RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000435142.1

USP9YP28-201, Transcript of USP9Y pseudogene 28, humanhuman

BASIC

Gene USP9YP28, Length 589 nt, Biotype unprocessed pseudogene.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP9YP28-201ENST00000435142 NEUROD4Q9HD90 331 aa10.07□□□□□ -0.8
USP9YP28-201ENST00000435142 STARD13Q9Y3M8 1113 aa10.07□□□□□ -0.8
USP9YP28-201ENST00000435142 GRIK4Q16099 956 aa10.06□□□□□ -0.8
USP9YP28-201ENST00000435142 KRTAP1-3Q8IUG1 177 aa10.06□□□□□ -0.8
USP9YP28-201ENST00000435142 MICALL1Q8N3F8 863 aa10.06□□□□□ -0.8
USP9YP28-201ENST00000435142 ZDHHC1Q8WTX9 485 aa10.06□□□□□ -0.8
USP9YP28-201ENST00000435142 TNFRSF25Q93038 417 aa10.06□□□□□ -0.8
USP9YP28-201ENST00000435142 L3MBTL2Q969R5 705 aa10.06□□□□□ -0.8
USP9YP28-201ENST00000435142 SFSWAPQ12872 951 aaKnown RBP10.05□□□□□ -0.8
USP9YP28-201ENST00000435142 WASHC4Q2M389 1173 aa10.05□□□□□ -0.8
USP9YP28-201ENST00000435142 C8orf86Q6ZUL3 223 aa10.05□□□□□ -0.8
USP9YP28-201ENST00000435142 SLC30A3Q99726 388 aa10.05□□□□□ -0.8
USP9YP28-201ENST00000435142 SCHIP1Q9P0W5 487 aaPredicted RBP10.05□□□□□ -0.8
USP9YP28-201ENST00000435142 EML1O00423 815 aa10.04□□□□□ -0.8
USP9YP28-201ENST00000435142 ALBP02768 609 aa10.04□□□□□ -0.8
USP9YP28-201ENST00000435142 NOS2P35228 1153 aa10.04□□□□□ -0.8
USP9YP28-201ENST00000435142 TEAD4Q15561 434 aa10.04□□□□□ -0.8
USP9YP28-201ENST00000435142 NBPF11Q86T75 865 aa10.04□□□□□ -0.8
USP9YP28-201ENST00000435142 GDPD2Q9HCC8 539 aa10.04□□□□□ -0.8
USP9YP28-201ENST00000435142 NID1P14543 1247 aa10.03□□□□□ -0.8
USP9YP28-201ENST00000435142 ABL2P42684 1182 aa10.03□□□□□ -0.8
USP9YP28-201ENST00000435142 C7orf43Q8WVR3 580 aa10.03□□□□□ -0.8
USP9YP28-201ENST00000435142 SOX11P35716 441 aa10.02□□□□□ -0.81
USP9YP28-201ENST00000435142 NEUROD1Q13562 356 aa10.02□□□□□ -0.81
USP9YP28-201ENST00000435142 SERBP1Q8NC51 408 aaKnown RBP eCLIP10.02□□□□□ -0.81
USP9YP28-201ENST00000435142 C9orf172C9J069 976 aa10.01□□□□□ -0.81
USP9YP28-201ENST00000435142 ADH7P40394 386 aa10.01□□□□□ -0.81
USP9YP28-201ENST00000435142 EML3Q32P44 896 aa10.01□□□□□ -0.81
USP9YP28-201ENST00000435142 TRAPPC3LQ5T215 181 aa10.01□□□□□ -0.81
USP9YP28-201ENST00000435142 ZNF358Q9NW07 568 aa10.01□□□□□ -0.81
USP9YP28-201ENST00000435142 ZNF232Q9UNY5 417 aa10.01□□□□□ -0.81
