29.95■■■□□ 2.38
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PTPN4-208ENST00000460289 TPTE2Q6XPS3 522 aa29.94■■■□□ 2.38
PTPN4-208ENST00000460289 HOXB7P09629 217 aa29.93■■■□□ 2.38
PTPN4-208ENST00000460289 GNAI1P63096 354 aa29.93■■■□□ 2.38
PTPN4-208ENST00000460289 TTLL7Q6ZT98 887 aa29.93■■■□□ 2.38
PTPN4-208ENST00000460289 IFT57Q9NWB7 429 aa29.93■■■□□ 2.38
PTPN4-208ENST00000460289 ZNF853P0CG23 659 aa29.92■■■□□ 2.38
PTPN4-208ENST00000460289 PDIA6Q15084 440 aa29.92■■■□□ 2.38
PTPN4-208ENST00000460289 CCDC24Q8N4L8 307 aa29.92■■■□□ 2.38
PTPN4-208ENST00000460289 TTLL6Q8N841 843 aa29.92■■■□□ 2.38
PTPN4-208ENST00000460289 KRT24Q2M2I5 525 aa29.91■■■□□ 2.38
PTPN4-208ENST00000460289 MBIPQ9NS73 344 aa29.91■■■□□ 2.38
PTPN4-208ENST00000460289 LRP10Q7Z4F1 713 aa29.89■■■□□ 2.38
PTPN4-208ENST00000460289 NECTIN2Q92692 538 aa29.89■■■□□ 2.38
PTPN4-208ENST00000460289 ZBTB3Q9H5J0 574 aa29.89■■■□□ 2.38
PTPN4-208ENST00000460289 DDX21Q9NR30 783 aaKnown RBP eCLIP29.88■■■□□ 2.37
PTPN4-208ENST00000460289 ARFGEF1Q9Y6D6 1849 aa29.87■■■□□ 2.37
PTPN4-208ENST00000460289 GTF2E1P29083 439 aaPredicted RBP29.87■■■□□ 2.37
PTPN4-208ENST00000460289 CCDC27Q2M243 656 aa29.87■■■□□ 2.37
PTPN4-208ENST00000460289 PROSER3Q2NL68 480 aa29.87■■■□□ 2.37
PTPN4-208ENST00000460289 HDGFL1Q5TGJ6 251 aa29.87■■■□□ 2.37
PTPN4-208ENST00000460289 GIGYF2Q6Y7W6 1299 aaKnown RBP29.87■■■□□ 2.37
PTPN4-208ENST00000460289 ZNF622Q969S3 477 aaKnown RBP eCLIP29.87■■■□□ 2.37
PTPN4-208ENST00000460289 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP29.86■■■□□ 2.37
PTPN4-208ENST00000460289 DUSP27Q5VZP5 1158 aa29.86■■■□□ 2.37
PTPN4-208ENST00000460289 NYXQ9GZU5 481 aa29.86■■■□□ 2.37
PTPN4-208ENST00000460289 FAM177BA6PVY3 158 aa29.85■■■□□ 2.37
PTPN4-208ENST00000460289 ANXA1P04083 346 aa29.85■■■□□ 2.37
PTPN4-208ENST00000460289 ATP10DQ9P241 1426 aa29.85■■■□□ 2.37
PTPN4-208ENST00000460289 COPS6Q7L5N1 327 aa29.84■■■□□ 2.37
PTPN4-208ENST00000460289 ADCY9O60503 1353 aa29.83■■■□□ 2.37
PTPN4-208ENST00000460289 SRGNP10124 158 aa29.83■■■□□ 2.37
PTPN4-208ENST00000460289 CNKSR1Q969H4 720 aa29.83■■■□□ 2.37
PTPN4-208ENST00000460289 MASTLQ96GX5 879 aa29.83■■■□□ 2.37
PTPN4-208ENST00000460289 DBF4Q9UBU7 674 aaPredicted RBP29.83■■■□□ 2.37
PTPN4-208ENST00000460289 ANKRD31Q8N7Z5 1873 aa29.82■■■□□ 2.37
PTPN4-208ENST00000460289 STYK1Q6J9G0 422 aa29.82■■■□□ 2.36
PTPN4-208ENST00000460289 ZNF34Q8IZ26 560 aa29.82■■■□□ 2.36
PTPN4-208ENST00000460289 XAGE3Q8WTP9 111 aa29.82■■■□□ 2.36
PTPN4-208ENST00000460289 CHPF2Q9P2E5 772 aa29.82■■■□□ 2.36
