RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000436282.1

TOP3B-206, Transcript of DNA topoisomerase III beta, humanhuman

TSL 2

Gene TOP3B, Length 2,890 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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TOP3B-206ENST00000436282 KIF1BPQ96EK5 621 aa17.8■□□□□ 0.44
TOP3B-206ENST00000436282 GCP02774 474 aa17.8■□□□□ 0.44
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TOP3B-206ENST00000436282 VPS53Q5VIR6 699 aa17.79■□□□□ 0.44
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TOP3B-206ENST00000436282 CPA1P15085 419 aa17.78■□□□□ 0.44
TOP3B-206ENST00000436282 PLEKHO1Q53GL0 409 aaPredicted RBP17.78■□□□□ 0.44
TOP3B-206ENST00000436282 PI4KAP1Q8N8J0 262 aa17.78■□□□□ 0.44
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TOP3B-206ENST00000436282 PDRG1Q9NUG6 133 aa17.77■□□□□ 0.44
TOP3B-206ENST00000436282 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa17.77■□□□□ 0.44
TOP3B-206ENST00000436282 TM6SF1Q9BZW5 370 aa17.77■□□□□ 0.44
TOP3B-206ENST00000436282 USP42Q9H9J4 1324 aaKnown RBP17.77■□□□□ 0.44
TOP3B-206ENST00000436282 C1orf141Q5JVX7 400 aa17.77■□□□□ 0.43
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TOP3B-206ENST00000436282 NBPF7P0C2Y1 421 aaPredicted RBP17.76■□□□□ 0.43
TOP3B-206ENST00000436282 RUFY2Q8WXA3 655 aa17.76■□□□□ 0.43
TOP3B-206ENST00000436282 VPS37CA5D8V6 355 aaPredicted RBP17.76■□□□□ 0.43
TOP3B-206ENST00000436282 MAP3K11Q16584 847 aa17.76■□□□□ 0.43
TOP3B-206ENST00000436282 ANKRD24Q8TF21 1146 aa17.76■□□□□ 0.43
TOP3B-206ENST00000436282 JAKMIP1Q96N16 626 aaKnown RBP17.76■□□□□ 0.43
TOP3B-206ENST00000436282 ZSWIM6Q9HCJ5 1215 aa17.76■□□□□ 0.43
TOP3B-206ENST00000436282 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP17.76■□□□□ 0.43
TOP3B-206ENST00000436282 TTC41PQ6P2S7 1318 aa17.75■□□□□ 0.43
TOP3B-206ENST00000436282 SRGAP3O43295 1099 aa17.75■□□□□ 0.43
TOP3B-206ENST00000436282 AKAP4Q5JQC9 854 aa17.75■□□□□ 0.43
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