USP9YP28-201ENST00000435142 NOD1Q9Y239 953 aa10.01□□□□□ -0.81
USP9YP28-201ENST00000435142 GPC6Q9Y625 555 aaPredicted RBP10.01□□□□□ -0.81
USP9YP28-201ENST00000435142 PIK3CDO00329 1044 aa10□□□□□ -0.81
USP9YP28-201ENST00000435142 SPEM2Q0P670 501 aa10□□□□□ -0.81
USP9YP28-201ENST00000435142 H2AFB1P0C5Y9 115 aa9.99□□□□□ -0.81
USP9YP28-201ENST00000435142 H2AFB2P0C5Z0 115 aa9.99□□□□□ -0.81
USP9YP28-201ENST00000435142 GTF2IP78347 998 aa9.99□□□□□ -0.81
USP9YP28-201ENST00000435142 C20orf204Q6ZNR8 217 aa9.99□□□□□ -0.81
USP9YP28-201ENST00000435142 SLC9A9Q8IVB4 645 aa9.99□□□□□ -0.81
USP9YP28-201ENST00000435142 PSME1Q06323 249 aa9.98□□□□□ -0.81
USP9YP28-201ENST00000435142 TBCELQ5QJ74 424 aa9.98□□□□□ -0.81
USP9YP28-201ENST00000435142 RAB44Q7Z6P3 723 aaPredicted RBP9.98□□□□□ -0.81
USP9YP28-201ENST00000435142 KRTAP4-12Q9BQ66 201 aa9.98□□□□□ -0.81
USP9YP28-201ENST00000435142 SERTM1A2A2V5 107 aa9.97□□□□□ -0.81
USP9YP28-201ENST00000435142 LZTS3O60299 673 aaPredicted RBP9.97□□□□□ -0.81
USP9YP28-201ENST00000435142 EPHA4P54764 986 aa9.97□□□□□ -0.81
USP9YP28-201ENST00000435142 ADGRE1Q14246 886 aa9.97□□□□□ -0.81
USP9YP28-201ENST00000435142 RHPN1Q8TCX5 695 aa9.97□□□□□ -0.81
USP9YP28-201ENST00000435142 LILRB5O75023 590 aa9.96□□□□□ -0.82
USP9YP28-201ENST00000435142 SKIP12755 728 aa9.96□□□□□ -0.82
USP9YP28-201ENST00000435142 SELPP16109 830 aa9.96□□□□□ -0.82
USP9YP28-201ENST00000435142 LCE3BQ5TA77 95 aa9.96□□□□□ -0.82
USP9YP28-201ENST00000435142 TNS4Q8IZW8 715 aa9.96□□□□□ -0.82
USP9YP28-201ENST00000435142 CEP63Q96MT8 703 aa9.96□□□□□ -0.82
USP9YP28-201ENST00000435142 BRD7Q9NPI1 651 aa9.96□□□□□ -0.82
USP9YP28-201ENST00000435142 MBTPS1Q14703 1052 aa9.95□□□□□ -0.82
USP9YP28-201ENST00000435142 SH3PXD2AQ5TCZ1 1133 aa9.95□□□□□ -0.82
USP9YP28-201ENST00000435142 A0A0A0MRY4 1105 aa9.94□□□□□ -0.82
USP9YP28-201ENST00000435142 SFI1A8K8P3 1242 aa9.94□□□□□ -0.82
USP9YP28-201ENST00000435142 ELNP15502 786 aa9.94□□□□□ -0.82
USP9YP28-201ENST00000435142 LRP8Q14114 963 aa9.94□□□□□ -0.82
USP9YP28-201ENST00000435142 TXNRD3Q86VQ6 643 aa9.94□□□□□ -0.82
USP9YP28-201ENST00000435142 LENG1Q96BZ8 264 aaPredicted RBP9.94□□□□□ -0.82
USP9YP28-201ENST00000435142 ANKIB1Q9P2G1 1089 aa9.94□□□□□ -0.82
USP9YP28-201ENST00000435142 KCNH4Q9UQ05 1017 aa9.94□□□□□ -0.82
USP9YP28-201ENST00000435142 KCNQ4P56696 695 aa9.93□□□□□ -0.82
