RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000459697.1

RABGGTB-203, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 2

Gene RABGGTB, Length 1,177 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-203ENST00000459697 GOLGB1Q14789 3259 aaKnown RBP8.13□□□□□ -1.11
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RABGGTB-203ENST00000459697 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa8.13□□□□□ -1.11
RABGGTB-203ENST00000459697 FAM83GA6ND36 823 aa8.12□□□□□ -1.11
RABGGTB-203ENST00000459697 AP1G2O75843 785 aa8.12□□□□□ -1.11
RABGGTB-203ENST00000459697 SH3D19Q5HYK7 790 aa8.12□□□□□ -1.11
RABGGTB-203ENST00000459697 KRT27Q7Z3Y8 459 aa8.12□□□□□ -1.11
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RABGGTB-203ENST00000459697 VWA5B2Q8N398 1253 aa8.12□□□□□ -1.11
RABGGTB-203ENST00000459697 KCTD17Q8N5Z5 321 aa8.12□□□□□ -1.11
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RABGGTB-203ENST00000459697 INSM2Q96T92 566 aaPredicted RBP8.12□□□□□ -1.11
RABGGTB-203ENST00000459697 POLMQ9NP87 494 aaPredicted RBP8.12□□□□□ -1.11
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RABGGTB-203ENST00000459697 SHANK3Q9BYB0 1731 aa8.12□□□□□ -1.11
RABGGTB-203ENST00000459697 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP8.12□□□□□ -1.11
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RABGGTB-203ENST00000459697 GNL3Q9BVP2 549 aaKnown RBP eCLIP8.11□□□□□ -1.11
RABGGTB-203ENST00000459697 ZNF395Q9H8N7 513 aaPredicted RBP8.11□□□□□ -1.11
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RABGGTB-203ENST00000459697 RASSF7Q02833 373 aa8.09□□□□□ -1.11
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RABGGTB-203ENST00000459697 DISP2A7MBM2 1401 aa8.05□□□□□ -1.12
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RABGGTB-203ENST00000459697 CAMKK2Q96RR4 588 aa8.05□□□□□ -1.12
RABGGTB-203ENST00000459697 SYT17Q9BSW7 474 aa8.05□□□□□ -1.12
RABGGTB-203ENST00000459697 FHDC1Q9C0D6 1143 aaPredicted RBP8.05□□□□□ -1.12
RABGGTB-203ENST00000459697 ERVK-7P63135 1459 aa8.05□□□□□ -1.12
RABGGTB-203ENST00000459697 CLIP1P30622 1438 aa8.04□□□□□ -1.12
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RABGGTB-203ENST00000459697 USP17L8P0C7I0 530 aa8.04□□□□□ -1.12
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RABGGTB-203ENST00000459697 TMEM2Q9UHN6 1383 aa8.04□□□□□ -1.12
RABGGTB-203ENST00000459697 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP8.03□□□□□ -1.12
RABGGTB-203ENST00000459697 AATKQ6ZMQ8 1374 aa8.03□□□□□ -1.12
RABGGTB-203ENST00000459697 MARSP56192 900 aaKnown RBP8.03□□□□□ -1.12
RABGGTB-203ENST00000459697 FOXD4L5Q5VV16 416 aaPredicted RBP8.03□□□□□ -1.12
RABGGTB-203ENST00000459697 LYSMD3Q7Z3D4 306 aa8.03□□□□□ -1.12
RABGGTB-203ENST00000459697 ADGRB2O60241 1585 aa8.02□□□□□ -1.13
RABGGTB-203ENST00000459697 ESPNB1AK53 854 aa8.02□□□□□ -1.13
RABGGTB-203ENST00000459697 ARHGEF15O94989 841 aa8.02□□□□□ -1.13
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