PTPN4-208ENST00000460289 DLEC1Q9Y238 1755 aa29.82■■■□□ 2.36
PTPN4-208ENST00000460289 NUP98P52948 1817 aa29.81■■■□□ 2.36
PTPN4-208ENST00000460289 KLRG2A4D1S0 409 aaPredicted RBP29.81■■■□□ 2.36
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PTPN4-208ENST00000460289 AIMP1Q12904 312 aaKnown RBP29.81■■■□□ 2.36
PTPN4-208ENST00000460289 WWC1Q8IX03 1113 aa29.81■■■□□ 2.36
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PTPN4-208ENST00000460289 PARP10Q53GL7 1025 aa29.79■■■□□ 2.36
PTPN4-208ENST00000460289 HSP90AB3PQ58FF7 597 aa29.79■■■□□ 2.36
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PTPN4-208ENST00000460289 C9orf131Q5VYM1 1079 aa29.78■■■□□ 2.36
PTPN4-208ENST00000460289 PPP1R42Q7Z4L9 355 aa29.78■■■□□ 2.36
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PTPN4-208ENST00000460289 IBTKQ9P2D0 1353 aaPredicted RBP29.77■■■□□ 2.36
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PTPN4-208ENST00000460289 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa29.77■■■□□ 2.36
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PTPN4-208ENST00000460289 ELL2O00472 640 aaPredicted RBP29.76■■■□□ 2.35
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PTPN4-208ENST00000460289 ERFEQ4G0M1 354 aa29.75■■■□□ 2.35
PTPN4-208ENST00000460289 NUTM1Q86Y26 1132 aa29.75■■■□□ 2.35
PTPN4-208ENST00000460289 IL16Q14005 1332 aa29.74■■■□□ 2.35
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PTPN4-208ENST00000460289 TCIRG1Q13488 830 aa29.73■■■□□ 2.35
PTPN4-208ENST00000460289 SOGA3Q5TF21 947 aa29.73■■■□□ 2.35
PTPN4-208ENST00000460289 PRPF40BQ6NWY9 871 aaKnown RBP29.73■■■□□ 2.35
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PTPN4-208ENST00000460289 ZNF526Q8TF50 670 aaPredicted RBP29.73■■■□□ 2.35
PTPN4-208ENST00000460289 RNF181Q9P0P0 153 aa29.73■■■□□ 2.35
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PTPN4-208ENST00000460289 WDR63Q8IWG1 891 aa29.7■■■□□ 2.35
PTPN4-208ENST00000460289 TSR2Q969E8 191 aaKnown RBP29.7■■■□□ 2.35
PTPN4-208ENST00000460289 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP29.7■■■□□ 2.35
PTPN4-208ENST00000460289 RNF123Q5XPI4 1314 aa29.7■■■□□ 2.34
PTPN4-208ENST00000460289 CRY2Q49AN0 593 aa29.69■■■□□ 2.34
PTPN4-208ENST00000460289 CCDC30Q5VVM6 783 aa29.69■■■□□ 2.34
PTPN4-208ENST00000460289 RIC1Q4ADV7 1423 aa29.69■■■□□ 2.34
PTPN4-208ENST00000460289 ABCC12Q96J65 1359 aa29.68■■■□□ 2.34
PTPN4-208ENST00000460289 NFKBIEO00221 500 aa29.67■■■□□ 2.34
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