USP9YP28-201ENST00000435142 HYAL3O43820 417 aaPredicted RBP9.92□□□□□ -0.82
USP9YP28-201ENST00000435142 NRG1Q02297 640 aaPredicted RBP9.92□□□□□ -0.82
USP9YP28-201ENST00000435142 NCOA4Q13772 614 aa9.92□□□□□ -0.82
USP9YP28-201ENST00000435142 C1orf53Q5VUE5 145 aa9.92□□□□□ -0.82
USP9YP28-201ENST00000435142 RAC1P63000 192 aa9.91□□□□□ -0.82
USP9YP28-201ENST00000435142 BHMTQ93088 406 aa9.91□□□□□ -0.82
USP9YP28-201ENST00000435142 HSH2DQ96JZ2 352 aa9.91□□□□□ -0.82
USP9YP28-201ENST00000435142 HCN4Q9Y3Q4 1203 aa9.91□□□□□ -0.82
USP9YP28-201ENST00000435142 SHISA2Q6UWI4 295 aa9.9□□□□□ -0.82
USP9YP28-201ENST00000435142 NFATC2IPQ8NCF5 419 aa9.9□□□□□ -0.82
USP9YP28-201ENST00000435142 TP53INP1Q96A56 240 aa9.9□□□□□ -0.82
USP9YP28-201ENST00000435142 PSMA6P60900 246 aaKnown RBP9.89□□□□□ -0.83
USP9YP28-201ENST00000435142 TBC1D8BQ0IIM8 1120 aa9.89□□□□□ -0.83
USP9YP28-201ENST00000435142 UBE2OQ9C0C9 1292 aaKnown RBP9.89□□□□□ -0.83
USP9YP28-201ENST00000435142 IGFLR1Q9H665 355 aa9.89□□□□□ -0.83
USP9YP28-201ENST00000435142 JPH1Q9HDC5 661 aaPredicted RBP9.89□□□□□ -0.83
USP9YP28-201ENST00000435142 TYRO3Q06418 890 aa9.88□□□□□ -0.83
USP9YP28-201ENST00000435142 DEPDC4Q8N2C3 294 aa9.88□□□□□ -0.83
USP9YP28-201ENST00000435142 ZNF280CQ8ND82 737 aa9.88□□□□□ -0.83
USP9YP28-201ENST00000435142 NUDT8Q8WV74 236 aa9.88□□□□□ -0.83
USP9YP28-201ENST00000435142 SUSD3Q96L08 255 aa9.88□□□□□ -0.83
USP9YP28-201ENST00000435142 PHACTR1Q9C0D0 580 aa9.88□□□□□ -0.83
USP9YP28-201ENST00000435142 CHMP3Q9Y3E7 222 aa9.88□□□□□ -0.83
USP9YP28-201ENST00000435142 ALG2Q9H553 416 aa9.87□□□□□ -0.83
USP9YP28-201ENST00000435142 SLC6A14Q9UN76 642 aa9.87□□□□□ -0.83
USP9YP28-201ENST00000435142 HIRAP54198 1017 aaPredicted RBP9.86□□□□□ -0.83
USP9YP28-201ENST00000435142 TSPAN10Q9H1Z9 355 aaPredicted RBP9.86□□□□□ -0.83
USP9YP28-201ENST00000435142 USP21Q9UK80 565 aa9.86□□□□□ -0.83
USP9YP28-201ENST00000435142 ZBTB7BO15156 539 aaPredicted RBP9.85□□□□□ -0.83
USP9YP28-201ENST00000435142 TRIM50Q86XT4 487 aa9.85□□□□□ -0.83
USP9YP28-201ENST00000435142 DMRTC2Q8IXT2 367 aaPredicted RBP9.85□□□□□ -0.83
USP9YP28-201ENST00000435142 TPCN2Q8NHX9 752 aa9.85□□□□□ -0.83
USP9YP28-201ENST00000435142 SSBP4Q9BWG4 385 aaPredicted RBP9.85□□□□□ -0.83
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38 ms